Os05g0203800

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0203800

Description

Similar to MADS box protein

Version

NM_001061424.1 GI:115462578 GeneID:4338067

Length

11215 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0203800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:6428944..6440158

Sequence Coding Region

6429209..6429212,6429716..6429777,6429962..6430003,6430105..6430146,6430246..6430345
,6430440..6430501,6431041..6431122,6439191..6439450,6440008..6440055

Expression

GEO Profiles:Os05g0203800

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MHIYKEQEAEPSTGLMMPEPAPVASPGSGGSGGSGSVGAEKIGS RGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRSGLLKKAYELSVLCDAEVALVVFSSRGRLYEYSNN SVKETIERYKKANSDTSNASTVAEINAQHYQQEAAKLKQQITNLQNSNRTLVGDNITT MNHRELKQLEGRLDKGLGKIRARKNELLCAEIEYMQRRETELQNDNMYLKSKVAESER GLQTVNMMGSASTSE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10947..10950#10382..10443#10156..10197#10013..10054#9814..9913#9658..9719#9037..9118#709..968#104..151#actccatctcatctcatccttccccaaccattctcttctccttgaacacacccctctcttcctcattataatctcttctttgattagagaggaattagcaaacatgcacatatacaaagagcaggaggctgaaccatccactggcctgatggtaattgtttttcttggcttggaaactcctaaatttcctcttctctttcagtgtcattttgcaagagggtttggatttcttttttaattgtatgcatatgggagctttgggaaagtagaaaagtagaatcatggctgctagctgatgtgtgagaatagctagatggccatgaagagggagagatatagctagagatctttagtctttaagcaaaacaagaaaaagaagaaaaaaaggtgaaagaaaggcacaagatcaaggagattgatcaccacaggaccaaagatctctccttttttttcccctcaaaaaaagatctctcctttttccttcgatctacaagaattatacaactcacaaaagggggctgtagttacatatattgatttttaagagagatgatggccatgatgtctccagcacttcttgattttcttgccaaagatccatcttccggtcttgcaatttcttgattatgttggctcatgctgtgctgctaagttcttacatagaggactgagtcatatctctggaattattttgtgactcaaatttagatgccagagccagcacctgttgcttcccccggctccggtggctcaggtggctcaggctcggtgggagctgagaagattgggagcaggggaaagattgagatcaagcgcatcgagaacacgacgaaccgtcaagtgaccttctgcaagcgccgcagcgggctactcaagaaggcgtatgagctctccgtgctctgcgatgccgaggtcgccctcgtcgtcttctccagccgtggccgcctctacgagtactccaacaacaggtactgcattcctcttcctctcttcagctctagaaacctaaattaatccatgtgatatatgttatcttgtcctaattggagcaagttagttgctaccttttcttgtgacaaggaggaggcatatatatggtgatgtgcgtccatctcaccttcttttctgttactacatatatgtgcttcagttaattaactgtcttgttgttacttctgtgctttcttgggggtagtagcaactagcaagtgagaaagaaattgcaggagtttctttgtgtgtgtgtgatgatctgtgtgcttgctgatgtggtgtgcacatttctggtttcttttgtgtttcctgtgaggtgagctagatgtgtagatagattcagcacaatgcatactttgtgaagcaagcatgagcatgtacatgcattcttgtgagcttttcttgtgtgtgatgggtgtctgtgactgtgtgtctgtgtgtgttgctttggcttggtggtcctgttcttttattgctccatttatgttctttcctttctctacctctgtctgtgtgatgaggcttgcttagatccttaatacctcactgcatatagcgatcatatattatattttctctattggctatgcatgtgtgcagtaacttgtaactactagtaactagtatgcaagattgtgggcatgtgaggtttgatgttttttttttcagaggtaaaaagtggtgtacacgagtgatgcacacattgatcattcatgattcttttgcatcatcttcttcaattggaggttagttagggttagggtttcatcacatcctccatctctctctctctctctctgcagagtgctgtagatgttactgttttcactagtcatttctctgttcatttacagccatgtgtggtttcctgtattaacaggatgccccatcacgagtgctctgggcccctagctacctatcctctctgacaccggcactgtacttctcatgaggtaccgaacacagtgaagtcagcagtaaataggaaaaacagtgcatgaattacccttttttttctccatctataaggtttggactttcatatgtatttttgttactacctaaggtttacagattagtaatttgtgcaatatttttagtagagaatcttaaggatttgttgtgcttctttttccttgtgcgattacagaagaaatacacgcacacatgacaccacacacgcagaccacactcacacaagtgtgtgcttagttatgcctatagttgttcagccaagaaaggataaagagtaatttatactatataatcaggatgtatgccatgataatacccttatgttctaaatcctaatcccatgtgaaaaaaaattatgaaatgtgtgatcccctgtgagtctgtgactacacatgaatgaactactagtagtagagatgagtaactagtactagtagcaaaaagatctagaaaaaaactctaaactagatcatgtatgatttgtccttcatttttaaaattacgttttaataacccgtcttggttaagaaaaaatatctttacttaaacaattaaacttcatactccaaatgttaataccctgcacaacactatctagcttagactctagtatcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagtaaatttgttatatatatactcctgtattatcttgttggattacgacggactggtcaatacgtacgatagagatattttttgtgcatttcttaaaagtgatttataggactcccattaatttaacagtgaattttccttgttttgatctattgagtaataaaaaaattggtttaacaattgacgacttgtttggacaagaagcaaattctttgcacagcagcagcagacaaacacactctctcagtacgtgtgcgtgaggctgcaagtgtaaaactgtacactgtactgtgcagaagcaaaaattaaccaatggcacggtcagtagaatacgtacaaatggcagcgtttgcatcgggagactacaaagagaaaaaggctggtttacccggtcagaatggttaaggtccctgtctgcctggctggctggctaggttggaccgtagctgcttctctctcttgcattggctctctctttctctctctataagccattggtcacttgggtactcatatgattcactgtttgcagccagccaatcatgatcatgctggctatgtttagatccaaactttagatttaaatttctaactttttccatcatatcgacctgtcatacacacataacttttcagtcacatcgtaccaattttaatccaaactttcaactttggaaggaactaaacacagccgctgttgtcaataggatgctcgaagatattaaggttttgtaattcgttggtaaacattactacaagacaatgctaataaaatattcatttaggaagaattttagagaagtgttgctacttgttcacacatgctccatgttaatttgttccaatgagcttgcatctttgtatttttctttaaaaaataaattgttaagaaaatcattgttggtcaaatttgcttggaccatgatttcttcacatgttttttcttgtttaaaaatgtatccaataataccgttcctatgtgtgtgagagatagacagaagctgacttgcattgcttttatattggctcttgggaatagttacttggcactattatacgtatgtgacgtgacatttgctctgatcttgcctttgagaattcatgtttggtcttgacgaggaaagggaaatgatatgatagttttcttggttagatttttgtatggcactttattgcttatgggcatgcctgagattgacaaagtgacaaagtgttggagtacgaaatgtggccaaatgatcttgtctgtcaattttcagcaggagtacgtctttctataggaactttgtgatatcctctttggtttgtactctgtagtagtctcgatcagataggggtgtaaatgattaacccgtgacctcactcataagtaaatatataaaataagttacttatatgtcaaaataagctgtttattttattgacttataagtaggtttgtggttagccactaagtacacccttaatctaggacaatatcaaaggaaaattagttacacatattttgtactatttcaattagatgatgaacgtatatatactttgcgtatagtagtagtttttcttgtatcaagagaggaaaggacgttactctgagtcctttcttgaaacgtgtacaagatctatgatcaaggcatatatgcatagtttttatgttgttagtagaaaaaaatggctaagtaattttgcaaaattttttttggctaaaataatgaagacaactagaaaggtagcccgcgcacatgcgcgggcatcttctcgtataatgtgaatgaaattttattatgaatatttatatgcaggtggctttttattaaaatttcttgtattatattctaaactaaaattaaacttattttgtgtgctttgaaagctttttctatttttataattacccttgcaacatataaattctaaaataaaattacttgagatcatgtggttttgaattgatgagaaactattgtgtcgaaacaatggaggtggttcctatgataaaatttagggtattttaaatcgccaaaaggatagcttacaacctcaaaacaaattcaataatatcattttttttgtttgattgtattttaatatatatatatatatatatatatatatatatattcattctaaccgtccttgtaaaatgtttgaatttttctatcaagtattggttttaaatccaacaaaatttgttcaattttcaatttatttcatgcccatttttattttttttcttttggatagttttattctatgaatca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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0203800, RefSeq:Os05g0203800