Os05g0392100
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0392100 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001187481.1 GI:297724092 GeneID:9268788 |
| Length |
6768 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0392100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19078265..19085032 |
| Sequence Coding Region |
19083901..19084056,19084350..19084413,19084546..19084667 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:19078265..19085032 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:19078265..19085032 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>cttgaactagtacccctcagcattttcctactaataaaggagtttcaaccatatattttttttacctgcaggaatgatgctggtgtacttatacggactgagagactaagaaccaaagaaataacacaaaaggtgaaagcgaagaactactggcagggaggtgtttgcttggccttcgctgatgaggtcttatgctggttgtatggcactgttagagaaaacgaggactacatcctgcaatttgtacatccattcaatcgcttggaacttctacgtgcccagtctccctgtcctgatgccatcactcatcatgtggagcagctctctggtacagcaggctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>LELVPLSIFLLIKEFQPYIFFTCRNDAGVLIRTERLRTKEITQK VKAKNYWQGGVCLAFADEVLCWLYGTVRENEDYILQFVHPFNRLELLRAQSPCPDAIT HHVEQLSGTAG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5637..5792#6086..6149#6282..6403#actcgaatcgcatcgcatcgcaccacaaaccctcccccccgaccagaaagccaagaaagaaacctttcttcgtcggtctctctctctctctgcccatggacttctcggagcaggacgtcgaaatcttcggcgaggactacgacgacgccgaggccgacggcggcggcggcggcggtgcctcgtccggctcctcctccccgtcctcatcctcctcgtcgtccgccgccgggtcctcctcctcctccagcggcgcctccagcagcagcggcgggggcgggggtgggggcgaggacgaggacggggtcgaccagggggacgccagggggtacgacgacgacccgttcgacggcgcgcccgcgagggccgccggtgggtacggtgacgaggagaggggcgagggtgatgcggaggaggaggaggaggaggaggagagggatttgttcggctctgacaacgaggattacgtcaagacccccgcgcgtagcaactacctagtcccaggtccgcctctaatatttgctaaattatcgtgcacattttgggtgacaatgatcagtctctaagcatgtctaatcagtagaattaattagggcatttttacaaaatccaacccagttcttttggttgcgggtaagctgatcgtagggtttaggggattcagtgagcatgtagaaaattgcgggtttcacatgtatgtatgatgaattattcttgttctggactttttaattcttccttccactttcgataggcatatgatacgcacaatgtgtcttataaagtaacagtacatcatggctactgtcttctgcttgcaactcacttttaaatcgcaagagatgttttacaacaccatcaagcataattgttggagagtagccattgaacactgcctaacgataagtgttaggggctattggattagctgatagttacattgcactatgctagtatgttaatctcccgttttgattataggtagactacagttgaataacatctatctgcaaacgaatttgaagtataattgaagtgaactctgcagtagattacagttatgaagaatactgcatctgatctgatttcctctgtagaacaatttttttcacattcttctcaatctgccatctaactagaaacatagaagtttgaactttgaaagatcaaagttgataataaaacatgcataatttattgaaaaccttcaatatatgctaatcatatttgtgataggaagctccctaaaatcaatacgctatttgtgatgatttagtgctggaaggaatggagatcatgctaatgctttatgtgtaacaacttgatatctattgttggcatacattttatcaatctactaggtccattagtgattggtaatgcccatgcttgtggtaaagattgtaactgggttattttactggctatacgcttgatatgttggtgcggggcttggggcagctagcactttaaaatgtttgaattatctaggagggaaggttgagcttcaacactatatttcattccatgccttcccttatagtgctaccctcaatacggaacaccaacaatcattctcggggaggatatggggggcggaatggcagaggtccacctcttcttccaaggccaggaggccatccaggacggcataactttggatatggtgggaggttttcgcatggaaatgggcgtaatgttgaaggttttgtttcagaaatgaagcttaataagagtgaagaaactttatctaggaagtttgttgcttttcaggaggtgagtaatgataccatattcttttgatttttatatattatctctggtatctatgtatccaaatcctttcctattcatgcagccttctgagattgcatgctacagccgtattgagggtggggatgtatattttgatgaccgcagcttggtaagatcacagaattgctcacgatcaatttcactttccctttagttcgccatttccttaaagtctgtctatgtagtattacagaaaagtattgttataaatttgctgctgtactaaacatactgttattttagaggctcttcaaacgtaacatttgcgactatgttggtgaaaatctcaataaaggatttgaatcttttatagagaaaagaggtaattccatcaaaaactcatgttttctgtttttatgttctggagtactccctccgtcccataaaaggcaaaccttgtacgagatgtgacacatcctaggagacatgtccaaattcatagtactaggatgtgtcgcattccgtactaggtttgtcttttatgggacggagggagtagttgatataaagagtactgttaaatgtagaaattgttcttatctctggtattgcaaacttctgtttcaatcatcctggattaacttgtccacatttatagaaagttcatgacagcatggcaccttccactaattttacttggataatttattcttccttaaaaaatggcatgagagaaaatacataactactaattagaggttctaattatttctcatagagccaaaagagaaatgaaataaattattggaactaattaacccagaagttctttttttttttttggaatgagttgaatcctacatgtggatccagataaacagtagttctgttatttggaagttgttctttccttttgaatttattttcattcaaggggactgtttcatgacgaatgtggtttaattgtcaatatcagatttgggttcagaaggatttggtgatcttcttgcatgcataagaaattcaactgtacctcttcagaacatacattttgtggtaaaatgctgctgtcaaccttccgttttctattttagtactctatgcatggcacgctgatcatgtatgatgctcttcttgcagacataccgcaacaatcttaacaaggtatgatccttctagttcgaactatctaaaacaaactctgtcttcccctcatttttgtagcatataccactcgttttgttcaatatgcttgtatgtttatagatcgatataacaactaatattgttaccagatattggccacggcttatctaagagaaccatggaagatgggtgtgcacaaaagaaatggtgttgtatacctggacgtccataagctccccgaaagaccacaaagtgaggttgaacgccggaggtgattctctttctctgaatgcttcattaagttgatgtatatggtgatggtaatactgttagtgatgctcgttaaacgcatttatgttgggtgatagaaaaagttgatatctggtatggtaaatatattaatggccttagtttatactttatacgtgaattgtcctatagagattctactttcacaagaaagataaatggagattctcttttgaaaagtgttcctgtttatccaccatcagttatttatatcacaaggatatcttgtccaattttatttctttatgctgttttaattcactggcaaactgatgtaacaagacatgcgtaactgttagattccctgggaagtttgacacatgagattagctgtatcttcactcttgctctgtgcatgtatcatgttgccttaatgtttatagtcaattaatcatatgctcagtgttgttattatcgttacatgggaagaatctgaaccataatactttttttgtgtgccttgtctttatctctatatttactctcagatgttattggggatattcttttgaaaatcttgcaactgagaattccattgatgaggatggaagaggtattgatgcaaatgtagagttctgtgctgtaataaaaacgaaattgggtgcacatcgtattatcatgggtgctgagatggactgctgtgacgcaactgatgatggtaggcggttctacgtggagttgaaaacaagcagagaggttagcattactttttttttttgtgatttgctttagtttgggtaccacatttatttgaaatactcagtttttgagcctctggcgtgtaacagctggagtaccatacagtggaaaaatttgagaaagagaagttgcttcgattctgggtaaaattttagtcctgctgtatttcttattctccattcaattcaatatcatttgtaacttactgctctgtcctgcagtgtgaaagtttattttgtgttgtggttcattctcttagaactcttttttaatcaatgtctaacgctgctatttgcttttgttaagcactgataaaaaacactcaattgcattgtaaagcaataatgagggtagggatgcgtatctgttggcccatgggtaccctttggctcaatggtggagccagggaattcttagagcctgagtgaatctaactatgttagatatttgttaccaaaaatcaatttaattcctagagtaatataaaaagttagtgtacgtttgagttttgatgatgagagtgggctgccgcccggcgctggccgctgggtggtggctccgccactgctttgggccattcaacccagccattggttgcacttcaattgctagttcatattaggtacaaaatgtaaaccaaatgaattagtgtttagctgatgggtatccatggtcaagtggtcaaccaacttgcatctttaactgagagtagatgataaggtagcaatcttgttatgactctgtctaccatgagtccatgatccacttagctgccttttatttttttcagaaagtatgcatattttaacttctaacattaactttttttctttactaaatattgcagattcaatcatttattgctggtgttccatatgttgttgttggattcaggtagtattcattctttattgttttcccttacgccatccattttttgtagtcaatgtgatgagctttctatcacctgacagctggcatttttgcaatggaaaatgattttcgtgataaaatgtttgctgatacaatttacatgttaaagaagctgtgcaatgttagtattgggccttctgcttggctaggagattgacatgctggttatcacaaatcagtatgccactatggttgtcctctacaaggaacaagagtaatttcatttacacctggtgtcatcaactgtgtacgaagcaagctcatatttgtgatagtcagtcgtttctcatggatgtcctgttgcaataaataattgtgctgcctacccaacttttgtggggctaaaggctgctggtgctattacaataaatattttattatttggtactaaggtatatttttcccggtacgtgtatgctcattttcgagttaattttgtctaaataattacaacacgatttcatcttcgggataccaaatctttgtgtagtaaactagaggttcatggagacatggactatttctggtaatatactgatatgtctccatttattgattgtaataggcataataacttaaacacatacttgattttctagattcttcagttcaatttgtttgactgcatcacatgtacttgataaaatcgtatgcttatttttaatacaatgttctgatttggtgtggtattttgctcaatatttaacctaccccatatgatgcaaaagaaggcttttacttttttaacttcgactttgtcccaattttacattgattccagtggcttgtatttgtaacttgaactagtacccctcagcattttcctactaataaaggagtttcaaccatatattttttttacctgcaggaatgatgctggtgtacttatacggactgagagactaagaaccaaagaaataacacaaaaggtgaaagcgaagaactactggcaggtaatcaagctttcttcctagcaattttaaaggacacatgcctagatagacaactataatttagacctatcagcaggttaaatactggaaatgtgaatcatctgtaactctagactcccaaaggacgtgcttcctttgcaacaatttacctgctatgtaaaatatgtgagattagattgtctaaataagtagttctcaattaatttcctgccacttcaagcataaaagggataagaatacaatgtacttatcttgaaaataacaataatatctgatatccgtatgtacttcagggaggtgtttgcttggccttcgctgatgaggtcttatgctggttgtatggcactgttagagaaagtaagttcatttatcattctgaatatctaactagttgcattttctcaaatttttaaatcacggacttattggcactcataatcatatgatactctctgtacgcctgacattgcttttttccatctcttacagacgaggactacatcctgcaatttgtacatccattcaatcgcttggaacttctacgtgcccagtctccctgtcctgatgccatcactcatcatgtggagcagctctctggtacagcaggctaggttaattcgtacacacaacttcggcaagtaaaagggctgtttgaggtagatccgtgttgaaggattctattctaggggtgctgactcttaaacaaaacttcggcaattatataatggttgagctgacgacttacccagccaagcaacataggccgacgactaaatggtttgctctttgaactgccaaagagattttgaaattgtcaaaaccttgtgtttctccagtaacattaagttataaattagggaaatggagagctatgcggcaatgctactactgggtcatgccaccgaggcaccaatgatgtaactctctaccagataccagtaccaagggaaatgatatgaattctagagagtttctg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
