Os03g0300300
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0300300 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001056391.1 GI:115452510 GeneID:4332567 |
| Length |
5482 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0300300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:10606895..10612376 |
| Sequence Coding Region |
10606981..10607074,10607181..10607332,10607420..10607535,10607707..10607861,10608605..10608693 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:10606895..10612376 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcccgcggccgccaccatccgcgacctgctcacctccttcagccccgccgcggacttcctcgccctctcctctggcgacggccgcatcaaggtatgggacgccgtgcgcggccaccttcagaccgagttcgctgatatcccgccggtggaggtgggcggcggcgcgcgcgcccccggggcgaagcgcggtcacctcgcactggactacacctgcatgaagtgggtacagctatcgagcaagaagaagcggaaggcagggagttcgctgctggtgcttggcactggcagtggagatgtccttgcacttgatgtcgccgcagggcagtggaagtggagggtcactgattgccaccctgggggtgtcacagctgtagcctactcgaagcatgggcgaagtttgtacaccggaggcactgatggcatggtctgtaggatcaatgcctcagatggctctgttgtagagaaatttaaatcttcatcaaaagcaatttctgcattagctgtgtcaccagatggggagattttagcaacagctgctggccagttgaggacctttgatgcttctgataacaagaagattcaaaaattctctggccatccagtagctgtgaggagcatggtttttagtggtgatagccaatatgttctgtcatctggagttggggaacgctatgttgccatttggaagttgggtagtggtaaaactcagagttcaagctgtatactctctatggagcatccagcgatctttgtggactgtaaatgttcagacattaatgatacagaaggagaaatacatgtgttggctatttctgagattggtgtctgctacttttggtctgggactaatatggatgacctgcgtaataagaagcccactaaaattgcattgtctgattcctctctttcaagatctaagcaaggttttgcaatatttgccgcaaaactgcaaggaatagatggccctaattctgcacatgttctgctggcttatggatctgtggtgaaaccgtcttttgacaaactgttggttcgttatggcatggatattagtttgggtgtatctgatgatggagttctcttacccatgattcaacccacaaagcctcagaaaggccaatctgctaaaaagcaaggaattataacggctctagaccgtgctaatgcagaagatgcaatccttcctctcccacagctccatacgcaggaaaagaaaaggaaacataatgcaacagaatccagtggtgacatccagtctgcacctcatagtgaccttagttctacaaaattgattgagaaaagagctcctatgcaaagaattgaagatgacagtgtatgcatcgaagacatgatgcggaagtgtggagttattgattctagagttgatcagggcatggaaggtcatcctagcatacccactagtattttatctgatctatttggcagcagcagtaaaatcgatgctaatttacccaacaagaagattcgagcacatctaagatccttgaagcctggagatgcttgcgaacttttagaaaaattagtatcttcatggaaaacaagatctggtagtgcagaggttgttttgcggtggatatactgcttattaattatccatggtcgttttatcccctttgagaaatctaaaaaaataattagcgaccttgagaagatgtgtggggaaagatacaaagcagctgaagatttactgaagctttctggtcgtcttcgattgctcatggctcagatcgtcaaggatccaaacgatgtttctgagcttccatcagaggagatgcaggattcagcggctgctcagtctgatgaagaggaggaagatgatgaaattgatgaaacggtgtatggtgaagacgctgattcgtctcaaacaagtgatgacgacgctgaatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPAAATIRDLLTSFSPAADFLALSSGDGRIKVWDAVRGHLQTE FADIPPVEVGGGARAPGAKRGHLALDYTCMKWVQLSSKKKRKAGSSLLVLGTGSGDVL ALDVAAGQWKWRVTDCHPGGVTAVAYSKHGRSLYTGGTDGMVCRINASDGSVVEKFKS SSKAISALAVSPDGEILATAAGQLRTFDASDNKKIQKFSGHPVAVRSMVFSGDSQYVL