Os03g0680500

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0680500

Description

Tetratricopeptide-like helical domain containing protein

Version

NM_001057438.1 GI:115454604 GeneID:4333725

Length

7177 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0680500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:27782077..27789253

Sequence Coding Region

27785662..27785742,27787607..27787708,27788474..27788644,27788729..27788808,27788956..27789019

Expression

GEO Profiles:Os03g0680500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:27782077..27789253 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>gctgtgtcaaactggactgttgaaggaattcttgcccaggccaaatcgaaacatgccaaatcaaaatgttcaaagcccaaggacaaacaggatgatcagaatgaaaaggctcagctcaaactatgtggtgagaaagctgttaagagaaaggactaccgtggtgcctcaaatttctacagtcaggcaattgagatggatcctactgatgcaacactctattcgaataggagcctttgccatcttcaaatgaccgaagcggaggcagctttgtttgatgctgagttttgcatacaattgcggcctgaatggataaaaggttattacaggaaaggagctgctctcatgttgctgaagaagcacgaaaaggcatgcgatgctttcatggctggactgaagctggaacctggaaatgctgagatggagaaagcattacgggaggcgattgaggcgatgaagaagcatcatgtcgctacaaagaacttcaagccatccgattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>AVSNWTVEGILAQAKSKHAKSKCSKPKDKQDDQNEKAQLKLCGE KAVKRKDYRGASNFYSQAIEMDPTDATLYSNRSLCHLQMTEAEAALFDAEFCIQLRPE WIKGYYRKGAALMLLKKHEKACDAFMAGLKLEPGNAEMEKALREAIEAMKKHHVATKN FKPSD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3586..3666#5531..5632#6398..6568#6653..6732#6880..6943#gattgcgccggacgcaccacgcgaccaaccacgaaccacgccacacgctcgccgacttcttcgcctctccaaaagtctcctctcctcgcgaaaaccctagctggcgctcaaggcggcggccgccgccatggccgacccgagcttcaacttccgcgtcggcctcgccctccgccgcgcgctcccgtactacaatgacgccggcccgcagagcgagttcttcgaggcggccacccgcggcaacgtccgccgcctcaggggtgagccgtgagctcgctgcgtcctttcccccctgcgcgatctccgctgccggccctttgcttcgcgtcttactcctgttttttttttctggatttttctttcttttttttgatttttttacgcattttttgttggatttggtgtgctactgaagagctagcgagcggcaaggacgcggaggggaaggcgtggctcgccgacatgggcttctcgggcatcgggccgctccaggctgcagcgcgcttgggggaagtggagtcttgcaggtgcatggtggaggagctcggcttcgacatcaatgccggcagccagcttggtacgtacgtatgttgtattgttgttcctcctatgtagagctctgctctgcttccttcgtagtgattgctctgccgtatccttcgatggaagtaaatttcagtcttggaacattgctcattttgtgtatgccccccattgaattcatctcatcaattgaacattgcgtcatcttgatatgcactccggtttgtggtttatggctctctagtcgctactcagtcttaatgaccatggatcacttacttaggtcgcaactaattgcattggagagtttttgtgtaaatccatccttagtttggaggggtgccgataatctcaagttctcaacagttacttgtttttttatggttattcccaggcataacagctttggctgctgctgcgttggatggaagactggctgctgcaaggtatcttcttgaccatggggctgatccaaataagaagtgcaatgcatgatctgttcctcttcactgtgctgcaaaaaatggttatctttctaccttcattcagctctatgttgaccagttaatctcttgattgataaaaagttggaaaaagtatagcagggtgcttcgttgtgtgccggagcagtttctgtttctgccatttagacatttacgcctctctttttttttcattttacgtaattcccatagatctagtgaaggtagtttgaatatcgaggtatataagaaggatgattgatttgactgattttccctagtccctgctggtccttggtgatgtgcagagtccagacctgtaatgccgattagcatctctgttctgttttttatgctacttctctgacaagctagatgagctcactcacatgttttgattttttttctacgagttggtgtaacttatacatattccagttttacttattttcattatgaatgttagtacatcctggaacttctatttgccttgttataataaagtgggaacaaatatattcttgttcgtgcgatcagtttcccgaatcatcgtattggatggcatcttaaatagttaacttcagccaatagccatcaagtaaaagatgcatgctttggtgtctaggtaggacagtaaaaatattatttttatgaatcatgcatcttttaagaatatatatatttctgttgtttagccatctgtttgataaatgcttattttcatggtaattttgtcatgttatttttgtgcatcttgtttaggtcatgatgaagtagcacgactgttgctatctagaggagctagcattgatatagcttattttcatgggacaccactacatattgctgctgcatatgggaaggctgatgtcatgaaagttttattggagcaccatgcagatgtaagaagtagattccatgtcttctcatattagcctttggtgctaacttggtacaatgcaaatgcatttagtttggatcacagttttatttagtatttctcttgtgaaccttgccactcaagctggtggggtgataaatcttacccatgccatgaaaaacgtgtttttttggttccaattgatcaacacactccatatacatttgtgttgatgaaaagctgttgttgcagttgacacttagccatgtattgcaaattgcataggactaatgattttgttgcctgttttctaaataaaatatggaggttcatgagaagagcagatactttttagggaatgcacaaaaggattgcccatatttgtattaagaagaataactgcatgctcctatttatattttgcaggatatagtttgcatctatatttatatcccaacatttaatatctggcatattatgtaataaatgtaattcaatatgttttcactaaaggcttgttcagtttgctatcattttcaaccttaccaagttttggcaaaattaccaaaaaagtggttacatttagtttgttgccaaattttagtaagcacatataaaatcttgccaaaatttggcaaccttgctaaaattttggcaaccttaccaaaatttggcaatgccaaaacttggtaaggttgaaaatggtagcaaagtgagcaggccctaaaggcagtattttttttccccaatttagccaaacaaggtttcagaagagttgggtacaccgttggttgcaactcttcatgctacttctcaaggactagctgagtctatttcactgaagtgtgtaaagctacttgttgaggtaacttgaattcactttatgggatcaatctgtttgtatgaacagtggcattgataattttgtgtgtttcatacaaataggcaggcgctgatgttaacttcagtgatcgtgacactccgttggtggtagcaattactaatggcttgactgcctgaattaaatacttgctaaaggctggcgcagaccctaatatcccaacttgtgatgtgagtttttgtattcttttgacttcctcatttccttttcttatccaaaaagttgtgaccaatgctagatatgcccccattatacataattatggcttatcaccttaagcccttgggccttgactgtcgagaatttgatctgactactaatatgggtagctaaaaggttgaaattttttttaatcgtgcttgtacaaataattaagttcttttgcgagtatgtaattggtttttgggttgagtgatgtttaggcttctacaaaatgtagctcagatgacatttaaagtgaagctcagatggcatttaaattgcagctgaaaatggcatatgagtgggcatcaataactccacatattttgtttcgaaaaaaaatatatccatctatttgtgcacatttcttctatttataattggcttatatacttctgctgttatttgtataatgaatgcttgtgatattcctgccttggtcgatattgcttttgaggtagtagttatataattgttgttctgttactttgtagtgtggtgccttgccaatacaacttgctgcaagctatggaagaagaaaggacgtggaattactgttcccgttaacttcccccatttgagctgtgtcaaactggactgttgaaggaattcttgcccaggccaaatcgaaacatgccaaatcaaaatgttcaaagcccaaggtgtgagtgaaaacaatttgttgagactgttctgtatttccttatgtgcctgtcaatttttttatagtttaaatattcgcacctatgctttgggtcacatgaatgtattgatgatattgttttctctagtgcatattactcccttcggttttatattgctattattgaggttcaagttgggattgtagaaatatgagctgcccctatgaaatggacccacatacacctagattcctattattatgatcgagaaacaaagaaacacatattagcatattaggtctcgcttgatcaagtctcctagctaacgggataggcctaccgtcaacagaatctggtatggccttatcctagtctttggacccttatgcttgggtattgattcatggatatggtacaaattccaagactaggatggaggtggaattgctctcatcaatggtgagcttcccaaaagctaggaggttgtgatcaacctaagtgtttgttgattgcttgatcgtaataattgcattgggtccctttcacatggatgactcaggatgctgtagtacctgtgggactgctcatgttagcttgatcctcaatattggatccttacattccttaccaattagaaattttgaatacacacaataactaatcccaatgttaggaaagtaatcaattatttattcattgaatattcatattttgataaggaaacccttaatcctgatgataggtatattctgtactgtttgagctgtacaaacacacataacacagaatgtcataatcttatcccatcatgcaaggagagtagttttttttttctagattccttttgtactagtcagggcaaggaaaactgccagagagttcggtatggtttctactatttgacataacagaaatgaagagactcattatttgttgttttagttttatttgagaaatgcttgatgtgatgttatttggtgatacataagatttgcagaaaatcttagaaaaattggagtttgcaaagaattaatgaccagtaactgtctaggtattgaccaatggctacacatgtgctccaaaaacataagcttagaagtttaaggttcagttgcggttatgtactgctatgcttggtgttaagctattgttgaattcagttgaaagtttttttgtttgttaagaaatcaaattaagtgtatacaaattgtgtaaactgaatgtttttgtcacaacttctctttcttcgaagcatgataattcttggcttgcaacttggatga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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0680500, RefSeq:Os03g0680500