Os04g0640500
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0640500 |
|---|---|
| Description |
ABC-1 domain containing protein |
| Version |
NM_001060571.1 GI:115460871 GeneID:4337164 |
| Length |
7230 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0640500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32972942..32980171 |
| Sequence Coding Region |
32973070..32973462,32973582..32973626,32973721..32973759,32974011..32974181,32974671..32974823 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:32972942..32980171 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcttctgctccatccgcgtccgctccccgctccagctccggcgaggcgattcgagcccgccgtccgggtcccaccgcctcgccgtcgtcgtcgtcgtcggcggcctcctcttcctccgctcgcctccgcctccgcctccgccgcgatctacagcgttggtagctccgacgaggacgcgttcaccaggtgctccgggtacctcttcgaggagggcgcggcgaccgagggggagctccccacggcttacgatctcgccggcatcggcgccgtctaccgccgcaggccgctcctcgtggtccggcgggcactgcagattggcacctccttcggccgatggtttacgctgcgatacctcgaccgcgtcaacgagcgctccgacgacatgttcgagatcagggctgctcaactcaggcgaatactattggaacttggcccgacatttgtgaagattgcacaggcagtttcatcgcgaccggatgtgattccacctgcgtaccttgacgaactttcactacttcaagaccgtatagcaccattttcaactgaggttgcttttaacattatagaaacagagcttgggttgccactggacatgattttctcagagatatcaccagagcctgttgctgctgcatctcttgggcaggtttatcaggccaggcttcgttccaacaggaaggttgttgctgtcaaagtacaaagacctggagttcaagcagcaatttccttggatatctacatcttgagattccttgctggtgtcgctaggaaggctggcaagctgaacacagatcttcaggctgtactagatgaatgggcatcaagtttatttagggagatggattacagagcagaagcaagaagtgggcttaaattcagggaattatatgggaaatttagagatgtactagttccagaaatgtatctggaacaaacaagaagacgagtccttatcatggaatgggttgagggggaaaaactgtcagaagtcagagaccaatatttggttgaggtcggagtatactgctcactttctcagcttttggaatatggattttaccatgcagatccacatcctggaaatcttttgcgtacagttgatgggaagctagcgtatttagatttcggaatgatgggagaattccgacaagaacttcgtgatggatttattgaagcctgtcttcaccttgttaaccgtgattttgatggtttagcaaaagattttgttactctcggtttacttcctccaactgctcagaaagatgaagtgacaaaagcattgacaggtgtatttcaaaatgctgttgacagaggggtgcaaaatataagctttggagatctgtcagggaatcttggtcgaactatgtataaattcaagttccagataccttcttacttctctcttgtaattcgaagccttgctgtcttggaaggcattgcaatcagcttcaatcccaactacaaagtcttgggcagttcatacccatggattgcaagaaaagttctcacagacagctcaccaaagctccgatcaactttgcagacgcttctttataaggatggcactttccagattgaccgtttggagtctttgctaactgagtcgcttcgagcaagaacagagcagtccctgaccagggatcaacaagaggaaactgatagttccaaatttgcaattaaacaagtcttgtcatttactcttactgaacagggtgccttcgtgaaggatttacttcttcaggagattgctaagggattagatgcacttggagctgctacattgagttctgcaacatctgctgcagcctccagattgccgtttgctgttccatccccatcaccctcactagacaatgaggatgccactaacttgagaaatttacatcgccttctcctacttttgtccaaggtccctcagaaggaggattcatctccaattccaggatacaatagcactgaggagaacgaaggtgatagtacagatgagatttctcttgtgttatatgaaatgagatctctaccagagttgttgccagtactttctgtcattcctgagcttccaccagagtcccaacagcagtttctcctcctgccagcagatttaactaatcgtcttctgtctcgcgctgttgcaagaaccatcagaagaatattcatatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLLLHPRPLPAPAPARRFEPAVRVPPPRRRRRRRRPPLPPLASA