Os04g0606400
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0606400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase (EC 3.2.1.113) |
| Version |
NM_001060335.1 GI:115460399 GeneID:4336917 |
| Length |
7187 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0606400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:31019684..31026870 |
| Sequence Coding Region |
31020088..31020324,31020429..31020599,31020685..31020765,31020977..31021078,31021184..31021292 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:31019684..31026870 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctcgtcggtcctcctcctcctcgtcgtcgtcgggggcgtggcggtacctcaacccggcgtattacctcaagcggccgaagcgcctcgccctcctcttcttcgtcttcgtcgccgccaccttcgccttctgggatcgacagtcgctcgtccgcgagtacgagtcagaaatttctcgattggatgataaagtaaatcagttgcgtgaccagttaagaaaggctggagttcatctggatgaaaatccaacaggtgacaaagtatccagagaaaagcttgtagaaattgatcctattaataatgaaaggagagaaaaggttaaggaggctatggcccatgcttggaattcctatgtgaagtatgcctggggaatggatgaacttcagccacaatcaaagaatggtgtcaatagctttggtggtctcggggcaactcttgtggactcacttgatacactgtatataatgggcctaaaggatgaatttcagagggccagagactgggtggccgattcactaagctttgacaaggattacgatgcaagtgtctttgaaacgaccataagagttgttggaggcctcctcagtgcatatgatctatctggtgacaaagtatttcttgagaaggccaaagatattactgaccgtctactacctgcttgggatacaccatctggtatcccttataatagaatcaacctagctcatggacgagcccataatcctggatggaccaatggtgatagtatccttgctgattctggcacggagcaacttgaatttatagctttgtcacagaggactggtgatcccaagtatcaacaaaaggcagagaatgtcatcagacagcttcagaagatatacccaagcgatggcttactccctatatacataaaccctcattcaggaactgcgtcgtactcaacaattacatttggtgcaatgggagatagcttctacgagtacttgctcaaggtttgggtccaggggaataaaactgagcatgtaaagcattacagacaaatgtgggagacatcaatggaaggcctactaagcttgaccaaaaaaactacaccctctaattactactacatttgcgagaagaatggtggttcattgtctgacaagatggatgagcttgcatgttttgcccctggtatgctggcactgggggcctctggctatgaggagactgaaaaggctgaagaaattatgaatcttgcgaaagagcttgctcggacctgttataacttctaccaaacaactcctacaaagttggctggggagaattattttttccatactggacaggatatgaacgtgggcacatcatggaatatcctgagacctgagactgtcgaatcacttatgtacttgtggcgtcttacggggaacaaaacataccaagactgggggtgggacatattccaggcatttgaaaagaactcccgcatagaatctggttacgttgggctgagagatgtgaatactggcgagaaggataacatgatgcaaagcttcttcctagcagagactctcaagtacctatacctcctgttctctcctccatcagtcatatccttcgatgagtgggtcttcaataccgaagcccacccattgcgaattgttcctttaaatgacaatagcaaagcccactcagtaggcattgcaacaccgacggtacgaccgttcgggaggaagcaggggaaacaagagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARRSSSSSSSSGAWRYLNPAYYLKRPKRLALLFFVFVAATFAF WDRQSLVREYESEISRLDDKVNQLRDQLRKAGVHLDENPTGDKVSREKLVEIDPINNE RREKVKEAMAHAWNSYVKYAWGMDELQPQSKNGVNSFGGLGATLVDSLDTLYIMGLKD EFQRARDWVADSLSFDKDYDASVFETTIRVVGGLLSAYDLSGDKVFLEKAKDITDRLL PAWDTPSGIPYNRINLAHGRAHNPGWTNGDSILADSGTEQLEFIALSQRTGDPKYQQK AENVIRQLQKIYPSDGLLPIYINPHSGTASYSTITFGAMGDSFYEYLLKVWVQGNKTE