Os09g0533100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0533100

Description

Similar to Pantothenate kinase 4 (Fragment)

Version

NM_001070301.1 GI:115480344 GeneID:4347680

Length

8761 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0533100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:21761270..21770030

Sequence Coding Region

21761270..21761309,21761807..21761862,21762452..21762568,21762736..21762855,21762945..21763039
,21763127..21763220,21763441..21763572,21764225..21764337,21764458..21764648
,21764983..21765196,21765815..21765856,21765937..21765985,21766478..21766560
,21766721..21766837,21766928..21766991,21767092..21767237,21767368..21767521
,21768078..21768161,21768242..21768436,21768542..21768613,21769497..21769586

Expression

GEO Profiles:Os09g0533100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:21761270..21770030 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggcggttgctagtgaaggtgggactgatgatgccaaaaggaggggtgacgcattcgcacatgctttttctgctcatttggcaaggttgatggaggagcctgctgcttatgggaagtttggtttagccaacctgttggagctgagagaagaatgcctgagagaattccagtttgtcgatgcatatgttagcattaagcaaagggaaaatgaagcttcactggctgttttacctgatcttctgatggaacttgatagtatgaatgaggaagctagattgcttgcactaatcgagggtgtccttgctgcaaacatatttgattggggctctcgagcttgtgtggacctttatcacaagggaactataatagaaatttatcgcatgagccgcaagaagatgcaacgtccttggcggattgatgactttgatatgtttaaaaagagaatgcttgctgataagaagggccaaccatacaaaagagcactgctttttgttgataactcgggtgctgatgtggtccttggaatgattcctttagcacgggaattattacgcaatggaactgaggtggttttggttgcaaattcattgcctgctttgaatgatgttaccgctaatgagcttccaggaattgtggctgaagctgcgaagcattgtggtatacttcggaaagctgcagaggcaggtggattgatctttgatgccatggctggcatccaagatgatctgaaagatgaaccagtatcagttccccttatggttgttgagaatggatgtggcagtccgtgtattgatttccggcaggttagctcagaacttgctgctgcagcgaaagatgcagatttgttaatcttagagggcatggggcgatctctgcataccaacctcaatgcccgttttaagtgcgatactctgaagctggcgatggtcaagaatcagagattggcagaaaaacttttcaatggaaatatatatgactgcatctgtaaatttgaacctgttccttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>CLDFISSKQLHRGGVDSPSWRSGAQPDNIVIKATGGGAFKYADL FKERLGVSLEKEDEMDCLVAGANFLLKSIRHEAFTHMDGQKEYVQIDQNDLFPFLLVN VGSGVSIIKVDGHGKFQRVSGTNVGGGTYWGLGRLMTKCKSFDELLELSQRGDNSTID MLVGDIYGGLDYSKIGLSASTIASSFGKTISDDKELSDYRPEDISLSLLRMISYNIGQ ISYLNALRYGLKRIFFGGFFIRGHAYTMDTISFAVNFWSKGEAKAMFLRHEGFLGALG AFMSYEKHGLDDLRIHHLVERFPMGAPYVGGKIHGPPLGDLNEKISWMEKFVQKGTQI TAPVPVGFPVTTGMGGFERPTAKGDILRSDASAALNVGVLHLVPTLDVFPLLEDPKMY EPNTIDLDLNEYKYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFAHAFSAHLARL MEEPAAYGKFGLANLLELREECLREFQFVDAYVSIKQRENEASLAVLPDLLMELDSMN EEARLLALIEGVLAANIFDWGSRACVDLYHKGTIIEIYRMSRKKMQRPWRIDDFDMFK KRMLADKKGQPYKRALLFVDNSGADVVLGMIPLARELLRNGTEVVLVANSLPALNDVT ANELPGIVAEAAKHCGILRKAAEAGGLIFDAMAGIQDDLKDEPVSVPLMVVENGCGSP CIDFRQVSSELAAAAKDADLLILEGMGRSLHTNLNARFKCDTLKLAMVKNQRLAEKLF