Os04g0578700
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0578700 |
|---|---|
| Description |
MscS Mechanosensitive ion channel family protein |
| Version |
NM_001060177.1 GI:115460083 GeneID:4336755 |
| Length |
6521 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0578700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:29585557..29592077 |
| Sequence Coding Region |
29586743..29587515,29587673..29587932,29588381..29588481,29589243..29589350,29590391..29590618 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MSMIAATLRRSSRVTGSQNIMEICLGPCVSSGASSRWFSSCTKH SNTSILNQIKAVDRYSPVNGMSMISRVPLSAHMDTNWLSTSNPRFNALPGFLGASSIC RAYSSDTGIKAEVPQNTVSNVPSTETVALGTSDGGSSWIDIFDNARKCTLDATTDAGK KVKELTDAITPHVQQFFDANPNLEKVVVPLGGTIFGTMMAWFVMPIVLRRIHKYSIQS PISALLGSSTKNDVSYETSLWSALEDPAKYLITFMAFSEMAGFTAPSISAYLPQAWRG AIVLSFVWFLHRWKTNFITKVAASSIDQTRLSAFDKISSLGLIALGVMALAEACGVAA QSILTVGGVGGVATAFAARDVLGNMLSGFSLQFSSPFKAGEYIKAGSIEGKVIEIGLT STELMNPEQLPVTVPNSLFSSQVIVNRSRAKWRSNVTKIPIRIEDIEKVPAISEEIKV MLRSNPKVVLDSEAPAPYCYLSRLESSYGELTIGCNLTKMTKDECLSTTQGILLEPAK IIKLHGVELGSTTQCC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1187..1959#2117..2376#2825..2925#3687..3794#4835..5062#5494..5598#aagaaaggccgaaagcgaaagcggatcacaagggggtagcccgtcaccatcagcgctcacgcctcgcgcacctgcgctctccctcccccttcccggcctaggtgtcggaagcgcggtggggaggaagcgaacgcgccgccgtccgggtctcctccgcctcctcctcccgagaatcgtaagctccgggcatcctactccccctcccgctcccagtccagtgtcgcgtcctagcggcgctttgctgtgttcgtttggtagcttcgattcgcacgacgtggttcgctgtactgcttcgagatgccgcgatcgctcgccctggagatttatcgcggctccggcgtattcgtctcgtgcgggtttttgtggcgcggtgctcttccgctggttcggttcggcgtcgcatcatttcaagggtttatgctagtgtagctttcgggaggtgggagtggtcgccgccggtatttcgatttctctcttcttatttgacgcccaaatgtgccctgttgcttaacctagttctgattgtgctgacgaattctaacccgtcgtgagtgtgattttggggttttgggtgctagttgtctcctaagatattataaggagatatctccgttgttttggtgttatggactgcggactacttgtttttaatgttcgatttctagaagtgggaacccaattagtcgatggaattcacagaatctggtatcgtgattgagatgcaaaatcgtgtttatttcataaagcagatggatctgttcatggctgcactttactgttcgatgtctataatctgtgtagctagatttaccatttatcacacaagtttaatctagttggcagtacggatctgcagttttgattatagtggattcgaatttttgtgcactgtgagtttcattttggtatttgtacatctacaattaagagtttcatgtagtatgtcgtcatgttgatctactgttctgcatgttcaaagtttgaagctatctctaagacatactgtattatggttcgttatgcatttcaacaggcttttaacacttctattactgggatgaatttcatcttaactgagcaatgtatgaagcattgacgcatgtattaatgaaatttcacgtttttcaggacttctattttgcctctgcatccaggttatttagaactctgtattcaggactgcacaatgtctatgatagcagcaactcttcgtcgatcgtctagagtaactggtagtcagaatatcatggagatatgtcttggaccttgtgtatcttctggtgcttcttcaaggtggttcagcagctgtactaagcactcaaacacttccatacttaaccagatcaaggcagttgatcggtattctccagttaatggtatgtcaatgatcagtagggtgcctctttcagctcatatggacacaaactggttgtctacttcaaatcccagatttaatgcactgccaggattcttaggtgcttcaagcatctgccgagcatactcctcagacactgggattaaggcagaagttccacagaatactgtctcaaatgtaccttccacagaaaccgttgcgcttggaacatctgatggtggtagttcttggattgatatcttcgacaatgctcgcaagtgtactctagatgctaccactgatgcaggcaagaaagttaaggagctgactgatgcaattacacctcatgtacaacagttctttgatgcaaatccaaacctagaaaaggttgtggttccacttggcgggacaatctttggtacaatgatggcttggtttgtcatgcctatcgttttaaggaggattcacaagtattcgatacagagtcctatatcagcacttttggggagctcaacaaagaatgatgtctcgtatgaaactagcctctggagtgcattggaggatcctgcgaaataccttatcacatttatggcattttcagaaatgtaaggcttctttttactttttctggcagattttatcgttgttgtggatggggtgcaacacactctagattgatgatatttcttcaatatttgcaagagatatatccatcttcgtattgttgaaatgttcattgttctgatgttttctcttcctcagggctggattcaccgcaccaagcatatcagcttatcttccacaggcatggaggggtgcaattgttctctcttttgtctggttccttcataggtggaaaacaaacttcatcactaaagttgctgcctcaagtattgatcaaaccaggttgtcagcatttgataagatctcgtcattaggactgattgcacttggagtaatggctcttgcagaggcttgtggtgtagctgctcagtcaatactaactgttggtggtgtgggaggtaatgttatattcccttcagtcataaatatttgacgtttagatcaatattacattaatttaaaatttaataagtttatgatatcaggatagtacttttcaactttcaaggaaaattttatcattacattccttttgtctttgaactaatcatatgattttttatggtcaaaatttaaaaaattagaccaaatttcatcctaaacgtctaatatttatgatcagagggagtaactgttttgagtaataacatgctataccacatttaaataaaaaatgtaactatggtttcttccagggcttataacctcagaatacatgaactgaaaaagctcaatacagtaatactataattatttagggggataatttgtagctcttgagtcttgactgcagtagatgagacttctaactaaactggaattctggattgttcctccataatgcaggtgttgctactgcctttgctgctcgggatgtccttggtaacatgctcagtgggttctccttacagttttctagtccattcaaagctggagaatacataaaggtgccttcttatatatgtggtcactttttctgtatattcagggggctgtatgtataaactgttcatttgctattcatagtatatgttgatatgcaggtgtttggcttagttactgcctttagattctcaagcaattttcctagtattgcttcaacctacaagggatacatactgttgttagagcttgatgtaaagaaaaaaatatcggtttttacagagctgaaggatagcaaatattgaagtgtctaaactgtgtgttaggaacaagtttccaggaaagggttaagtattgttttagaggctgtaagagggtataaaaaaattagatggacatgggcgacagttttgagcatcacatgtatactacatgcttcctaagttgctatgattatcactagaaatgtttctcgcggtacttgtgctttcagcacttgataacactaatgctataaacgttttcccccaccttaataaactctggccgactttctgttgccagcccggcgaaaaataacactaatgcaatgcatttctccaaggaataagcatgcggtccattttcagtaataaggtgggagaatttaggaagaatgacaggttctgttttaagtgactgggatcttaccttgtttctctaaaagaatattgcatttcaaattgacaactgtggctggccaaatactgttttaatcttttgtaattgttgattttctataaattatacttgtggactcccagcaactgaaggatttttgttgtaggctgggtcaatagaaggcaaggtgattgaaataggactgacttctacggaattgatgaatccagaacaacttcctgtcactgtacccaactctctgttctccagccaggtatcctatggcttgcattactggaaaccttttgaatcacatatttgcatgtacataggagtgacatgtaatatgcttttctgaaccaccttgacatttcattttgtttgtcctatccttactgttttggtgtgcgcgcgcgcacgcacacacacaaaacgaatgttttccaggcagtaactatagtaatgtcctgtaattttattggagattgattcttcaaggaacctaggcacttttgatatttagaagttttatcatagtatgatgcaatttaacctgaaagcagatttcactactctggagtaaatgataagcaaaatacctaggaggctaggacaagtgaaaacgagatgaaatctactacttcctccgtcccaaaatataacaacttttagccctcaagatttgtcccaaaatataacaacttctccaccaacattctcttcctaaccaatcacaactttccaccattcacttttcccacctaccaccactacttaaccaatcacaaccctccaccatttacttctacctactttcttaataactgtgtccaactataaaaatgcttatattctgggacggagggagtaacattttcaatggtttgcactatgcaccgtgaaccatggttcacaaatcacaatttgtagattcgttagctgatacaggggtcttttactgccaaagatcatcatcattcgttttatcactaaaatatgaaacttataccttgttcaaattttaaattttagtctcagttgggatggattaaaataaataatctttggagcatttaaatcacttgaaacttggaatgatgtttttctatttaaattttggaggacagaaagccctcaatgctttgttgcgttagttaactaaaatattactaaaaagatgctgattgttctgtatttcaagaataagcctgtgaggatttattcagcgagtttccctgcatttctgttttctggccttctcggtagggttagcagaagcgtaccctgtatcctgatattactaataacttgcaggtgatagtgaacagatcacgagctaaatggcgatccaatgtgacaaagattcctattagaattgaggatattgaaaaggttcctgc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|
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