Os03g0111800
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0111800 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001055263.1 GI:115450254 GeneID:4331367 |
| Length |
7195 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0111800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:653034..660228 |
| Sequence Coding Region |
653043..653139,653221..653498,653598..653691,653806..653888,654029..654249 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:653034..660228 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:653034..660228 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgccggcgaccacctgcggccgggctcctacctcggcgacgtctccgcgctctccttcctcccctcctccccccgccctcttctcctcgccggcaccggatcggagctgctcgtctacgacgtcgacgccgccaggcttgtcgcctccttccaagtgttcgacggcgtccgcgtccacggcatccagccccgctgcccggacggcccgtctcctggcgatgtcaccgtgttggtgttcggtgagaggagggtgaagattttcaggattcgcgccgacttcgaggatggcgaagcgtgcggcgtgcggttggagttggagcagaggctccccggatttgatcactgggtgctggacgcctgcttcctggaggctgatgggctgctcgcgatcggtttgagtgacaattcagtggcattatgggatttgagccagcgtgtgttgcatgcccgagtgaaatcgccagagaagtgcctactgtattcgatgagaatgtggggaaactctcttgaatctcttctcgtggcttctggaacaattttaaatgagattcttatttggaaaattgtaccccgagctctggaaaaatccttgttatgctcatataagagcaacactctcggtgtagaggactatgagaatatgcatattagtgataagcaatatataacaattcatcttggaaggttaaaggaacatgaaggttcaatatttagaatagcttggtcctctgatggatcaaagttcatgtctgtttccgatgaccgtagtgctcgcatctggatgttgagttctcagtcacagaactttgtcaataaggcagatggacaaaatgatgttcagattataccgaaactcacactttttgggcatagtgctagaatatgggattgctatgtatctaattctttagttattacagtcggcgaggattgttcttgttgcatctgggctatggacggaaagctaatcaagaagttcagggaacacatcggccgaggaatatggcggtgtttatatgatccaagcacactactgcttgccactgctgggtttgattcagccatcaaagtgcaccatctttataactcatcttgtcatgacaaaatggaagacaaggtggtctcagacgatgtcaattatgattctgaggtcttttcaatatcatcccctacagtgtcaggacagtatgggcccatggacagcaaaagtgagtatgtacgatacctacactttgtaaaagaaaatgatctctatgttgccacaaacaatggatatctgcatcatgctgagctctctaattccaacaatgtaagatggaccaaggttactcaagttgctgaggtggcaccgattatttgcatggatgttatggtaatgcactcagatatttcactgaatagggatgatatcattgcccttggagatggacgtggaaatgttactgttgtccatttaactgcctgtgatcttggacctaaagtgaattcatcttttacctggccagcagaaaaagataggcagctactaggagtatactggtgcaaatctcttgaatgtagacacattttcacagctgatcctagaggtgtgcttaagttatgggacataaggaatgcccttttttcaaatacccttgatatcactacatctcagaaggttcctcttattgctgtgtttgaatcttcctttggggcaagaatcatgtgcttagatgcgtttcctcaggacgaggtccttgtagctggtgataagaagggtaacataactgcctttcatttccctaaagtactggtagaacatgagagctgtgggacgcaacagaatatgccttcatgtgatcgttttaaaggagctcatggaatttctagtgtcacaagtgttcgtataattacctcaacttctgatcatcttcaaattcacaccacagggggagacggttgcatttgctttttcaagtatgacagaaatgtgcaaaagattgaattttttggaatgagacaagtaaaagagttgggcaccgttcaatccatctttcctcctcatgcctcagaaaagcaattgcttagcacctatgcaataggtttcacttctgccgattttatcatttgggaccttgaaaatgaaacaaagctgcttcaaatatcctgtggagggtggcgccgtccttattcatattatcttggcatggtccctgagtatcagaattgttttgcctttgttaaggatcataacattcacattcataggcactgggcaccatgtcaagacaagaaattgcttcctcaagttttccatatgcagttccatggaagagaagtgcactctttgtgcttcatagatccagcaggctattcaaatcctgagaagagctcaaatctgtatattgcaacaggatgtgaagatggaaccatgcgacttacagggaactcaattaatagtgctggaaaatggtgttcctccaagctgctgggggagcatgttggtggatcagctgtgagagcgacatgcttcgtgcagaagggctacacatcgttagataaatcatgtaacatcatccccaatggcaactctgatgacactttagtcaaaaacaaggataacatttccttattaatatccgttggatcaaagcaagtcctgactacttgggttttacagcctaaggttgcagaaaatagacatatctgttctagtggcttagatgtagactccaagcaaagcttgaaaggtgattcagccatgacatttcaatggctttctacccacatgcctccaaagcttaccaataggttgaaaactggcaatgtaaaaaataataatgaggaaggggattcctctatgatgcaacccaaccagtttattgtggatcagctggaaaatgactggcgttatctttcggttacagcatttcttttggaacatccttccaccaattcgacagtgtgttttgttgttgctgcttgctctgacgctacagtcgtgctccgtgctcttcttttgccttctaggctatggtttgatgttgccttgttggctccacagggatcaccagttctggtgctcaagcatattattgctgcagctagtgtcaactgcaaagacaccgcagaccatggagatacatacattgttgtgagtggatctacagatggtagcattactttctgggaccttacagatactattcatggatttatgcaactagtatcagagactcaaccacacatggttattgattgccaaaagcggcccagaacaggaagaggaagtcaaggcggtcggcgcaggtggagaacactgccgggccgttctttgaaaaagataaataaagagacatcgatccctgatgggagcatcccgaatactccaaatgccactgaaaatacatctgaaacttctaatgtggaagaaactgatgccacaaaccagaactatgcattctcaaatttgcaatcgtgtaatatacctgaagtgacaccaatgcacagattctccggtgttcaccagtcaggcgtcaactgcctccatgtctcagagatgagggcttgctcgtactcgacacctggcatgtcttactgtgtcataagcggtggggatgatcaagctgttcactgtttcagttttacattaggatctcttcaggattgcgcaataaatacaagcctagactcacctgacaatggtgcagttaaaattatttgtcaacatagggttccttctgcccacagttcagcagttaaaggcatctggacggatggcatatgggctttctctactggccttgatcaaagagtaagatgttggaagatggagtcatctggcaaattcactgagtattcccatgctatcatcagcgtacctgagccagaaactttggatgttgtacatgaccgtgcagagaggaaatactgggttgctgttgctggaaggggaatgcaaatggttgagttcttgtcagcagaaaatgacgaggaagaaatatcaaaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGDHLRPGSYLGDVSALSFLPSSPRPLLLAGTGSELLVYDVD AARLVASFQVFDGVRVHGIQPRCPDGPSPGDVTVLVFGERRVKIFRIRADFEDGEACG VRLELEQRLPGFDHWVLDACFLEADGLLAIGLSDNSVALWDLSQRVLHARVKSPEKCL LYSMRMWGNSLESLLVASGTILNEILIWKIVPRALEKSLLCSYKSNTLGVEDYENMHI SDKQYITIHLGRLKEHEGSIFRIAWSSDGSKFMSVSDDRSARIWMLSSQSQNFVNKAD GQNDVQIIPKLTLFGHSARIWDCYVSNSLVITVGEDCSCCIWAMDGKLIKKFREHIGR GIWRCLYDPSTLLLATAGFDSAIKVHHLYNSSCHDKMEDKVVSDDVNYDSEVFSISSP TVSGQYGPMDSKSEYVRYLHFVKENDLYVATNNGYLHHAELSNSNNVRWTKVTQVAEV APIICMDVMVMHSDISLNRDDIIALGDGRGNVTVVHLTACDLGPKVNSSFTWPAEKDR QLLGVYWCKSLECRHIFTADPRGVLKLWDIRNALFSNTLDITTSQKVPLIAVFESSFG ARIMCLDAFPQDEVLVAGDKKGNITAFHFPKVLVEHESCGTQQNMPSCDRFKGAHGIS SVTSVRIITSTSDHLQIHTTGGDGCICFFKYDRNVQKIEFFGMRQVKELGTVQSIFPP HASEKQLLSTYAIGFTSADFIIWDLENETKLLQISCGGWRRPYSYYLGMVPEYQNCFA FVKDHNIHIHRHWAPCQDKKLLPQVFHMQFHGREVHSLCFIDPAGYSNPEKSSNLYIA TGCEDGTMRLTGNSINSAGKWCSSKLLGEHVGGSAVRATCFVQKGYTSLDKSCNIIPN GNSDDTLVKNKDNISLLISVGSKQVLTTWVLQPKVAENRHICSSGLDVDSKQSLKGDS