Os04g0421900
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0421900 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001059322.2 GI:297602713 GeneID:4335834 |
| Length |
9878 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0421900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:20884901..20894778 |
| Sequence Coding Region |
20885003..20885419,20886183..20886328,20886720..20886817,20886894..20887088,20887186..20887313 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:20884901..20894778 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:20884901..20894778 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagcgacagcgacgtcgacgaggacgagctcctccagatggcgctgcaggagcaggcggcgcgtgacctcagccaccagcgccccgcgggggccgggaagcccgtcgtcaacctcgtccgcccccctgccaactcctcccgcggcggcggcggaggaggacgcggcggagggggccccgccaaggcgaggcagcccagccgcggaggcggcgacgacgacgacgacgactccgaggtcgagatgctgtccatttcctccggggatgaggatggcgccccctcctcccgtgaccgtggccccccgcccccccgcggcggcggccgcgccggggcacggcgggccgcgtcgagggatgatggggatttcgacgacgacgagcccaggagctggaagcgcgtcgacgaggccgagcttgctcgcagggttcgggaaatgcgtgaagggggggcagctcctacagttgatcagaaagcagctgctgcagcaactcggaaggcacttaccaatgtacagactttacctagaggagtagaagttctggaccctttgggccttggagtcattgataataagtctctgcgattaattactgatgcttcagtaagttctcctgtttcaagggagaaggctcagggtttagaccccagtatgcgagagaaagttatatattcttctccgaattttgaccccaaggtttttctttcgtgggttcacaaagatacaagtgctgctgacttagagtctggtgcgcttaccttgaaaactgatctcaaagggagaacacagcagaaaaaacaattagtcaaggagaactttgattgttttgtttcgtgcaaaaccacgatagatgatattgagtcaaagctgagacagatagaggaagatcccgaaggtgcaggaactgctcacttgtactcagtcacccagaaaattagtggtgtagcaaaccgtgcatttgagcctctatttgagaggcaggcccaagctgagaagatcagatctgttcaaggaatgcttcagagattccggacattatttaacctgccaagtgcaattcgtgggaacattagaaaaggagaatatgacctagctgtcagggagtaccagaaagctaaatctattgttcttccttctcatgtggggatactaaaacgtgtacttgaggaagtggaaaaggtaatgcaggaattcagaggcatgctttacaagtcaatggaggatcctcatcttgacctcgctgagcttgagaacattgttcggctactgttggagttggaacctgagaccgatccagtgtggcattatcttaacattcagaatagcaggatccatggattgtttgaaaaatgcaccttagatcatgaagcacgaatggaggttctacagaataaaattcgtgagaaaatactatctgatgcaaaatggaggcaattgcaacaagattcaaataaatcattggaagttgattctgctaccggtgactcttttcaagatgatcaactgtcaacaaatattatggctgatgaagctgatagcttaagggcagcctacattcgtaggttaactgctgtacttatccagcatgttcctgcattctggagattagctttatctgtcttcagtggaaaatttgcaaaggcagctgcggggaatgtactttctgattctgatatgaatacaaaacagagtgtaaataagactgatgataaaggtggagaagcaaagtacacaaaccatactcttgatgaagttgctagtatggttcgtgctactgtatctgcttttgacaccaaggttcagaatactttccgtgattttgaggaatgtaacattcttcgtccgttcatgggtgatactataaaagaaatagctaaggcttgccttactcttgaagggaaggattcatctccaactgctgtgaaaatgttgcgggcccttcattatgaaataacgaagctttacattctacgactttgttcatggatgcgggcaacaactaaggagatatcgaaatatgagacctggtttactttaaccacccttgagaggaacaaatctctatatgcaatttcaagcatgcccttggagttccgtgatatcatagtttcggcaatggaccgcattgattttatggttcttaatctgaggagtgagactgccaagtcttacgatatttctcaacacctccatgaaattcatgaatctgtcagacttgcatttctaaattcttttctggattttgctggttatctggagaggtttggaggggaactagctcagaacagatcaaataaagaaaacaaccatacccaaaatggatatgtaaatggtactaacagtgaaacatctgctggcatggatggggacttgtacaagaagctgttggttgttctgagtaacattggatattgtaaagctgaactttcagatgaactgtataccaaatacaggcacatttggtccccagtcagggataatgatgagcgtagtgctgacatgcgagatctgatgacttctttctcagcacttgaggagaaagtcctggaacagtatacatttgcaaagtcgaacttgatcagaaatgctgcacgaaactatctgttggattatgggattcactggggagcagcaccagcagtaaagggcattcgagatgcagctcttgatttactgcacatccttgtagctgtacacgcagaggtctactccggtgctaggcctctgctggaaaaggcgatgacaattttggtagagggtttgattgatatcttcctcagtattttccatgagaataagaccaaagaactcagaatgttggacgcaaatggtttttgtcagctcatgcttgagcttgagtattttgagactatattacggacatacttatcaactgaggcagagcaggctttgagatccttacaagagaatttattggagaaggcctgcgaaagtgtgactgaagccttggagaatcctggacaccaccgtcgaccaactcgtggcagtgaggatgctgcatcagatgatagacaatcagtatcacctgatgatctgcttgcacttgctcagcaatgcagtagcgatttgcttcaaggggagctggagaaaacccggttaaatattgcgtgctttatggagtcaactcttcaatcaacgcctgcaccggctggatcaaaacctgctgcttatcagtcatacaaggcacctgcgacacaccaaccagttcaagtgtcctccccaagttttagaaggcagcagacaagtacaaattcacctgcagcctcgaggcggcgtcgatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASDSDVDEDELLQMALQEQAARDLSHQRPAGAGKPVVNLVRPP ANSSRGGGGGGRGGGGPAKARQPSRGGGDDDDDDSEVEMLSISSGDEDGAPSSRDRGP PPPRGGGRAGARRAASRDDGDFDDDEPRSWKRVDEAELARRVREMREGGAAPTVDQKA AAAATRKALTNVQTLPRGVEVLDPLGLGVIDNKSLRLITDASVSSPVSREKAQGLDPS MREKVIYSSPNFDPKVFLSWVHKDTSAADLESGALTLKTDLKGRTQQKKQLVKENFDC FVSCKTTIDDIESKLRQIEEDPEGAGTAHLYSVTQKISGVANRAFEPLFERQAQAEKI RSVQGMLQRFRTLFNLPSAIRGNIRKGEYDLAVREYQKAKSIVLPSHVGILKRVLEEV EKVMQEFRGMLYKSMEDPHLDLAELENIVRLLLELEPETDPVWHYLNIQNSRIHGLFE KCTLDHEARMEVLQNKIREKILSDAKWRQLQQDSNKSLEVDSATGDSFQDDQLSTNIM ADEADSLRAAYIRRLTAVLIQHVPAFWRLALSVFSGKFAKAAAGNVLSDSDMNTKQSV NKTDDKGGEAKYTNHTLDEVASMVRATVSAFDTKVQNTFRDFEECNILRPFMGDTIKE IAKACLTLEGKDSSPTAVKMLRALHYEITKLYILRLCSWMRATTKEISKYETWFTLTT LERNKSLYAISSMPLEFRDIIVSAMDRIDFMVLNLRSETAKSYDISQHLHEIHESVRL AFLNSFLDFAGYLERFGGELAQNRSNKENNHTQNGYVNGTNSETSAGMDGDLYKKLLV VLSNIGYCKAELSDELYTKYRHIWSPVRDNDERSADMRDLMTSFSALEEKVLEQYTFA KSNLIRNAARNYLLDYGIHWGAAPAVKGIRDAALDLLHILVAVHAEVYSGARPLLEKA MTILVEGLIDIFLSIFHENKTKELRMLDANGFCQLMLELEYFETILRTYLSTEAEQAL RSLQENLLEKACESVTEALENPGHHRRPTRGSEDAASDDRQSVSPDDLLALAQQCSSD LLQGELEKTRLNIACFMESTLQSTPAPAGSKPAAYQSYKAPATHQPVQVSSPSFRRQQ TSTNSPAASRRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>103..519#1283..1428#1820..1917#1994..2188#2286..2413#2508..2666#3735..3839#4101..4175#4269..4406#4525..4707#4978..5133#5231..5354#5436..5646#6230..6345#6444..6669#6834..6927#7814..7891#8232..8288#8438..8587#8702..8908#9200..9442#agcgaaatctctcctcctccacctcctcgcctctctctccctctctctcccctctcatcactctctccccacccccctcgtcgcctcgtcccagatccggacatggcgagcgacagcgacgtcgacgaggacgagctcctccagatggcgctgcaggagcaggcggcgcgtgacctcagccaccagcgccccgcgggggccgggaagcccgtcgtcaacctcgtccgcccccctgccaactcctcccgcggcggcggcggaggaggacgcggcggagggggccccgccaaggcgaggcagcccagccgcggaggcggcgacgacgacgacgacgactccgaggtcgagatgctgtccatttcctccggggatgaggatggcgccccctcctcccgtgaccgtggccccccgcccccccgcggcggcggccgcgccggggcacggcgggccgcgtcgagggatgatggggatttcgacgacgacgagcccaggagctggaagcgcgtcgacgaggccgaggtatgtggggggagatcggcgagatctcgatctcggccgctcgtcttccgtgctagttttttgggggtcgcgtgctttgatgatccgaaaattttggttggtctcgcgggtttgttaaggcagcgagccgagtagcttgttatgaacatgtcagaatcgtggttgagtgcatttagctagtagtgtaggttatgaaatttatgctggtttgatcagtttgtttctgttccttctggggatcgcacaaattagctgtggtgctgcagagtggagctgcttgttgggtcgcctggggggggggggatttgggttaattcctaagacttgcctattggtgtgaactctgggtactggtgtgtttcaatcattcatgttgtgtagtactatgatatatggaggtataagggattaattaatggacttatagacaacatttttacaagtttgctggtctgacacacaatgcttggtcatcacatcaattgcatttgtgcagcgtgcattactgttggcacactctttcggtatagttcattttgatttccttctagctgcacattcatgttattcaaacctcctctctcagcttgtttgaaattgaatgccatgcttttcattttctctgttgttgcatttgttcatgtatcatttcatatctgcattctccatattagatgttaaatgcaccaaatacaaacatctgttttaacatgttatcttgtactgaatatgcctaatgtcagtctgcctttgctccacccagcttgctcgcagggttcgggaaatgcgtgaagggggggcagctcctacagttgatcagaaagcagctgctgcagcaactcggaaggcacttaccaatgtacagactttacctagaggagtagaagttctggaccctttgggccttgggtaactatctggatcacaaaactcatggtcaatacatgacacgcatcatcttcttttatatattttttccacattaatgtaccacttgaccacttgataaacattttataaaatgcaatcacctcatacattgatagtatgttagatagcaaacacattcactggttctaaaatttttgaaagtgagctgtacgtaaccttactgaaacatcaaactttgtattatcaatatattttggcagcaacaagtattaacctcatatatattaataatgtcctgctctgcattacctagtacatgtgtggtatgctctttatcatggagaattaaaattaccaatccaatgtcctctctatattcgtgttttaatagcatttattttcttaccagagtcattgataataagtctctgcgattaattactgatgcttcagtaagttctcctgtttcaagggagaaggctcagggtttagaccccagtatgcgaggtatgccttttggtcatacatattatttcattctgttatctgttcttccataacaagggtatgtttttatttgcagagaaagttatatattcttctccgaattttgaccccaaggtttttctttcgtgggttcacaaagatacaagtgctgctgacttagagtctggtgcgcttaccttgaaaactgatctcaaagggagaacacagcagaaaaaacaattagtcaaggagaactttgattgttttgtttcgtgcaaaaccacgatagatggtatctgttccttttttttcttcttctgctctgttgtagataattctcatgatcttaatttttgcacctgtttttaataccgcgagtttttctgcagatattgagtcaaagctgagacagatagaggaagatcccgaaggtgcaggaactgctcacttgtactcagtcacccagaaaattagtggtgtagcaaaccgtgcatttgagcctctatttgagaggcaggtataccaactaagttttctctagaacttcatttcactaatcatggtcattattactgcaattcttgagtgcggtaacgtaaaccgttgtgcaggcccaagctgagaagatcagatctgttcaaggaatgcttcagagattccggacattatttaacctgccaagtgcaattcgtgggaacattagaaaaggagaatatgacctagctgtcagggagtaccagaaagctaaatctattgttcttccttctcatgtacgtcaacttgatttattttatctgcgtctgttatttgaagatattagaagtggtgggaatgatggggatgggtgccaactgatcatagcgcactatctggggtaccgacacccgtaaagtgaaaaacaatgtgatttagtgggaaccacaatacccatcaggattcttacattatcaccgtcttacactacttctagtttagtaacacaagagaaacatgtacccgttctttttatttgatggctttgacctttcacggtccaagatgtaactttgaccattagctatatattgatatagtattatgagagtacctctcgggtacatacctagtgttacagtttcgtatagccaatctcgagttctcatgtattgatgttcaaagtaacatgggttctaggatgtcaaataagaaagaaagggtattgtctgacctacaggtagcatgggtttatcaaagttttaatgcggttgcattaacatttctgttgcccctgtttttctttttggctattttgtgggacatcccttaaccatttggagatcatgagaaaagcatgaaatagttttatgttggattaaaaatgcgatgaaatagatttgtggattatattctctttcttcctttcatgatggctcatatgcctgatacatgctatatgattttctttgttttccaagatcaattatcgtatgcttctttgttctttccttgcacaaaaattttgcatattgtttcctgttcatgccaatttcttgcacatgtatttggtaattaatataacatcataataactaataacattacatgattgattcacacaaagatctaagaaatccatagtttagatggctcatgcatgtccattacttgattttattatctctctattgtatgacttacaaaatcttgagtattttgatgctggagtaatagggactaaaaatttaactattgtcttgtgacatcccttctattttaggcacaatacgccacaacaaattgttgcttaagcacatccagtatttttactatattctttttatgatgaataactgacacaggtggggatactaaaacgtgtacttgaggaagtggaaaaggtaatgcaggaattcagaggcatgctttacaagtcaatggaggatcctcatcttgacctcgctgaggttagttgactttccaatattcaatgtagaatacttgaagttccttactagtgttgatagtcaaatactcaaatatcactcaactcgctaattttgattatagaaattttggtagttacatgaggaagttacttgatacctacacgtaggatgctgctggctgtaaactgaactactgatcgctagttgtttatatttatgctatttagatacaatatgattcagttctatctgcctcctgattttcttgccaactgccagcttgagaacattgttcggctactgttggagttggaacctgagaccgatccagtgtggcattatcttaacattcaggttaacgctcttgaccaaaattatctgtgctttatgtcatggccatacttgcttgtaccactacttatatgttctatcttcatatcttctcagaatagcaggatccatggattgtttgaaaaatgcaccttagatcatgaagcacgaatggaggttctacagaataaaattcgtgagaaaatactatctgatgcaaaatggaggcaattgcaacaagattcaaataaatcagtgagtagtttgggttcagcatagcactcatttgatcatctactatgatgctacaaatttacatggtatttgcaccttgtcttagttaacatggcacatgttccttatgtttgcatagttggaagttgattctgctaccggtgactcttttcaagatgatcaactgtcaacaaatattatggctgatgaagctgatagcttaagggcagcctacattcgtaggttaactgctgtacttatccagcatgttcctgcattctggagattagctttatctgtcttcagtggaaaatttgcaaaggtatgaatgggtttagctttaacatttgtcagatatagttaagatcttgc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|
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