Os04g0395900
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0395900 |
|---|---|
| Description |
Poly-A polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein |
| Version |
NM_001059197.1 GI:115458123 GeneID:4335699 |
| Length |
5947 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0395900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:19519792..19525738 |
| Sequence Coding Region |
19520186..19520407,19521093..19521405,19521650..19521711,19522260..19522319,19522675..19522782 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgctgcgcacgccggagctgcgcttcgccgccgcggcggggctcggggcgctctcgcgcccatcccgcgtcgcgccgtccccgctcgccgcgctggcggcgccgcgccggcgcaggcgccgctccccgtcgccctcccccgcgccctccgactccgactccaaccccgcctcctccgcccccgcgaacgccggtggggcggcggcggcggcggaggcgccggagtggaagaaggtgagcgcgaagcggttcgggatcaaggactccatgatccccgacgaggcctggaacgtcctccaccgcctccgcagcagaggatatgatgtctacctggttggtggttgtgttcgagatctcataatgaagaaaaccccaaaagattttgacataataaccacagctgatcttaggcaggtgaaagacactttctcaggatcagctgttatagtaggaaggcggttcccaatatgtcatgtatatgagaacaattcaattgttgaggtatcaagttttaacacttatgcacgagggtcaactagcaatcaaatttacacgtccaagagcccccattgtagcaaaaatgattatatccgatggaaaaattgccaagggagggacttcactataaacgggttaatgttcaatccatatgcagaaaagatctacgactacttcggaggaatcgaggatattaagaaagctaaggttcgtaccgtgattccagctggcacatcattccaggaggactgtgctcgtattctacgtgcaatcagaattgcagctcgtttagggttcaactttccaaaagaaactgcttattatgtgcgaactcttgcctgctctgtggcaagacttgataagggaagaatactcatggagatcaactatatgcttgcttatggttcagctgaagcttctttaaggttgctttggagattcggtcttcttgaacacctgctgccttttcaggcagcatatttttcttcaactcgttttaagaggaaggataaaggaactaacatgctactggtcttattttctaaattggataattttcttgctcctaacaggccatgccataatagtttgtggataagtattttagcacttcatgaagcattagtacgccaaccgcgtgatcctttagtggtagctacttttgccctagctctataccttggaggtgatatgtcattggcactagatattggaaaatcaatcaaccgtcaacataataccggattttcagagctattagaaccccaagtctgggatgataagcatttggtaggcgaggtgcaaagcctagctgtctcaatgcggcgggcattaactgaaatgactgatgaatattttgttgcaaatgctatggcaaaaattcctcaggcaccatcctcagatcttgtattcatcccactacaagcctacctaaaggttctcaaattaattgaatgtgttcaacatgggaaaaaggagcatggctatgaaccgaagagagatggaaatattgattatcatgatctatcttatggtacacctgcagaagtaagaaatgtctttacactggtcgtcttcaacacattatacccctcaaatacggagaatcagcaggatgtcagctcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALRTPELRFAAAAGLGALSRPSRVAPSPLAALAAPRRRRRRSP SPSPAPSDSDSNPASSAPANAGGAAAAAEAPEWKKVSAKRFGIKDSMIPDEAWNVLHR LRSRGYDVYLVGGCVRDLIMKKTPKDFDIITTADLRQVKDTFSGSAVIVGRRFPICHV YENNSIVEVSSFNTYARGSTSNQIYTSKSPHCSKNDYIRWKNCQGRDFTINGLMFNPY AEKIYDYFGGIEDIKKAKVRTVIPAGTSFQEDCARILRAIRIAARLGFNFPKETAYYV RTLACSVARLDKGRILMEINYMLAYGSAEASLRLLWRFGLLEHLLPFQAAYFSSTRFK RKDKGTNMLLVLFSKLDNFLAPNRPCHNSLWISILALHEALVRQPRDPLVVATFALAL