Os05g0230600
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0230600 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF1620 domain containing protein |
| Version |
NM_001061510.1 GI:115462750 GeneID:4338159 |
| Length |
9279 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0230600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:7938172..7947450 |
| Sequence Coding Region |
7938269..7938384,7940435..7940562,7940666..7940728,7941746..7941867,7941980..7942095 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:7938172..7947450 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:7938172..7947450 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgccgccgcgccatctcctcctcctcctcctcctcggcttcctcgccgccgcctccctcgcgttcacgctcaccgccgccgtgtacgaggaccaggtcggcctcgcggactggcatcagaagtacatcggcaaagtaaagcaggcagtctaccacagtcagaaaagtggaaggagacgtgttgtggtgttgacagaggaaaatgttattgcttctcttgatcttcgttcaggagatatattttggaggcacgtcattgagaagaatgatcctgtggatgagcttagtttatcacttggaaaatatgttgtaactctttcttcgggaggtagtatattgagggcatggaatcttcctgatggccagatgatctgggaaactaatcttcaagtttccaaatcatcaaaacctcttctgcatgttttgtcaaacaacaaagtagcaaaggataatctggtttttgtgttggctggacgatggatttatgccgtatcaagcattgatggggtaatttcttggggaaaggagttctcccttgatggcctagatctcaagcagattattcaatcacctgagaatgatattgtatatgctgtaggacttgctggttcctcgaagctaaacttgtatcagttgaatgctaaaactggagaaacagtaaagcatatacaagagtcattccctattgcattatgtggtgaaacaatacttggttctcataatgtgttggtagctttagatgagaccaggtcagatctatttcttattgagctcaagggtgagagcatcagctacaacaaggtccatatttcagatcttgttcaagacttatctggaacagtcaaacttctacctttaatgtccaatggtgtcatagctttgcaagcatcttctactgtttcccttctgaaacttaaaggaatcgatgggttggaagtaattcagagctttgaacaaccagctgctgtgagtgatgcgttgacaatcacagaaaaagacgaagcttttgccgttgtgcagcatacaggttctgaaatcgaatttgtcgtcaaatttacaagtgatgtcaccggtgaagttattagagaaaaaattaatatagatcaacataggggcaatattcaaaaggtcttcttgaataactatatccgaacagataaatcacatggttttcgagctttggttgtaatggaagatcattcactcttgttggtccaacaaggggaggttgtttggagcagagaggatggacttgcatcaattgttgatgtaacaacttctgaattgcctattgagaaggatggtgtctcagttgctaatgtggaacataatctctttgaatggctgaagggacacatgctgaaactcaagggaactctaatgcttgccaatgctgatgaacttgctgcaattcaagcaatgagactgaaaagctctgagaaaaataagatgacaagagaccataatggatttaggaaacttcttattgtattgacaaaggctggaaaagtgatagccctgcacactggagatggacgtattatctggtcaaacttgttgcagtcccttcgttcctccaagtctggtgaaatgccttctgccttaagaatatgtcaatggcaggttccccatcatcgtgtgatgcatgagaacccatccatacttatcattggtagatctggagcagatagtgctgctcctggtgtcctatctgttcttgattcatattctggagaagaacttaactctctgaagttagaccactctgttgtccaaattatcccattgacagtgaaggattcatctgaacatcggcttcaacttattgttgattctcactcccgtgctcatctctatccaagatctccagatgccatgaatgtatttcttcatgaaatgccaaatacatatctctacactgtagatattgagacaaatgttatcagggggcattcattacaaaagtcatgtgacaattcagctgatgagtactgctttagcacaaaggagttgtggtctattgtttttccttctgatacagaaagaattgctatctccgaaacacgaaagatgaatgaggttgtccatgcacaagcaaagatcatagctgatcaagatgtgatgtacaagtacttatcaaagaatttggtttttgttgctactgtgtctcctaaagcttctggtgaaatcggatctgcggcacctgaagaagcttggcttgtggcttatcttattgatgctgtaaccggacgtatattgcaccgtgtgactcatcatggagctcaaggccctgtacatgcagttgtaagtgagaattgggttgtatatcattatttcaatctccgagcccacagatttgaaatggcagtgattgagatatatgatcaatctagagcggacaataaagatgttatgaagctgatacttgggaagcataatctgtcagcaccaaccacttcttatactcgtccagaagtaatggtgaaatctcagtcatacttctttaccttttctgtcaaagcaattgcagctacacaaacagctaaggggataacttccaagcagcttcttattggcacgatcggtgaccaggttctggcacttgacaaacgttttgttgacccacgtcgttcagtaaatcccacccaacaagagaaagaagagggcattataccactaacagatgctttgcctattattccaacgtcctatttgacacactctcttcaagtggaagctctgcgaggaattgtttctattccttcaaagttggagtcaactactcttgttttcacatatggtgtagatcttttctatactcagcttgctccctcaagaacctatgactcactaactgatgagttcagctacgcgcttctactcatcacaattgctgcattggttgctgccattgttgttacttggatttggtctgagaaaaaggagttaagagataagtggaggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPPRHLLLLLLLGFLAAASLAFTLTAAVYEDQVGLADWHQKYI