Os05g0279300
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0279300 |
|---|---|
| Description |
Similar to tRNA pseudouridine synthase A (EC 5.4.99.12) (tRNA-uridine isomerase I) (tRNA pseudouridylate synthase I) |
| Version |
NM_001187389.1 GI:297723908 GeneID:9267107 |
| Length |
8739 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0279300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:11658914..11667652 |
| Sequence Coding Region |
11666049..11666089,11666233..11666367,11667256..11667388,11667455..11667547 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:11658914..11667652 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgctgggtttagcaccactccggtttgtttctccccctcctcgcggcgccgccgccgtttccgccgccgctatcggcggacatagtatctcgctcggggatggctgccattgcgcggtgccgccgccgggggagaaggacgccgacaaggcgcgggcggagacgacggagggagcgtcgtacaagtggcgtatggtgatcgcctacgacgggaccaagttcaaaggttggcagtatcaaccatcgcctccaaccatacaatgtagtattgagaatgcgctaacacgcatcacaaagctggatcgcaaggagctctgcttggttggagctggcagaacagatacaggtgttcatgcatggggtggcgcatttcaccacgcctttttcctaccattgtcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLGLAPLRFVSPPPRGAAAVSAAAIGGHSISLGDGCHCAVPPPG EKDADKARAETTEGASYKWRMVIAYDGTKFKGWQYQPSPPTIQCSIENALTRITKLDR KELCLVGAGRTDTGVHAWGGAFHHAFFLPLS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1564..1604#1286..1420#265..397#106..198#atttgggaaacggggcggtccttcggcacatgttgtctgtaccccctcttggtgccgtgtgcccgtgtgacagtgtctccccacgcatcggctggagaattggatatgctgggtttagcaccactccggtttgtttctccccctcctcgcggcgccgccgccgtttccgccgccgctatcggcggacatagtatctcggtaaagtgtccttctccttctacactcccttctctccatccagatctaacgtgaagagggtctcagctcggggatggctgccattgcgcggtgccgccgccgggggagaaggacgccgacaaggcgcgggcggagacgacggagggagcgtcgtacaagtggcgtatggtgatcgcctacgacgggaccaagttcaaaggttcttggtctcctcctgcgcagttatatttctcgtttttagggtggtgatggatgatttggaacttttggatgcttcccaaaagcttcctgcattgagtaatgggggaggagaaataggtttcgttgttctccatgaaaacacgctaaaatctgttaaaaaaaattcattcggaagggtgtgattttgggttgtttagggcagggtgacgcttgagatcttatcacattgaaaaaccccagaaaaaaaatggtactcctttttcaggatcttatacctgataggtatataaacaaaggttttcggtacacagggaaaacttttggagaactgatgactgcacatggttgactgcacaatgttcacttctagtttatatcctctttggattcgattgagtttggatcttcttctacatgcgctgtccattccaaacttatctcatttatatcctctttggattcgatttatacctaatttattgcaaaacctaagttcggatttcctcctgttctattatgtcctgtttatatggtcatgtgttgccactgttctggagttctgaagaggtagcggatgtatcatcatcatctcttgtaagcatatttccttttgaataaccaactggagatctgctattctgacatgtttccgtcgaagcaagttcgtaattatctaacacagcaatctgcattcctttgtttaactgagtatataactttttgtacggcttttccttgtcgtaggccatcagttatgttatacttcacttatcatccatctattatataaactaccttgttgacattatgtgtgaacatcactgagactgtgatcagaacttcagaattttgaaatctcaataatctaactacaatcatgtttcaggttggcagtatcaaccatcgcctccaaccatacaatgtagtattgagaatgcgctaacacgcatcacaaagctggatcgcaaggagctctgcttggttggagctggcagaacagatacaggtgttcatgcatggggtcaggttcaattatcttaacatatctgtaaataagtgttcaagttgagatatatagtcccacttatatcttgcaccgcttgttctggtgttttgtaatttttgttttatatggaggggtaacacatcatattttgtatctaggtggcgcatttcaccacgcctttttcctaccattgtcttgatagcatgcactctgcaatcaatgggcttcttccacatgagattcgagtgagggaaattagtgcagcaaagcctgaatttcatgcccggacatccacaaggagcaaaatttatcattacaagatttataatggaccagtcatggatccctttcataatcattatgcataccatagtgcgtataagcttaattcacaagctatgcgggaggctgcaaagcattttgttggaacacatgactttacatctttcgctaatgcagtacacaatgatcgtgtacgcagtcccataaagaagataatgcgctttgatgttattgaaatggtaattgaagctcgcagttcttagttttgccttttcaccctgacaatgcagcattaaggccctctttgtttaggcttataagccaacttataagccgaaaagtctaagactaaacaaacaagcggctttttcgtttggcttttttgaagccataagccactctaacactattaagccaaaagctaggttggagaagcttttttggcttatgtgaggtagatgtatgactccaccattaaacttaggacattaaatccaccggcttataaatcatataagccaataagctgacttaaaagtctaagccaataagcctaagcctaaacaaagagggcctaagtgttgttttcctttcttgtgtggtcattcagttgaccagacattaagtaccattgaattgacctgatatttttttcccttgtgccacacagggtgctatcttacagcttgagattgaaggcactggctttctgtacagacaagttaggaacatggtaattttgttctcacttcaataaattcatgtgtggactttaatttcgtaacatcttacatattctgaccatatgagggtagaaatggtcctaaataatattggaacaaactctctgagttatggatgcatctgataaaaaaataccatcttgcagaactgttcgtatttttttttattttgtctttgataactagaaatgaagacactagttcattcatcttgattaacttggttgctacgtatataacgtgaggtatctcaccatatctatgttatggtcttgggaagttcaaagtagtggatggtgggaggtcagggtctttgaccccaacagggtcattttgatgccttggtataacgagagaaaggaggaggctcattgcgcggtgccaaatagaataatggatatccattattccttcttgatcaacacttagcttaatcgctcttcaagttagagtgtctggctaacaaattttaatacccccatacagtagtagaagcccatgtggctcatattgatccagcatataaacacgtgcattgcaaccataactcctctgggttaacccttctacactaatcaagaacaaaagtgtaagtgagttgtcatgtatacgtgggtctgctccttggaagagcttgactaacgcagattctggaaactggggtgtagtaactaagatcacaccaactaatacgcagaatctgccagctgatcgatggaatgttgctgtatccttgctgggtggcaggctggcagtagccttgctgttgtcattttgctgatgagctgatctcctgcctatttgggccttgacctactcccataacatcaattcccttcctttacagtgttgactacctgactagtgactactgcaaattccgaaagacagttattgtttccacaaagcaggcatttagacaatagacattcaatacttatggttggagccaagatttggatttggggggtgggggtgggcaggtagagagaataatcataaaaacaatgtggccttggcttgcgtgtttgagaaaaaaataatgtgtccttggcaattttttttttctagactccaataatagcaaacatgataaagtatggtggcatatatagagatcccagaactttccatgggaatttctgagtagtgtgcattcgattgtgacattattcaacacttgcctctagatgcacatggacattctccttattcatagcagcatcatgtcaaactttcatgcactaattaatgtcaaactagttctacaaaacaaattggagaggaattggaccacaagattctgtagttaaataggaattattaggtctcaaggtctttttggcagagcttcagcttcaagaattcttggagctggatataagaccctctgctcttttttgggtaccaacaattaagaagccttttccctcttctgataaaaaaatagcagctctagtgagattggtaatatgagtacctttatgctttgctaagatgtaaagggccattttacgattccatttcttatttgggtgagccatcttattcatactttagagtttagactgaaatactggcttttaccacctcattttagcctacaaacttcatgttctgcaagaatccaggagttggagctctgccaaaaaagcgcttaattgtagcatatctgataatctgatttcagtctaccacacaataccttttttttaattgtagtctactagctggatgcctgtgctttgctacggataaaaaatatattataatattaacaggtaccagaaatagcatgcgctttgccatgaaatgtgttacctatcattttgctatatgtggctatcaatttagatttgattgatttttaatatttaatacgcagaagtttatggggtaatttgcaaacctataacgggagtaggtatggaactaccttattttaatgtagtatagattttaatacttagaagttcatggtaatttgcaaaacaacaatggaagtaggtgtggtaggctggtggcagattcattgccgccaccactaccttcttttaaagtagtgtagatataacaaatggaaagagtaaatcacaatcacagaaactgatgtcttaaagtccaatagctcatggcttccaatgattgatttctggctacaagcttgccactcacatggatgagtctatctcctccctcttgccctagaatggccagcgctgcagtagtaaacattggaggaggcggtgtttcccacaatcccatctcgaggtggagtattgagttttttcataacaagagattatatcctgaaagaccatgttgtgaaaagtcaagacgatgcactacctcttcatttcgtgagaccatgttgtgtactgtgttatcacctactagtacaattgatttcatctcatgaggggacccaaattaacataatactacaatgttactgacatattccatcagaaaatgacactagtgtagaagagaacatgctcttgtcagtgtagtag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