Os05g0235300

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Structured Information

Gene Name	Os05g0235300
Description	Armadillo-like helical domain containing protein
Version	NM_001061523.1 GI:115462776 GeneID:4338174
Length	13983 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os05g0235300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 5
Location	Chromosome 5:8288042..8302024
Sequence Coding Region	8288043..8288102,8288211..8288263,8288459..8288582,8289091..8289273,8290103..8290255 ,8290560..8290712,8290797..8290868,8290954..8291088,8291163..8291224 ,8291423..8291520,8292052..8292161,8292256..8292429,8292516..8292581 ,8293271..8293339,8293413..8293523,8293842..8293982,8294062..8294190 ,8294288..8294453,8294598..8294812,8296307..8296513,8297321..8297434 ,8297514..8297705,8297913..8297993,8298078..8298152,8298236..8298302 ,8298716..8298876,8299367..8299540,8299633..8299761,8299845..8299928 ,8300013..8300074,8300152..8300224,8300432..8300566,8301214..8301384 ,8301478..8301743,8301864..8301882
Expression	GEO Profiles:Os05g0235300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008398:8288042..8302024 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008398:8288042..8302024 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ctagttgatatcagacgccgtgccattgtcactttgactaaactcatacctacggtgcaggttggtactcatgtttcggttttggtgcatcatctaaagctagttttggatggaaacaatgatgatctacggaaagatgcagcagaggcgctttgttgtcttgcacatgctcttggagaagattttacaatattcgtgtcatcaatacacaagcttcttgtgaagcaccatatgcggtatagaaaatgggatgagattgaaaatcgattactaaggcgagagccactcatctctgagaacttatcagtacaaaagtacacacaatgcccgcctgaagtcattagtgaccctcttgatgattttggtggtgttccttctgaggaggctgatgaaacacagcggcaaccaagaagtcatcaagtcaatgatgttcgactgagaagtgccggtgaggcttctcaaaggagcactagagaagattgggctgaatggatgaggcacttcagtattgcgcttctcaaagaatcaccatctcctgctttacgcacttgcgcaagactagcacaacttcagccttctgttggtcgtgagttgtttgctgcgggctttgcaagttgctgggcccaaatgaatgaaacatcccaggagcaacttgtgagaagtctcaagactgcattctcatctcagaacatacctccagaaattcttgccacactgctgaacttggcagagtttatggaacatgatgagaagccgcttccaattgatacaagactgctcggtgcacttgctgaaaagtgtcgagcatttgcaaaagcactgcattataaagaaatggagtttgaagctgtatgttccaagaagatgggtgcaaatcctgttactgttgttgaatctcttattcatattaacaaccaattacaccagcatgaggcagctattgggatattgacttactcacaacaacatttagaagttcaattgaaggagtcctggtacgaaaaattgcaccgttgggatgaggccttgaaggcatacaaagcaaagtcatctcaagcatctgggccattacaaaacttggatgctacattaggtcgaatgaggtgtctagcagccttggcccgttgggaagatttaagtgcattatgcagggagcaatggactggctcagaaccatctgcccgactagaaatggctccgatggctgccaatgctgcttggcatatgggtgagtgggaccacatggctgaatatgtttctcgtctggatgatggggatgaaaacaagctccggatattgggtaacacaacagctagtggtgacggaagcagcaatggtgctttctttagggctgttctttcagttcgttgcaaaaagtatgaagaagctcgtgtatatgttgagagagctcggcggtgtttggctacagaacttgcagcattggtacttgagagttatgagcgtgcttataataatatggtgcgggttcaacagctttctgagctggaagaggtgattgattactgcactcttccaatggaaagtccaatagctgacagccggagggaacttatccgtaatatgtggaatgagcgtattaaaggaacaaaacggaatgttgaggtgtggcaagccttacttgctgttagagagttggttctccctcctaatgaagacagagacacctggataaaatttgccaaactttgctggaagagtggccgcattagtcaggctaaatctaccttagtcaaactcttacagtttgatccagaatcttcccctgaattgacgctgtatcatggacatcctcaagtagtcctggcatacctgaagtaccagtatgctgttggagatgagcttaaacgaagggacgcgttttgcaggctacaggatttgtctgtgcagcttgctaccgcaacaaatagttattctggaacattagcaagccaggttgccacatcaaatgctggagtaccacttattgctcgcgtctatttgacacttgctagctggaagagagcattatcacctgggttagacgatgattctattcaagaaatattggtctcttacaaaaatgccacacttaatgccaaggactggggcaaggcatggcacttatgggccttgttcaacactgaagtcatgtcccgctatactttgcgtggtcgaccagatattgcaggaaaatatgttgttgcagcagtaactgggtatttctactctattgcttgcgcatccacgacaaaaggtgttgatgatagcttacaggatatccttcgtctcttgactctttggtttaatcatggggctacctcagaggttcaaatggcactgcagaaaggcttttcacttgtcaatatagaaatgtggttggttgtccttccccagataattgcaaggatccattcaaataataaaatagtgagagaactgatacagtcattgctggttcgaattggaaaggatcatccacaggcattgatgtatcctctgttggttgcttgcaaatcaataagcatattaagacaacgagcggcgcaagaggtcgtcgataagatccgccaacatagtggaggtcttgttgatcaggcacagcttgtttcaaaggaactgatacgagttgccattctgtggcatgagatgtggcatgaggctcttgaggaagctagcaggatgtattttggtgagcacaatattgagggaatgcttgcagtgcttgaaccattgcatgcaatgctcgagaggggtcctgagacaataaaagaaaatactttcattcaggcttatggtcatgaattactggaagcccacgaatgctgtttaaaatatcgggctacaggagaggatgctgagttaactaaggcatgggatttgtattaccatgttttcagaagaatagacaaacagcttccaagtcttacaactttggatttgcactctgtgtcacccgagcttcttgagtgtcgaaagttggagcttgctgtaccaggaacttattctgcagatgcaccacttgtgacaattgagtattttgttcctcaattgattgttataacatctaaacaaagaccaagaaaactgacaattcatggaagtgatggcaacgattatgcattcttgctgaaaggccatgaagatttacggcaggatgagcgtgtaatgcagctttttggcctggtgaatactctgctggagaactctaggaaaacttcagagaaagatctgtcaatccaaagatatgctgtcatacctttgtctcctaacagtggtttaattggatgggttccaaattgtgacacacttcatgccctgatccgtgaatatagagatgccaggaagattttcttaaatcaggagcaccgatgtatgttgagttttgcacctgattatgaccacttacccctcatcgccaaagtagaagtatttcagcatgccctagaaaacagtgaaggaaatgaccttgcaaaggttctctggcttaaaagccgaacctctgaagtatggcttgagcggcgcacaaattatacgagaagtctggctgttatgagcatggttggctatttgcttggtttaggagatcggcatccaagtaatcttatgttagatcgttatagtggaaaaatattacatattgactttggcgattgctttgaggcttcaatgaatcgtgaaaagtttcccgaaaaggttccatttcgcttgactagaatgcttgtgaaagccatggaagttagtggtattgagggtaccttcagaaccacttgcgaaaatgtgatgcaagtacttcgaacaaacaaggatagcgttatggctatgatggaggcatttgtgcatgacccattaatcaattggcgtctgttcaatttcaatgaagtccctcaagttacaaactatggaaatgctcacagtcacacagttgtcaatagcgaagaagctgctaatcgggagctcatgcaaccaccccggggagctcgggagagagaactgctacaggcggtcaatcaactcggtgatgctaacgaggttttgaatgagcgtgccgtagctgtgatggcacgaatgagtcataagctcacagggcgcgatttctcttccggatcatcgttgtcgggggcgggaagctccacccaacatggtaacgagcatctggcttcaggagacactcgagaggtggaacctggtttatccgtgaaggttcaggttcagaggcttatacttcaagcgacttcgcatgaaaacttgtgccaaaactacgtcgggtggtgcccgttttggtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>LVDIRRRAIVTLTKLIPTVQVGTHVSVLVHHLKLVLDGNNDDLR KDAAEALCCLAHALGEDFTIFVSSIHKLLVKHHMRYRKWDEIENRLLRREPLISENLS VQKYTQCPPEVISDPLDDFGGVPSEEADETQRQPRSHQVNDVRLRSAGEASQRSTRED WAEWMRHFSIALLKESPSPALRTCARLAQLQPSVGRELFAAGFASCWAQMNETSQEQL VRSLKTAFSSQNIPPEILATLLNLAEFMEHDEKPLPIDTRLLGALAEKCRAFAKALHY KEMEFEAVCSKKMGANPVTVVESLIHINNQLHQHEAAIGILTYSQQHLEVQLKESWYE KLHRWDEALKAYKAKSSQASGPLQNLDATLGRMRCLAALARWEDLSALCREQWTGSEP SARLEMAPMAANAAWHMGEWDHMAEYVSRLDDGDENKLRILGNTTASGDGSSNGAFFR AVLSVRCKKYEEARVYVERARRCLATELAALVLESYERAYNNMVRVQQLSELEEVIDY CTLPMESPIADSRRELIRNMWNERIKGTKRNVEVWQALLAVRELVLPPNEDRDTWIKF AKLCWKSGRISQAKSTLVKLLQFDPESSPELTLYHGHPQVVLAYLKYQYAVGDELKRR DAFCRLQDLSVQLATATNSYSGTLASQVATSNAGVPLIARVYLTLASWKRALSPGLDD DSIQEILVSYKNATLNAKDWGKAWHLWALFNTEVMSRYTLRGRPDIAGKYVVAAVTGY FYSIACASTTKGVDDSLQDILRLLTLWFNHGATSEVQMALQKGFSLVNIEMWLVVLPQ IIARIHSNNKIVRELIQSLLVRIGKDHPQALMYPLLVACKSISILRQRAAQEVVDKIR QHSGGLVDQAQLVSKELIRVAILWHEMWHEALEEASRMYFGEHNIEGMLAVLEPLHAM LERGPETIKENTFIQAYGHELLEAHECCLKYRATGEDAELTKAWDLYYHVFRRIDKQL PSLTTLDLHSVSPELLECRKLELAVPGTYSADAPLVTIEYFVPQLIVITSKQRPRKLT IHGSDGNDYAFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLENSRKTSEKDLSIQRYAVIPLS PNSGLIGWVPNCDTLHALIREYRDARKIFLNQEHRCMLSFAPDYDHLPLIAKVEVFQH ALENSEGNDLAKVLWLKSRTSEVWLERRTNYTRSLAVMSMVGYLLGLGDRHPSNLMLD RYSGKILHIDFGDCFEASMNREKFPEKVPFRLTRMLVKAMEVSGIEGTFRTTCENVMQ VLRTNKDSVMAMMEAFVHDPLINWRLFNFNEVPQVTNYGNAHSHTVVNSEEAANRELM QPPRGARERELLQAVNQLGDANEVLNERAVAVMARMSHKLTGRDFSSGSSLSGAGSST QHGNEHLASGDTREVEPGLSVKVQVQRLILQATSHENLCQNYVGWCPFW</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os05g0235300, RefSeq:Os05g0235300