AMTFQWLSTHMPPKLTNRLKTGNVKNNNEEGDSSMMQPNQFIVDQLENDWRYLSVTAF LLEHPSTNSTVCFVVAACSDATVVLRALLLPSRLWFDVALLAPQGSPVLVLKHIIAAA SVNCKDTADHGDTYIVVSGSTDGSITFWDLTDTIHGFMQLVSETQPHMVIDCQKRPRT GRGSQGGRRRWRTLPGRSLKKINKETSIPDGSIPNTPNATENTSETSNVEETDATNQN YAFSNLQSCNIPEVTPMHRFSGVHQSGVNCLHVSEMRACSYSTPGMSYCVISGGDDQA VHCFSFTLGSLQDCAINTSLDSPDNGAVKIICQHRVPSAHSSAVKGIWTDGIWAFSTG LDQRVRCWKMESSGKFTEYSHAIISVPEPETLDVVHDRAERKYWVAVAGRGMQMVEFL SAENDEEEISK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10..106#188..465#565..658#773..855#996..1216#1364..1502#1597..1679#1793..2005#2107..2463#2556..2727#3054..3245#3332..3538#3630..3722#3926..4125#4298..4807#4920..5000#5083..5166#5289..5932#6026..6176#6253..6349#ctcctccccatggccgccggcgaccacctgcggccgggctcctacctcggcgacgtctccgcgctctccttcctcccctcctccccccgccctcttctcctcgccggtatcacctccacctcctttctccgtgcgtgtttccatcactgaatgggtgggtgatgtgctgctcgcgttgctgctgcaggcaccggatcggagctgctcgtctacgacgtcgacgccgccaggcttgtcgcctccttccaagtgttcgacggcgtccgcgtccacggcatccagccccgctgcccggacggcccgtctcctggcgatgtcaccgtgttggtgttcggtgagaggagggtgaagattttcaggattcgcgccgacttcgaggatggcgaagcgtgcggcgtgcggttggagttggagcagaggctccccggatttgatcactgggtgctggacgcctgcttcctggaggtatcaagcttagctctctctctccaaggctcttagctacttgcctctgtgatgaaaaccactatttacttaatggtggttaatttgatctgggagcaggctgatgggctgctcgcgatcggtttgagtgacaattcagtggcattatgggatttgagccagcgtgtgttgcatgcccgagtgaaatcgccaggttagatgagcaattgagcatctcggtgttccgtttgtccttactagatatggtatcttctgtgtgctcaaagctcggttgacatttgattctggtattgttttccggatgcagagaagtgcctactgtattcgatgagaatgtggggaaactctcttgaatctcttctcgtggcttctggaacaattttaaatgaggtatgtttttgcaggctctgagctgtttctctttcagctccactctacgccaagtaaagcttgagataaaaagaactctttggtttagggagagttttattatatagaaattcgctctgagtagtaactttatttcgcagattcttatttggaaaattgtaccccgagctctggaaaaatccttgttatgctcatataagagcaacactctcggtgtagaggactatgagaatatgcatattagtgataagcaatatataacaattcatcttggaaggttaaaggaacatgaaggttcaatatttagaatagcttggtcctctgatggatcaaagttcatgtctgtttccgatgaccgtaggttggttcattttccctcacttccctctgcattctttacactggattttctttgcttacttatcgggcttctggaacatttttttgtttcgacgcttctgtcttccgtattacttgtatcatctacctagcttcgttgttatggcagtgctcgcatctggatgttgagttctcagtcacagaactttgtcaataaggcagatggacaaaatgatgttcagattataccgaaactcacactttttgggcatagtgctagaatatgggattgctatgtatctaattctgtaagttgaccaaacttttttttttgtaacttgaatatagtttaagtttctagctgagcttatcttgatgtttccaactgaaccggccttttagttagttattacagtcggcgaggattgttcttgttgcatctgggctatggacggaaagctaatcaagaagttcagggaacacatgtaagttgggtagagcacttagttagattgttagctggagtttaacaatttggacgggaagaaatgtctccgttaggatgacttaaatttgcggtgctgcttccatgttacagcggccgaggaatatggcggtgtttatatgatccaagcacactactgcttgccactgctgggtttgattcagccatcaaagtgcaccatctttataactcatcttgtcatgacaaaatggaagacaaggtggtctcagacgatgtcaattatgattctgaggtcttttcaatatcatcccctacagtgtcaggacagtatgggcccatggacaggtatggtgtttctgtgatttgtcataatctacatgttatctctattttctgtagttttgtagcgtgccagtgaaagtaattatttgtttggttcatcacagcaaaagtgagtatgtacgatacctacactttgtaaaagaaaatgatctctatgttgccacaaacaatggatatctgcatcatgctgagctctctaattccaacaatgtaagatggaccaaggttactcaagttgctgaggtggcaccgattatttgcatggatgttatggtaatgcactcagatatttcactgaatagggatgatatcattgcccttggagatggacgtggaaatgttactgttgtccatttaactgcctgtgatcttggacctaaagtgaattcatcttttacctggccagcagaaaaagataggcagctactaggagtatactggtgcaaatctcttgaatgtaggtctgtggaatggctgatctttttttttttaacttaaacacttcagtcggcaggcattcattgttctcgccaatttcccttctcctttgcagacacattttcacagctgatcctagaggtgtgcttaagttatgggacataaggaatgcccttttttcaaatacccttgatatcactacatctcagaaggttcctcttattgctgtgtttgaatcttcctttggggcaagaatcatgtgcttagatgcgtttcctcaggacgaggtaactattttagaactttccaccttctctttgaaggaaaagtcaaacatgctgaattgctgactgatgtaatattgtgtgagcagcagatggtaatgttatggttgtaggaatgttgattgtatagtgttatgtagctagaatgctagtgcctgattcataccaagcagaaagaagagccaaataaggaaaaaaattatttggtagcctgtttggtagaagagaatgctatgaccctgccagaaagaatgaaataacttgaacatagttttcatggacaaaacatatgcaactgtgacatgtgacgtttctcttattccatgcaggtccttgtagctggtgataagaagggtaacataactgcctttcatttccctaaagtactggtagaacatgagagctgtgggacgcaacagaatatgccttcatgtgatcgttttaaaggagctcatggaatttctagtgtcacaagtgttcgtataattacctcaacttctgatcatcttcaaattcacaccgtacgtttagagtgcttttgttattcctttgattgagttcatgaacttagcttggcattcactactgatccttgaacattttatagacagggggagacggttgcatttgctttttcaagtatgacagaaatgtgcaaaagattgaattttttggaatgagacaagtaaaagagttgggcaccgttcaatccatctttcctcctcatgcctcagaaaagcaattgcttagcacctatgcaataggtttcacttctgccgattttatcatttgggaccttgaaaatgaaacaaaggtaagtaggtacatgctgtatgaattgggacattagaacatagaaccaatagttcacttaatctgttattctgaattttcgtcttctgtagctgcttcaaatatcctgtggagggtggcgccgtccttattcatattatcttggcatggtccctgagtatcagaattgttttgcctttgttaaggtttgtgtttcccctgcttgtggttcgttctctctttgtcgtgctgtatttgcaagtttagattgcatttatatggctcttagtgtgctgaccactctatactccttactgtgtgtggattattaaattataaaagtgagtcacctgaggtgctatatatttttgctcacatagttaaattgatcctgttggttttcaagcaggatcataacattcacattcataggcactgggcaccatgtcaagacaagaaattgcttcctcaagttttccatatgcagttccatggaagagaagtgcactctttgtgcttcatagatccagcaggctattcaaatcctgagaagagctcaaatctgtatattgcaacaggatgtgaagatggaaccatgcgacttacagggtaatgatttgtctttgatacacaagcatctagcacggctcgatgtaactttctggttctctattctatgcagtgttgaaaaagcatagctgttcatttcaggtgttctgtaaacggtataattttttgaaaggatttaaatgataccttttggtctcgatgtttgttacaggaactcaattaatagtgctggaaaatggtgttcctccaagctgctgggggagcatgttggtggatcagctgtgagagcgacatgcttcgtgcagaagggctacacatcgttagataaatcatgtaacatcatccccaatggcaactctgatgacactttagtcaaaaacaaggataacatttccttattaatatccgttggatcaaagcaagtcctgactacttgggttttacagcctaaggttgcagaaaatagacatatctgttctagtggcttagatgtagactccaagcaaagcttgaaaggtgattcagccatgacatttcaatggctttctacccacatgcctccaaagcttaccaataggttgaaaactggcaatgtaaaaaataataatgaggaaggggattcctctatgatgcaacccaaccagtttattgtggatcagctggaaaatgactggcgttatctttcggtta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|
| External Link(s) |
