Os05g0397700

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Structured Information

Gene Name	Os05g0397700
Description	SecY protein family protein
Version	NM_001062003.1 GI:115463736 GeneID:4338708
Length	7211 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os05g0397700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 5
Location	Chromosome 5:19352988..19360198
Sequence Coding Region	19353805..19353894,19355127..19355233,19355336..19355459,19356171..19356300,19356372..19356491 ,19356919..19357060,19358301..19358384,19358709..19358800,19358913..19359002 ,19359115..19359194,19359421..19359509,19359645..19360125
Expression	GEO Profiles:Os05g0397700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008398:19352988..19360198 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008398:19352988..19360198 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgccgcactcactctccctcctgctcgcgcccagccgcgcgctctccctctcctccccaccgctccgcctcgccccaacgcacccaccacttcgcctgcaccacgacggcggccacctcctcgtgggcacgacgaggcggcaggctccctcgcctcgccgccgccgtctccatgccgccagggcttccgcgccgtccgccgccgcggcgtcccccgtagggcctgcgggcgagggtggcgaggtggggggcagggcgaggaaggcggcggggtaccggaacaggttcctggacctggcgcggctgggggccgtggcggagagcgcggcggaggcgctcttccgcagcgagattcgccggcggctggccgtcacggccgtgctcatcctgctcagccgcgtcggctacttcgtcccgcttcccgggttcgaccgacggctcatccccgattcctacctcagctttgcaccccttcctgcagatgacctcggtgatttttcatccgaattgaagctgtcatttttccagctcggaatcagtcatcagatttcagcatctattgtcatgcaggttctctgtcatgttcttccatcacttgaaaaactacgaaaggaagggttagatggacatgagaagatcaaaggctatatttggtggctgtcgctgggttttgcacttgtggcggcttttacagtgtcatgctactcactgcaatattctatatatgctgcaagttacagagttaagcatgtaatgataacaagccttttccttgttcttggtgcaatgacaatgacatggatctgtgacactatatcggaatctggatttggacatggctcttccttgattatctgtgtgggaatattgactggttatacagacacactccacaagatgttaactcaattttcaggaaattggtacagctgttggccctacatcttggggatagctgggacttttattttggttaccatgggagcagtactggtgactgaagggtgtaggaagataaagcttcagtactatggatttaaattggcttctggtgcaaggagtgagagctccccagttacagaggtagagccatatatcccttttaacataaatccaactgggatgcagcctttgcttaccacctcatacttattagcttttccaagcattatggccagcatttttggtacgcaattttgggaaagtttgaaggaaacgttgaatccaaagacttcagttggtggtggtccatgggtttattatttgacatatgcatttcttgtcttcgtcttcaatatttttgacattgcaaacttgccaaaagagatatctgactacctgaataaaatgagtgctagagtaccgaagataaagcctggaagagcaacagtagagtatcttacaaaaatacaaacatctacacgtttctgggggggtatattgctgagcttgttggcgacttcctctttattacttgaccgatatctcaggcagataaatgagggattttctataggtttcacgtcggtgttgattattgtgggctcaatcatcgagctgagaaggtcttatcaagcatacaatgtgatgccagcactaagcaaagttctaaggagatatggtgcctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MPHSLSLLLAPSRALSLSSPPLRLAPTHPPLRLHHDGGHLLVGT TRRQAPSPRRRRLHAARASAPSAAAASPVGPAGEGGEVGGRARKAAGYRNRFLDLARL GAVAESAAEALFRSEIRRRLAVTAVLILLSRVGYFVPLPGFDRRLIPDSYLSFAPLPA DDLGDFSSELKLSFFQLGISHQISASIVMQVLCHVLPSLEKLRKEGLDGHEKIKGYIW WLSLGFALVAAFTVSCYSLQYSIYAASYRVKHVMITSLFLVLGAMTMTWICDTISESG FGHGSSLIICVGILTGYTDTLHKMLTQFSGNWYSCWPYILGIAGTFILVTMGAVLVTE GCRKIKLQYYGFKLASGARSESSPVTEVEPYIPFNINPTGMQPLLTTSYLLAFPSIMA SIFGTQFWESLKETLNPKTSVGGGPWVYYLTYAFLVFVFNIFDIANLPKEISDYLNKM SARVPKIKPGRATVEYLTKIQTSTRFWGGILLSLLATSSLLLDRYLRQINEGFSIGFT SVLIIVGSIIELRRSYQAYNVMPALSKVLRRYGA</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>6305..6394#4966..5072#4740..4863#3899..4028#3708..3827#3139..3280#1815..1898#1399..1490#1197..1286#1005..1084#690..778#74..554#gccggattttgcaatcccatcggccggcagagcgcgacggcggcagctcggccaccgccgcggcatcgccgccatgccgcactcactctccctcctgctcgcgcccagccgcgcgctctccctctcctccccaccgctccgcctcgccccaacgcacccaccacttcgcctgcaccacgacggcggccacctcctcgtgggcacgacgaggcggcaggctccctcgcctcgccgccgccgtctccatgccgccagggcttccgcgccgtccgccgccgcggcgtcccccgtagggcctgcgggcgagggtggcgaggtggggggcagggcgaggaaggcggcggggtaccggaacaggttcctggacctggcgcggctgggggccgtggcggagagcgcggcggaggcgctcttccgcagcgagattcgccggcggctggccgtcacggccgtgctcatcctgctcagccgcgtcggctacttcgtcccgcttcccgggttcgaccgacggctcatccccgattcctacctcagctttgcaccccttcctgcaggtctcttccctttacagtcctccgagaatattagttcgtgctagctgtagtgtatgaaagtgcgcggtcgtttgatcattttgatggccttggtgaactgtttgaagaatgtgcggtgctctttcggttgtgcagatgacctcggtgatttttcatccgaattgaagctgtcatttttccagctcggaatcagtcatcagatttcagcatctattgtcatgcaggttctattttatcccttgtttggtcctgctcttttgttttccaatggcaacgtatgtctcaagtagcagcaatccgctcaataacctgttgcaaactgagccttagttcttttattctagagtgtgttcgtttttgctctttaagagcgttttgcatcagttgcttctaacgtcgtactaaagcttttctcagtatttggtgatagtaacaaattgtgatttttaggttctctgtcatgttcttccatcacttgaaaaactacgaaaggaagggttagatggacatgagaagatcaaaggctatatgtgagtcgagttctctttcttgaactgaattatttgaaaaggggatcttttattttctttctcaacattcatctacttttaaattttaagtctggttattttgatgttctagttggtggctgtcgctgggttttgcacttgtggcggcttttacagtgtcatgctactcactgcaatattctatatatgctgcaagttacaggtgacagtatgttagctctatatggagaaaaagctttactaataataatttgtttggactggaaggatgctcatcagtatttctttacctatacctttttttaatctttcagagttaagcatgtaatgataacaagccttttccttgttcttggtgcaatgacaatgacatggatctgtgacactatatcggaatctggatttggtaatactctatatcatgtatatcggaatcttggatttggtattctagcatcatctctgcatgctttgattatactgtgttaaagctgtattcaatatggcatattatgccatatccaaactttaagactaaactcagctgttggacatgaaaacatgcatgctggcatgatttctttaccatatatctctatgattgcgattcacgtaaatgatcttgtaaagtaaaagcataaaatgatggttgttatccatttagtgcatattttcttgtacttggttggaacttttgttcttatattttcttctatgtctttgcatccaggacatggctcttccttgattatctgtgtgggaatattgactggttatacagacacactccacaagatgttaactcaattttcaggtaatctttcacgacactaattgcaacttttcaactgctaagttttactcctttgagttggatgcgaccagtaaattctaatgataatgatgtgtatgtactgaatttattatccttgcatcttcttatatctctttgcggaagttttgtggtaggtggagtatttcaaggcacttttccaaactgcattgtcatctatgatgatcttatactttgatttttttttatctgcctgtttggtgcctcacattgtgttgccaaccaaaactcattgttggattgtaactcctttaaaggattgaatttcattacagcttggcataactgttgctcaaataaataagaagcaacatggtctgagtagaatggataattccattatgccactcaaattttgccaaaccagggatgtgctgttatcgtacaagtacaatactttacccttttatttcattgcagacaaaattccatcagtcaaatcatgcccaggatgtgcaaagactattttaccccttctctatcagtttcctctgttttctattgcacttttccatagctgactggagagaacgacctcatctatcctccaatgaccaatggctagtttagagatatgttagtcattattcagagaaattaaaaaatgagagcaaaggggtaaaatttgatcaacaagggtagaaaagggtaatgttttggtacagtacagtcatatctggagttggttttcaatgggatatctaggctcagacatattgttaatgatatatatggaattatcccttttcatcttctattaaatcattacaggatggtgaaatcttattttgcacttaaaaatcttggatggttgtgtctgttataacctcgtcagtagtgttatcttagctgatctacctgagctccatttctctagctgagcataacataatatgcatcgtgcaatgttaaggtttgtttgcacgatcatttgggcactagccagttcatgaagatataatgttgacatttttgtcagtaacgtgtatatacgaactagaattttaagtcttaaaacacttcaccagtttctacaatacaataacttgtttaccaagatggatcagataaacatttggagaaaagaaaccgaaaatgtaactcctaatttctttcggtcatatacagtatgtacacagacagctgatatgctgagacttctagtgttattttcttttatttgatatgcctttcgaaacaggaaattggtacagctgttggccctacatcttggggatagctgggacttttattttggttaccatgggagcagtactggtgactgaagggtgtaggaagataaagcttcagtactatggatttaaattggcttctggtgcaaggtaatgataaaatcaactctacactcatttttattatcatgtacttttgaatgctatttttgcatggagcacataagaacattatccacacaagctgcacataagaacctttcatgttgcccaaatgcccaaacagaatatactttatcacattaactgcaaaccttttgtttgaaacatctatttatgttatttgaaaactccagtttgttatattctgcttaagttctaatttctaaacaatttaacagcacccttctaccggtatttttagctgcagcctggcatggttatatggctcaatgatatggttggatgtggattgacctagcaaaggctactccatcatcacctatttgtgctaatactacgctttatggttttctcaatccttttacttatcttatatttgatcattcttttgtaggagtgagagctccccagttacagaggtagagccatatatcccttttaacataaatccaactgggatgcagcctttgcttaccacctcatacttattagcttttccaagcattatggccaggtaattcattgtgtttattttttgggtatgttttggttaaaatttccattctgattttggaatttctccagcatttttggtacgcaattttgggaaagtttgaaggaaacgttgaatccaaagacttcagttggtggtggtccatgggtttattatttgacatatgcatttcttgtcttcgtcttcaatatttttgacattgtaagttactttctcatcttaataactgtctaactattttatttttcaggatacagtcattataccaatattccttctattatcttgtggtgatgttctcttatagttgctcgtgaccttgttttggtgcctgcggaacctggctgacccccttagagaatgcattgtttaaaaaattccgtaatgaattgtggatgtagcacacagagtcctttaaacctacaaaaaaaaaattcaaattgtctagatgttgagatacagaaaggacaagcatacatcacggtattgttcaccatgaagtagcagtagccgtaagacttttccttttgtatcttgacatgtaggaaaaaacttgagttttatatttttctttacacagagctactcatgctacatccatgaatcattttggaattttttaatcatcgcttatgttgattcatcagatttttttatgggggacaacgaatcccctggggaccaacaactatgcataatctaactgttgaacctagtatcacatacaaaacttttcttaacaatgctcttgtagatcttcaaaaacatgacagatatttgtgatgtaattttgatatcagaactcatgttctcaacattttcaggaagataatattcttttattttcttttcatgattttatttgcacatgccttatcaaatatagcttaatctacacattattcactgcaggcaaacttgccaaaagagatatctgactacctgaataaaatgagtgctagagtaccgaagataaagcctggaagagcaacagtagagtatcttacaaaaatacaaacatct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External Link(s)	NCBI Gene:Os05g0397700, RefSeq:Os05g0397700