Os04g0164900
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0164900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Starch debranching enzyme precursor |
| Version |
NM_001058664.1 GI:115457057 GeneID:4335042 |
| Length |
13104 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0164900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:4397539..4410642 |
| Sequence Coding Region |
4399980..4400163,4400564..4400654,4400779..4400872,4401109..4401204,4401839..4401979 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:4397539..4410642 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>TISVSPPITKHPGRIMETVMQDSAGIRHLRKLSAAGLTHVHLLP SFHFASVDDNKSNWKFVDEAQLAKLPPGSDEQQAAIVSIQQEDPYNWGYDPVLWGVPK GSYASNPDGPSRIIEYRQMVQALNRIGLRVVMDVVYNHLDSSGPFGVSSVLDKIVPGY YLRRNVNGQIENSAAMNNTASEHFMVDRLIVDDLLNWAINYKVDGFRFDLMGHIMKST MIRAKSAIRSLTRDVHGVDGSKIYLYGEGWDFGEVAQNKRGINASQINMSGTGIGSFN DRIRDSVNGGNPFGNPLQQGFSTGLFLEPNGYYQGNEADTRRELATYADHIQIGLAGN LKDYVLRTHTGEAKKGSDIYTFDGSPVGYTSSPVETINYVSAHDNETLFDIVSIKTPI GLSIDEKCRINHLASSMIALSQGIPFFHAGDEILRSKSLDRDSYNSGDWFNKLDFTYE TNNWGVGLPPRDKNEENWHLIKPRLENPSFRPLKNHILSVFDNFVDILKIRYSSPLFR LSTASDIEQRVRFHNTGPSMVPGVIVMSIKDAQNEKCKMAQLDKNFSYVVTIFNVCPH EVSIEIHDLASLGLELHPIQVNSSDALVRQSAYEASKGRFTVPRRTTAVFVQPRC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2442..2625#3026..3116#3241..3334#3571..3666#4301..4441#4717..4767#6197..6267#6369..6461#6945..7035#8289..8360#9351..9476#9662..9718#10051..10125#10695..10783#10939..11016#11433..11571#11993..12102#12276..12375#12673..12780#gattcgccttctcccccccgaatccaaaccctctcaaatgcagatgctgctccacgccaattccctcctcctcctcgcgccgacgacctcgcggctctccgcctccgcctcgccggggagatcggggacggcccggccgctgcctccgccgcaggggcacgcgcattccgcccgcgccgccgctcgcgggacacggaggccgcccgccgtcgccgcagcctcgccgcggacgccgatggcggtgggggaggagtgcgccgccgccgtggcttcccaggtgcgccatcgctggctcgcggctgcttttttctcttccgttgatgtcgcaatcgtcgctggactcccacgcgttccgacaaattaccgagatgcccccacctgtgggatgtggggcccacatgtcagccgctgtttcattgctacgttttttaacaagccccttggggttcttctggtattgcaaagtcgtccctctgacgccgtaggacccacttcccagtgaccgtactgatgtatgttataatattccctccgtcgtagaatataaccctctaggaccagatatgatatatccgtaaatgtccaaattcatagtactaggatgtgtgatgtgttccatccggttataggttgctatattttgtaacagatggagtacttaccatatagaaggtttgcaattttgttctgcgtatttactaatgccggggaaattttggaatttttagaacttttttttttaaaaaatgaagaaatattgaccagattttgactaaactcacaaaaaatatggaaaatttcgggcggaatagtgtctgcagaccgaaattgcaaacactgatagagattagtaacttgtgaggctgtgtcgtcagcacaagagtgaaaatttcttaaattttttccgacttttttctttgaatttagacaccatatgaactgatttttgtgaagcttactctagcattgatgtgtttcatcttcaggggttcgtgacggatgcgagggcatactgggtgacaaggtctctgattgcctggaatgtaaacgatcaagacacctccctcttcctgtatgcaagcagagatgccacgatgcacgtatctgatggggccattcatggtaggtgaagtaaactgtttgtctgttaagctcttttcacccaaagatgatttatgatagctgtagaaacttattgatgcataccaaatttgaaatatctttgctgatttggtaggttatgattcaaaaattgaactcgaaccagaacatgccagccttccagacaatgtaagatcattcttagttgacaagtgtaccattttttcaagagtgatttgtgctgttgtgcgtactcgttcttcataatccttgacgaattcatatggactgccacttgacatttttcaggtggctgagaagttcccgtttatcagaagttacagaaccttcagagtccctagctctgttgatgtcgcgagccttgtgaaatgccaactagctgtcgcttcttatgatggtaatccgaaaatctctgctcttatgttgccttcttctgcaactctcacctactgttttttttttgttgcagctcatgggaggcatcaagatgttactggattgcaactacctggtgtattggatgacatgtttgcttatactggaccacttggtgcagttttcagtgataaagatgtcgacctctacctttgggctcctacagctcaggtctgcttgcagaacgtcactaagcatctcagctgttatctatggtcccttatattttttgcttgcaactaaaatttccttgctatttctgtaggatgttagagtatgcttctatgatggtccagcaggacctttactgcaaactgtgcaactcaaggagttaaatggtgtttggagtgttactgtaccaagataccgggagaaccagtactatttgtatgaagttaaggtttatcatcctagtacatcacaagttgagaaatgtttagctgatgatccctatgccagagggtatgtgtgttttaattaatttgttacactaatttaataatccatacagatattgaaaaaaaatattactattaatttggccaggctttctgcaaatggcacacggacttggttggttgacattaatagtgaaactttaaagccagcttcctgggatgaattgtcagatgagaagccaaaccttgagtccttctctgacataagcatctatgagttgcatattcgtgatttcaggtgaactgtgctacttgatttatgcaactgtaaatttgatggattttatgcatgtttcttttggagaatttacttctctgcttcatcttaattgttaattacagtgctcatgatagcacagtggactgtaactctcgtggaggatttcgtgcatttacatttcaggttgttcagacttaatttactgaacgatttctgtttcaccacctataacaaaacatcctggtcgcattatggaaactgtgatgcaggattcagcaggaatacgtcacctgagaaaattgtctgctgctggcttgactcatgttcatttgttaccaagctttcattttgctagtgttgatgacaacaaaagcaattggaaatttgttggtaaggaaagtttcttttattatgttttaccatttaactgtatggactgagtagtcgatggttaagtcactgttgcaatttactttttgtgttttctaatttgaacttctaataaaatacaaaatcgaatctacattattaatcaagtgtagaacagaaattacacaacatttgagttcaacataattccagaaatgaatttcttttttatggctcatgaattttttttcttatggaaatatgtgaaaggttcttgtttggttggtatcttttggtgatgactatttataagtccttagtggattggactaaattctttcacttccatctgatgtatgtttagttgacttattttgttgttcctgtttgaataaatggggaaattcatttactctggcagatgaggctcagctggcaaaactccctccaggttcagatgagcaacaagctgcaatagtatctattcagcaagaggatccttacaattgggggtattcttccttgctcttttctttcaaacattacacatactaatgcatcttggtggtcttttcaaagtaaagtttgttatgttcttgcctgtaaattattctcacggtcatatgcacactaaaggtatgaccctgtactctggggggttccaaaaggaagctatgcaagtaacccagatggtcctagtcgtattattgaataccgacagatggttcaggtgtgttctctatttcaaccctgaaatgcatacataatgaaatatcaccctgtttggatgtgtgattccagcaggaattctacaaatttcatgtgatttgattgagggtcacctgttttagggaaaatatgttctaacttgtatcttccatccttgtgctgtaattcatggaatgaccaattctgtcagctctatgcagaacggatgttacgtttctgatgaaatttgtactgcaggccctgaatcgcataggtcttcgtgttgtcatggatgttgtatacaatcatttagactcaagtggcccctttggtgtctcctcagtgcttgacaaggttatcactttctaatacttacatttttgtttataattgttctgatctacagatcattcttttttagtatatttgatgtaatgtctttgttgttgcagtagtaaaacacttgaactacagtttaattaaatttggtccaatcaagaatacatacgtatgcacaagaagtttctggcatttagcacttagcagcacactagcacgtccctacaacaccacatctttagagaggaacaaaacagccattgtgcagaagccattactgcctgtccagtatccatttagtagattagagccagaataaaggtgagtacagcataacagggttcatgatttttagaaattaatttaacttgattgtacatgattttcataaatatgtgaatttttgtggcgtagctataagccaccaaaatgcttcttgtataccaagtgaatgtaatttgtgaacttttattttaagccaagaaatgataagggtcttaaaatgcttacatgtatgtgttcgttaactcaacgatatgtgtatcatagattgttctaaaaaatggtcaatagcattctaagtctttttttccgtttttgccccctaatgtgtcttctaatatcttgtttttgtatgggatatttacagattgttcctggatattaccttaggcggaacgttaatggtcagatcgaaaatagtgcggctatgaacaatacagcaagtgagcatttcatggttgataggttaatcgtggatgaccttttaaattgggcaataaattacaaagtaagttgtgataataatattgtactattggcacatcatatattttttattttatacattcaagaatatctgtaatttctggcaatgtctcgcctccttttagagagagagtaccttgcttctcctttttcctttttttttctggaacatgcaagagagcctttttgatttttttttctgaagtgtcaaaacaatctcatgtttatgttttacatgtcttccaagtgctgcactttattattctgcatcttaacaattatatattcttgtcgtaggttgatgggttcagatttgatcttatggggcatatcatgaaaagtac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