Os05g0275100

From RiceWiki
Revision as of 20:07, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os05g0275100

Description

Protein prenyltransferase domain containing protein

Version

NM_001187388.1 GI:297723906 GeneID:9271043

Length

4556 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0275100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:11268958..11273513

Sequence Coding Region

11272870..11273511

Expression

GEO Profiles:Os05g0275100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:11268958..11273513 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:11268958..11273513 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>cggaacaagagatttctcccagataatttcacttattctagcctcattcatggttgtgctgcttctgggtctattgatgaagcttttagtctgagggatgtgatgttgagcgctggtctcactccaaatattataacgtacaattctcttatctatggcctctgcaagtctgggaagctatcaagggcagttaaccttttcaataagttgcagtcgaagggtatatcgccgaatggtatcacatataatacacttatagatgaatactgcaaggaaggaaaaacaacagaagcttttaaattaaaacaaaagatggtagaggaaggtattcagcctaccgtaataacctattctatactgatctatggtttgtgtactcaagggtatatggaagaagcaatcaagttactggaccaaatgattgagaacaatgtagatccgaattatattacatactgtacactgattcatggttacattaaatctggtaatatggaagagatttcaaagctttatgatgagatgcatatccgtggacttctcccaaccaattggattggaaattggaaacgatcagatcctgttgttgtaaacaactggaacagaaaagatggtcatatgaagacgtacagtcagtgctag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>RNKRFLPDNFTYSSLIHGCAASGSIDEAFSLRDVMLSAGLTPNI ITYNSLIYGLCKSGKLSRAVNLFNKLQSKGISPNGITYNTLIDEYCKEGKTTEAFKLK QKMVEEGIQPTVITYSILIYGLCTQGYMEEAIKLLDQMIENNVDPNYITYCTLIHGYI KSGNMEEISKLYDEMHIRGLLPTNWIGNWKRSDPVVVNNWNRKDGHMKTYSQC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3..644#tacggaacaagagatttctcccagataatttcacttattctagcctcattcatggttgtgctgcttctgggtctattgatgaagcttttagtctgagggatgtgatgttgagcgctggtctcactccaaatattataacgtacaattctcttatctatggcctctgcaagtctgggaagctatcaagggcagttaaccttttcaataagttgcagtcgaagggtatatcgccgaatggtatcacatataatacacttatagatgaatactgcaaggaaggaaaaacaacagaagcttttaaattaaaacaaaagatggtagaggaaggtattcagcctaccgtaataacctattctatactgatctatggtttgtgtactcaagggtatatggaagaagcaatcaagttactggaccaaatgattgagaacaatgtagatccgaattatattacatactgtacactgattcatggttacattaaatctggtaatatggaagagatttcaaagctttatgatgagatgcatatccgtggacttctcccaaccaattggattggaaattggaaacgatcagatcctgttgttgtaaacaactggaacagaaaagatggtcatatgaagacgtacagtcagtgctagctcatctttgaatatgctttccatacttgtaagtgctggtcacttgtggattatgtgagaaagctcatgagggtattgctgacctgaagaggaatcggtaagtgaatccttgcctggtgggcttgtttaaaacctctatactttcagccggttatatttatttgttgtttatttttgttggcaatgccatataacaaactgatctttctattttaaaataccacattaacttcaaagtttgaatttgaagttcatgaactgaaaataggccttgtactttttctcgtttgcaacatggttttcctctccctggatagtgcgccttattttcttgcatggttctttcttttatattctagacttctaatactatctccttccccaaataagggattttgtatgcataccatccctcatttttttcccgtctattggttgttttagtttgttcgaggaagctttcctggataaggacatgccctagaggagaacctggtagcttcaacaaaacttttttatcactaagtacagtgtatccagaagttctcatgaatcatgccagttgaatgccagcttaaggaaagaatggattcagatgatcctttttgtgctaaggtgaaaacaaaagagaagcagttgcagaaaagtaaggatttcttgtaactcttttctactgattaatttatttgaaaacataattaaattgaatgcatttactgtctgtcttttatgaggatactggctcaaaatgcttattgatttggtggaaagcatgacaacttgatgaggacatcctccactattacccgctggcaaagacgcaaaagtcgggcggcgaccgtgtgagcctctgaaaaatcccaccttgcttagcttgggaggaggaagccacctttaaagggagagccacccttcccctatcggactagtcttttagggagattgggcctttccccgagtgggtgtgcctatgaattgttggggtccgggcaaccttaatttattgggccttggtcaatcccacctgggccggattgttatcacaacttctccaatcaaagtgatgaagaggacaatgtggtactcctaggtgatacaactagtaatttatatctatcaattttacctagttgcctaatacttttcagaatgtaactagctgcctagttattaatccaattgttttaatttaatgtttagaaagaatggattgaaggtcttgcagcaaatttcatttccttttcaatcctaattgcctgacaaactttacatttcaatgcaaaaaaggatgaggttaaaactttccaattatgataagaaaaatattgatgtttttgtttcatgtgtttacttaaattgtatgtaagaaccttttgatgaaatcacaattgcacttttggtaaaaaagagtcataattgcactgttgtactaaagtactccctccatcccataatataagggatattcccttttaggtaagattaaggatagcgagacaatactagaatccccctattaaatgagatttgcttgtgggtgagtgggttgttgggggttaaaataggtagaaatttgaattgaaattgatagatgtgacaagtaatacaccaaaatcccttatattatgggatggagggagtaatacatagtactccctctgctccgttttatagggcatataagttttttcacaaagagaccaagttacgagagtgcggcacgatttcttctggatatgtcccgatttcttatggatgtgtccctaattaagccttaatccaaggcatgcagaattcctggctctcctcccacagttcacacatgcatggcttgctgagtagttgcatgcagatacccaagtgttacattacatgcgatcatgcgcatgcaaaacagaagggcatcctgggaacaaatgcagctgagcgcacaatactccctatattctaggacactgtcaaaaaatttatgcgccctataaaacggcacggagggagtagtatacgacaatgcatagaaaccatgtgcattatgaactatacttttatttttcttaaatatattcaagttcaattggatgaaaatgcctgcgtatttatattcaccaaatggcgtgttacaatttattttgttgaaatttgatgcagtacctagtcctggtgcaaactctataggttgatgttcttactttgttctgacttctgagcaaattggctccagaaaattatccactacacttccgccgagatgttcaaaactacaatgacattttatttaatggcgagtacacccattttttttcttacttcccttatttagtaaacatatgtcaggctttttttaatcccattttccagctgatccagttctgtggcgagctgttacatatctcacatggccactactccctctgtcccaaaaaaaggcaaaccgtgggtttccgtgccaacgtttgaccgtccgtcttatttaaaaaaattatgaaaaaaattaaaaagataagtcacgcataaagtattaatcatgttttatcatgttttatcatctaacaacaatgaaaatactaattataaaaaattttcatataagacggacagtcaaacgttggcacggaaacccacggtttgcctttttttgggacggagggagtatctttttccagtaccatttcctctgaattaaatagcacaaagttctaggaatataaatcagtagcccttgattttttttaaacacccaaagcttcctgtgttaatgaagctttagtttattgtgcatatatttactgctgaggttcatgagcttctaaaatgctgcatataacaacaatataacaaagattagtgtagtgctaaaaattctccatctgcaagtcatttgtttaaatcgaatgtagtaacatgtggtcagtatgaccagtgacctaataatctctgggtacctctatcaggtcagtggctgagactgttctataagtgatagaagtattgagaaacctgtataatgtgttattgaagttagcagttatcctctaatatgcctcaggaagcttgggaaatagtttactgtcccactgattgaattgctagcccacattttgcttaagtggtgctatgataaatctggagtgatagtttaatagataaaggttcgataaaaaaatgaatatgaatcagcaaatgcaggatcaaattttgcttaaagccatatactgtatttttctattttcaaatactatgttcataccaggattttaggtttgtttaagctaattatctgtcactgtgattgttcattgttcttacatgcaaacaggtgagagctgaaaaacaaaattcaatttacagcttgtctttggtcaaaatgctatcagtctaaaattttgatatactgtttaactgaatgtctcaagcattgctctatgtcctttgctaaatgatgatgttccaaaacatcttttatctccttttcgtgaagtatcaattctgtgattaattgatgattttgttgctagtgacttgatgtttagtatggttttgtggtaataatattgacagctatcagaaacttagaatccagaacttagttgatagctgatattgctatattttccaggaaatgttgcctttgcttcttccgctcttaaactcgtccttagtgaagaagtttcttctacctttgtccaaagatagatcagcattcagcaagtccttctggtgatgaaggcttaaaacagactgccttatctgttgctccagtcctagcattcccttagtagctctcccatgtcaacacaggtactattctttctaattgccctcaaatcttttatcatttatagtaacttaccatcttaacttgtaaaggaaactcatttcatgttaaatagtggaagatgacaggcgtttatc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0275100, RefSeq:Os05g0275100