Os05g0481100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0481100

Description

Protein kinase-like domain containing protein

Version

NM_001187539.1 GI:297724208 GeneID:9272054

Length

8970 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0481100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:23700563..23709532

Sequence Coding Region

23701701..23701797,23702673..23702817,23703352..23703423,23703680..23703751,23703886..23704029
,23704115..23704186,23704284..23704355,23704453..23704527,23704611..23704679
,23705063..23705131,23705199..23705270,23705794..23705880,23705975..23706046
,23706374..23706870,23707290..23707442,23707642..23707925,23708014..23708065
,23708285..23708535,23708614..23708748,23709017..23709385

Expression

GEO Profiles:Os05g0481100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:23700563..23709532 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:23700563..23709532 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgatcaatttcggaggagtactctgtgcagttacccttgtggtgttgctccccttcttagaggctgcagatggaaaatctactgatccttcagaagtcagtgcacttatggctatcaagggaagcttagttgatcctatgaacaacctcaagaattggaataggggagatccatgcacaaaaaattggacaggggtcttctgccatgatttgggtgatacatatcttcatgtaacagaactgcaactgtttaggaggaacctctctggaaatttggtaccagaggtcagtcttttatctcagctgaaaatattggattttatgtggaacaatttaacaggcaacatcccaaaagagataggcaatatcactacgctcaaacttatattattaaatggaaatcagctctctggtcttttaccagatgagattggcaaccttcaaagcttaacaaggttacaggttgaccaaaaccatctatccggcgcaatacctaaatcatttgccaacttaagaagtgtgaagcatcttcacatgaataataattcattaagtgggcaaatcccgtccgaattgtccagactgaatacacttttgcacctccttgttgataacaacaatttgtctgggcctcttcctccagaactagctgcggcaaaaagcttgaaaatacttcaggctgacaataataacttcagcgggagttccatccctactctgtattacaacatgtccggactatttaaactgagtcttcgaaactgcagtttgcagggtgctattcctgatctgagtgccatacctcaactggactatttggatcttagctggaaccagctgacaggatctatcccaactaataagcttgcttcaaatatcactacaattgatttgtcacataacatgcttaatggaactattccatcgaacttttcagggcttccttatcttcagctattgtcacttaaaaataatcttttagatggttctgttccctcggaaatttgggctggcgtcaaccctaacagaaacggaagccttgtactggacttccaaaataattctctcaatatgcttccagctgaaattagtcctcctccaccaaatgttactgtcgtgttatatggaaatcctatatgtgagaattctagtgaaactctgataatcaacctttgccgcctccagtcaataaacctggaaaaatctaaacaggaaacaagcactgccatggtttgtggagcttgcccgacagaaaaaaattatgagtacaatccttcattctcggaccaatgtttttgtgcggtgccacttggagttggacttcggttgaagagtccaggagtcacagactttcatccatacgaaaatgctttcaagattgacctaacttctttgttgcagttgtttccttaccagctatatattgagaactacatatgggaagttggtccaaggctaaatatgcacctaaagttatttccaagcaatacaagtttgttcaacatgtctgaggttgtccgactcagacacgtacttgctggatgggaaattacacttttagatgtatttggtccatatgagcttctcaatttcacacttggttcctatgaagatgaatatccaaatctagcttcatcaggtttaagcaaagctgcactgggtggtatcttggcaagcacaatagctagtgctattgcactttctgcagtagttactgctcttataatgagaaggaattcaagaactaatagaatttcaagacgttcattgtcgagattttctgtcaaaattgatggggtcagatgcttcacatatgaagaaatgacttctgctacaaataattttgatatgtcagctcaagttggtcaaggaggttatggaatagtctataaaggaattctagctgatggaacaattgttgcaatcaaaagggcacacgaggattctcttcaaggttcaacagagttttgcacagaaatagagctgttgtctagattgcatcatcgcaatctggttgcgttggttggttactgtgatgaagaaaatgaacagatgctagtttatgaattcatgccgaatggcactttacgtgatcatctttctggaaagtccaaaccacctctcggttttggtttgaggctgcacattgcattgggtgcttcaaagggaattctgtatctccacaccgatgcagatcctcctatatttcaccgtgatgttaaggccagcaatattttgttggattctaaatatgtcgccaaggtagctgacttcggtctttcgaggcttgctccagtaccagatgttgaaggggctttaccagctcatgtctccaccgttgttaagggcacccctgggtatcttgatccagaatacttcctaactcataaattgacggataaaagtgatgtgtacagccttggggttgtttttcttgaattgttgaccgggatgaagcctattgagcatggtaaaaacatagtgagagaggtaaaaaaagcttaccgatcaggcaatatatctgaaatcatggatacccggatgggcttgtgttctccagagtgtgtggatagcttcctccaacttgcaatgaagtgctctcgggatgagactgacgctcggccatccatgacagagattgttagagaacttgagctcatcttgaagataatgccagagggtgatcttatccagctggaaactccacagacatactcaggacgtgctatgagcaaggaccctatgagtaaatctacatcaaattcaacaaatgggaattacttggcctcatctcaaacttttactagtgttgatgcaagtagtagcggcgtgctttctgggatggtgagtcctcggtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MINFGGVLCAVTLVVLLPFLEAADGKSTDPSEVSALMAIKGSLV DPMNNLKNWNRGDPCTKNWTGVFCHDLGDTYLHVTELQLFRRNLSGNLVPEVSLLSQL KILDFMWNNLTGNIPKEIGNITTLKLILLNGNQLSGLLPDEIGNLQSLTRLQVDQNHL SGAIPKSFANLRSVKHLHMNNNSLSGQIPSELSRLNTLLHLLVDNNNLSGPLPPELAA AKSLKILQADNNNFSGSSIPTLYYNMSGLFKLSLRNCSLQGAIPDLSAIPQLDYLDLS WNQLTGSIPTNKLASNITTIDLSHNMLNGTIPSNFSGLPYLQLLSLKNNLLDGSVPSE IWAGVNPNRNGSLVLDFQNNSLNMLPAEISPPPPNVTVVLYGNPICENSSETLIINLC RLQSINLEKSKQETSTAMVCGACPTEKNYEYNPSFSDQCFCAVPLGVGLRLKSPGVTD FHPYENAFKIDLTSLLQLFPYQLYIENYIWEVGPRLNMHLKLFPSNTSLFNMSEVVRL RHVLAGWEITLLDVFGPYELLNFTLGSYEDEYPNLASSGLSKAALGGILASTIASAIA LSAVVTALIMRRNSRTNRISRRSLSRFSVKIDGVRCFTYEEMTSATNNFDMSAQVGQG GYGIVYKGILADGTIVAIKRAHEDSLQGSTEFCTEIELLSRLHHRNLVALVGYCDEEN EQMLVYEFMPNGTLRDHLSGKSKPPLGFGLRLHIALGASKGILYLHTDADPPIFHRDV KASNILLDSKYVAKVADFGLSRLAPVPDVEGALPAHVSTVVKGTPGYLDPEYFLTHKL TDKSDVYSLGVVFLELLTGMKPIEHGKNIVREVKKAYRSGNISEIMDTRMGLCSPECV DSFLQLAMKCSRDETDARPSMTEIVRELELILKIMPEGDLIQLETPQTYSGRAMSKDP MSKSTSNSTNGNYLASSQTFTSVDASSSGVLSGMVSPR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1139..1235#2111..2255#2790..2861#3118..3189#3324..3467#3553..3624#3722..3793#3891..3965#4049..4117#4501..4569#4637..4708#5232..5318#5413..5484#5812..6308#6728..6880#7080..7363#7452..7503#7723..7973#8052..8186#8455..8823#acttccacggcgccaaccgccaacccactccctcactcctccgcactaattcctcgcctctacaatctccttctcctcttccgctcgcgctcgcgctcgcggcggctactatgacgcagctcaggcgatccacctcgcggagcgcggagtggatataggataggatcgaggcggatcggaggaaggaggaggaatcctgggttggcttgattccccgccccagttcgagtgagcttccggagtttaatttggggtagtgttcttcttcgcaacaaggtatattctccccgcttgaatcatgggggcgcgtttgcctgtgtgtgagttttttttttttgtgaatttttcggtggttcggttggattattctcagccacattttaccacaggaatttgctggggttttggcgttccttcctcttttatataggagtagtagtcgacaggtcccatctcgagttttcatcctgatttgatgggattttcggcatttctcgcgatttttttgcacttgttgagttggtactagtacaaaagtaggagtactactactagctagtagctgccgctgcatgcatctgcggagtttagttgggacgtcgtggttgcgaattaggatggtgttactgtcaggtttcgttggcctgatgttgctgagtggcagatgtgttatttgtctctagtttgattgattttgatcgcacagagccattgcttgagcacaaaagcgactagctaggcaggttgttagaggcagaagaagtaggtacaagtaaacgatacaaatggggtgatcttcttttctgaagaactttcatgtcacttgcatactgttaccgtcaaatttggccatctgtttcagttttcattgatccaactttcattaagcaacggagtatagagaaccggagtgatttgttttcttgatattggggaattttctgaaccccatgtaccaaactgggcatgcatatgcaaacacccaaaacctcgtgcttcaaaaagaggaataaatgatatctaacatcataaacaatggtggtattcataaactcttcttttttcctagttaggatcctgaaattttggaattttgctgtcgtggatatgactagttgctgctgattatcttgaagacatgatcaatttcggaggagtactctgtgcagttacccttgtggtgttgctccccttcttagaggctgcagatggaaaatctactgatccttcagaaggtaatctttgcaagcgtattcttcactatgagccaaatcattctttgcaagcatattcttcatgctgagccaaacctgggctgggtcatattaagctggttttgaactaacacgttctcctgatcacaaattcctcattatatgttgacacatggggtaggcttaggtttggactaggccttggggcaagacatgcttgattagttgattggaccattttaaactggcttttgaaccaatattctcttatgatatctctgtaattacatcaacttttagtttcttatttgcacaatactccgttcatttctagatgggtgcttcagtgttctcccactattgattctgtaagacagtgggagtaatttgtttatgcccttgaaaaacaacaaaccagaaattgtacttcatggattacaaacataccggaactctggtctaatgaaaacatgcaagaattctattttatgcctgctgtgatgccagagtccatttctagtaactgaagtaggtattttttgacgacaatgagccgaacatagtatttgtggctatacagttttcctactaggtaggtatttgtaaatcataccctaccagttagtatgtttgtctaacagagaatgatattatacacagctcttatttgaaaaatgaaataaagagttgcaaaaatgtatgctaacgttgtaaatgaaataattctctcataggatttgtaaaaaatagtttgttatctcttgtgctcgataaccactttctatcaacagactatgagatgtttaatgccaacagtattttacattgagtttctttagttaaaagttctaaaatatttgctgcaaaatatatgttgtttttctccctatatgcagtcagtgcacttatggctatcaagggaagcttagttgatcctatgaacaacctcaagaattggaataggggagatccatgcacaaaaaattggacaggggtcttctgccatgatttgggtgatacatatcttcatgtaacagaactgtatgaccaatacttctacataatttatttgccatatcctcactttcagtttggttgtcataataggaactatgaatgctagtggtcatagaaaacggttctatagttaaatgctgatgactatgttttccatagctgattaggaattacaaatttctgatgcatgattaattgtataatctattaaagaaataaatagttgatgtcttacaagtgtcttattgccatactaaacatttgaagcatactgaattgaagtgttatatttagtctttattattgaatggtggcaatgtggcatgatgctacatttactggtaactatgcatctcgtttgatagtaataatatgtcccaccatgttaccgcagggaacctcagtcctgtctgtacgaggccccttttttaaaaaaaaaattctaagcattgttggagcagccttttgaagcttttctttgcttgaaatattcgataagggcatacagttccagtaaatttcaatctgttgctgattatattattttgctccatgtaggcaactgtttaggaggaacctctctggaaatttggtaccagaggtcagtcttttatctcagctgaaaatattgtaagtatactctaatgactgaagattttattttttgtaagttctgcattcattaaatattaatccttagtactatcttcatatcactatattttccataaaataaattaatggtgtcttcctggataaaagattagccttcatcttttacttgctgaaaaattactaaagaaaatactaattgatcagcatatagttgatttttttgcatcaatctcttataccatatattaacttattgctgtttctcttgaagggattttatgtggaacaatttaacaggcaacatcccaaaagagataggcaatatcactacgctcaaacttatgtatgtattctctttcaattaattctacacccctcttcaatatgcacagaaaacaacggaactccttaattaaattatttgctatttttcttatatctaccaatactttactctttttttcatgctttatgtagattattaaatggaaatcagctctctggtcttttaccagatgagattggcaaccttcaaagcttaacaaggttacaggttgaccaaaaccatctatccggcgcaatacctaaatcatttgccaacttaagaagtgtgaagcatctgtaaggattgttcatttccattttgttcctgctttgttcttcaatctgaattcagtgctagactcaatttcccctttcatttcagtcacatgaataataattcattaagtgggcaaatcccgtccgaattgtccagactgaatacacttttgcacctgtaagtggaagcctattggttgcatttttttctaatgcatgttgtatcaggtaacatggaattaatcttattatatactctaactaaaactttgcagccttgttgataacaacaatttgtctgggcctcttcctccagaactagctgcggcaaaaagcttgaaaatactgtatgtatccattgtcaattgtcaaactcaattgaaaatagcttgctatgatagcatacacctgtttcttatattcgtattttttttctgtttctagtcaggctgacaataataacttcagcgggagttccatccctactctgtattacaacatgtccggactatttaaactgtgagcactatatgttctctctctactatatatgtctaaatactgtgttgttatgctgaggataatatttcttgtcacatcaggagtcttcgaaactgcagtttgcagggtgctattcctgatctgagtgccatacctcaactggactatttgtgagtacagtaaaaatcatgccgaaagtactaccatcttaattttgcaatcaatatatcttaacatcattatcaatttatcactgattgctacttcaaatatggcacttaatgctccctatttctgacagttgctctgtggttaaattggtaatttccttcaaaaaagaagtttagaataattttcttaaagataacgggaatggcttacatctctagcctctgttgttaggcacaaccaattagttttgttgaagaaatttagagttatagttttcttccaaaaagaaagatttcttaacaatgtgcaaccatttctctagaacatgagctcatgagataaatctatagatgtctaaactaatcctcacatgcattttcagggatcttagctggaaccagctgacaggatctatcccaactaataagcttgcttcaaatatcactacaatgtatgcagcttttataatttttatttctgttctttaatcattgagctgatttctaattttctggcagtgatttgtcacataacatgcttaatggaactattccatcgaacttttcagggcttccttatcttcagctattgtaagttgtaacatttagctttgttaaatcttgctccagatagctttgtgttcgatcagaattttttttttgcacctacttcttcttattccaaataaaaatcacagacctgtgtgttctctctctcaaatagaaaagaatgtattttagttttttctttaatggaaaggcagcagctctgtcagttttacttagatgagggggggggggggggactgagcaacgagcaggcagatcaccaaagaggatagcaaatttaaagaggtgctcgcatgtgatcaacctggtggtttgggggaatttgattttaaaaatttcttctgttcttctcatgcattttacattatttcttatttattacatacaaacttgaggttatatcagttcttgctggtgcatattgtgatccactcattattgcttacaatttccactcgttttgacataacacaaattaaaccctctatgaacttttttttaaaaacaatgcatttaaaaacatgtcaatgttgcaaatttgcaggtcacttaaaaataatcttttagatggttctgttccctcggaaatttgggctggcgtcaaccctaacagaaacggaagccttgtactgtatgattctttttgggaatatatatatatattttttcatcttgttctaagttctgacaataacatatatttgacatggttgtcaattgtgcagggacttccaaaataattctctcaatatgcttccagctgaaattagtcctcctccaccaaatgttactgtcgtgtacgttcctacatatatgcaatacactatcaatctacattcctgcataaaaattctgtgttgcggatggatatttaactgtgagcacgcaagtttcgcagttaatttccattttgatgattaacaccatttcatttatttaaagcaagcttatactgcttatataacagttttcaggctacactattcttatttgagaatggacatcataaccaaaaacagtttattcatcatcgtattatgagtgaaaatctggactataactgaatattgcttacataaaatactcagttcttatagttgtcacaaccaatgttatttgtgcaggttatatggaaatcctatatgtgagaattctagtgaaactctgataatcaacctttgccgcctccagtcaataaacctggaaaaatctaaacaggaaacaagcactgccatggtttgtggagcttgcccgacagaaaaaaattatgagtacaatccttcattctcggaccaatgtttttgtgcggtgccacttggagttggacttcggttgaagagtccaggagtcacagactttcatccatacgaaaatgctttcaagattgacctaacttctttgttgcagttgtttccttaccagctatatattgagaactacatatgggaagttggtccaaggctaaatatgcacctaaagttatttccaagcaatacaagtttgttcaacatgtctgaggttgtccgactcagacacgtacttgctggatgggaaattacacttttagatgtatttggtccatatgagcttctcaatttcacacttggttcctatgaagatggtatatacacttgaagctaaagtgtataaaactagttttgcgatgaaactcctcgttttaacttattaaggataaattggaatttgttttgcacatttttttctgaaattttttttgatggatcatttaaacaaagattgatcgtatctcagctgtacacagtgactaattactaatggaatacaagtctgtactatttaatgttcattaccaaaatgttagtgtatgaatgttcattaagattattgtacaaggtaaataagtaatcatcgtatttatatttttaacacatatattgaataacaaccaaagtttttattttttttaacctgtggttcaactgcggttctctgccttttccggttgctctcttctgattactaatatagtatatctgtttttcgtttttttttctgtagaatatccaaatctagcttcatcaggtttaagcaaagctgcactgggtggtatcttggcaagcacaatagctagtgctattgcactttctgcagtagttactgctcttataatgagaaggaattcaagaactaatagaatttcaagacgttcatgtaagtcattgtaagaagtaagctatcattacattgcattccaagcggtcatggatgtatgtactttgtggcactcctgttatcttcataattgttcttttgctccatgctaattgaatatctgattgtgcaaggcaatttttgtcttgatttttcaagagaaaaaacatgaaaatatatgtcatattaccatttgcagtgtcgagattttctgtcaaaattgatggggtcagatgcttcacatatgaagaaatgacttctgctacaaataattttgatatgtcagctcaagttggtcaaggaggttatggaatagtctataaaggaattctagctgatggaacaattgttgcaatcaaaagggcacacgaggattctcttcaaggttcaacagagttttgcacagaaatagagctgttgtctagattgcatcatcgcaatctggttgcgttggttggttactgtgatgaagaaaatgaacaggtgcatctctttgattttatttatttgtgtggaaataatattctggcaaaatcatcctgataagataaaaattgtgttttttttacagatgctagtttatgaattcatgccgaatggcactttacgtgatcatctttctggtaagcacatggctagttcttttatcccactgatctactgcaatcctgaactgactcctatggctttgatatcaagatcagccattcagttgtcagtttactgaatcttatagttgatgtgccttcttgaacctgcttatagtgaattgtgtaatactttgttctgttgccaatatccttgttctacttcaatctcctcgttttatttttcaatcgcaggaaagtccaaaccacctctcggttttggtttgaggctgcacattgcattgggtgcttcaaagggaattctgtatctccacaccgatgcagatcctcctatatttcaccgtgatgttaaggccagcaatattttgttggattctaaatatgtcgccaaggtagctgacttcggtctttcgaggcttgctccagtaccagatgttgaaggggctttaccagctcatgtctccaccgttgttaagggcacccctgtaagtactagttgcacacggttgttctttctcttttacagctatactatactaactatatccttgttactttggcaggggtatcttgatccagaatacttcctaactcataaattgacggataaaagtgatgtgtacagccttggggttgtttttcttgaattgttgaccgggatgaagcctattgagcatggtaaaaacatagtgagagaggtacacgctcttcaactttgagtaatacgttcagttaactgttgtaaaccaactgaaaacatatacaaaaccgaagtcttttcttttttattgaggaaaaatggttttgtaatcagttaaactttatgaggagaacatcagttgttcttaacctggttgtttgcttccttggaaaaaaaaaacaaattgttcagcgtatacaagtcgaaattaaatgacaacagtttagtagtttaatgaaagaactacatttttgctttttctgcaggtaaaaaaagcttaccgatcaggcaatatatctgaaatcatggatacccggatgggcttgtgttctccagagtgtgtggatagcttcctccaacttgcaatgaagtgctctcgggatgagactgacgctcggccatccatgacagagattgttagagaacttgagctcatcttgaagataatgccagagggtgatcttatccagctggaaactccacagacatactcaggacgtgctatgagcaaggaccctatgagtaaatctacatcaaattcaacaaatgggaattacttggcctcatctcaaacttttactagtgttgatgcaagtagtagcggcgtgctttctgggatggtgagtcctcggtaatgttatggtagttctaaacatgcagcaatactctgtaatattatggacttcacactttcatttgtcaatgaaccagccagccttgctggaaaatgcaatacatgatagtaacaattgataatgcaagaaaaatgtaaatgttcgtcg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0481100, RefSeq:Os05g0481100