Os09g0252100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0252100

Description

Similar to Acetyl-CoA C-acetyltransferase

Version

NM_001069220.1 GI:115478179 GeneID:4346520

Length

5555 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0252100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:4535890..4541444

Sequence Coding Region

4535931..4535992,4536239..4536300,4536660..4536758,4536843..4537016,4537107..4537212
,4537571..4537709,4538357..4538434,4538763..4538828,4539113..4539198
,4539839..4539938,4540145..4540255,4540357..4540398,4540571..4540657
,4540913..4541002

Expression

GEO Profiles:Os09g0252100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>accccctccctcctccgcctcgttcactccgccgccgccgccgccgccagatccagcagcttcaggtcggggctgaaccttggacttggagcggccatggcttcggacaacattggctcgagagatgtatgtgttgttggggttgcacgcacccctatgggtggtttcctaggtgccctgtcttccttgtcagctaccaaacttggttccatagcaattgaagctgctctgaagagggcaaatgttgatccagcccttgtgcaagaggtcttctttggtaatgtgttgagtgctaatttggggcaagctcctgcaagacaagctgctttaggtgcagggataccaaacacagttgtttgcagcgcagttaacaaagtttgcgcatctggcatgaaagcgacaatgtttgcagcacagtcaattctattgggcatcaatgatattgttgtagccggtggcatggaaagcatgtctaatgctccaaaatacattgctgaagctagaaaaggatctcgttttggacatgacactcttgttgatggcatgcttaaagatggcctttgggatgtatacggtgattttgccatgggaaattgtgctgagctttgtgctgacaatcatgctctgacaagggaagaccaggatgcctatgctattcaaagcaatgagcgtggaattgctgctcggaacagtggtgcttttgcatgggagattgttccgattgaagttcctgttgggagagggaaaccaccggtacttgttgacaaagatgagggcctggacaagtttgacccagtgaaactgaagaagctccgtcctagtttcaaggagaatggtggtactgttactgctgggaatgcttctagtataagtgacggtgctgccgcattagtattggtgagtgggcagaaggcacaagaacttggactgcaagttattgcacgaatcaaaggatttgcagatgcagctcaagctcctgaattatttaccactagcccggcacttgccatacctaaggctcttgctaatgctggcttggagtcttctcgtgttgattactatgaaattaatgaagccttttcagctgttgcacttgcaaatcaaaagcttcttggaattccttcagaaaaaattaatgtacatggaggagctgtgtctttaggacatcctcttggatgcagtggtgctcgaattttggtcaccctgcttggtgttcttagggagaaaggtggcaaaatcggagttgctggtgtttgcaatggcggaggcggagcatctgctctcgttctcgagcttgcataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>TPSLLRLVHSAAAAAARSSSFRSGLNLGLGAAMASDNIGSRDVC VVGVARTPMGGFLGALSSLSATKLGSIAIEAALKRANVDPALVQEVFFGNVLSANLGQ APARQAALGAGIPNTVVCSAVNKVCASGMKATMFAAQSILLGINDIVVAGGMESMSNA PKYIAEARKGSRFGHDTLVDGMLKDGLWDVYGDFAMGNCAELCADNHALTREDQDAYA IQSNERGIAARNSGAFAWEIVPIEVPVGRGKPPVLVDKDEGLDKFDPVKLKKLRPSFK ENGGTVTAGNASSISDGAAALVLVSGQKAQELGLQVIARIKGFADAAQAPELFTTSPA LAIPKALANAGLESSRVDYYEINEAFSAVALANQKLLGIPSEKINVHGGAVSLGHPLG CSGARILVTLLGVLREKGGKIGVAGVCNGGGGASALVLELA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>42..103#350..411#771..869#954..1127#1218..1323#1682..1820#2468..2545#2874..2939#3224..3309#3950..4049#4256..4366#4468..4509#4682..4768#5024..5113#gttttgctcctcacccgcgatctcctctcctctccgcctaaaccccctccctcctccgcctcgttcactccgccgccgccgccgccgccagatccagcagcttcaggcaagcatctctctctctctctctctctcttccaaagcagcgtccgtgcttgccatccaccgcggcgccggccggaaacctccgcctgcgattcaaaggccacaccctctctctctcccaccgcacgcacgtccgtccacgagagcaacgagaatcccaaatgcgatcacagatcccagcgttggatgtagtagctacaatctgcgtaatcagaatctgtcctaaaagggggccttacttttgcaggtcggggctgaaccttggacttggagcggccatggcttcggacaacattggctcgagaggtacgactgatctctcgctgtctcttcttctactgaacctcacttcaattattcctgaattcctgatctaatatgttgcaatgaaggattttatttgtttggtggttggcaaattcattttcatttttgtgcttttcatgcaatgtttagttgtcaaagtactaatgggaaagaataaacgggagcatgagattcaaatcttgcatctagtggctagtttcactgctctgtgtttgttcattccaccagagtttgcctttctctgcaatcagcatgtctcggtcatttaaaaaatatactccggtaaaagcactgtgatgcactgcaataataatattttttttcttccatggtgacagatgtatgtgttgttggggttgcacgcacccctatgggtggtttcctaggtgccctgtcttccttgtcagctaccaaacttggttccatagcaattgaaggtgataccagtatcttctcatatgctgtatgtgtaattgttcttttaacccaaatataactaacatcatcagtgtggtgatcagctgctctgaagagggcaaatgttgatccagcccttgtgcaagaggtcttctttggtaatgtgttgagtgctaatttggggcaagctcctgcaagacaagctgctttaggtgcagggataccaaacacagttgtttgcagcgcagttaacaaagtttgcgcatctggcatgaaaggttacagttcatgaggcagcctttctataaattctgttcaagaaattatatttacctgatcatgggcttgtttttatttcctttctgcagcgacaatgtttgcagcacagtcaattctattgggcatcaatgatattgttgtagccggtggcatggaaagcatgtctaatgctccaaaatacattgctgaagctaggtctgcaaagtgttcttttggttgtacatcctgatacagcgcacaataaaagtacaacagaaatttaattggcaaacaatagtatgcgaggaaaagtgtagtatgaaaattgaaaatatatattctaagaagattagggccttgttcttaaacgatttcatgtgcacattgctttctctgtacttctcttccactttatctgtttacatagtaaataaatgaaacataagtctactttataagtatagagcacttaaccttcactgtggtaattagacatatttctcagtttgaaatttaaaatatatgaggttcttgttttggcttatgtacagttttaatttatgtatgtttgcagaaaaggatctcgttttggacatgacactcttgttgatggcatgcttaaagatggcctttgggatgtatacggtgattttgccatgggaaattgtgctgagctttgtgctgacaatcatgctctgacaagggaagaccaggtatttttttactagtactataaataggagtaactaccttctgttgtaatattattcttacacttgtctacctgactcaaaaaaccaaaactatcttagttattgcttctggaggttcggtaacagtgaatattaaatagaagtgtgcataaacaattgttagttcttttcagaatgcagggaaatttacattccatacagattgaatttcgtatggcataaatcaatattgcttaactgcaaggagcctactcttcctataccagggattcgccataaggaattgctagggcagattatatgatgctccatatcagtaaacaaatattctagtttgcttgtttcaaaggatggtggtgaacttgttaaaaccaaattgaaaaaagtattgtaccaaaattttgtattcttgttcaccaaatacaatcattaatttcatatataggttgctcttggtaaacagcatatgtttttctgtcgcttttatttctagaggaagttgatatatcttgatgtcttaatactagagcaagaactatcacatgtcccggtgatcacattgatttgttgtaatatttctattatactttgtaatacatatatttatcattagtaacatatctgatattttaataattcttctataggatgcctatgctattcaaagcaatgagcgtggaattgctgctcggaacagtggtgcttttgcatgggagattgttccggtgatttcctgtctgccactaattttttttatttattactaaccaaatgctcattaatggcaacagatttcatataaatttaccacaattttgaattttaaaaagctgtatatatttttcaggaaaaagaacatttctaattcacagttgatcatcaatccatatgaatctatataacaaatacattattgcaaaccatgtgcacaaatgatatattatccagagaagatcatactaactcaaaagatggtgggctcacctgtcaccaccactaggttcttttatgtgacttatttattttccttattctccttgctgtaccatccagattgaagttcctgttgggagagggaaaccaccggtacttgttgacaaagatgagggcctggacaaggtacaatctatatagcaaatatggcacgataaactaagtcttgtaatttagtcaacattcacctgtagctgtaaattgcatgtttccaagcataacttggtgccttgatgcactcttcagtgtaatgtgtattggcactaggctaaaaaacacgtcagtatgcagtaggcacaatattgttggtgttctaaaagcttgccaaggaaaagatcacatttgaacatttctgtaatattttagtgccataatggtactatgtaatttgatcattatgtgcctcttagtttgacccagtgaaactgaagaagctccgtcctagtttcaaggagaatggtggtactgttactgctgggaatgcttctagtataaggtgcttgctttgacacttattttaatttatttttaagatttgtgaggtatttctgtagtacatggttttaggactacctatgttagcagaacagttgtatcatcatattaatttacacaagtatgtgtaaatatgctgaaagacttgttattccactgcagagttttgaagttttcttcttttactaggtgatgcatttgatttgttttccctgttatcctgtgtaaccaaattcaactgttgttcttctaaattgccacccctgtaatgttttttattttcttagtactgctagtcctattaaaatgaaaatggagattccttatgaataactaaatttcacctctcccttaaatgccacttttgtcccacgtcattgagacatcagtggcatctgagggatggatgaggtaaacttttcagtggtatacaagaaaccatcctaaaaaataaaatgtcgaggtctgtataaagtttatacttgcttaaggtaaattgagttccccattaatgccacttttcaactctatgctttgttcattgactgttcttatccaattggtgcgtaaaatccccagatgtgtttgtttatccagtgagagtgtgatgcttcttagctaatttgttttacatggaacagtgacggtgctgccgcattagtattggtgagtgggcagaaggcacaagaacttggactgcaagttattgcacgaatcaaaggatttgcagatgcagctcaagtaagccacagtatcacttctaatctgacttaaacaatattgtacaccctctgaggtaccttaataaaatgatatggtttgtgaatggaaataagaatctgtcatcagcggagtacttttggagtttagtacttgaatgttattctatatctgaattcctaatcaagaattctattgttaacgcagctatcaattttgttatgcaggctcctgaattatttaccactagcccggcacttgccatacctaaggctcttgctaatgctggcttggagtcttctcgtgttgattactatgaaattaatgaagccttttcagtatgattgatcatctgtattcaacttattagtttttttttttgtaatcataatttgttccaaaaattctaatggtatttatttttgacttatcaatacaggctgttgcacttgcaaatcaaaagcttcttggaattccttcagtaagctgccttagttcaactataattatttctggaactaattgttttttaaattgttcttggaaattgcatttaagttcccttcactatttgaaattcgctggcaatctttagtgtggcccaatatttatgtattagttccttaatactctgctggtatttgctcctgtaggaaaaaattaatgtacatggaggagctgtgtctttaggacatcctcttggatgcagtggtgctcgaattttggtcaccctgcttggtgtaagttttaccttgagatgtccttttgttctatgattttctctctgttttcctatgattttatgagattct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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0252100, RefSeq:Os09g0252100