Os09g0527100

From RiceWiki
Revision as of 21:02, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os09g0527100

Description

Similar to RNA-binding protein

Version

NM_001070264.1 GI:115480270 GeneID:4347640

Length

12336 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0527100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:21445030..21457365

Sequence Coding Region

21451060..21451095,21451168..21451336,21451463..21451524,21451618..21451696,21452131..21452234

Expression

GEO Profiles:Os09g0527100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:21445030..21457365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008402:21445030..21457365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgagccccctctatagccatcacttgaatgatcagttgcagatgtcttatgttgctggtactaaccaaagtgcgattccacttggtgggatggccagatattcagtgggcatggacagtggaatccatggcgctacaagaactgaatcaagaactctctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacatatttttcgccccttttctggttttcgtgaggtgagattggtcaacaaggagtctaggcatgctggaagctgtaacctcttgtgttttgttgatttttcatctcctcctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggctataagtttgatgaacatgaccatgagtcttccaacctgcgcacacaattctctctcactcctcgcaggaggtcaattggtgggccttgtgttagaaactaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSPLYSHHLNDQLQMSYVAGTNQSAIPLGGMARYSVGMDSGIHG ATRTESRTLYVEGLPSNCTKREVAHIFRPFSGFREVRLVNKESRHAGSCNLLCFVDFS SPPEARAALETLQGYKFDEHDHESSNLRTQFSLTPRRRSIGGPCVRN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6031..6066#6139..6307#6434..6495#6589..6667#7102..7205#acgtgacacgtcatacgccgcatccttcgttcacgccgccgccgcctcgcgctcttgccgacggccaccgcgccgcctcgccggtcgccgctcccacccttccacggcgaccggagccaaagacggtgaccggcgggcgcgacgacctaggggaatgtgtacctcacctaccccacatcgtccccgcacccgcattccctaaacccccaaaccctagcccgctcctccgttgtcggatacgccaacctgctatatgcgagagaagggcatccacaactgtttgatgatctccaccggagccgccgtttaccggagtaaccgtgcttacgcgtcagctggaggggtgacctcggattcggtggagggctgatggctccgacccagctggtcgatcgctgcggcggcggcgcccccgcgagtcgctgctgtgagcctgtgatcgcctgtgatgggggtgtccgtggtggcgcaggcgccatgggggaagtaactcatgagatgggatgtggccgcaggcgcgattgtcgctgtgatggcgcccttggctatgcttggggcgacgatggtggcactgatgcccctgcaagcggcttcggtgcccacgattggtggttcattcgtgatggtggacttgtgaccttgccaccgcctcctccgcaagacgaatttgtgatgatgatgcagcctatgatagtatgatagcacattcatcgatgactgcgatgtcgctgtgatgccgtacccacatgccagagctgcgatggagctgctgcctttgtgcgcaggccttccaccttattgacatggtattgcagccccaacaagctggacctatgatgccattgttggcacagccgcctttggccatggcactcctctactcaagcttcaacatctggactactttggttcgttctaacactccacctcccctgtactttacattggcaacataagacatgagatatttttaatgttgctagtcgtagctattattattgtcaggttgatataagcttcttttgtctaaaataaataaataaataaataaataagcaagaaatgaagtgagctgcatagcacatcagcgattagcctcttatattccttgtaatgttaagatgtaacccagtgattggatgtagtttcaacatggaggtatgcaatgttttgttcgttgttttgattgtagcttttcttaagcatgactgcaattgcttggtgttatctactgatcatcattgatctgtgatctttggctttgttaatgaactttagaatataagtgatcactgatcattgatctgtgatctctaatctatgtttttctggtaagcttcaagataatcttaggaacagttgttgttttagaattgaggttatgccttttccttttatgctttggcttgtacagtttttaaacatttgttcagtgtagcctacccttttcggttgttaagcaaaatggcacataaggttttcttgtagagtttcaattttgggttagggaaatgttttcaactgctcttgtgaagaaatttggaatgtctgtttggaccaaagagacgatgcaatttataatctgttgatggcgatttcacgtagatctgatcggttagcttaggatttgcatgatactgcattttttgccgctcttacttcatgcagttattgaaagtgcagtaatgcaatctcctgtttccttttaatattggagtatcatttatcgataggatgttttcttgttacacttgctatctcgaaccgagcaagagcattagtaattgccattttggcaattgtttggaaatttgtgtgtacacaattatagcgctgctgacagcatgatggttcaaataacttgccattctcagatggccatctattaatttttcaactcaatagccatatgcttatgtgataaaaatgaaccatacatattcgaaagaaatggttgtggttttcccaatactagtcaatgcctgtgtattgcaatggatttgtgaaagattaattgtgcatgtttctgtttttagcccattgggatggttttttgggttgtttttaaaaccttttttttgtggtgggtgggggagggggggggggaggcaaggatgtgccctgcatgtttatttcttcttgcattgcatgcggtggaggaaggggagggcggacgaacgattgcccttttaagtagtttagagagaaatttcagaatttgccaccgaatacgtaggcctttaaggatttgccacccaatccgcactcctttcaaaatttaccactgaggatgcgaatttcttcattccgtgccgcttcgtccacttgtgcagctgagccttctgtccttccgctggctccatcctcgtccatccgccatacacgcgaacccagctcggcgccaacgtcatccatccgctgcctgtgtcagcgtaatctgtccgcttcgagggtgtcgcgtgggcggacgtcacgggcaaggtggagctgacacgctcgtgttccctccttctctaacggctctcacctcccagcatccaccgcaggagaaaccaagctgcgacgcatggggtcccatcctccctcttccctctcgtcgatcccatcccccaaaacactcgagttacgacgcgggagagcacacatccgtggtgcaccgcgggaataggaagcggcagcggcggtgcacggactcccctcacccccattctctggctcctcacatgtgaagtgcggcgtatatgtccctcccaaaccctagaaattcgacgggctggtgcttcttccacacagttggctagcttgggatcggttgtggtcatagatggtggcgatgcacactgggctcgcaaagtacgttggtggcagatggaagatgatggagccaatgcaaaagatagacggcatgacttcacgggcaaacggagtggtatggaacgaagaaattggtaccctaagtggtaaattttgaaaggagtgtggattgcgtggcaaatccttagaagcctgcatattcggtggcaaattctgaaatttctcgtttagatatgcaccatacacattcttaccatgatttgcagagaacctaggccattggcgaagctaggatttaaacttgagggggccaacttaagctcattaccgagtgacaatgaccataaaaaagttgcatcataatacgcacaaaattgaaacattttgacatggataataaatcatatgaatatatttgttagttttgaccatacaaaaggatgttttcctgcctattatttagtcattggctacatacatattttttgttttgaagattttagtatttcaaattaaagtgaagaggtaaataaaaataaagtattagggcttacaaaaaaatgcatatttagaacacggtatgcggacattggaacaactgagctgtccaagtgtgttgtgttcttcgtgttagcttgttaggtctgcttagcctaggaagcagtcatcaccatctaaaaacgatatactgctatgtctcccaaataacttgtttgcatgcaatcctagctggtagtggtagcattggaagcctgaatacgccaatgcaccaagtacatgacataatcatgtatttgatgattaattagccggtacttaagaaaaaaaattcgccgttgggggaggcctgacctccctccacccctccctggctctgcccttgacctaggctttttctccacattaatgtatatgcactttcatgatgtattatttgatcacctccatcttgatggacacactctaaccccatgtcatgcaacaccacccggcacatgtaactgacaaacaacacatgaatagtaactgccaacaaatcactacatgtttttgcacaattaagcccattcaatccacaccaacacacctctatcaaagaaacatccaccgtatacgaatatggattaaaaaacatataccaccggtaaattgtgactcacctaatgcctccccagttactgaccacaccactgtccccatctcagtctcatcttatctgtgcctttttatgtgggcatctggtagaggtgctctcttcatctgcatccaccatttcattcaccaactaagtaggcctttttgagctaggtggttggttggccttggccttattaatttttcatgtggtactacaatatgccattatgtccctaagttgtgtccttcacattttatttagtatctatgtagttatgtcttttacatttatttacatagttatgtcttttacattttttttacatagttatgtcttttacttttttttacatagttatgtcttttatgtggttatatgatggagaagaagcttccgatttgtctttcttgccgttttgagtttcttttcttgtggtcagagcagaatgcaagaattaaaaattaggtgagaaatggaacagaaattttggatttaaactttgtttcttctcttgttgttatgccctctgatatttggccatggccacacctcaatgttttccaccactgcttctaccatgcacctgcagtttgatctctcattgttctgcatttgatgcgtgcgtttgtagcagttgttgccttgttggtactaagttgttgttgttgttgttgttgtttcttcaatgctcaaaattgcaacttgggagataaagtttggcggagaaagagaagtgtgagaagaaatatcgatcctaataacaatggatgatgcaataccggcaattttttggggcatccaaaatagttttgactaatcaacccatgttaccctgaaaattatgtggcctatatctgcattaagtcacctgtttatacaacatttctggtttcttatcctttttctttcttagtgtaaatgttgtatgctgattgttattgttagctgggcctctgttgcttcgtgtaattattcttgctttattgaggtgttacgtatgatggaaagttatagtgtagtttgtactttggagtaacatgtaatccagtgaattatcagttcttccttcataagacactatttagcattcattttacctgtcattgtttgtgggcaattcctacctatttgtttgtttttatataatggcaattccccagtacaacactaacatttctcactaatggctttcaatctttgttgttctttaaaatgaatggttacctcaattgcctgatttcataacccagacaaagaaatttctcttgtattttttttctttgctttttttagttgtttcacaaaattatattggtgaacccgtcaatttttataaatagatgccatggtaactgctatgtacaaaatataggatcaacctgtcagagatttccctaattctctagtaatctggtgcgtcttactggctggctggctggtggttgatctgctcgctggtggtgttgcagtcttgcaggattcatcagtggtgtgagctgaagtgggggttctgtggttttttgtttctccgttaaggtttctctttccgtttcccctctcgcttgaggggactgttcacatgtttgtttctgttgcactcccatttattgtaacttcttaaatggaaagggaaaaaaatgttaatgacactttacactagtttctgcctaatgcattttctccaagtgggatgtacactagtttagcattgctcgaggagagaggattgacgtgtcctttcatgtaaacatttctattactgtatttttgcaaatttagtgcatctgatatctaggaatgtgtttttcaattcacatggattgctccttttctgtgctgctaaactaagatcatatttgcctataattagtctaggtaaaaatatatcttttgcgatgtaattcatattgcacctcgttggtgcttttgccctcagaaaaatattgacgagactgttcactaatttctgcctaatgtattttctccaagtggaatgtgcatttaaatattttagcactttacacgtttgtttgtagatatgccttctggaacagggaaatggcctcttccatgaatgaatgagccccctctatagccatcacttgaatgatcaggtagcatattgattataagtttgttgatttgaggctagcaacttttttaccaacatagtaattatcttccagttgcagatgtcttatgttgctggtactaaccaaagtgcgattccacttggtgggatggccagatattcagtgggcatggacagtggaatccatggcgctacaagaactgaatcaagaactctctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacgtatccttttctatgcttgtaaactaaaatcacattttcctagctataattagtctaggtatcttttgcgacgtaattcatattacacctcctaggtgcttttgcccttaactctttcttctgcagatatttttcgccccttttctggttttcgtgaggtgagattggtcaacaaggagtctaggcatgtaagttaaatgctacctgtgatccaaattttccctgttattttttgcaaagccaagcatgcttacatgtcaaatcccctctctgttttgcaggctggaagctgtaacctcttgtgttttgttgatttttcatctcctcctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggtaattataacatcatattttctgcatccatatgcattgtacttatgttgccaatttcgttagatagtgcttgcgcacagtttcattcttttatgtttgtgtgcctttagtctttttaaaaatctgtttatttttctgaatatttttccctttgtcccacatccagtaggttttagtgtgatgactgaactaaaactaagattgttatttcgaaatatcatattttttccttgttccactttgaaaccagcttactgtcattctatgtgtgctatatcatatgtaataatatttgtgtgcacatcaactttagtgctttccatcataaaactagacgtttcattggtagggagagaataaactttgagcttctaatacttgttcaggttataagcttgaatttggctctgaaattatgacgttttactttgcaggctataagtttgatgaacatgaccatgagtcttccaacctgcgcacacaattctctctcactcctcgcaggaggtcaattggtgggccttgtgttagaaactaagtttcttgggtggagttgaattaataatgcagagcaaaatttgtggagaatctctagggagacttgtatacaatgctagaccaaacttgactctagggaaacagcctcttccacgaagcaatgagcccccattatgtccatcgcttgaacaatcaggtattatatcaattataagcttgttaatttaaggatagcaactttcttactaacatagtgctggttgcagatgtcctatgctgctggtgctaaccaaagtgctattccacttggtgggatggccacatattcagcgggcatggacagtggaaaccatggcgctacaaggaccgaataaaaaactctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacatatcctttttatgcctgtaaactaaaatcacattttcctagctataattagtctaggtatcttttgcgatgtaattcatgttacacctcctaggtgcttttgcccttaaccctgtcttcttcagatattcttcgcccctttctggtttctttgaggtgagattggtcaacaaggagtctagatatgtaagttaaatgctacttatgaaccaaaacttccctgttcatattttgtaaagcctagcattgcttatattttgttctcttttgcaggtggaaggtatataatctcttgtgttttgttgattttgcaactccttctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggtaattacaacatcatttttacctatgaaatttatgattgtctgcatccatatgcattttcttatgctgccaatttctctagttaatgtctctgcacctgcattagatgcttttctttgctgtgctttaacatgcattgaagtatagcagtttagttttcataggcacccatttcacccgtcatacactttcagccaaaaattgccacagttgtgccagccacacttttcatggcaaaaaagtgtggctgccaactaaagtgctatatacaatgattaatgtatgccatcttcatttgtggttagtacattttttttctgtcattttgtttcaccctatatagaccattgttgcatgtctacgactattaaaggatatgcttgctattctgaacaacttagtagcaagctcttctatcttaaaccacatgccaacaggcttatctactttcacgattttttgtgaaaccaggcactattttgtcatttcagtaattcagttaaaatataattatacaatgtcagtgcgcttttggagttgctatggaaaccattgttggaaacaggcaggggcatatgtacagtagtatcactggtctcagatggatgccatccaaccaatccagtgtattgctagcatttgtacgcatttacgcacttacccccggcagtgcaactgtgcaagcttgttgaccccagccgctaaattgcagcagctcagaggctaaacaatatagctccatctttgaaaacttaaacagtttaactggtgtggtaggtgctggagcccgaatctattttccaacatccttcctctttcatattataagatgttttagattttgaatagattcattcatgcatccatcatccttcctctttcacattataagatgttttagattttgaatagattcattcatgcatccacatgcgctacatatatatgctcaacttcatatgtatgttagtgaatttagacaagagataaaaagaccaaaactttttataatgtgaaacggagggagtatatgttttggtaccatcagccaccactaatgtcgcagtttaaaatatttgatctgttgactataattatttcttttagctaatgtttctatccatgtaattaggccaataattctattatcaactattaaaagttaaccatatttttagctattagtaaaaacaacttcaataacttgcttgtctgaccaaaagaataaaggatttgtatgtcttattaggttctaactctcaaagtattgctcaatacagaattaagtctaaaattaagtgattcaaaccttaaactttaattagtctcaaatgaacatgctcattgaaacaacagcaatattctaccgacaactctagctaaaaagatcagctcaaggacaccttagcttagaaatatttagaaatggagcccttccaaacaccgcataagtataagtgagtggtgacaccggtgccccaaaatcctggatacacccctggtaacagggaaaccaccaagttttggttggatcggtgtctgcatggcaaaacgatatttgaattagctccaaacttgtgctagctgatctctaagtgcacctttaaacaatgcactgtggctcaagcgctgaataacagaagatggttggctgccacatggtgcttttattgttcaagtgcttatttcacttgagaaggcatctacatcaggaagttggcctataatgcttatttcatgtggtctatcaagtttgctccttggaagtgaatttggaaaagttgggctagcttcgctgcaagttattcacttggttagctgtttaacaactggtgttggatggttgacaggcttgctaagcgaggtttatcgcacccgaatgcttgtcccttctgcgaccaggatgatgaatctattcggcactttctcatctcatgtgtatttccccgccatgtctggacatgtattctacagaagctgaatatgttggcctccgtgcctcggtctaccgcgtgtctctctagttggtggtaagttaacagaggtgttcctaaagaccaaagaaaggggctcaactccttgatcattctagtaagctaggaaatatagaagcaccggaatgcatgtgtgtttgagggaacaaagccccaatgttcaggtggttctgcattctattgcggaagagagcagcctgtggtgctgggctggcacctccgcacttcgtgagctacttgtttggtcgctcacaatagtcacctagtccgtccttatggtgttatcctcctttgatcttgttcccattggcaataggcaattgtttttagtccttttgatcttggggggggggggggggagaagggggtttatcctcctttataactttctaaaacaatcgtctaatttgcatctcatatttccccaaaggtacatcaaccatttctacgcatcagtaaaatttgtcaattggccgttgaaatggcaaaattactactacatttttctattttgttactaaattatacattcaataccctttaaattctacaacaacctgtaaccccttccaaccgtttgtaagtcagcagggtctagatttgtttttgttttttttggcccccatggtatatttctgttaaaaaaagataaaagtaataacctttttttaaaaaatcttagttctgtcacttgttcccattggcattgactgtatacagcttctaccaatgcatttgtgttttgaggaactgctaattaaagtactggagttttttatgtggtagcacgcccttagtagtattgcaaacttgcgattcttggtgagtagaagcatgatgttgttacataggctcatatcagttgctggtgtgattagacaaatcatgctctttgacatgaatgaacctatcctaatttatcctttgagcttcattaccaggaacagtagttggttgtgctgtatacttttaatcttgcgtggatattcacctagtctcaatgtttcatgaacgtgagaaccacatatggctgccaaaacatgcaagcgtgattccagtttattgaatcgtgcatgctagataaagggcctaattacctttatagatgtgttggcaagcaggagtagaaatcagtgtggttgtgtgagtttaatgatcttttgtattttactattgcaataaattgaaagtttaagttgggaagaaaggccgttctgaacattgttgttagaggtttaaacaaacgagatggtattagaaagggggtcctggttatcctgcaaccttaaccacctttaccacctgttatcattatccattacttggctgtatcttcgtaggctgatgctaggttattcaacctctggctgtttgtagcaacagggtaatagaacatttattgatttatactcactgactaataaatgaaacgccggtttccttctttgtcaagagagaagaattttgtccttcctattagacaagataaacacggcatattacttttctagcaattaactgtgggtagtgatcgtttcttctttctgattgtcgaaatggccattgccatccagctttccaccataaataaactgacatggatattgcggtaaaagaactgccattgatagcaaaattctaaaatctatcctgcaacattaatttctgactagaagaataaggcaaatttatttttttgctcctgctgcattatttgcttcttcaagttccagcatgacaatataaattcattcgactagacaaacttgaaatgtttaatggacgtagtgtaataatagtactaccatttatagcacagttttgtcactacctgcagcaattttgaaaaaaaatcaacactaatgtggttgtaactatcagacatgttgatacgaaatctattcataggatgtgacctcaacttctgcctgatacgctcaaaggtctgtgtgttttgcagtgatcaccagttactactaaggaaaggtgttcggtgatgccactaagatcatggttccagggacgatgcaaaggcaatggaacatgtttcactgaggttctcattcagggcaaaggggaattgctcttcggagctatgtgaatttggtaagtggtacccttcttagagtggtctattccatggtgcaacagcttatgcatcatacagattttggaatggttcttatgttatgatcgttttgatgtactccattcatcctaaacatatttaagcttgtctatctacttttcttttttcagtttggcagaaacactgcttcgtatggttgcaagtgtattctagcgtgaattgtattttctcaaggtctaaactgtaactgaatttaaattgtaatgcttggagtgaatgtcttaagttaaaaacttttgctttttgtt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0527100, RefSeq:Os09g0527100