GKVKQAVYHSQKSGRRRVVVLTEENVIASLDLRSGDIFWRHVIEKNDPVDELSLSLGK YVVTLSSGGSILRAWNLPDGQMIWETNLQVSKSSKPLLHVLSNNKVAKDNLVFVLAGR WIYAVSSIDGVISWGKEFSLDGLDLKQIIQSPENDIVYAVGLAGSSKLNLYQLNAKTG ETVKHIQESFPIALCGETILGSHNVLVALDETRSDLFLIELKGESISYNKVHISDLVQ DLSGTVKLLPLMSNGVIALQASSTVSLLKLKGIDGLEVIQSFEQPAAVSDALTITEKD EAFAVVQHTGSEIEFVVKFTSDVTGEVIREKINIDQHRGNIQKVFLNNYIRTDKSHGF RALVVMEDHSLLLVQQGEVVWSREDGLASIVDVTTSELPIEKDGVSVANVEHNLFEWL KGHMLKLKGTLMLANADELAAIQAMRLKSSEKNKMTRDHNGFRKLLIVLTKAGKVIAL HTGDGRIIWSNLLQSLRSSKSGEMPSALRICQWQVPHHRVMHENPSILIIGRSGADSA APGVLSVLDSYSGEELNSLKLDHSVVQIIPLTVKDSSEHRLQLIVDSHSRAHLYPRSP DAMNVFLHEMPNTYLYTVDIETNVIRGHSLQKSCDNSADEYCFSTKELWSIVFPSDTE RIAISETRKMNEVVHAQAKIIADQDVMYKYLSKNLVFVATVSPKASGEIGSAAPEEAW LVAYLIDAVTGRILHRVTHHGAQGPVHAVVSENWVVYHYFNLRAHRFEMAVIEIYDQS RADNKDVMKLILGKHNLSAPTTSYTRPEVMVKSQSYFFTFSVKAIAATQTAKGITSKQ LLIGTIGDQVLALDKRFVDPRRSVNPTQQEKEEGIIPLTDALPIIPTSYLTHSLQVEA LRGIVSIPSKLESTTLVFTYGVDLFYTQLAPSRTYDSLTDEFSYALLLITIAALVAAI VVTWIWSEKKELRDKWR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>98..213#2264..2391#2495..2557#3575..3696#3809..3924#4012..4819#5052..5780#5890..6111#6341..6436#6525..6719#7555..7668#8647..8907#actccacaccccaacacatcacgacttgtcgaaccccgccgccgctgccagatcggaggcgagagctccgatcccaaaacccccccgcccctcggcgatggcgccgccgcgccatctcctcctcctcctcctcctcggcttcctcgccgccgcctccctcgcgttcacgctcaccgccgccgtgtacgaggaccaggtcggcctcgcggactggtgcgttctctctcgcgctctccccactccgatatctgtgcgtcgtctggatccgatccgcgcctcctgtgcctggatctggttcgcccgggcgacgggatgtggcgggctcctcgaattcgatttgttgtctcgcggagttttgagtgtgtagtgtagggctgtaggggtagggtgggattcatctgtgttagtagtggtgttcactggttggtagcatatgcgctattattttgtactatggaagatgggagttctttagcttccaagtgagtagcagttttagtacggctgcatctagttcgaacgttttatcttcctttttttccgccttgaggattatgtgcaggggcaagatgagcgtgttgcaatggcaaaaggcaggccgatttggccttaagtttgttgacttatgctttctgcagattagatcagatcagaatactttctatgttgaattttaactggagaactgcgtagtgcaaattgctctgaggctttgttgttggttacgtgcctcttgtttaattatgactttggtctgaaggatgtatattttggtgtttcaatgtatttgtctgatgtccatgattcgccttgatatttaggactttgttttgtgtgtgtggattaactttgctaaaaaaaaattgcactgtttccagttgtagcttctcactgatctgtgttgttgtgcgatcatggttttccttgtatatatgtgtttcgtatattgatgatcaatgggtacacaatttaagacttgatcgtcatggtgactcagttgctggccttgcacattttgcttcagtgcgctcaattatcctgagcaaggtcacaatgaaccatgtttgattggttcgaggggcagggctgatgtagatggtacactgcctgttaaaatctatggtactatagggtatacctcttctagacaatggtttgggacgtgggacttgagcctaaccatgattgttgcagcatcgacatgggcattgtgtaggaggtgccatggcgtccaggtggcggagggaggatgccacggaggctcacttcgcattcaacatctggtaggggctgcacgagggagaaaaagtggtgcctctgttggatgaggaggtggaagaaggggagatggaagtggagaagaggggggagggcactggggtcctgttgaggccttgagggagtggcggcagcttgaagagtttcagtggctatgcgtaatgcgtaggggaaaggagatggtagggttgcagcctgaagtgctacactgataactggccaatccagcccatcttgccaacataaatagataggaaactagggttcctgagttcagtccaacgctgcctcttccatgtgctgtcactcaagcttgatcctatccatgtaacatcagcggcggcatccccccctgtgcgcgtcctctggctccaagctgcgtctccaatatcctctctatgaactttattccgtccaagtgcttgtgtatcaatcttctgtttcctgctctgcactctacctcgcctttgcttgccatggcatccaggtgccccactggcaccatggttgccttacttgccgtgacaaccttgaacctgacaaatccaggttgatgacctaggtcgataactcaatgtattgggtttatggttactacaatttgctgctctctagattgctggcatttcacactaatgaattgaggaatcgttcttagtgatgctgctatatactactccgtactttacaaaaacctaaggtggtaatttgccccccttctgtgcatattgtacatgttaacttttgatggtcatgccttctattaaaagggagtttatcactgatgtatttttttcaatcttatccactgttgtggcatgttatttctgtttctaaaattttctcagtagtattgctattttgatttactattgtgtgctgcttgtccggtgcacttttaggcacatggagatttcactaacagtatgtaattttggagatttacaatctattgactgttgtaagatgctgatattctttgtaggcatcagaagtacatcggcaaagtaaagcaggcagtctaccacagtcagaaaagtggaaggagacgtgttgtggtgttgacagaggaaaatgttattgcttctcttgatcttcgttcaggagatatatgtgagttttttttcctcttaaggaagatgcagttcttctaaatattttttgtagatgtatttctgtcctttcccttatatatgcgttgatttttacaatgcagtttggaggcacgtcattgagaagaatgatcctgtggatgagcttagtttatcacttggaaaatgtgagtctaactttctgtttccatttggagggatgtttttaataagaacaatgatgttggtggtgtttgtgtttcttatatgtttttaatccattcttgatacgatttcatatttgctttacattacagttgttaggcctatttatccaaagcttggtttagttttcccaaaaatgtatttttgtactgatacctatatgtccactggtaatggtggctagcttttactttagtaataaatttactggtttacatggttttatggaatgttgttttgaccaacattggatagttgcactactggaccatgtttattcaaaacccagcacacataggattgcacacaatatgactcatgaatccattgtatatcagtcatggactaaaggaggagcagcattatatgcatatttcagagttcaaggtccatattttcattctatctgtgagaacatgctagtggacaatatttatttcttatcttgtctaagtttttaaaagagggagttggagatgatggtaggttctacgcccaacactatatattttgctacggcaaatatgtactgtacacatgtgcatattattgcaagatccttagtgaaaaaatatttgcatctttgcatagtaggagcatatgtaggcaatcaattggtctcatatgagaccattttatatgtttatatttgagaataattcttaattattgcatttaataatttagaattataacatatttagctgggaatgggatccatcgcaatgcacagatatgcttgtattatacaagtactttacacatttttctcctaagaaaagaatattgtgatactttattacttacaactgagcaatgagcgcaagaaaactggatgctgtcaaaccatgtttctaaacttagaaagtgacaccttcacatctgtttgtccccaaacccatgtatgcatttactgcatccttttatcttctttaccattctaagaaaacaaaatctgattttgaacttgtctttttcagatgttgtaactctttcttcgggaggtagtatattgagggcatggaatcttcctgatggccagatgatctgggaaactaatcttcaagtttccaaatcatcaaaacctcttctgcatgttttggtctgtatggactgtattttccaccatctaataattatcacatgtggataatacaataaatatgtctatatataaatcctttccttgagtgatcagttcttgttgtttgcagtcaaacaacaaagtagcaaaggataatctggtttttgtgttggctggacgatggatttatgccgtatcaagcattgatggggtaatttcttggggaaaggagttctcccttgatgggtatgctctatgcataatttctccccattttttacttgtttacaacatcagaatacagtgctaacttgttctccgatgtctatgcagcctagatctcaagcagattattcaatcacctgagaatgatattgtatatgctgtaggacttgctggttcctcgaagctaaacttgtatcagttgaatgctaaaactggagaaacagtaaagcatatacaagagtcattccctattgcattatgtggtgaaacaatacttggttctcataatgtgttggtagctttagatgagaccaggtcagatctatttcttattgagctcaagggtgagagcatcagctacaacaaggtccatatttcagatcttgttcaagacttatctggaacagtcaaacttctacctttaatgtccaatggtgtcatagctttgcaagcatcttctactgtttcccttctgaaacttaaaggaatcgatgggttggaagtaattcagagctttgaacaaccagctgctgtgagtgatgcgttgacaatcacagaaaaagacgaagcttttgccgttgtgcagcatacaggttctgaaatcgaatttgtcgtcaaatttacaagtgatgtcaccggtgaagttattagagaaaaaattaatatagatcaacataggggcaatattcaaaaggtcttcttgaataactatatccgaacagataaatcacatggttttcgagctttggttgtaatggaagatcattcactcttgttggtccaacaaggggaggttgtttggagcagagaggatggacttgcatcaattgttgatgtaacaacttctgaattgcctattgagaaggatggtgtctcagttgctaatgtggaacataatctctttgaatggctgaaggtaatcctgaataaataatctgttttaaactagcttaa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|
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