Os05g0256000
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0256000 |
|---|---|
| Description |
Similar to TGF-beta receptor-interacting protein 1 |
| Version |
NM_001061571.1 GI:115462872 GeneID:4338229 |
| Length |
5655 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0256000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:9459861..9465515 |
| Sequence Coding Region |
9459984..9460383,9460985..9461112,9461675..9461794,9461899..9461988,9462631..9462717 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:9459861..9465515 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:9459861..9465515 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaggccgatcctgatgaaggggcacgagcggccgctgacgttcctccggtacaaccgcgacggggacctcctcttctcgtgcgccaaggaccacacccccaacgtctggttcgccgacaacggcgaccgcctcggcacctacagcggccacaacggcgccgtctggtcctgcgacgtctcccgcgactccacccgcctcatcaccggcagcgccgaccagaccgccaagctctgggacgtccagaccggggcggagctcttcaccttccgcttcgacgcccccgcccgctccgtcgagttcgccatcggcgacggcctcgccgtcatcaccaccgacaacttcatgggcaacgtgcccaccgcccaggtcaagcgcatcgccgacgaccccgatgaccagtcggaggagtctcttctcgtgatttctggcatcaaggggaggattaacagggctgtatgggggccgttgaacaggaccatcatcaccgccggtgaggatgccaccatccgcatttgggacactgagactggaacatgtctgaatgagtcagacaaagaacaaggacaccagaaaacaattacttcactttcaaaatctgcagattggtcacatttcctaacaggctccttggataagtctgctaagctatgggatacaagaactctgaccctgatcaagacatatgtcaccgagcgacctgttaatgctgttgacatttctcctcttctagaccatgtggttatcggaggtggtcaagatgcgatgaatgtgactatgacagatcgtcgagcgggaaaatttgaagcgaaattctttcacaagattttgcaagaggaaattggtggtgtaaaaggccattttggaccaattaacgcactggcatttaatcctgatggacggagcttctcgagtggtggtgaagatggatatgtaaggctgcaccattttgattctgactacttcaacatcaagatttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRPILMKGHERPLTFLRYNRDGDLLFSCAKDHTPNVWFADNGDR LGTYSGHNGAVWSCDVSRDSTRLITGSADQTAKLWDVQTGAELFTFRFDAPARSVEFA IGDGLAVITTDNFMGNVPTAQVKRIADDPDDQSEESLLVISGIKGRINRAVWGPLNRT IITAGEDATIRIWDTETGTCLNESDKEQGHQKTITSLSKSADWSHFLTGSLDKSAKLW DTRTLTLIKTYVTERPVNAVDISPLLDHVVIGGGQDAMNVTMTDRRAGKFEAKFFHKI LQEEIGGVKGHFGPINALAFNPDGRSFSSGGEDGYVRLHHFDSDYFNIKI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>124..523#1125..1252#1815..1934#2039..2128#2771..2857#2975..3054#4408..4483#acgcactaccaggcagcccaacccacccgcgagctagggttttccagagttccagaacccccacctccctaaccctaaccacccatcctccccggcggcggcggcggcggcggcgaagagaagatgaggccgatcctgatgaaggggcacgagcggccgctgacgttcctccggtacaaccgcgacggggacctcctcttctcgtgcgccaaggaccacacccccaacgtctggttcgccgacaacggcgaccgcctcggcacctacagcggccacaacggcgccgtctggtcctgcgacgtctcccgcgactccacccgcctcatcaccggcagcgccgaccagaccgccaagctctgggacgtccagaccggggcggagctcttcaccttccgcttcgacgcccccgcccgctccgtcgagttcgccatcggcgacggcctcgccgtcatcaccaccgacaacttcatgggcaacgtgcccaccgcccaggtcaagcgcatcgccgacgaccccgatgaccgtaagatgcctcttctctaaccttctatttatgtttcgaaagcttctggtggcttctatttggattgggagttggagggattggtcatgggagtttcattttagtaactccctccgtttcacattataatataagtcactataacttttttctagtcgaacttctttaagtttgattaagtttatagaaaaatttaacatctatagcatgatattagtttcattcaaactaacatttaatatattttgataatatgtttgttttatgttgaagatattgctaaattattctataaacttaagtttgactagggaaaaaaaagtgaaagcgacttataatatgaaatggagggagtagtagagatgagatgatgagaaacatctcgtgatacttaggaggaaattcccttccaattacgtgcccctatccaggtattgaaaaggtgggagttcactcttaaactccccttcccaatccctcctaaaaactcccatgtcctccaaccaaacaattgacttaatccccacccctcaaactcatattcctccctaacaattccccccaacaacgtgggttctgaagtgtgtggttgtggatgaagagtcggaggagtctcttctcgtgatttctggcatcaaggggaggattaacagggctgtatgggggccgttgaacaggaccatcatcaccgccggtgaggatgccaccatccgcatttgggacactgaggttagcttgcatttacaacatttgcacatagttctactaaccatcgttggtgctacaaactcatcgctagtactaggcttctggtgcttttcaggaatgcgataatttgcttataactgtggtatgtggacctgtagcgctcttgtaggatcatttgacatgtatctggactgacaagtgaaaagttgtttaatagttaaaaatgctcatcgatatggttgaaaaatcattgttacgtatgtgtgattgtcagtttgttattgatggcaacattatgaattaacatgacatatgttagtgactattgaaccagcgataaatacctttcaggtttcttgttttatttaaactgactctggcaatatggtgccaacgacaaaatggtagtttgtgtttgtgcactaattgaaaacatgctacattcatacataatgtacgctgggttgtcattttaccttttattaaacatgccaactatttaattgtatgggtaggaacatgtttttccgtcaactctatcattgaatgcatttttaaattctgtttggtttggcatgtgcagactggaacatgtctgaatgagtcagacaaagaacaaggacaccagaaaacaattacttcactttcaaaatctgcagattggtcacatttcctaacaggctccttggataagtctgctaaggtgatattttgttgatgtggctagcataatcatgtcttccaattgtttgcactttgtgctacaaatatgattatttcctgacatgcacattgctatctggctagctatgggatacaagaactctgaccctgatcaagacatatgtcaccgagcgacctgttaatgctgttgacatttctcctcttctagaccatgtatgtgcctatgtaatacctaatttttatctacattttcgtaagttcttctatagatttttttaatcaaaatacatggtcatgctttaaattacttggtgttatctcatgctacatgcatatgatctcaatatgtagtagggattgaaatgacctttactctctgtctctgtattttgctttgctgtggtcctccttataagttgaagttggatatgacttgtgcttttttccgaagattctggtttcttctcttctcctgctgccacattttttgttctcagtttcaaatcattttctttgtgtgattagtttcaccaagacgagagcaacaaatgattcattcacatgtttattatctgcaattagtacttttacatgcataaataacaattaatatacaatgggaagttcaaggcacctatatacctgtccagcacatcttttgaccctggatttagcacaattccatatttatttgagtgctgttggctatcaaggatgtgtatttttactaccattggaaaaatgtactattggctacatctgaactatccacctgtaatgttgctgtaatgagtagtcagttcttgttatcattattccagctatataagtcacaagaaatctttgttgtgttaggtggttatcggaggtggtcaagatgcgatgaatgtgactatgacagatcgtcgagcgggaaaatttgaagcgaaattctttcacaaggtcagttctttgcacatggtttctatcttatgttttagtgagaacaatgatagtgtagttttcttttgcaatgttattttttcgtttagcaataagacacttatattttactttcagattttgcaagaggaaattggtggtgtaaaaggccattttggaccaattaacgcactggcatttaatcctgatggacggaggtaatattcttaatacatgtgtaatattatatgaatgctatatttatgttctaccaccgcacttatgttctcgattagctttttgtttcatattactttgtgtgttttctgctcaatgattaagccatgttaatccatggcaatatgcgctattctgaatcatattaagatgtcataaacattatgagagcaggtgtctattttgtattttaacctgccacatggatttttagcacattcttgtggttctactggctgtgtttacatgggtatttctcttctttttactcaaaagtttttttgacttttatattgttgtacaactattcatcattcacctgttattttaacccaccgcctctctagatttgtcccttaaattggttcattggtcttcctatctgtttgacatttttgttctccattgaatccttatgttttttttgtttctatttgtcttgttgaagtacttttcttgtcatacatagctcagtgattgcagccgttttcattggcaatatacgctatgctgactgtttgatgacaaataagaatatgagagctatgccatgtccaatatttaatttgataacctgttagtgtgaaattgagttgcattcttagtatagctgtttgaagcgtcgtatgtgcctgttggtttcaaagctctgtgatttcaaccaatcacattggttttatacgctattctgattggagctgttgaaaaataagacttatgagagctaccttttctgtcctcaacatccacgaggcatcctaggaagaaacatagttatctatcacctccatatttatataattattatgttgatgcaaggtttcatgtattgattgagtgtatctatcacctccatatttatataattattatgttgatgcaaggtttcatgtattgattgagtgtatgtgcataaggtaatggcttcatgaccatttgcaatgcattttccattgggagccactatttctttatctgaaaattgtaaagtatgtcaaaatatatattttttaaattgcaagttagattgatgaaggtttatacttggtctcatttggtgatgtcttgctgggggcactaagctggccttctgatgattgctgtatatttttattttatctcatggtggctcagtgattgttgccaatcagatttggtcatatacgctattctgatttctattggtgaaaaagaaaatttatgagagctgctttatgtgatagctagtttatattcttcaagcatattttctcacatgtcatggttaatttatgttgttcagaaagtgttttgctttgagcttcagttcttcatgtataatacggtgttaacagcttctcgagtggtggtgaagatggatatgtaaggctgcaccattttgattctgactacttcaacatcaagatttaaagcaagaagttgtgaaactctgaggtaagatgtccttcagcagcaaagcattaacattgtatcttaccaggctcagtatgttttttacagcactcttattcaagttgctcaagtagtcaagtgttcatttgcaattatttgtgatatagtaagatgtccttcagcagcaaagcattaacattgtatcttaacaggctcagtatgttttttacagcactcttattcaagttgctcaagtagtcaagtgttcatttgcaattatttgtgatatattttacactattatacacacatagaagtgagttaggtcctctttgattcaaaggaaattcataagaattttagatgacttcattcctaataggaatttttcctatatagccctttgaatggaaggaatgaatcctatgaaatcctataaaattcct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|
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