SSGVGERYVAIWKLGSGKTQSSSCILSMEHPAIFVDCKCSDINDTEGEIHVLAISEIG VCYFWSGTNMDDLRNKKPTKIALSDSSLSRSKQGFAIFAAKLQGIDGPNSAHVLLAYG SVVKPSFDKLLVRYGMDISLGVSDDGVLLPMIQPTKPQKGQSAKKQGIITALDRANAE DAILPLPQLHTQEKKRKHNATESSGDIQSAPHSDLSSTKLIEKRAPMQRIEDDSVCIE DMMRKCGVIDSRVDQGMEGHPSIPTSILSDLFGSSSKIDANLPNKKIRAHLRSLKPGD ACELLEKLVSSWKTRSGSAEVVLRWIYCLLIIHGRFIPFEKSKKIISDLEKMCGERYK AAEDLLKLSGRLRLLMAQIVKDPNDVSELPSEEMQDSAAAQSDEEEEDDEIDETVYGE DADSSQTSDDDAE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>87..180#287..438#526..641#813..967#1711..1799#1929..2463#2592..2759#3411..3589#3711..3790#3888..3996#5012..5086#5182..5343#gagcaaaacctttcgccgcgcagccacctaaacccctctcctcccccttcctctcccgccgccgccgcgcgcgcgagccggcggccatggcgcccgcggccgccaccatccgcgacctgctcacctccttcagccccgccgcggacttcctcgccctctcctctggcgacggccgcatcaaggcatggagctcgaagctttccgcccgcccatcctccaaaccgccgggagctgcacggttactgatgatgccatgggctaactcgatcctttccacctccattgcaggtatgggacgccgtgcgcggccaccttcagaccgagttcgctgatatcccgccggtggaggtgggcggcggcgcgcgcgcccccggggcgaagcgcggtcacctcgcactggactacacctgcatgaagtgggtacagctatcgagcaaggtgagcattgcccccgaattttcgagcttctacggttggtgttgtggtaccgtgtgcctatcgtgtgctcgtgtttttgccttgcagaagaagcggaaggcagggagttcgctgctggtgcttggcactggcagtggagatgtccttgcacttgatgtcgccgcagggcagtggaagtggagggtcactgattgccaccctgggtacgtttggtgcttccatgggaactcgtggcttcatttgttaaactatactccaagctcattgaacccttgattgtcgctttgaacatgtttggaatttctatgttaatctccgcaagctttagctagatgtgttctcttacattggagtgcttgtttttatgtgttcaggggtgtcacagctgtagcctactcgaagcatgggcgaagtttgtacaccggaggcactgatggcatggtctgtaggatcaatgcctcagatggctctgttgtagagaaatttaaatcttcatcaaaagcaatttctgcattagctgtgtcaccaggtatgcccatgaaattacgccgctggttttatgtctggtttcacccccactgaactccccatttgctaactatgcatacactactttacttcctatgttgtgtgcccgttggtcatctggtttacctatattgatgttttaggatattaaactgtcttctttaatatttgtcaactgtaacttgattgccctgagggacactaataatagttgaagtgttgagtgttttctgtaacctttgtaatgaataacattttcaacttattttgccgtgctattgtgttgatgccccgctgttggctaatttatggcctaggagttctaagtgcctcttgagatgttcccttttcacatgtaacattaatgttcttctcgaagtagagatggaaatgtaacataggtatacctgtcggacacacgaattgaataaaaaaaagcccagagttcttccttgaaatatggtgtattgattatgcatatggatttagcttgttgcatgaatttgaagcttaaaatctttatttatcaattaataagatgtatgtatagaaatattctctttgctgatatttgtagtttgcttaggccttttaggatctaatatctatattgattatatgtcttgtgctgtaacaaaacatgcgtatgagtatgttgcacttacatctagtctctatctgaaccatgtccaccctagctcaaacttcaaagtaacaaatactgcttttgcttcattttattagatggggagattttagcaacagctgctggccagttgaggacctttgatgcttctgataacaagaagattcaaaaattctctggccatccagtgagtgtctttgcttcctcgtcctttaagtgtgttctacttctgagattgtttatctttctgctcgtattattttgtcctaaaatgctaaccttctgctattggctaccctaaaattaacatttttaggtagctgtgaggagcatggtttttagtggtgatagccaatatgttctgtcatctggagttggggaacgctatgttgccatttggaagttgggtagtggtaaaactcagagttcaagctgtatactctctatggagcatccagcgatctttgtggactgtaaatgttcagacattaatgatacagaaggagaaatacatgtgttggctatttctgagattggtgtctgctacttttggtctgggactaatatggatgacctgcgtaataagaagcccactaaaattgcattgtctgattcctctctttcaagatctaagcaaggttttgcaatatttgccgcaaaactgcaaggaatagatggccctaattctgcacatgttctgctggcttatggatctgtggtgaaaccgtcttttgacaaactgttggttcgttatggcatggatattagtttgggtgtatctgatgatggagttctcttacccatgattcaacccacaaagcctcagaaaggccaatctgctaaaaagcaaggtatactgctggtatctatagatatacacataatcctgcacttctgtttggtcccttgcctccattgcagaacgctcaactattgtcaatggttactcttgggctaaatctcaattgttttcttgtaggaattataacggctctagaccgtgctaatgcagaagatgcaatccttcctctcccacagctccatacgcaggaaaagaaaaggaaacataatgcaacagaatccagtggtgacatccagtctgcacctcatagtgaccttagttctacaaaattgattgagaaaagaggtaaatcatctgtttgtagcatcttcagtagtcataattcttttgttctcatggcagtgtagatacgaactggtacataactggcacagttagctagtggaagtgtggaaccacataagtttgtatagtacatatatgtgtgcttccgcatgtttgggcaaacttcaaataaatatactataacatcttataagttacaaatgaaaattattattataatccattctaataattatatacatgagtgcatgagatcaatctacctagcctacgaatacgcatgcaaaataacctggtcttttacaaaagatccttcaaacaacaaacatgttttcgggagtggggaaatgggtgtagagcacacccatttgcctccaactccatctcaaaggaagataagtgacgttatgtgtccatatgatctttctctagagacttttaactctgtgggagcaatttattgcaggggcctatacccttgtggttttcatggcaagaatgtaacaactgctatgagcaataattctagtctctcagttgttataggttttactatagttttaacattaaacacaaattttgttatatttaacatgtatttctgttaaattgatcttcactatttgctcaaaaacccttttgcttgtctagctcctatgcaaagaattgaagatgacagtgtatgcatcgaagacatgatgcggaagtgtggagttattgattctagagttgatcagggcatggaaggtcatcctagcatacccactagtattttatctgatctatttggcagcagcagtaaaatcgatgctaatttacccaacaagaaggtttgtgagaactgaatttcagtcaaatgttctgtacttccaccatataactgtttgcatgtttacacattacagtatatatacaactgatgaaacctgatgcattgatatggttcaacagattcgagcacatctaagatccttgaagcctggagatgcttgcgaacttttagaaaaattagtatcttcatggaaaacaaggtgtccatgactcttttcccatgtttgttcccccacaacgcattttcattcgtttttatccttgtatgcttaccaattgctgatttattctctacagatctggtagtgcagaggttgttttgcggtggatatactgcttattaattatccatggtcgttttatcccctttgagaaatctaaaaaaataattagcgaccttgagaaggtattatatgtgttaccagtactatctcttgtgtgctatgcagattatttgaaacatgttactgttgtggttgtcatcatgctgtgttgtagtggagttggggggttaagctattagcaactattgccttaaatgactgcagaatgtggataacatattctgattctaatttaaagaccaccaatgcaggcagggtatttcagaatatagtttcgtgacctatttttctgataaaagtacaagtaacaatgatggcaagaactcacctttgatgagaacttgccaagtcacaatctgagccatttgatccactctagtggatgctaatgtagttgttttcccatgagagttctcaagtcgtcattgaacaatggattcccattttagatatctcctgacaactcaaacaatgttgtattgacacttcataacatcaattaaaaagtcatgtgcagtattgagcaaagcacatagaaagttaaagaaataagcatgctgtgtatctagattgggaagatgtcatgctatgcagtgctagtaaattatagatatctttattttatgtaccatgactgatttgatcaagttgcccccaccaatgctggccaatttctgttatgtcaaatctggggttgtcaatttggctgcccaaacttataataaatttactaaagtatattgcatgcccagtatttacaaatgaaacacttcccaatttcaacaacatggtcagattttgatcaatattacttggaaaaaaactgagactataactgtgtgtttactacgtcaagaaaaagaactgaaaattcaaaggtcgaactgaaccaccgcaactatgagcttaccatgtcttaccatgtcgaa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|
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