Os05g0408200
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0408200 |
|---|---|
| Description |
SBP domain containing protein |
| Version |
NM_001062057.1 GI:115463844 GeneID:4338766 |
| Length |
9167 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0408200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19929980..19939146 |
| Sequence Coding Region |
19930214..19930863,19932361..19932533,19932967..19933220,19933323..19933397,19933489..19933596 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:19929980..19939146 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:19929980..19939146 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgcccccggcggcggcggcggcggcggcggcggcggaggtggggtggatgccggcgagcccgtctgggactgggggaacctcctcgacttcgccgtccatgacgacgactcgctggtcctcccgtggggggacgattcgattgggatcgaggccgatcccgccgaggcggcgctgctcccccctgccccgtcgccgcagccggcggaggcggaggcggaggccgcggggccggcgtcgctgccgtcgtctatgcaggcggagggaagcaagcggcgcgtgaggaagcgcgacccgcggctggtttgcccgaactacctcgccgggagggtgccgtgcgcgtgccccgagattgacgagatggcggccgccttggaggtcgaggacgtggccacagagttgctggcaggggcgcggaagaagccgaagggtgccggccgtggtagtggtgcggcagtcggcggaagtggtggaggggctagccgtgggacaccggccgagatgaagtgccaggtgcctggttgtgaggcggacatacgtgagctgaagggataccaccgccggcacagggtgtgtttgcgctgcgcgcacgccgccgctgtcatgcttgatggtgtccagaagcgctattgccagcagtgtggcaagtttcatatattactagatttcgatgaagataaaaggagttgtagaaggaaattggagcggcacaacaaaagaagacgaagaaaacctgattccaaaggcatattggagaaagatatagatgaccagttggatttttcagcagatggtagtggtgatggtgaactaagagaagagaacatagatgtcactaccagtgagacgcttgagactgttctgagcaataaggttttggacagggaaacacctgtgggttccgatgatgtgcttagttctccaacatgtgcacaacccagtttgcaaatcgaccaaagtaaaagcttagtgactttcgctgcttctgttgaagcctgccttggcactaaacaggaaaacaccaaacttaccaattctcctgtgcatgacacaaagagtacttactcatcctcgtgtcccacaggacgtgtatcattcaagttgtacgattggaatcctgctgaatttcctcgacgcttacgccaccaaatatttgagtggctttctagcatgcctgttgaactggagggctatattcgtcctggttgtacaattttaactgtatttgttgcaatgccacaacatatgtgggacaagttatccgaagacacaggaaatcttgtcaaaagcttggtaaatgctccaaatagtctcctgttgggtaaaggggccttctttatccatgtcaataatatgatatttcaagtattgaaagatggtgcaacattgaccagtaccagattagaggtacagtccccgaggattcactatgttcatccatcatggtttgaagcaggaaagcccatcgatcttattctttgtggaagttctcttgatcagcctaaattcaggtcacttgtgtcatttgatggactgtacttgaagcatgattgtcgccgtatactgtcacatgagacctttgattgtattggaagtggggaacatatacttgattctcaacatgaaatattccggataaatattaccacatcaaagctggatactcatggacccgcatttgtggaagtggaaaacatgtttgggctatcaaattttgttcctatccttgttggtagcaagcatttatgttctgaactagagcagatacatgatgctctgtgtggttcttcggacataagttctgatccttgtgagcttcgaggacttcgacagactgcaatgttgggattcctcatcgacattggatggctaataaggaagccatccatagatgaatttcaaaacctactgagtttagcaaatatccagagatggatatgcatgatgaaattcctgatacagaacgattttatcaatgttctggaaataatagtgaactcgttggacaacatcatagggtcagagcttctttctaacttggaaaagggtagactggaaaatcatgtaacagaatttcttgggtatgtaagcgaagctcgaaacattgttgataatagacctaaatatgacaagcagagacaggttgatacaagatgggcaggtgattatgctccaaaccagccaaagttgggcatttctgtgccacttgctgaaagtactggaaccagtggagaacatgatttgcactcaaccaatgcagcttctggagaggaggaaaatatgcctctagtgactaaagctctcccacacaggcaatgctgtcaccctgagactagtgctagatggcttaacgctgcctccattggtgcttttccaggtggtgccatgagaatgcgtcttgccaccactgtggtaattggtgctgtggtatgttttgcagcttgtgttgtccttttccacccacacagagtaggggtgcttgccgcgccagtaaagaggtacttgtctaggaactactcatcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAPGGGGGGGGGGGGVDAGEPVWDWGNLLDFAVHDDDSLVLPW GDDSIGIEADPAEAALLPPAPSPQPAEAEAEAAGPASLPSSMQAEGSKRRVRKRDPRL VCPNYLAGRVPCACPEIDEMAAALEVEDVATELLAGARKKPKGAGRGSGAAVGGSGGG ASRGTPAEMKCQVPGCEADIRELKGYHRRHRVCLRCAHAAAVMLDGVQKRYCQQCGKF HILLDFDEDKRSCRRKLERHNKRRRRKPDSKGILEKDIDDQLDFSADGSGDGELREEN IDVTTSETLETVLSNKVLDRETPVGSDDVLSSPTCAQPSLQIDQSKSLVTFAASVEAC LGTKQENTKLTNSPVHDTKSTYSSSCPTGRVSFKLYDWNPAEFPRRLRHQIFEWLSSM PVELEGYIRPGCTILTVFVAMPQHMWDKLSEDTGNLVKSLVNAPNSLLLGKGAFFIHV NNMIFQVLKDGATLTSTRLEVQSPRIHYVHPSWFEAGKPIDLILCGSSLDQPKFRSLV SFDGLYLKHDCRRILSHETFDCIGSGEHILDSQHEIFRINITTSKLDTHGPAFVEVEN MFGLSNFVPILVGSKHLCSELEQIHDALCGSSDISSDPCELRGLRQTAMLGFLIDIGW LIRKPSIDEFQNLLSLANIQRWICMMKFLIQNDFINVLEIIVNSLDNIIGSELLSNLE KGRLENHVTEFLGYVSEARNIVDNRPKYDKQRQVDTRWAGDYAPNQPKLGISVPLAES TGTSGEHDLHSTNAASGEEENMPLVTKALPHRQCCHPETSARWLNAASIGAFPGGAMR MRLATTVVIGAVVCFAACVVLFHPHRVGVLAAPVKRYLSRNYSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>235..884#2382..2554#2988..3241#3344..3418#3510..3617#3993..4110#4426..4561#6702..6876#7412..7939#8703..9014#gtcctagtcatcggacgccgcccacctacccgactacccgaggcagcctctctctcctccctcgcccaccaccacacgacacgagacgagaagactgattcattcgctcgcgtacacgcctaggcgctccgagaattcgtgagggaatcccgcatcgccggagccgatcggcggcgccgcgggcgggtggggggggggggttagggttagggttttgggggtggcccaccggggatggacgcccccggcggcggcggcggcggcggcggcggcggaggtggggtggatgccggcgagcccgtctgggactgggggaacctcctcgacttcgccgtccatgacgacgactcgctggtcctcccgtggggggacgattcgattgggatcgaggccgatcccgccgaggcggcgctgctcccccctgccccgtcgccgcagccggcggaggcggaggcggaggccgcggggccggcgtcgctgccgtcgtctatgcaggcggagggaagcaagcggcgcgtgaggaagcgcgacccgcggctggtttgcccgaactacctcgccgggagggtgccgtgcgcgtgccccgagattgacgagatggcggccgccttggaggtcgaggacgtggccacagagttgctggcaggggcgcggaagaagccgaagggtgccggccgtggtagtggtgcggcagtcggcggaagtggtggaggggctagccgtgggacaccggccgagatgaagtgccaggtgcctggttgtgaggcggacatacgtgagctgaagggataccaccgccggcacagggtgtgtttgcgctgcgcgcacgccgccgctgtcatgcttgatggtgtccagaagcgctattgccagcagtgtggcaagtaaggctccatttcctcattccaggctgctttatgaacttgtggaagatccattgggatcagtagcagtaggagggataattaagtgctttaacacttatacaatcattgttgctatatgatttggtgtttaatgcattataccttttctagaatatagtggctgttggatatgatatttggtcatttcatagaaaaaaaaacatttacacactcgagagtctaagtggagtgtttgctcaaattatgcatgacgattcatttaattaatttattctgagaatggttctttaggattggactgttctcaacatgtctttgtagcaatggtatctgatcgtccgattaaccgcgatcaatcatcctgaccggtcctctgacttctgatcagggacattaactcaatcagctcaatcagaatctgatgataaatcagcgattcatcatccgattatgctaggtaacaattaatttcagtaggagttttgggctgcatgcgaagttgggcctcagcagtattgtgccggcccattcccatagggtttaccggtttagtcccctagaagctgtcacaaataaaaactaacaagtaagcaaccatctaaccatcaaatatttcctttatgattgcttatactatgcactatatatacattatcgattagcctcgattaattggcctgattgacctgatcggtgccttggcgatcagggtcgatcagacgatcagataacattgctttgtagttttaactatattgaaatctaccaactttacattttcttagaatttttcgtttcctctgctaggctatattatgtggtgtacataatttgctgtatgactgtattaatatagttttgttcaattgagaagatgggttttctattttgtactttttcttgaggtaccaattacgggttgcttaactggtttttttctggggggtggggggtcaaaatattcaggtggagccttatgattggttggagctaacatataaatttacactagttccatttccatgcagaatcagtttgttactgatggatggtcgctaaactttctaaaaattgcatgccaagctcatttgcaataaagctaagtcttttatttccaaatcaaattcatatttaaagtttgattaatctcataaactaaggaacatcctgctttaatgcataaattttcttgtatgtttttgacatgacgtaaggtcactgatcaaacaaactgcaagcatggaagtacctctgtccttgtgcatctgtccacaacctgttggccacttgatatatttttgaaacattactttagcaattgttcaaaattctttgcctagctcgaggtactaacctaaacctctttgctgttgactatggttgtggcgatctaacagctgtcctgggctcctggctgtatatattgtttttctactagcagtttaatttttgtgtgctaacactattctctctcttaatatatttctgctgcaggtttcatatattactagatttcgatgaagataaaaggagttgtagaaggaaattggagcggcacaacaaaagaagacgaagaaaacctgattccaaaggcatattggagaaagatatagatgaccagttggatttttcagcagatggtagtggtgatggtgaactaagagaaggtagatatttcaaagaaaaccgcctttattttttaatatgtttgctctgttataagtttttctatttgaagttgaacacaaaaggttttagtgatgtatttagaccaactatgagtggtaaatttgacttggctgtttccagagcattttacgaaagaggtgctctggatattttttttgcctagcaaatatggcattcattgttttgatataacttcattggcaaggtttcatggaatatttgggatcatgagttctctgtttgtgatacctactcaaccgagcaaacccttgatctgatccagatacataattgactcttaacaagatgagcctgtttacttctgttgtctatgcattttctccagacatgctggaagttctctgctgtctagtctggaacatatttgttaaccaatcatttctttaacagagaacatagatgtcactaccagtgagacgcttgagactgttctgagcaataaggttttggacagggaaacacctgtgggttccgatgatgtgcttagttctccaacatgtgcacaacccagtttgcaaatcgaccaaagtaaaagcttagtgactttcgctgcttctgttgaagcctgccttggcactaaacaggaaaacaccaaacttaccaattctcctgtgcatgacacaaagagtacttactcatcctcggtaagcgcttctccttgtgtacatattattctgtaatatataattattttctgttcttgctctctctaaaggttattagtaatgttgtatcatccattgtagtgtcccacaggacgtgtatcattcaagttgtacgattggaatcctgctgaatttcctcgacgcttacgccaccaagtatataaccaggctctaagtttctcaatagcacgctgttttcatgcccaaaagattgttctgaactcaatgccatacgtaaaatatgcagatatttgagtggctttctagcatgcctgttgaactggagggctatattcgtcctggttgtacaattttaactgtatttgttgcaatgccacaacatatgtgggacaaggtatggatgcttgtactaaaatgccaaatcattacttagtccaaaggaggacatttttttggatgcatccaaatgaagacctaccaaatattggtctttcaattccatgtccatgttttacagttcaaacaattttgagctgctaatttttataccacatccagttcaaaatatatatctctatggtatgcaaatgtatttttaccacttatgaacaattacatagttgtggagtgtaatgagtgcccacttgtggcatgtaaagtgtaattagaatttcccacaaagtgaactgaatggacttgttgtatggaagtcaataatactattttttttcttttacaagatagcatttatatctgcatttctttacagttatccgaagacacaggaaatcttgtcaaaagcttggtaaatgctccaaatagtctcctgttgggtaaaggggccttctttatccatgtcaataatatgatatttcaagtattgaaaggtgtgtaccacatgtcctgtttttccatgacgtgataacaacataaccttcttgtttatacatcatatatttgtacttaagctgcattgttcctgcataagagacactatacagtagattgataccaatcatagcctcactactacaattactatctgcagtttcagtatcacttgcaaaatcaatattagttgcatacgctaaattcgatgcataattttgaacttgtatcatttaattgctagcttattatatcttttgtttttatgagataattaccttacctgattgagaatattaactgctgtacttcagatggtgcaacattgaccagtaccagattagaggtacagtccccgaggattcactatgttcatccatcatggtttgaagcaggaaagcccatcgatcttattctttgtggaagttctcttgatcagcctaaattcaggtatgacagttccttgtaccttctacctgtttctgctggttattcttctgtcaggatacattatgttcagtttagctatggtgatatattcatatcattacctgagagatactatatctcaacgcagatcctgtaggaataagtcttggtcttggtcttgtggtgctttttcttgctttttagctctaggacagcatctctactttcagtttggatgctctaggacagctaggacagcagtttgttgagatgctctaggacagtttgttgggatgctctaggacagcacccacttgccctagcatggctgctacaagcagctataaatatgtatccaatcctctttgggaggatatggcttttgagtttgtgaatgaagaaaaccagaaaattgccccactctgagtgccatcctcttctcaatgagagtaaccattgaaattcgaacagaaccttgatgccacctttccattgtctatgaaatggagttcaaccattaaattttattgcaaatattttatagaagctaatatgaataaaaaaggttgcccatggtgacaatagtttcttactatagagggggagtagtgaatttttggaaaggtgttgattcaggaggtgttctttatttgtctatctgtgcatgcttgattttgatgtttttaacaatacaagcaagtggggagggggaaaggatgattaaaaccattctttagatgcccttggttgcgttgtaactctctcagtgatagaatgcccttggttgcgttgtaactctctcagtgatggctacaatcgtatttttgcctattccctcagcttggagaaataactaaatgaatatgagtgcaatgtgatatccagtacgcaatttatttcattttttgatcatgttccatgcacaaacttgctaggcgtcagtggttactgcatgaaatagaagtagtggctaaccaatgataacatgaaaccgcattagtggatcaggaagattttagtatggtcatactctgtgtgttaacttctattttatggattgtattttgagtaaagtccatcactggtccctacacttgtaccgttgtgtcattccggtccctaaactcgcaaatcgatcgttcaggtcctcaaacttgttcgactgtgtcataccggtccctaaacttgtagatcacttgtttaggtcctatccaacttgttcagttgtgtcaccccggtccctaaacttggatttgaatatcatcttggtcaaataggacggtctaaagactttatatttaaaaataattcataactttttcatgtgaactctaatgaagacaaactttatatcaaacttgtagccctcgacgcgatctacaactttgtagttgatttcgtgatctacaactttgtagttgatttttttttattttaagtcactttttgtcccaaaatgtaattttaaaattaaaatttcaaaatctataaacatgcaacaatattttgggacactaaacagttttaattcaaaaaattttcaactacaaagttgtaggtcgcgtcgagggctacaattttcatataaagtttgtcttcattagagttcacatgaaaaatttatgaattattttttgatgtaaagtttttagaccgtcctgtttagggaccagagtgacacaagtgaacaagtttgaggaccgtgatctgtaagtttacggaccgggatgacacagtcgaacaagtttgaggacctgaacagtcgatttgtgagtttagggaccgtgatgacacaacgttacaagtttagggaccggtgatagactttactcttgtatttttcccatttataacttaattgcgccatgacagccatggttcatgggtatttgtttaagtatccagaaattgaatccacacagagatctctcgcttgtgtggattatgctgcagttgcaacaatggctgtggctgcagctacagtacaagcagcacagattatgctgcagttgcggcaatctcttcccaacatccccatagtctataaccttattcttgtagacaagttctttcttagccggcagctgtctatgctcttgctaggtgttttgaatgccttacaggtgttttgagtacctctgaatatttgtaatcatggcaggtcacttgtgtcatttgatggactgtacttgaagcatgattgtcgccgtatactgtcacatgagacctttgattgtattggaagtggggaacatatacttgattctcaacatgaaatattccggataaatattaccacatcaaagctggatactcatggacccgcatttgtggaagtaagtatctgttacctttgactaaaccggtaaaattctctttcagggtctgcatattaatttacaccttttttttctctattgacaccaatttagcttgcacacaattggcttcaatgctttctattgtctagggcacgtagtgattagtgtgcttaagtttgtgtaatgctctgtacagtattggttcttggccacttcacaaaattgattgagatctttttaggcagcttaagtgtgaaccatctgaaatagtgtgttattttagtagaatctagaatgaacaatcaatgcacataagcaatcatttgctctgtgcactgtaatgtagaatgtgaacttgccaaatgttctgcaaacatatgatttgtatgcaattagccaaaaaaggtgttcgtgcaaaaaggacaaaaaatattttcaaaatatgaccaaatagttgacagaccacacttatttttgaaatcaagttgtcaccctttgacatttctgtagttctatatgatgaccgcagttctatgattttattttgcaggtggaaaacatgtttgggctatcaaattttgttcctatccttgttggtagcaagcatttatgttctgaactagagcagatacatgatgctctgtgtggttcttcggacataagttctgatccttgtgagcttcgaggacttcgacagactgcaatgttgggattcctcatcgacattggatggctaataaggaagccatccatagatgaatttcaaaacctactgagtttagcaaatatccagagatggatatgcatgatgaaattcctgatacagaacgattttatcaatgttctggaaataatagtgaactcgttggacaacatcatagggtcagagcttctttctaacttggaaaagggtagactggaaaatcatgtaacagaatttcttgggtatgtaagcgaagctcgaaacattgttgataatagacctaaatatgacaagcagagacaggttgatacaagatgggcaggtgattatgctccaaaccagccaaagttgggcatttctgtgccacttgctgaagtaagtgatcgtgttacacgctaattatcaatgacaatgaaagtgacactattcttcatattgctctcagccttttctaattgacatatataaattaatagaactagaaaacctagcttcatgctctagtaaaaaagttgtcaggatgatatttggcttgaaactggcattccacacatgcaagtccgtgtacaaaatatgtatgtctctgagtttttgtttgctagagttattagttattatatgccctttttattgtgaagtttctttttctactggttcatatttggtaatggaccttgcaaaaaaaatctggtaaaggaaaaagctatactacaaataaataattcgttacattttttttacaaaccctgatgtggcacgctattattgaatcttgattttataacttccaactaattaaattgaaatatcgagaactttgttagtaagaatttattagtatgtatagcactacttttcgccataatttattagtatgtatccacaattcatccgatcgttagcatctctcgtttgattcaagatcttaatcctgattacttttgagttcggattagctttttttcactgttgattgaatcctgggagttgtatgggagggaccctggctttatgaagtgttaaaacgacataacaacattagtgttgcatttacactttatttgttttctttttgtatcgcatacttttgtctccttatgtctggcagactactgaagtgtttggaacctttctgcagagtactggaaccagtggagaacatgatttgcactcaaccaatgcagcttctggagaggaggaaaatatgcctctagtgactaaagctctcccacacaggcaatgctgtcaccctgagactagtgctagatggcttaacgctgcctccattggtgcttttccaggtggtgccatgagaatgcgtcttgccaccactgtggtaattggtgctgtggtatgttttgcagcttgtgttgtccttttccacccacacagagtaggggtgcttgccgcgccagtaaagaggtacttgtctaggaactactcatcatagttgaagctagattagattaaccttcctgttgcttttcccctgtatcatatgcatgtacctttctaatttgaggcttagcttgtgcatccgatgttcaaatatttgtaagaggacccacaggcataaatgcaaatttttgcagctttttttggc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