NGNIYDCICKFEPVP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..40#538..593#1183..1299#1467..1586#1676..1770#1858..1951#2172..2303#2956..3068#3189..3379#3714..3927#4546..4587#4668..4716#5209..5291#5452..5568#5659..5722#5823..5968#6099..6252#6809..6892#6973..7167#7273..7344#8228..8317#tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggtatgcaaccatttctttgtattgttaaaaatcgaaatcatttatgttttggggtttggattgtccacaaattttgtgtactaatgttattttaatactgcaaattgctttggtggtcatagattgatgtttaccacattatgaacagggatttgagaatatgtagatagttgctagagttactaatttacttttatcacatgcatttatattagcaatttcaagttggccattatcttctgtgtttggctgaattgtgccctgaatatctttattatgatggcatacttgagtttgttcatttcatgttttttcacattcttcattgtcctgtccattctggaagtttaccagctgtctaatttgctagagtttggctgaatttgatacttaaactgtgatcatcacatttttgtccacatggtttcctaaggttttgttagtctaggccgttggcctgcactttcttagcattgagtagaacttttttgctgcaggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggtgacaaataatgagacagcaccctttaggtttatgaaagtttgtttggtcaatgtttcgattaatgtttgttattgttcattagcacttgaatatttggatagcaatccattattctcaatctaccttgtgttgttggtgtagatgatttcaacctatggttttggtgaataacaatcataacgctgtagaacaacttgtagtaaaccatgacaagaataccttccttcccatttccccaagattagctcttgtatagcacttgaatatttggctagcaatccattattctcaatcctaccttgtaggtgttgttgtagatggtttccacctatgattttggtgaataacagtcattacactatagaccaacctgtagtaaacagacaagaatgtcttccttcccatttcccaagattaactcttgtgtcataatgactgtatctcatagaagcaaagtctttttcccccacttatcaggaacagactgcgtactgatgttttcatgtacaaaatactgactgagttatcattatcttgatggcattaaagttatatattttagttgactatgatattttgtggaaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaaggtttctatctctgagttaccctaccctatttaggttgagactattcagttttatattctatatgatctatgtaatggactaaggcagtaagtcatatttcaaatttatctgaagattgttcacattcaaaaaattaaattacattagtaagacttatgtgttttcagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggtaccttgcagtttttttttttaaatatcttttttggattggacttctttttttggtttgctggattttgttggtcgtcgtttttgaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagaggtatttcttcttctgctcatggacatcatacatttctgttgagatctgagaagtttgagaactcctaaaagtatgattttctttcagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaaggtaatagcaccgatgatggaaaccgtcttgttaacatttcatgttccataaagttatcacacaatgtagacctatgtttgaaactataaattgttaaaatctgctagtcagacttggtacttgcacaactcacgatgtgtcagaaacttcagaatagaggtccttcaagtgcccaattcttctttcttactaattgctgcgtgcttcttctttatggcagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcaggtatgacaaataatgataactatttgatacaagtggcccaatcttcatcagaatttttccatagagatgcacatttaccatttcttttataaatttggaagtttgaaaaagtggtccaaatattgtagcggtgagtctaattccacacaaacaacagtaatcttatctgaaaaagaaaatcaatagaagaacataatttttttacttgtattttgttatgttgtgttctttaatggaaaaaaaaggtggtataggtgtcagtagggttggaaaaaatgagtctgggtagtaatactgccaaagatgatattagatgacaattctaaacaatgggttttggtgttaagggtctattatcacttcctatggctcaaggtagtgatttaggataatgtgtgttgttacctattgtaggatgtaggctaatagcataatgtgctcaaagctggtgttaatttgtcttccatgttccgggttgagtttatggtgtactgatttttcaaaaatatatttagccaaaggatttacaggcccattgaattttatcagtggctgtatcaattgtgatgttaattctctcgtttattttactgctttttccaacttttttgcctctttccattgaagctaattcaattgttttggtttgtagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtaaaacttccatataggttcttgtttttatgttgctcgacagtagcttagcttattttgaaaacagtttcctccacaagttctgttcaagaaaccaacgtatgctatatatttgtaaaggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaaggcaagtacatctactcttgatcatggtaaccttaatggttttgttggtcattggggttttagttgttttagaacaaatttattgcttgaaagaagtccacattgaaatggaaaccacactcatccaactaaaatgaacacatgaactgaaacgcacactcttggacttctttttcccccctataaacagctgctgggatgagttgaaatcttttccacctgttgttactcttggctcgtggttaacattctctggctccctgttattctgtttgatctattcatcatgtatggctgctagattaataatcatgtggaactgtacttcttcccagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtaagccacagtcatccagttctctataacaattattgcaattttgaaatataagggtacctgcagtaaattcattatggaagctggaggcacacttttggtactgtaaaaggtccaaaaggttgggtgaataatgggtaatttgcctcaaaaagctaaagaaagcatcaaagtcatcacttctcaaaacatttttaggcagaagtaattgagatactttagcatattatctaaatatttgaaattgcagtctccattttttttaatataaagagctgcactgcaccccagccaaacagaggtcttgatttgaacttaagaatcatcttgtgttagctcagggttaagaaatatgagctctttcaccgaatcacctaagcagctcttactgtatttaccaattaaaacaatagtagtctatctatagttctataccttttttctgacattgtggatcaacttatttaaagcatttttatcctacatatacatgccaaaattgcttgaggacaagtggttttattgtgcataagcttgctgatggtctgatggaacaattgccatgtgcagctcaattttagatcatgcgtaagttgtaatatattatctgtattgcaggtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtattatttctgcttcccctatttctagatatcttgtaggaattgaatcatttgatgatatctgagatgtacaatgccaggtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggtatggtgtacttcttgcaataaccttgtataacttacgagataagacaccagagttttctttgacaatatggcttagtgataattatttttttcatgctcccctccctccatatgagtgtgcatgtgtgctgctacctatctcatcctgttcctaaaacaatgtcccattgggtcctcataagttatagctaaatacaagccccaataacatgccaccagtttgcagtattttttttattgcttttgttggtttacacctaagaatgattatactcactcaaatgttcccacaaactcaacatttcttattaagaaaatttggcattataactagtaacaggtcaatcaatattatacgttataatttatttgttagcaatttatgaatacacaagtaactgtttatgttggaatctccacctcaattcctcttgtgaatgtgtgaaaaatgttcttttttgtactaatgtgcgcatgttattgttggtaggcggttgctagtgaaggtgggactgatgatgccaaaaggaggggtgacgcattcgcacatgctttttctgctcatttggcaaggtacgcagttgccattacatgacattagttagtacggagtatatttcagttttcttcattcaaaatcgagcattgataatctgttagtctgtaaagattgatattgtaaaactcattacactatgtcacttagcttcctaactcttttggttaagtttaggttgatggaggagcctgctgcttatgggaagtttggtttagccaacctgttggagctgagagaagaatgcctgagagaattccagtttgtcgatgcatatgttagcattaagcaaaggttagttcctgtctttctcgctctttatgtgtgtacgttcatgtgttcatgtgcttttatctaatcttacggttttaattgtgtgtgaagggaaaatgaagcttcactggctgttttacctgatcttctgatggaacttgatagtatgaatgaggtaggagatagcagggcttgtcattcaggcgtcattctgcttagctcagcacccaacagaattgatctgaatatttgttgttgtgcaactatgttttcaggaagctagattgcttgcactaatcgagggtgtccttgctgcaaacatatttgattggggctctcgagcttgtgtggacctttatcacaagggaactataatagaaatttatcgcatgagccgcaagaagatgcaacgtccttggcgggcaagtattccaattctgaccttttaaatgttatatttgtactgcaagatttacccaaagtttcaaattacttgcaaacttcttttttataattgctttgctgtgtttatatttttgtctcttatttcagattgatgactttgatatgtttaaaaagagaatgcttgctgataagaagggccaaccatacaaaagagcactgctttttgttgataactcgggtgctgatgtggtccttggaatgattcctttagcacgggaattattacgcaatggaactgaggtataagttaagaaaaacaataagctaaagacaagtcgcccttttgttatctttatgcacatttgtgttcaaattataggtaacagacatgatgctgtttcaagagatttaatcatggaaacaggaaagtttggatattaacaatgtatttaattaacattcctgtgttcctgcacatcaaagtacagtgaatgatagattgggagattgtcctttataacctagaattgagatgacttataaattttaccggccctgtgaaatattccttccgtttataaacatgtcgttttagacattgacatggtttccaagatgcaaagttgaccactaatttctattttagtatatttgtataacccaataaaattgtaatattatgaaagtggttttcgagacaaatgtacatatcattttcacgcatccaactattaaatgtaaaaaaaaaatcacacacctttattatagtccattttaatattatttgagtttaattgtatcagatctgatatccatacagttgacttgagctggtaacaaaatgttgattttgtaggtggttttggttgcaaattcattgcctgctttgaatgatgttaccgctaatgagcttccaggaattgtggctgaagctgcgaaggtacaaatgaatataaattctattttcttgtccatcctattgttatcttaagttctgttgttgcttgtaatgtactacagcattgtggtatacttcggaaagctgcagaggcaggtggattgatctttgatgccatggctggcatccaagatgatctgaaagatgaaccagtatcagttccccttatggttgttgagaatggatgtggcagtccgtgtattgatttccggcaggttagctcagaacttgctgctgcagcgaaagatgcagatttggtaagatagactgtagctctttgaactgaatgcattttctcatgtaaaataaattggaaagttatgtggtttgatatatcggttgttgttttaaatgttgtgcagttaatcttagagggcatggggcgatctctgcataccaacctcaatgcccgttttaagtgcgatactctgaaggtacttgtttctgcaaacagctgatttattgatgcgcacaattacaaacttgtcattcccttggctaaataccagtacaaagtaactctgctgtaattattgtactgaatatcttggaaaaaaatgttgaatcaacagtgtgaccagtatcggatctagaattattttagagcccgggcaaacttcactatagctagtatttattaccgaaattatatctcaatttttcctaattacatggaattttagtggattatccgctgacgagcctgggcagctgcctggggtcgccaggtggtacatccaccactgagtgtgaccatggtagggatgtacttacgatagagacaattctcaaatgcaaccatcagaggaaaaatacaataaccttgaatgaaatatgcaccatttggtcaacagccactgcgttgctgaatgctgacactttgctagcgaccactgcactgccagagccctgcttgcacgcctcagtcctcaatcgacctcccagcatgccagcaccaatctctgcccagatttgggtagagagtggtggtggtggagcaacaccaatggtgtgggagtggaggtataagagtaagaaagtccggaagtggacaatatgggggaaggggagtgcttagtaggaggaaaaggaaaaatattttaaaacagaacttttaaggtctaacagcgtagttgctttttgaagtaatggttctggcatctatgggttgaacccaactggaaatttattgccttacttgtcagtatgttcgggattgataagaaggctacattaaatctttgaataattgaattgtggtgtcatacttaaatcttgtgtgtttttacaaggttaacaaaatgactttatttgcagctggcgatggtcaagaatcagagattggcagaaaaacttttcaatggaaatatatatgactgcatctgtaaatttgaacctgttccttgaacaatgcggaagaatgtgccgtggatttggtttgctctagcacagaagcagctaataacaggtactgtgacactgtcagcacatcactttatcttatatggcactaaaattgtttgctgaaatgacgacttcgatttgtgcagaacctagataataatttgttcttaccagttttatcattttactgtaatttgcaggtacatctcacttaatctgtaaccagtggggtcatggtattagcagtgtcacatatccaagcaaaaagccataagaacaaatttcttatataagaactaaaagatcctctcaatgtactaaatgctcctttagatggtaaagaatcaaagaagtgttgttgacttgttgtgaatattgttatcaaaacaatttttctgaacatggagtagcgacataataaaggtttttaaagaatttgtagaaagc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0533100, RefSeq:Os09g0533100