Os05g0577900

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0577900

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001062945.1 GI:115465620 GeneID:4339704

Length

4875 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0577900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:28856547..28861421

Sequence Coding Region

28856694..28856862,28856945..28857017,28857466..28857547,28858118..28858208,28858285..28858361
,28858990..28859031,28859535..28859668,28859921..28860001,28860164..28860252
,28860413..28860496,28860593..28860646,28860764..28860804,28861013..28861160
,28861268..28861350

Expression

GEO Profiles:Os05g0577900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:28856547..28861421 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcggcggtacgacgagatgccgccggcgatggtgctggtgccgccgcccttcacatttcccgccgccgccgcccgcaccaggatggcggtgccggcgtacgaggtcatgttcgggaagctccagcggcggagcctgtttgacgattacttcgatcaagttgggagcataacctcagggatgattatgttgaggccactggttgattctcatgttgatttgaccgccaaaatgactacaacgggtggtgaggctctgtttcgctggcagagatatttggatgatccaaatacctttatggaccttcatttgtcaacaccaaaacccatggtgcagctgaggtcgtgtgcttactatcctaagtatcgaattggtgcatttggaacattccctttacttaaggcaaacagggactgttcagaaggagattatggtattatgggtttaagatatggttcagagaatctgtctattggggcatcctttctgccgtttgctttatctggtcaagtaccctacggtgcatggttagttggcaggaaagggaatataagcgcagggatacaatacaagccactctcaggtgaaagcatgcatcctgtgcctttgacagacttgaagaactggaattgtgcaattagttatggtatgggctcaactagcccactcagcccttcattcaatttttctctagagcttgtcagaaatacacagctagttgcatcgttctatcagcacttcgttgttcagagaagggtaatgaatccccgtgaagaagaacacattatcggaaccacgaactttgttgactttgggcttgagttagccacaagcttggataaagacaaggcgaaagaaaatgctagcaatccctcattccaggtagctgcaagttggcaggctagtaagaactttctagtaaagggaaagttaggtccctccaaatcttccatggctttggcaatgaaatcttggtggagaccattctttacatttagcttcacagctatgtatgatcatttgaaggggacaggatcatatggatttgggatttccattgaggatcttaaagagcccagttatcaaatggcttattcgaactatgtgattgtcacacaaaacaaagaggatgtggaaccccggtttttaaagaagctagggaagaagtacatatttcagccggacattgattcaggcaattatgacaatttgcctacagggttgaagccaatagacaagatattgtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRRYDEMPPAMVLVPPPFTFPAAAARTRMAVPAYEVMFGKLQRR SLFDDYFDQVGSITSGMIMLRPLVDSHVDLTAKMTTTGGEALFRWQRYLDDPNTFMDL HLSTPKPMVQLRSCAYYPKYRIGAFGTFPLLKANRDCSEGDYGIMGLRYGSENLSIGA SFLPFALSGQVPYGAWLVGRKGNISAGIQYKPLSGESMHPVPLTDLKNWNCAISYGMG STSPLSPSFNFSLELVRNTQLVASFYQHFVVQRRVMNPREEEHIIGTTNFVDFGLELA TSLDKDKAKENASNPSFQVAASWQASKNFLVKGKLGPSKSSMALAMKSWWRPFFTFSF TAMYDHLKGTGSYGFGISIEDLKEPSYQMAYSNYVIVTQNKEDVEPRFLKKLGKKYIF QPDIDSGNYDNLPTGLKPIDKIL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4560..4728#4405..4477#3875..3956#3214..3304#3061..3137#2391..2432#1754..1887#1421..1501#1170..1258#926..1009#776..829#618..658#262..409#72..154#ggacttatcagcagcggcggccgcttggttagtttggaagcgagatcgatttgcaggggaggaggagcacgatgcggcggtacgacgagatgccgccggcgatggtgctggtgccgccgcccttcacatttcccgccgccgccgcccgcaccaggtcaccaacatctccgcgatcttctactactcagattgcttgcattcatcgacgaatttggttgtcttttttatggagctgaagtgtggttggcattgtttgggcaggatggcggtgccggcgtacgaggtcatgttcgggaagctccagcggcggagcctgtttgacgattacttcgatcaagttgggagcataacctcagggatgattatgttgaggccactggttgattctcatgttgatttgaccgccaaagtatccattcgaacattgactttttttcgttttgttagcattgtgatgatctttgatctggttcctttttatttcggtgaaattttgtgcgaaacgtggattatcaataacgtttttttcttctctgtttgttatgatgtttttaccggtttttttttcctcctacgttattgcaatgtatttttttttcttaactcggctttactagatgactacaacgggtggtgaggctctgtttcgctggcagaggtggttattattgcatagtttactaaagcttcattatttccagatttctatgccactttgttactattctaagcatttactctaaacaaaaaatggctcaactgaattactttacagatatttggatgatccaaatacctttatggaccttcatttgtcaacaccaaaaccgtaagcattttcttgttggattgacatttatgttgaaacttatatcctaaatggtgcatagataatgttgatttcgcttataacttttttatccagcatggtgcagctgaggtcgtgtgcttactatcctaagtatcgaattggtgcatttggaacattccctttacttaaggcaaacaggtaggccatatcttgtttatggtcgcagatcatgcataggtgttatacttttccactatatgctaccaataattctgatattctcattattgatttctatcaatatgcattgaacccataaaaatgacatggttaaatttatttatttatttatttgtagggactgttcagaaggagattatggtattatgggtttaagatatggttcagagaatctgtctattggggcatcctttctgccgtttgcttgtatgtaattactcatagttctaattctaacttatttggacttggagaatgaaaataatatgcagccaagtagatcagctgtctcaattttaaatcaatatgtttaagtcaagctctaatgatattcttacatattgtcacaacataatattttctttgcagtatctggtcaagtaccctacggtgcatggttagttggcaggaaagggaatataagcgcagggatacaatacaagccactctgtgagtgcgagttactaaaccttaacggatcataggaagagtagcctaatgaaacttaagaattttcccccttatctctcatgagttttgaggcattacatatgcttatatgttaaaaagttgtcctttccttgcattcaaataaggccttcaaataattagatgttgatttccccttttataaacttttaaaagtttatggcattatgttgttgtatttgattctctctttttcattcataaatactctagcaggtgaaagcatgcatcctgtgcctttgacagacttgaagaactggaattgtgcaattagttatggtatgggctcaactagcccactcagcccttcattcaatttttctctagagcttgtcagaaatacacaggtttgccattattgttctcattatttgataacagagcttcacatagtttgtactatattgcagttgttaggatattttgacaagattatcgaaatagcatgtttttgatggataccttgtgcatgttattaaggcatcttttagttttagttctgccgcactaaaaatgtgactattcatgtcatcagtctcagtatatgtatgcacatgtgtttatacacaagaatttcatatccgcacgattatctatacctccatgttgaataacgaaacaccgaacaatgtcatgaaactatgggcctgatgtcttgtttcttcctaaccttgactctgttgggaaggaagcaatgatctattatctaaaataacaacaattatatttgttcgctgctaagaaaaacttgataacctgccgtaatttgatcttatctcaatctcaattgcaacaatatttatcttttgaatctcatgtgtgatgtcattttcttttccttgatgtgcagctagttgcatcgttctatcagcacttcgttgttcagagaagggtatggaatttttaatttagtctatgttccataaaaatgcttcatgttttctcaatttatttaaaggattacccattctgttgcgctcatcaatgtgctctaggttctagcagcatgttaaggattagcttatttgttttagcactattctttctaggatgaaatgtaaattgttgtatactgtgtgcacctgaccaaataatttccatccttttttggttcgatgcatattcagattataagatgtgcatgcaggtgcatttcaatggagaaagaagaatctgagatagcaatgccactttacatgttttcaaaatagataattttgcttactatattccctcgtgcatactgttttagtacccccccttttttttttgctttcattatctttgcacctctaggaagccattgcattgtgcactcttttcaaaaaaaaaattgcattgtgccattatgatacaactaaaaactatacaaaactgatattataggatataggacactaagttatgaagattcatgagttgaaacgctaagttattttatttattaatcattttaatgtaactaggacatattgaatcttgacaacaatctgcattgtgtatgtctaattgtctattaggtaatgaatccccgtgaagaagaacacattatcggaaccacgaactttgttgactttgggcttgagttagccacaaggtaaacataaaaattaagataattttctgaattacgcatcaattatattaactaatcccttttttttgagccttagcttggataaagacaaggcgaaagaaaatgctagcaatccctcattccaggtagctgcaagttggcaggctagtaagaactttctagtaaaggtcagttatttttcatatcatttatgcattaataaaataaaatttattagagaataccttaatggatgaaggaaatttcaaaaaatctattaaaaagaaaagaggcggctcacatgctacttggtggcaaagttttgtaggacttctctgctaaacatattttaaaattttcttttaaatttataataaactagcatattactcgtgcgttgcaatgagattttaattattaagttatcattaatgtgttattaccatctcttaattattgtacatatttgttactcacgtgtggatctttttagcttcacactctctcacaaaaagtagagagttggtggaagtagttgacatatgggtcctctaacccccatatgtcatctctttttcttaaaaaaatttgagagttgatagttaggtggtggtggtacccccactactcattttataaggattattgaatggttcacaactcacaaggtgtattgagagtaaagatgaaattaacccttatgcttaggttggtattttcatttatttgtggtgacactatttctattttctcaacagggaaagttaggtccctccaaatcttccatggctttggcaatgaaatcttggtggagaccattctttacatttagcttcacaggtttgtagaccttctaattttagctagcaacaattttatttgcaaggggaaagttatcacaacaagattcatggacacttcaacattaaattacgctttaaaagttctgtgttttttttaccctcacttaaatatctctttttgttcccctctattttggtttcaatgagaattttatgtttcccaatagggagatagaaattctcttttaatattagcaatttatatttgaaagattaacaatcgaagattcgtaatctaaatatccccacatacccccccttttgtttctcttacatcaagtgctatagtattcaagttttttctcaataagtaaaacctcatatttgggggtttgagatgctcatatattatatgtggctcgttataataggaaatgatgttgtttaaattgttcataatggctccataatatttctttttgcagctatgtatgatcatttgaaggggacaggatcatatggatttgggatttccattgaggatcttaaagagcccaggtttttttttatctaccacaagataatattgctaatatgttacaatattgataataatatttgctatcttattgggatgcagttatcaaatggcttattcgaactatgtgattgtcacacaaaacaaagaggatgtggaaccccggtttttaaagaagctagggaagaagtacatatttcagccggacattgattcaggcaattatgacaatttgcctacagggttgaagccaatagacaagatattgtaactatattccaatagacaagatattgtaatcatataatttccattctttggtgtaggaacttcaatatagcttaatgtctcgttttactttttttttaaaaaaaatacctgcatttttttctcatagtgaatattgtggcatttttct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0577900, RefSeq:Os05g0577900