SASAAIYSVGSSDEDAFTRCSGYLFEEGAATEGELPTAYDLAGIGAVYRRRPLLVVRR ALQIGTSFGRWFTLRYLDRVNERSDDMFEIRAAQLRRILLELGPTFVKIAQAVSSRPD VIPPAYLDELSLLQDRIAPFSTEVAFNIIETELGLPLDMIFSEISPEPVAAASLGQVY QARLRSNRKVVAVKVQRPGVQAAISLDIYILRFLAGVARKAGKLNTDLQAVLDEWASS LFREMDYRAEARSGLKFRELYGKFRDVLVPEMYLEQTRRRVLIMEWVEGEKLSEVRDQ YLVEVGVYCSLSQLLEYGFYHADPHPGNLLRTVDGKLAYLDFGMMGEFRQELRDGFIE ACLHLVNRDFDGLAKDFVTLGLLPPTAQKDEVTKALTGVFQNAVDRGVQNISFGDLSG NLGRTMYKFKFQIPSYFSLVIRSLAVLEGIAISFNPNYKVLGSSYPWIARKVLTDSSP KLRSTLQTLLYKDGTFQIDRLESLLTESLRARTEQSLTRDQQEETDSSKFAIKQVLSF TLTEQGAFVKDLLLQEIAKGLDALGAATLSSATSAAASRLPFAVPSPSPSLDNEDATN LRNLHRLLLLLSKVPQKEDSSPIPGYNSTEENEGDSTDEISLVLYEMRSLPELLPVLS VIPELPPESQQQFLLLPADLTNRLLSRAVARTIRRIFI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>129..521#641..685#780..818#1070..1240#1730..1882#2050..2085#2893..2936#3278..3368#3455..3496#3592..3700#3849..3963#4042..4091#4265..4343#4451..4501#4654..4795#5003..5047#5322..5429#5531..5572#6076..6258#6620..6739#6869..6973#ctctttttggcgcctaatcggctaatcccctccagcttccacttctccccggttcatccgctctcaaactcttcaatcctcgattccccattcgaaatttcgagtccctgagatccccacgtttccagatgcttctgctccatccgcgtccgctccccgctccagctccggcgaggcgattcgagcccgccgtccgggtcccaccgcctcgccgtcgtcgtcgtcgtcggcggcctcctcttcctccgctcgcctccgcctccgcctccgccgcgatctacagcgttggtagctccgacgaggacgcgttcaccaggtgctccgggtacctcttcgaggagggcgcggcgaccgagggggagctccccacggcttacgatctcgccggcatcggcgccgtctaccgccgcaggccgctcctcgtggtccggcgggcactgcagattggcacctccttcggccgatggtttacgctgcgatacctcgaccgcgtcaacgagcgctccgacgacatgttcgaggtccgccatgctttacgtttgcttttgatctcgtgcacgcttgctgtttgattaaattcctacatttttggggggttgttcgtgagctgattttgcattggtcggtgctgatgctgcagatcagggctgctcaactcaggcgaatactattggaacttggcccggtatgcttccgtttgcctgtactgtgtacatatgggctcgttcgtgtaccgttatgatgattgatgggtatgtcattctgctctttgatggcagacatttgtgaagattgcacaggcagtttcatcgcgaccggtgagcctcagcagccaagtagtcgttgcattttcatcacttctattttagagctttagcttatgattttgatgaattgttatctggcaaatggttagtcatgcaccatttaacagtcacatttattggagcatgaatgtgctattctgcttgcataatatatcagttgctagtttagacaactcagtggctattctcttgctactaaatgattggtgggccatggacacctcctgtctcatttgttgcaggatgtgattccacctgcgtaccttgacgaactttcactacttcaagaccgtatagcaccattttcaactgaggttgcttttaacattatagaaacagagcttgggttgccactggacatgattttctcagagatatcaccagagcctgttgctgctgcatctcttgggcaggtatgtttgttttattttttttgtaatgtcttgaagattcgatctacctcttcagcaactttgtgattacctgtttgcactttgaactgtataaacagaccaaacttgtgtgcttgtctcctgtcagctgcacttagttaaattcaactgtacgattcatgtcaacttgttgatgtttgaactgtgcgcattaaaaccgatgcacggcacaatgtttatttacttttataaagtaatattcaaaactaatttcatttatttgaaagctagcacctggaagcatctaaacttaaactaaacaaattctggctgtaacatgctctgagttgttcgataggatggggatcccaaaactgcatactgtttcagccctgctaatcaaccatgttatgttgaacaattggtgaaatgacagtgatactctgtatagtgcattgtcagatattttcatctctggacgatataacatttcatattctactattgtaggtttatcaggccaggcttcgttccaacaggaaggttgttgctgtcaaagtacaaagacctggagttcaagcagcaatttccttggatatctacatcttgagattccttgctggtgtcgctaggaaggctggcaagctgaacacagatcttcaggtaatgctaaagtcctatagattcccaatgaaatcaaataaagtggtcattgcgcaacaggaagggaagttaccatttaataagaaatctcaactatcttattcatagagattctatttatatatacttaatttataactgtttgtatctgattacttcatatgcaggctgtactagatgaatgggcatcaagtttatttagggtaactttctacacatgctcaccctttaaatatttcacatcttttcatgtcatctgaagtaatcaatgtggctataggtatgaaaattaaacattaactagcacaatccgaaaggaatggtgttattaggctgtcataacaataagctgaaaaaaaaatggaggttagcatccaaatgactgtggatcagtggaagtcaagtgtactattcaattaaagttagaagattttttgagctaacattctattctagtagtaactctaagcctagttcactaggattttgtttttttttttgccgggtcggcggaagaatgccggccaaatttcattaagattgggagtaaaatacatgtatcccgacattaaactgtcgagtcaaggtaaaagccttgaaacaaagtgagaaaaagcaaaggggaaaactatttacagaagcagcaactaaaaggtctactcctcactaaactgaaaaataccggcagctctccagaccatcacatcttctttaatgtcttcactaggattttgtaattcgaagcctgcatatatacaaatggaacgacacatttacatgccaaagaagaacttgttggaaattcaggatcatcgtatgaatatgaatagtaaagttaaataattattgatgaattgtttttaaggaaacaagcattacctttcttgcaagtctgtcctatgacttgcaatattctatgtacacttagctagttagctacctgattttaaaaataaggttcatattcttagagctacacattgaatacaggtaaatcacatttaatgcaggagatggattacagagcagaagcaagaagtgggcttaaattcaggttacattcttcatttattagcaaaagtcaattgaattgctttgtctaatatgaacactgttactatccattatcttgaaacaattcaagttacaatttgtagaaacttcaactagtctgtagttcaatagacataaactttttattactttaacaagcccttgcaatttctgaaaagtatattgttctaacatggggccagttcacagaaacattaaatccgttgctccgccttgactatgcatgagtgctatcactaaaccaatatgcattgttcattttggctgaatcgaggataaatataacacggataccccttttgcacttcctttctgcaacagggaattatatgggaaatttagagatgtactagttccagaaatgtatctggaacaaacaagaagacgagtccttatcatggaatgggttgaggtgaaatctgcactctcattcactcgttagcaacttgaacagcgcataggcaaccctagttactggcttatactgtggtcttttagggggaaaaactgtcagaagtcagagaccaatatttggttgaggtaagaccagtgcatatataagtgattgaaatcttgtacctcactattagtaacaccgttgaccagatagatctgctgacattgttacctcacaggtcggagtatactgctcactttctcagcttttggaatatggattttaccatgcagatccacatcctggaaatcttttgcgtacagttgatgggaagctagcgtatttaggtaataattgtgttattctgtttctgcctttaatgtttctgattttttagtcttggtaatgagttagttcctaaatttactcatttgctaccctttacatgaatcttgttccattttaactatctgaaacattttgttctctatgtagatttcggaatgatgggagaattccgacaagaacttcgtgatggatttattgaagcctgtcttcaccttgttaaccgtgattttgatggtttagcaaaagattttgttactctcgggtaagaataagcactaacatccagttggcgctgggtatctgtgtatccccatatctgacctatctttaatttctgcagtttacttcctccaactgctcagaaagatgaagtgacaaaagcattgacaggtactccagatctagatggatgctagcatgctaagaaaagaaattactgaaccttaaagtcgctttaccctgctactgctatccttgttacgttaattttggatcattaatgatgatataataacatatgtccatttggcacaactcacaattccctgtttttaatatctcaggtgtatttcaaaatgctgttgacagaggggtgcaaaatataagctttggagatctgtcagggaatcttggtcgaactatgtactaatctagtttatgaaaccctattttacaaaaataaatggggtttatatcaaactgttgattctctataagactgctcttaactagagttaatcttgtttcaggtataaattcaagttccagataccttcttacttctctcttgtaattcgaaggtaataagttttccctagcgtaggtatcactctctaccagtaactatatttattaacggacaacaaacatgcaaattactactctagaggtctaaagatgatgctgccttgctgttttttacatttgaaaggtttttgatgttatttttcagccttgctgtcttggaaggcattgcaatcagcttcaatcccaactacaaagtcttgggcagttcatacccatggattgcaagaaaagttctcacagacagctcaccaaa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