Os05g0486300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0486300

Description

NOT2/NOT3/NOT5 domain containing protein

Version

NM_001062414.1 GI:115464558 GeneID:4339144

Length

10532 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0486300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:23959020..23969551

Sequence Coding Region

23967301..23967366,23967457..23967531,23967736..23968281,23968390..23968442,23968513..23968554
,23968664..23968808,23968891..23969001,23969119..23969130

Expression

GEO Profiles:Os05g0486300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggagttgcatcgcaaggatcatcttcctaagaatgcaaatattatgcaagcacaacattatcctatgggcaaatcatctggctttaacacgggcagcagttgtccaccccgtaaacaacataagcagacagctaattcggttcaaaatactgggcctgaaaatgttggaccaaagccagtaaattctccaaggttgcctttaaatccgaggcctcgtgaacaagttatccagcaaaatcatgaaccacaggctcagaagtcagttaggctgcagtcatcttccggcccagagtctcacaaggttcagagtcccaagtcttctcagagaactgataccacaccagagtcttacaaggttcagagtcccaagccttctcagagaaccgataccgcaccagagtctcacaaggttcagagtcccaagtcttctcagagaactgataccgcaccggatccatatgatccatatggcttacatggactactgagggtaatgaagttgaaagaggagggaccggcatctcttgctttagggattgatttgacaacactagggttggatatgaactcttcagataatctttacaagacatttggctctccttggtcaagtgagccagttaaagaagagtattcttatgaaattccggattgctactcttctatgcagcctccacccctgcaagcgttgcattttctgaggtttcacctcatgacactattctacatcttctacagtatgccacaggatgcagctcagttatatgccgcgaatgaaatatgcaaatacgggtgggtttaccacaaagagctgcgtcagtgggttaaaagagctcctaatacgacccctctcgtcaaaactacaacttatgaacaaggactctgctatctttttgatgccaacatttgggatgcaattcctaaggacaactttattctccgttatgacgatatcgagaagatacctgcccttcctccccttcttcctgccacccaaaatcctgccacccaaaatggtagtgtaagaataaacaagccattgcagtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MELHRKDHLPKNANIMQAQHYPMGKSSGFNTGSSCPPRKQHKQT ANSVQNTGPENVGPKPVNSPRLPLNPRPREQVIQQNHEPQAQKSVRLQSSSGPESHKV QSPKSSQRTDTTPESYKVQSPKPSQRTDTAPESHKVQSPKSSQRTDTAPDPYDPYGLH GLLRVMKLKEEGPASLALGIDLTTLGLDMNSSDNLYKTFGSPWSSEPVKEEYSYEIPD CYSSMQPPPLQALHFLRFHLMTLFYIFYSMPQDAAQLYAANEICKYGWVYHKELRQWV KRAPNTTPLVKTTTYEQGLCYLFDANIWDAIPKDNFILRYDDIEKIPALPPLLPATQN PATQNGSVRINKPLQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8282..8347#8438..8512#8717..9262#9371..9423#9494..9535#9645..9789#9872..9982#10100..10111#gcgacagagagatcctcgcctcccgccgctaactctcggtctcgccatcgccaaaactcagattaggtcggtggccgcgccgctgctcaccggcggatggatcttgtgtcatctcgattcgcagccgacggcgtgttcgtcccggcccaggggaatagtttccagtcgtgcatcgtgcttggattttttttcttttttggggggagttgggagtttgatttagcggcggcctttcctgcattcgaattagagagatgcttgggccattggcgttggagtttccagcctgggtgatctgaatgaacccaatctgcagaatgttctctccctttccggttgccccgggggagggattgatggaatgggatagggtggggggctttattctgatgattttgaatgaactcaagccacagaatgttctacaggtctcaaattattctgttggtctatcgggtagtcttcgatgctgtatgtaattccagttaggctccggtttgagattatttttttcttgcagtaaattggtaggtttcatgaactcctgctcagctgcggacgcgagcgtctgcgatttgatccaagctggggagctcaatcttcggagaacatggatatgcattgttctgttattctcgacaagccgacatcatcgttcttgttcaggggattgactgatggatcctgaaaaccccgatgtttttcgcaggtagctacctcaagagaattaagaatcctctcgtatggagctgtacatatatccactgaaagataattgtgcttctaacatcttcattgtttgtatgttttagtggcttaacaactcattggtatctgtttgtatgtcgtgttaaccatgcagatttattttgtactacaagtttgagattcagagttcatacactatagactatgggtgagtttgagaggaggggaaaagagaagattgggaagatacgcaaaacgaggtgagctattagtacatgattaattgagtataaactattttaaacttcaaaaatagattaatatgattttttaaagcaactttcatatagaaaatttttacaaaaaacacaccgttagtagttcgggaagcgtgcgcacggaaaatgaaacaaactaactcacaaactcctcctgccgaacgctccctatatgattcttggagaaaaggctttggagttcggacaatggtgcataactgcatatttcttaccttccaggggaagttagaagtgacactaaaccaactaaacaatgtgaggttgctttcttcaatactttttcttcctcttgctaatttaatgttccattagcatcatctcatgatagaaaaagaccacaaacagaccagtgtacaattttttttaatttgtatgccttaagttactgtcttataatggattcaaggtccttttaccttttaagaactcccctagagtctagccagaatggaccttccttttaatccaatatacaaaataattattataataatattcctatttgtgctgagtaatgcgtatctatatttattttgccaattaaatacggtttaggattgaaacaacacatgaattctgcattattttctactcttattggcatgcaagttaggtaactgagtaaaccgaccctatagttgtaccatgtaactgtactcgttaatgaatgagatttgaactacactaaactaaaacctatctgcacatggatggtcatgcttttgttcttactgctcaaaattggtgcctgtgggagaagcaattacatagaaaatctttctttacttggttgacttaaataaatcaaccccaaaactaagcaaccaaggtgatgttagaaattggttacaaaagaatggtgacctaccatagatttgcttcctcaagtagccttcatatttggtcaatgcatctgatcaagaaatcaatgggagagattataggtgtgcatgagatgatgtgctgatattgggccagtttggtagagctccaactcctaaatttagctccaggagttgggtctggagtggagttatggagctgcctaaacccagctccacctctctagttcattttgtgagagagagctccacccagctccgctcccatttttgttggagctgaaactgtttggctgagctccagctccagaagaggtggagctggagctggagctgtgccaaacagacccattgtatagttgaatgagggagaagaacctaaaatatttttattgggtggaaattttcttctcagttcgtagtgtgaatatagggtaggatttgttcaaactaaccaaagaaaactttatatctgtggcttaccttcataaaggtgctaactatagtaagggcctgacaactgagttttgtaggattttcacatgatacaagtcattataggatttggaatgtgcattctaaatatagccaaagaatgagctttgtacccatttgtgtatatctatacaagagactacaaattacaagtggcttattgttgataaaatttgatccaccagagtaatgtttgaatgcttacgtttaatatggtaatttccagtcccttttccttatttttgttcagtatgttgcaatacctatgagtgaaaaaagagcatgtgttattctgatgaaatttcattgtttcttgctgacccaccacctaattttggaagtcacttttggaaatttcgagtttgcatctcaagctcatccaaacatgttattggtttagtatcacatagctaattctactattcaggattatacatggaaggtccataaatacgtggcctcttgaggctagttggaacaccagcttattataaagctactcacaaaatgttaatcctagacttccatgggttgtgagttctagtctccagttatagtaggcctgtgtttgttcagtgttggtaattattactacctccgtttcaggttataagactttctagcattgcccacatttatataaatgttaatgaatctaggcacacatatatgtctatattcattaacatatatatgaatgtggacaatgctagaaagtcttataatatgaaacggaggaagtatttgtttcattttatatttctttcatttcaaattattttgtaagcattagcacttttgttttgccttctagtgatcaactactaagtataattttcgcctgtcaaattaggttgaattttagtcacatattctaaagtaccacttttaaacttgcttgcactcaccctcatttgggttttcggactggttgtaattcacctactctcattatggatctctattactttttctagaatttttccatcaacagttcattagtttgccatgcatgacatagtgcctatttgcaatataacgagcaatgtgatcacatgttccaacatatgtcaaacaaatatactaaagatctatagttaaaaaaccaacatataactatccacagttttataagttgtatacacaaccatctaaatcaaccaaatacctaaaaacacatgtagatagtgcattttttaggagaatactgccaggtgacagccaatagtcgcttttaactagtaatatgtccgttcattgcaactgaccatacgatggtggggtgtgggtctaacctaaagcatgggatacaactggtattttttaccatttgttttttatggttttcttggggaggtagtgactcgtgctgtgcgtcatgagggggagggcagacggacgactccacctctaagtagtagagattaagaggcaacaaggattactaaaaccacaatccttacaaagttcgtaaccagctaagactatatctttaagagtctcattcattctgcgaatatgctgaagaatatttttcctaatgagaaaatcagaaaaactgtgactgtgtgactgcgtgagaatggaggaagatgttgccaatagtggagtggtaggtcaggattgaggaggtgaggaggaggtgccaattgatgagggtacaaccaaccaagaggtgggatacaagatattttttttgacatgacgggatacaagatatcaccggtgaactgataatgaaaatgaggattaagtgttgccatggtggcaaaaggaacaataaagatgagaaagaagggcattcactagagcaaaaatgtattttgatgtatcaataggcaaataaagaagggaagttgagaaaggtggtcaatggattggagggcaattttgcaagggcaaaaagggacgaaatcaactttcaagggcaaataaggaatttactcaattttgtatgcttagcccctttcgataaattccttattcacccctaaaagtttgcatatcctcttatttgccccttaatctcacaatggcatgtgggttatgggcccacatgtcaaagagattagggggtaaatatgggattgaacttatgtgcctatggcaacaagggatagatgcggttttgttccataaaaggggttgaacccctatgcctagccgcaattcttggtcttttcacctctcaaccttctcaccaaagtaaacgctcaaggatgggcggccgcaaatctccatcaaagtcgacacaggtaatcctccctttccgccaactcctcaacgactgattttggtaattgttgttgtgatttggttggtacgcatgaggtttggtaggtagagatagtcggcaagtatgtactatactaggtaagacctcaattttccatttattcgggagtggtctacgttgacaagtatttaggattccccgtggaaaagcaattgaatactaatctagcggtaaaacgcatagatctagggttagggttagggatggcaattgggtgtgacgggcacgggtattggctacccatgcccacgcccgc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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0486300, RefSeq:Os05g0486300