HVKHYRQMWETSMEGLLSLTKKTTPSNYYYICEKNGGSLSDKMDELACFAPGMLALGA SGYEETEKAEEIMNLAKELARTCYNFYQTTPTKLAGENYFFHTGQDMNVGTSWNILRP ETVESLMYLWRLTGNKTYQDWGWDIFQAFEKNSRIESGYVGLRDVNTGEKDNMMQSFF LAETLKYLYLLFSPPSVISFDEWVFNTEAHPLRIVPLNDNSKAHSVGIATPTVRPFGR KQGKQE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6547..6783#6272..6442#6106..6186#5793..5894#5579..5687#5393..5458#5054..5178#3883..3972#3235..3406#3020..3085#2415..2527#2139..2312#2011..2058#153..317#gaccgagccaccaccgaggtccgacccccaaacgccacacacacgaaaacacatcccacgcggcggcgtgacacgcgcgaatcgccggagacctcgccggaggtggcgagctcgggtgccggcgatctcctccccgcgggcggcgtccgtccatggctcgtcggtcctcctcctcctcgtcgtcgtcgggggcgtggcggtacctcaacccggcgtattacctcaagcggccgaagcgcctcgccctcctcttcttcgtcttcgtcgccgccaccttcgccttctgggatcgacagtcgctcgtccgcgagtacgaggttcgcgcctcctctcccacccgttgaagttcccctgatccgggttgaggcggcggggatctgaccggttttgctgcccgccttagcttcggatttccttttttttttgtttgttgtggtgatgattggtcgctggatctgagtatcgagagcttgtgcgggtggttttgggacatgtgcgcttgcggagcagagtgtggtttttccaggattcaggatccagtcttcgtttttgttgtgttctgtggattactggtgggacgagaatctggaagtttgcaaatcaaccacatggagtgcattctggttagctcagctgtgatgataattcggttaaaatgttcgaactctttcagtgttagtttaaggattagtggaggtactcggccactcttggtacagtgagattttcgtagtctcgatttctcgttaaattaagtaaatgggaaggtctgaactattcctatttatttcaggtggaagtaaagttttacgtttctatgttttaggactaatagaaggtgtagatttggagaactgggttattttatgctctttgatgtgttagtttacagcatactcactgagattggtgtagtctaaaaaatctaaaaatttctgttttgtgattattttagaggaggatatcatcacaaattcctatagtgttatgtattttgaggagaaaacaaatgtcagagatgtagttggtgttatgtcaatttaagtttgacaagatgaaattaaggttaggttgttttttcccacttgttcattgaggcttgtaagtaatcagctaatttgaaggataccacacatgagtcatgaatgtatattttgatcaattttcatcctttggatttatcaagtcaatctagctcttctgtaaaccataagaaaacatggattagttggtctgtttgaaaatcacatgggtctgttgggctgttggcatgttttatttcagtttgagtcaactcatatcttatctcctggagtatgcatatacttttgatattcctctgttcactcttattgtttgagttccttgtagaatttagaacttaaaagtacaaatgtaaggtatgctatctgaaaggtgcctcgtcaccatcttgaattgttcattctgaagtgctacagatgaatggctttaaattatacttgtgaaagtgcaaggtactccctccggttccatattaattgacgttttggacaaggttgaggtcaaacttttataactttaaccattaataactttaaaaatatttggtttaaaagaactagaacaacatatatagatttgtcttttaaagtactataataaaaataaacatgcatttatttattatatatattataatagaaaagtaagattaaagatgtatcttgtagaccgtgtcattgtccaaaacgtcaattaaaatggaaccggagggagtagggtatttgcgaggttgtcttaaatgctgcttgttgaacagctcagtctagtgctagtaaatgcaaatgaatatacggatggcagatattgggttgtacaggaaaatatcttgcagttcagattcaacgattttctgttgaataaagatatcgcagttatgatttagttctccactattgatggcttcaaagctccaggaatattaccttgtttcctacacttactttgttctgttatcctcaatttcagtcagaaatttctcgattggatgataaagtaaatcagttgcgtgaccaggtaaagtttgttctgaaatgcggtgctggtttacttaacttttaatccagctttaaaataaatctttgtttcttgtatagttaagaaaggctggagttcatctggatgaaaatccaacaggtgacaaagtatccagagaaaagcttgtagaaattgatcctattaataatgaaaggagagaaaaggttaaggaggctatggcccatgcttggaattcctatgtgaagtatgcctggggaatggatgaacttcaggtttgtttagtcaacattctgttatttctattgcccttctaacttatctgagtgagctctgaagtgtcttctgtatttttctttgttcaaattattttccagccacaatcaaagaatggtgtcaatagctttggtggtctcggggcaactcttgtggactcacttgatacactgtatataatgggcctaaaggatgaatttcagagggccagagagtgagtttaactattttttcaccatacagaatgtacataatgcttcctcatgcgctttaatttggtccattcacgacagagacttctattagattttaggtttctcatattaacattcaatacttcagactaaacctgtgtctgcttcatcctttaatattccgtgatgttaaaatatggcattccctaatttagaaagtaaacttatttgtcatttaggtattttaggcttttagcaatgaatgcgtctctttatcccttgtgatatagggaaatcggaatttcttgattacttctttaggcattcagtttgtttcatctattcatgtgataaatggcttttatgagtatattttgtttagcactttttttattatttatatcttgttaagttctctaatctgcttgtttatagctccattacagagtggagtatcttcttatgatttatgtcatactctaattcagtcgatgtctatttcatgatgccagctgggtggccgattcactaagctttgacaaggattacgatgcaagtgtctttgaaacgaccataaggttgccttataaggtttactattgttgtagtattttttttcttaaaatatttgacttctttgatcgatgctatgtaggcagaccacattttttagaacataaaagtatatctagttttttctaagtttctgttttatttttatattcagagttgttggaggcctcctcagtgcatatgatctatctggtgacaaagtatttcttgagaaggccaaagatattactgaccgtctactacctgcttgggatacaccatctggtatcccttataatagaatcaacctagctcatggacgagcccataatcctggatggaccaatgtgagtaatagattctattttgctagtggtagtcaattacatggagtgttccttctaagcacactgaagcttacagctaactgttttaaccatgttcacagcatcccatttttcttcataatgatgcaaactttgttgttcctttagagctctgttttcattcgagggattgaatcacatgtcatcacatacatctttatgattaattcatcatgtttataatttgtttcagccccttatctccacagtgatcaaattagaagtttttttaaaaaaactgatcaaattagaagtttaatgtgatatttaccaatatctttgtaaaaacacttttttctcgaatagtcaagagagctgcataatctttataaaaacacatcaataattgctcaatggattgtttataaatgcatttgacctgaaactattttctctctctttggatggtgaaccatgtacattgtgtgtttctgcagggtgatagtatccttgctgattctggcacggagcaacttgaatttatagctttgtcacagaggactggtgatcccaagtatcaacaaaaggttctacagattactcatatttcatacatcctgccagttttatgcaattatcttggtaaattaagtgcaaccagttgtgtgcaaaacatggcttctatttccttcctcgaataagaagaagagggggtagaacacgcgtgcaaaaccaaacacgcacacactgagttctaggaaccatgcgtgtcacaaacccgaccacaaacacaaacagataaaatgaccacgacccacaaaccaaaccacgacgtgagactaaccacctggctcttgactcttgagcaagcaaaaaggaccttgtaatcatatataatactttgattgttccctttgttgttgatgtgcatgcatgcatccctttttcacttgatgctatggtcataaccactggaaccaaatctccttgatgcctccttttgtgacacacataagtactcaaatcatgactgcgggaataaatgattttttgtgatagttcataagtcatatttaaagtgttttattttctggatggccttcaaaatcatagccttcttcatatacaaatgttcttcccctgaaaagttcttgaatttagcttgaccccagtattgtgggttaagtatatatactgacttctctctatcagatgacgccaggtttgctttagatctcctttcaagaataaaatagtgtctcaaagaaaaggctgttataagttggaaatagaaaatatatccaaatcataatcaatttgattatattggtcctacttatagatcctaaataaccttgttccttatcctatttatttgacatgctattgcatggatcaaatcaattggtatgagttccatcaaaaactttgatccctaatgtaaatttg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