YLGGDMSLALDIGKSINRQHNTGFSELLEPQVWDDKHLVGEVQSLAVSMRRALTEMTD EYFVANAMAKIPQAPSSDLVFIPLQAYLKVLKLIECVQHGKKEHGYEPKRDGNIDYHD LSYGTPAEVRNVFTLVVFNTLYPSNTENQQDVSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5332..5553#4334..4646#4028..4089#3420..3479#2957..3064#2763..2872#2623..2668#2440..2512#2224..2354#1968..2054#1356..1453#353..475#38..233#ctcctcctctcctctcgccgccgccgccgccgccgggatggcgctgcgcacgccggagctgcgcttcgccgccgcggcggggctcggggcgctctcgcgcccatcccgcgtcgcgccgtccccgctcgccgcgctggcggcgccgcgccggcgcaggcgccgctccccgtcgccctcccccgcgccctccgactccgactccaaccccgcctcctccgcccccgcgaacgccggtaagggttcttctcctccctcctccgcgtctggtgccccgttcgaactgtgcggctctgctagtgcccgcgtcgtcggttatcttacttgccggatgttggggtggcttggggcgcaggtggggcggcggcggcggcggaggcgccggagtggaagaaggtgagcgcgaagcggttcgggatcaaggactccatgatccccgacgaggcctggaacgtcctccaccgcctccgcagcagaggtgcgtgtgcgtccatgtctcttcctcttttaccgtacacaagactcaagtgttagttaatctgagttccagacatgctcgatttcttgtatgggttctgatgatgccccgtggttgcgaacatgcaatcgtttggtggaatcaagcaccaagtagtggaaatgatcactctgtgtccctcgtgtatcgtgtattattcccacggtttatgtggtggggaacataaaccaacatcctgaaaatttctccggtaggaacaggaacatatcgcttcccgtctctggagaaacaaaaaaaaagttacacatgacatttcattcgactgacatctgtaaatctgttgatcaggatttagtgtaaaactgtcatttttatgaatattccttatggccattgtttaaaaaatatttattttgacatatttgttttattgttatatttattgtggtaatttgtagtctattgcaatgcttagatttagtgctagcctgttcttaataagaacaggtgaaatgctgaattattatctgaactgaatttactctgctttatcatcagataccttgcttgctcatcttgttgtaaatttcactaaatatgtctgagaaattgcctgtttatggcaaatattattgcattttactgtattcgatttaaactaccatgttttgtctttcctttttctgaactaggtgcaatcttatattaattgagtatgctatttgattgaactgttttttttttttgtaaaaataaatactctaaggccacagtgataatataagattttgtgttacagctgggctaccgctctttttttttttaaaaaaaggtacttgctgtaatataatatttgatggtttctttcttcattttgcaggatatgatgtctacctggttggtggttgtgttcgagatctcataatgaagaaaaccccaaaagattttgacataataaccacagctgatcttaggcaggttataattcaaattaccaagcttcttatgctgatgaagtgatgttcttatttttgttagaaggaggaagtgttgttcttacattaatttttctagctgaggtttgtggcatgcattttcctagagctggttttttttactgaaattggttcataggaagtttaccacagtagtttgcttttgcttttgcaaatatcaacgtcaacaaagataagtaaataagtaacttgcttaccgtgcatttgtcacctccctttttcgcaacggcaagattagattgttcagtgttgacaatgatatattccgtgcactagaaaatgtaatatccaatgttctgaaatataggaatatttcaagcattcacgtaaaaagcctgcaaaatactttatatgttaatttttcacttttgtttgtgaaaagtaaagtgtgattgttaaatgttgataccaggattacatcggttaatttataatactttatagagattaaaaatattactttccaactcctgcaggtgaaagacactttctcaggatcagctgttatagtaggaaggcggttcccaatatgtcatgtatatgagaacaattcaattgttgaggttaggacataatcattcttactatctgtcaattctggtatccttgacatatatcttaattttgggtgctcattgcaaactgcgcactttgattctgacaaattagattttctttcacaacctaagatttagagcgacctggatatttctggtgtcttcttgttggcaggtatcaagttttaacacttatgcacgagggtcaactagcaatcaaatttacacgtccaagagcccccattgtagcaaaaatgattatatccgatggaaaaattgccaagggagggacttcactataaacgggttagtgtatctatcctttttaatgatatctgctggccatattgcagggtctagtgtatatttttctcaagataaatgtttgcaggttaatgttcaatccatatgcagaaaagatctacgactacttcggaggaatcgaggatattaagaaagctaaggtaagctgtacctatttactttatatgtttattggttcaatttccaatcatcctatttccgtgttcatgaatcaactcatcctgtaatcttctttatgccctttcactaggttcgtaccgtgattccagctggcacatcattccaggaggactgtggtcagtatctgaaattcaactatgctttttctagatttttctgccttgtttttcatgtgaacttttggtattaatgctatcatgtaattaacagctcgtattctacgtgcaatcagaattgcagctcgtttagggttcaactttccaaaagaaactgcttattatgtgcgaactcttgcctgctctgtggcaagacttgataaggtcaaggcttgacatgcacactgtctttttttagaatgttttggatctttttcttgtttgcctctaaatgtctatctgctacagggaagaatactcatggagatcaactatatgcttgcttatggttcagctgaagcttctttaaggttgctttggagattcggtcttcttgaacacctgctgccttttcaggtataaccatactctcccctgagcatatatatactccatccatccacttatgtagggaatattttgattgggagaactcttcagaattagacttttgacattggttgcttatgcaatatactattaaagctataaaatcaatgccataagaaagtaatttgaaatacgattatattggtaatttgttataacttttgatgcatataattttattaattgcatttgctggtaaaaatctacaagtcttgcatgcgctattagtggatgcatggagtatctagattctaaaagttaagttttcatatggctgttaggttttctgcttttggttgaatgatttgaatgtactgtacaggcagcatatttttcttcaactcgttttaagaggaaggataaaggaactaacatgctactggtaagtttgattttgagctatttagttaattgaagctggaaaaagatcattcacctcggaccgtgattatgaaccattgttatcctcgaaattgttgcttcttgatgatgtacaagagattgattcaagtggaccttctgcgacaagttaatattgccgtgttgcaactttgtatgctgcaggctttcaaaataaatggcagcccttgtttcttgtgctctgcttgttttatttgtgtttgctttccataacagaattttgttcatgtgcactttaattttgtgatggaggtcattatgaattacttttaaattcttgatcatggaaaattttatcaattcaaattcaactttttcactagctgtgtgtaaactgtaaagcttagcttgtttaagttttttattgttaaatctggattaatcaggagtaaggtgtttattttcttttgaaatcatcaatttcatgttttggtggtatgctgctaattgagatatgcacaatgtatttcaatgtagctttagttgctaatttgtttgttgtgtatgcaggtcttattttctaaattggataattttcttgctcctaacaggccatgccataatagtttgtggtgagatatgcattattcaacttgctatttataaccgaggccaaaatttatacattgattgctttatttctagctgtttggattgtttaaactgacaaagatggaatttatgaagctagtatgaatgctactcaagaactaaatgtttcaaacttcttttgaaaaagcacatgtttttatttgagattacttggattcactattattctgcaaaatggcattttattctccttccattttacaggataagtattttagcacttcatgaagcattagtacgccaaccgcgtgatcctttagtggtagctacttttgccctagctctataccttggaggtgatatgtcattggcactagatattggaaaatcaatcaaccgtcaacataataccggattttcagagctattagaaccccaagtctgggatgataagcatttggtaggcgaggtgcaaagcctagctgtctcaatgcggcgggcattaactgaaatgactgatgaatattttgttgcaaatgctatggcaaaaattcctcaggcaccatcctcagatcttgtaagcacaatatacttctaccttccatttttagtttggactctttttttcatttattggaagtcatgagatctgtctattagtatcaagttactctgtttagctatttagaaatatataatacggaagctcagtcatacttctataatttgatgatgaacttctatcatggggaaattaataagctgcatatgttcgtgca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|
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