Os05g0154600
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0154600 |
|---|---|
| Description |
Similar to VIP2 protein |
| Version |
NM_001061218.1 GI:115462166 GeneID:4337844 |
| Length |
5703 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0154600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:3167898..3173600 |
| Sequence Coding Region |
3168121..3168586,3169097..3169505,3169588..3169616,3170657..3170715,3171578..3171747 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:3167898..3173600 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>agggaggaggtgagggaggaggagggggaggagggggagggggtgggcgggaaggaggaggagaaggcggcggccgcggccgcggcggtgtcgtgctcgatctgcctcgacgcggttgtcgccgccggcggggagaggtccacggcgaggctgcagtgtggccacgagttccacctcgattgcattggatcagcatttaatgccaaaggcgttatgcaatgccccaactgccgcaaaattgaaaaggggaactggctctatgcaaatggttcccgacccacacaagatgttaatatggatgagtgggctcatgatgaagacctttatgatgttagttactcggagatgccctttcggtttcactggtgcccatttggtcgtttggctcaacttccatccttctttgaggaaggagaatcatcacccccagttacttttcatgacttcatgggacaacatatgtttacggagcatgtagctgctgtatcttctgcacctggggcagctcatccatgcccatatgtggcatacttgcatcctcttccatcattggcgtcatcatcaagctctcatgttcctgagagaactatggatggtcctgcatatcatgatccctggcaccccttggctgggccttcagatggtaggcccttgcaatcagtgcaacctgctgattttcatcataaccattgggcgcatgttcccaattcctatcctcaacccaacaacaataatggggtggccgagcagcaaggagtcccttttggaacaacgagggctgcaagagttgatggtgatacccaacgtcgaggatcatctatttctccatcatacttcagtaatggatctggttctagatctagagctcctaatgttcctcctatggtacctcaattcatgagggcgcacggcagcattagtgaacagtaccagcagagttcatcatccagcttatttgctggggctcatagatcaggaggcatgcgaactgcaccgccgccccctctaccagagaacccggcattttgccttttcccaccaggttcatctggccataactcgatggagactgatgatgcaggaggaaaccgattctatgcctgggaacgggatcgcttcgcaccatacccactaatgccagtggactgtgagacaaactggtggagttcacaacaatctcatggtacatcagaacccgcgcctgctccaaggagactatttgggcaatggattggtgttggaagatcatctccggaaaatcgatcacccgagggctcatcgtatcggcaaatgcacaccccaaggatgtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>REEVREEEGEEGEGVGGKEEEKAAAAAAAVSCSICLDAVVAAGG ERSTARLQCGHEFHLDCIGSAFNAKGVMQCPNCRKIEKGNWLYANGSRPTQDVNMDEW AHDEDLYDVSYSEMPFRFHWCPFGRLAQLPSFFEEGESSPPVTFHDFMGQHMFTEHVA AVSSAPGAAHPCPYVAYLHPLPSLASSSSSHVPERTMDGPAYHDPWHPLAGPSDGRPL QSVQPADFHHNHWAHVPNSYPQPNNNNGVAEQQGVPFGTTRAARVDGDTQRRGSSISP SYFSNGSGSRSRAPNVPPMVPQFMRAHGSISEQYQQSSSSSLFAGAHRSGGMRTAPPP PLPENPAFCLFPPGSSGHNSMETDDAGGNRFYAWERDRFAPYPLMPVDCETNWWSSQQ SHGTSEPAPAPRRLFGQWIGVGRSSPENRSPEGSSYRQMHTPRM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5015..5480#4096..4504#3985..4013#2886..2944#1854..2023#2..179#gagggaggaggtgagggaggaggagggggaggagggggagggggtgggcgggaaggaggaggagaaggcggcggccgcggccgcggcggtgtcgtgctcgatctgcctcgacgcggttgtcgccgccggcggggagaggtccacggcgaggctgcagtgtggccacgagttccacctcggtatgtatgtggctttcggatgatctacagatgtgttattggtagggaattgtaagttagagcactagaactgcgattttttttggactcgcgctgtcaatttgatttgggtgagggtagctgtaaaatgtgatgcttttgttaggaattggggctggacttggtgggaattaagataattttacgtcttctagctgtaatggtgcagaattttgggcgatggttcgcataggtagtgagtgccttttgggggtaaccatcaatgttttccccagtgggtgggtgggttgggggatgaaaggaagatttcgtgctaaaattgctggtatatagggtgaaatagtctggctgacatgcatcacaaatttccggtactggcctggtccgatgactcgtagagtttgcggatttgatcagatactatgaaagaacatcagaatagcttgagcggagtttcttgatgggttcttagttcaatggaagttatgaaacaaagcatcggaccaaataattattttagccagacaaggaaatcaagtaaatcacatcagttggaaattgatactaacatggaaaccaatggaagcaaacagatagagcaaatattgatcttgagattgcgcttctctataccatggtagaggcaggttggcatgttgagcagataataaattggccccttaatacaacgatggacctatgcacccactggtaacctttaaacagggctggcttagtggaccaatggtttgacccacccatttggacccctggatgaaagtctgtttggttcccaggaatttttgggggttattgagctagctgttcaattttagtgaatggttgcactttgaaggcttgtctggaggatttaaaaatgtcccatggcatgcttagacctaaacttataggaaactaaggacgacacagatttgaatagttcagtttgatggtttcattgagcgttgagccatagtgacactgacatactgtagtagatagggtttccctctctcctttttatgctgtacaaggaattaggtgcaatcctgagaatatgtagttaactgcaatccttgtttcctactttcctggaaattactcttaggtaatattttttgttggaagtcagaaccatgtttacattctatatatacttggttcatgttcttttactggtatcaagttttatctggtctgttgttatttggtaacaagttatcttgatgggattgagtttttgtcttataagctgtcagccgtgacgcatgagcaaggcaacagaaaaataattttagtgcagacttctatacttctactcttagtggttaaaagcctaaggctgaaaaatagagaaggatggaaaaacatctaaactaattcaaaattaagtttcaaaactcaaatttggccgcagcttataagctgccgagctgccaacaagttagtatcaaatatggactgtcttttagttatcaaaatcctttagattttctaagttaacaagcctcaatgatcttggattcacttattaaccaccattgttttttgtgcattagcaatgattttatttgctttttacatttgttaagcgtatgatcttcaagtggaagttttgaatttctagtattttcatttattacaacattttgatgattgtggcattgtttccagattgcattggatcagcatttaatgccaaaggcgttatgcaatgccccaactgccgcaaaattgaaaaggggaactggctctatgcaaatggttcccgacccacacaagatgttaatatggatgagtgggctcatgatgaagacctttatgatgttagttactcggagatggtacgcaaccatgttatctttaattttttatttgtttttgttgtgaattatctttttcctttctaatctttaatttattatttgtttttgttgtgaattgtcttttacctttcttgtttgccacatgctatcccatcatgtttttactagtttacctgatcatcaatatggtttcttcgacttgttcttttcttacaaatgattcacttgactaaaccttttcttttggagacatctgtgttgctacgtgaatatgtcttctatgccgatattcccttcagatcaagatctttagttatgggcctcttgacagcggaattcatttataatcgttcttataggttgccactggcagcttttgtgaattgcattactgttgtttttctgttctccaatttagtcacttgaggccatgttctctctgtgaagaaaacaatatgggagttttgaacaagtgcagtgtgcattcttgcaaatgatctagattctagttcttttgtcagttgaaggttaaactcgagagaagtaatacattagaggtcacagctgtttttttatgtgtacacactatggtgcatcagtactgactccttatttacttgaagtaaatttgtcattttccctattattatgcttaacattgtgcacaaagtaataattctgagatgaaagttgtcacagcttattcaatcatgctacacatatgcactaactaattgcattttctaaaagatttatgctacttacatagttggttttcattattattgatttttcattttctgtcatcatttgagcttacggaggcagttactctagattctgttctgagttctgacaacaatgtatttgaattgtgcagccctttcggtttcactggtgcccatttggtcgtttggctcaacttccatccttctttgagtatgttctgcagtcttcgcttgaaattgtggtttatcgttttatttcacctttccaattgtccagttctatttctagctcagcactataagatctttcaagtatagtaataatataaaacaccattgaatttgcgggtagtgaaaattggtcttatgaggtactataactagatgttgtatttatgttggtccattagcgatgctatctatactctatactcctcaaaaagattccaatggtggtggcattgaatctgccaccccacccactccttttgtagattttacatattaccccttgaacttttaatgttacataacaactaaatctaggtggatagccacatatacaattaaattaaggtgggtattccctataacaaaaagacgggtaacatatacatttcatgaaaaatatgttattgcttattttaggcaatattatgaaaatattcttttatctatccatagcaaagcatatgggtatttagctagtgttttgaaaaattaataagcaaatgagttaactctaggacctgtaatatcaacaatctgttttagggagggatgaatataaggtgaatggcctttcaattctcggtgatgaagtgcggaacaatatacattttttcttaggtttagtcctatcatgatgcatttggtttttgacaatctccgtgctagttctctttccatgagactctaactctactttgcatggatcttctgacaagccactgtctattgcttgtatataccaatatgtcagtataccatttgaccaaagtgctgatcagactactggtgacagcattaatgatgataccattaagccatattgtctttcccgataccgattgcagtcagtgaacatatcaattctttaagttctatcttttgctgcacccttctcttaacaccaactattgtctgtgcaaaatctatagcacgctatattaaaagtttcagagtttcattgtttgaaattggtgctatgtaatattatgttcctcacttaatgttcccctcttttgccagggaaggagaatcatcacccccagttacttgtaagttcttatttaaatgggatcattttgtaaaacaatagctatattgagtttgaaatatgtcttgatattggccatgcagttcatgacttcatgggacaacatatgtttacggagcatgtagctgctgtatcttctgcacctggggcagctcatccatgcccatatgtggcatacttgcatcctcttccatcattggcgtcatcatcaagctctcatgttcctgagagaactatggatggtcctgcatatcatgatccctggcaccccttggctgggccttcagatggtaggcccttgcaatcagtgcaacctgctgattttcatcataaccattgggcgcatgttcccaattcctatcctcaacccaacaacaataatggggtggccgagcagcaaggagtcccttttggaacaacgagggctgcaagagttgatggtgatacccaacgtcgaggatcatctatttctccatcatacttcagtaatgggtaattacttattcatttctgctcaatctactaatttgtccttgtttttgttgccatgtactttatcagaacacatatcagattagtaaaatcagtaaacaatggaaaattgtgttgggtaccaaaaaagacattgtacgcatccgtgtcctattctgctaccatttttaccaatactgtttgtccacgtttcctttgctggttttatcatgctctgttttaacctgatgctataacaactttcacaaatacaattttgtatttttgtttatgctataacaaaaaaaatgggaacctgatggtgaaatcaataataagcttgtaagcatgagtgtcaggctaagatcttatacaggcaagaataaattcctaaaattacttcaaattcaaaatcttcttttgtagaagagactattgcat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|
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