Os03g0833300
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0833300 |
|---|---|
| Description |
Similar to Squamosa-promoter binding-like protein 8 |
| Version |
NM_001058343.1 GI:115456414 GeneID:4334685 |
| Length |
7584 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0833300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:35858788..35866371 |
| Sequence Coding Region |
35859225..35859662,35859886..35860467,35860555..35860693,35860808..35860949,35861051..35861168 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:35858788..35866371 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:35858788..35866371 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggctgcccgggtcggggcgcagagccgccacctgtacggcggagggctaggcgagcctgacatggacaggcgcgacaagaggctgttcggctgggacctcaacgactggcggtgggacagtgaccgcttcgtcgctacgccggtgcccgccgcggaggcgagcggcttggcgctgaacagctcgccgtcttcctccgaggaagccggggccgcgtcggtgagaaatgttaatgctagaggtgactccgataagaggaagcgggtggtggtcattgatgatgatgatgtggaggatgacgagctggtggagaacggcggcgggtcactgagcttgagaattgggggtgatgctgttgcccatggagcaggggtgggtggtggtgctgatgaggaagacaggaatggcaaaaagatcagggtgcagggaggcagtcctagtggccccgcgtgccaggtggagggctgcactgcggaccttactggtgtgagggattaccatcgacgacacaaggtctgcgagatgcatgccaaggctaccactgctgtggttgggaacactgtccagcggttctgccaacaatgtagtagattccaccctcttcaagaatttgatgaagggaagcgaagttgccgccgacgtttagcaggccacaacagacgaaggaggaagacccgccctgaagttgctgttggtggttctgcatttactgaggacaaaattagcagttatttattgttgggtctccttggagtatgcgccaatttgaatgctgacaatgctgagcatttaagaggtcaggagttgatatctggtcttttgagaaacctgggggcagttgccaaatcattggatccaaaagaactctgtaaactcttggaggcatgccaaagcatgcaagatggatcaaatgctgggacctctgaaacagctaatgctttggtaaatactgctgtagcagaggctgcagggccatctaactctaagatgccttttgtgaacggtgatcaatgtggcctggcatcatcatctgttgtaccagtacaatcaaagtctcccactgttgcaactcctgaccctccagcatgcaaatttaaagattttgatttgaatgacacttatggtggcatggaaggtttcgaggatgggtatgaaggttcacctacaccagctttcaagacaactgattctcccaattgtccatcatggatgcaccaagattctactcaaagcccaccacagactagtggcaattcagattcaacatcagctcagtcactgtcaagctcaaatggagatgctcagtgtcggactgataaaattgtcttcaagcttttcgagaaagttcctagtgatttacctccagttttgcgatcacagattcttggttggttgtccagtagccctactgatatagagagctatattagacctggttgtattattttaacagtatatcttcgcttagttgagtctgcatggaaagagctctctgataatatgagctcatacctggataagcttctgaatagttccaccggcaacttttgggcatctggtttggtatttgtaatggtacggcatcagatagctttcatgcataatggtcaacttatgttggacagaccacttgcaaacagtgctcatcattactgcaagattttatgtgtgagaccaattgctgctcctttttcaacaaaagtgaatttcagggtagaaggcttgaacctagtcagtgattcctcaaggctaatttgctcatttgaagggagttgtatattccaggaagacaccgataatatagttgatgacgttgagcatgatgatattgaatatctgaacttctgttgtcctctccctagttcaagagggagaggatttgtggaggttgaagatggtggatttagcaacggcttcttccctttcataattgctgagcaggacatatgctctgaggtctgtgagctggagagcatatttgagtcctccagtcatgaacaggcagatgatgacaatgccaggaaccaagctttagagtttctaaatgagctgggctggcttcttcatagagcaaacataatatctaaacaggataaggttcctctagcatcctttaacatatggagattcagaaatcttggtatatttgccatggagcgggaatggtgtgctgtgaccaaactgctgttagatttcttatttactggactcgttgatatcgggtcccagtctccagaagaggtggtgttgtcagaaaatctgctacatgctgccgtgcggatgaaatctgcccaaatggttaggtttctgctgggatacaagccaaatgaaagcctgaagagaactgcagagacattcctattcagacctgatgctcaaggcccttccaaatttacccccctccatatagcagctgccacagatgatgcagaggatgtattggatgcacttactaatgatcctggactggttgggatcaacacgtggagaaacgcgcgagacggcgcaggcttcaccccagaagactacgctcgccagaggggcaacgatgcttacctgaatatggtcgagaagaagatcaataagcatcttggcaaaggccatgttgtcctcggcgtccctagcagcatacaccctgtaataaccgatggtgtgaagcctggtgaagtcagcctggagatcggcatgaccgtgccgccgccagcaccgagctgcaacgcctgcagccgtcaggccctgatgtaccccaactcgacggcgaggaccttcctgtacaggccagcgatgctgaccgtgatgggcatcgccgtcatctgcgtctgcgtcggcctgctactccacacctgtccaaaggtttatgcagctcctacattcagatgggagctgttagaacgtggaccaatgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAARVGAQSRHLYGGGLGEPDMDRRDKRLFGWDLNDWRWDSDR FVATPVPAAEASGLALNSSPSSSEEAGAASVRNVNARGDSDKRKRVVVIDDDDVEDDE LVENGGGSLSLRIGGDAVAHGAGVGGGADEEDRNGKKIRVQGGSPSGPACQVEGCTAD LTGVRDYHRRHKVCEMHAKATTAVVGNTVQRFCQQCSRFHPLQEFDEGKRSCRRRLAG HNRRRRKTRPEVAVGGSAFTEDKISSYLLLGLLGVCANLNADNAEHLRGQELISGLLR NLGAVAKSLDPKELCKLLEACQSMQDGSNAGTSETANALVNTAVAEAAGPSNSKMPFV NGDQCGLASSSVVPVQSKSPTVATPDPPACKFKDFDLNDTYGGMEGFEDGYEGSPTPA FKTTDSPNCPSWMHQDSTQSPPQTSGNSDSTSAQSLSSSNGDAQCRTDKIVFKLFEKV PSDLPPVLRSQILGWLSSSPTDIESYIRPGCIILTVYLRLVESAWKELSDNMSSYLDK LLNSSTGNFWASGLVFVMVRHQIAFMHNGQLMLDRPLANSAHHYCKILCVRPIAAPFS TKVNFRVEGLNLVSDSSRLICSFEGSCIFQEDTDNIVDDVEHDDIEYLNFCCPLPSSR GRGFVEVEDGGFSNGFFPFIIAEQDICSEVCELESIFESSSHEQADDDNARNQALEFL NELGWLLHRANIISKQDKVPLASFNIWRFRNLGIFAMEREWCAVTKLLLDFLFTGLVD IGSQSPEEVVLSENLLHAAVRMKSAQMVRFLLGYKPNESLKRTAETFLFRPDAQGPSK FTPLHIAAATDDAEDVLDALTNDPGLVGINTWRNARDGAGFTPEDYARQRGNDAYLNM VEKKINKHLGKGHVVLGVPSSIHPVITDGVKPGEVSLEIGMTVPPPAPSCNACSRQAL MYPNSTARTFLYRPAMLTVMGIAVICVCVGLLLHTCPKVYAAPTFRWELLERGPM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6710..7147#5905..6486#5679..5817#5423..5564#5204..5321#5005..5112#4857..4931#3822..4051#3437..3739#2695..2876#434..1026#attcccaccaaaattcctctctactcccaaattccccccacccctcccggcgaattccccccctccgccgctcgattcggcgctcgaatccgccgtctccgccgccaattcgctcggtccggcggttcgctgatccactctctcgtttttttgttttttttttaccttcttacgcggcgattcggggtgtatgagctcggtttcgcggcgggttggttgatttgctccgccgcgtcggagggcggcggcgcggggaagaggggggcatgtgggtttcgctggtctggatccgtgggtgcgtgggcgtcacgttcgtcgactacttgggcgggagggaagccgagtagatccttttacgcggtgtgccggggagggaggtggtggttgaggttgaggttgacgaggggttctagggtttcgggggcggggggccatggaggctgcccgggtcggggcgcagagccgccacctgtacggcggagggctaggcgagcctgacatggacaggcgcgacaagaggctgttcggctgggacctcaacgactggcggtgggacagtgaccgcttcgtcgctacgccggtgcccgccgcggaggcgagcggcttggcgctgaacagctcgccgtcttcctccgaggaagccggggccgcgtcggtgagaaatgttaatgctagaggtgactccgataagaggaagcgggtggtggtcattgatgatgatgatgtggaggatgacgagctggtggagaacggcggcgggtcactgagcttgagaattgggggtgatgctgttgcccatggagcaggggtgggtggtggtgctgatgaggaagacaggaatggcaaaaagatcagggtgcagggaggcagtcctagtggccccgcgtgccaggtggagggctgcactgcggaccttactggtgtgagggattaccatcgacgacacaaggtctgcgagatgcatgccaaggctaccactgctgtggttgggaacactgtccagcggttctgccaacaatgtagtaggttagtttaattcaaactactactgcctttcattctcattctataatttgttcatattggaatgattaggtagaatatgctatgcaagtttgatgcaatgcggctaaacagattctagaccctcacaaacttccaaccctaacaattttgtaagcattggattttgaaagtaatcctgatgaatatggtaaattaaattgataaaatgatagttaaagagaggagttggtgtgatctatcatctgtgcatgttcaatctagattggctgagataaatttatacgtagacttgtctgtattatatacttcctccgtttcacaatgtaagactttctagcattgcccacatacatatagatgttaatgaatctaaacacatacatatgtctagattcattaacatctaaatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttacattgtgaaacggagggactattatggaagtaatgattttggatcgtaccttttgattttgaagaataattttaggtatattttttttccttctcatcctaaagtcaaattctcaaattcatgatgatatgatatttgtctgcaccttttgagcttagagtgtaatgattctttaactcaggacgtggtttattaatttgacatctgtcacagcatatgggcgcagtggtagtaaaatgaaaaggacaccataatttgtggagcgaagattaaaatgacgatgcttatgttgtaattgtgaaaaacacggactatcagtcataggcaagatttagtgatgatgctggaagaagtgatcaacgtagtgccatgctaagagaaatcgttagggattaactcttatgaaagcagtgaatacaaccgaaaaggagtcgtattgcacaacccatttgaatatacgatataaaagaaaatgttcgaaagtaaatatattataaaatggcctatgcccttctagctgtgcctgtatatctaagatctatgtggtactgccgatggctcagctcaaaattacagttgtacgtgtcataacaatcagactgctttctctcgtaatttctttggattattttctcttcaaagaaaatacttttttatttccaacatctgtactgaaagtctgaaattaattttttttggggaaaaattagttgaagttgacaaagccagaaacatttttgctaagatattttttgaatcgtagaatttctgagaccatttttacatttcgtaattgctagaactagtacgcacgtttttcatggaccagtattttcatatattctttttcgtctgatgtaagagaacatttggttccttaatgtcctcatttgtgcatcccacgtccaacagtaatgctttcttttgctcacccttttatgtgtgtgggttgttcctatgcttaacaccactgtcaacttttagaaaatattgtgaattcttcttgggcactgtcaattataatagtttttacagtatttgtttttcatgcatattttttcataaatgtttcaaaggaactggcactctgttcaaggagtaccgtgtgattacatagtgctaatactatttacaatgtactgtgctatggtgccatagtatgcattttttttttcaaaaagatatgggtgaactctgtaattactgtacatgcttacatgttccttttacagattccaccctcttcaagaatttgatgaagggaagcgaagttgccgccgacgtttagcaggccacaacagacgaaggaggaagacccgccctgaagttgctgttggtggttctgcatttactgaggacaaaattagcagttatttattgttgggtctccttggagtatgcgccaatttgaatggtaagtaaacatattcttatttgaactgtaggtaatgtttttatggtacaataacatagatcctccatctgcacgtatgtattggtgagctggtactagtatagtttgttttcaattgcgtacttgagtttgactttatctgaatatgtttctgagtgaatttacttggtattgattgaaataagacttctgatgttttcaagtaaggtagcttttatgttgtatatggttcttgtttattggaaaggttgttagtggcatagtttctaggactacaaagactgtagtgtggtactagatgagttcatagttaagtcttatattcaactcccagatttgcttacaggaaatttccacctttgtgtcaagattgcctatcctatgtcaagacttcacaacagcacaattctgcaatcttttagccatttgcttaaatgtagagcctcccaaaataacgtaggaatacttctagtgcctagactggactattatgaacatacttggtccatgcaagctagttttatgataatactcacaggactccacaattgtacttgcagctgacaatgctgagcatttaagaggtcaggagttgatatctggtcttttgagaaacctgggggcagttgccaaatcattggatccaaaagaactctgtaaactcttggaggcatgccaaagcatgcaagatggatcaaatgctgggacctctgaaacagctaatgctttggtaaatactgctgtagcagaggctgcagggccatctaactctaagatgccttttgtgaacggtgatcaatgtggcctggcatcatcatctgttgtaccagtacaatcaaagtctcccactgttgcaactcctggtgagatgcacaacatttctagcccttcagtgaatgtttccaaatgaagattttaagttacactagtggctttttttcacagaccctccagcatgcaaatttaaagattttgatttgaatgacacttatggtggcatggaaggtttcgaggatgggtatgaaggttcacctacaccagctttcaagacaactgattctcccaattgtccatcatggatgcaccaagattctactcaaagcccaccacagactagtggcaattcagattcaacatcagctcagtcactgtcaagctcaaatggagatgctcaggtttgcaaatttgttccttgcaacttaatgtaaagaaaactagtttcccaaaactaaagggatcgcttcaattttcaaatgctcacgacttattggtctataataacatccttatcttttgataacaagttaacaagaggtacataccaaataaggaaataactatcttaagtgggcattagttcaagtgggattttgaactggaaggggattttagtgcacttctacaagggttggagtgctgtcaaacatgccttaatttatgcagtactagatatgcttcagattctgttttaaggggtatataagtatgaacttaactgtacattttgaacttaaaagttacacacttacacgtgcatgacttttcagtacctttactagaaaaattgttgcagatatcatcaagaaccaaaaacattaagtctgcagagaaatttgaacagaatgcacattttcccagatccaaatttaactgactcatctgcaccagtgaaatgtctctaactaattcatcgcatctgtttctcacataaatgccacataaacaaggtgaactgaactaccttttgatcagtataaagaagtgcatgaagaaagagaatttctactgataacaacagtcggtctagtacatacgtattgagatgccaaatgccagtattttctattttgtaatattgcatagtggatttgcacctcaaatatgttgaaatgcgtgtgctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcacacacacacacacattgattgtcattatgaatgcttgcagtgtcggactgataaaattgtcttcaagcttttcgagaaagttcctagtgatttacctccagttttgcgatcacaggtaaattatgcattccctcagcaacgtggaagagtaaatatcgtaaatctaacacttcaatcctgaatttcagattcttggttggttgtccagtagccctactgatatagagagctatattagacctggttgtattattttaacagtatatcttcgcttagttgagtctgcatggaaagaggtatgatttttcaactaattatttcatgtcatgacaatgatctttttgcttaatgcttgatagcttgatgttttcctcttatttactacagctctctgataatatgagctcatacctggataagcttctgaatagttccaccggcaacttttgggcatctggtttggtatttgtaatggtacggcatcagatagctttcatgcataatggtaagcccgaatgcttagttagcgcagtgctcttcaagttctattatacatattttacatcggaattttgttattctcaccactcctttatatcactgcaggtcaacttatgttggacagaccacttgcaaacagtgctcatcattactgcaagattttatgtgtgagaccaattgctgctcctttttcaacaaaagtgaatttcagggtagaaggcttgaacctagtcagtgattcctcaaggtactttgccagtttgcatctacagtttacatatgtttgttcttgatggagacataggttgatgtttgcttaagcttacttgtcatctaaagattgatcatctcatgttttcaggctaatttgctcatttgaagggagttgtatattccaggaagacaccgataatatagttgatgacgttgagcatgatgatattgaatatctgaacttctgttgtcctctccctagttcaagagggagaggatttgtggaggtacagcttttcatatgtctgctgttttcatgtgtctgttttctgtcacaacctttgaatttactagaatgccatcgttaatttcaggttgaagatggtggatttagcaacggcttcttccctttcataattgctgagcaggacatatgctctgaggtctgtgagctggagagcatatttgagtcctccagtcatgaacaggcagatgatgacaatgccaggaaccaagctttagagtttctaaatgagctgggctggcttcttcatagagcaaacataatatctaaacaggataaggttcctctagcatcctttaacatatggagattcagaaatcttggtatatttgccatggagcgggaatggtgtgctgtgaccaaactgctgttagatttcttatttactggactcgttgatatcgggtcccagtctccagaagaggtggtgttgtcagaaaatctgctacatgctgccgtgcggatgaaatctgcccaaatggttaggtttctgctgggatacaagccaaatgaaagcctgaagagaactgcagagacattcctattcagacctgatgctcaaggcccttccaaatttacccccctccatatagcagctgccacagatgatgcagaggatgtattggatgcacttactaatgatcctggactggtattccccttatctataatccttaggatatggttttaagtatttgctcgtattctatgtgccttttgcacagaaatatagacttccgttgcaattgatgttgggcacatcaacaacggtgccgtgccatgtgcactatagatctttctatcctagtttttttaaaaaatgaattacacttgaatatcctgtctaatcttcctgctgctacctgttattgcaggttgggatcaacacgtggagaaacgcgcgagacggcgcaggcttcaccccagaagactacgctcgccagaggggcaacgatgcttacctgaatatggtcgagaagaagatcaataagcatcttggcaaaggccatgttgtcctcggcgtccctagcagcatacaccctgtaataaccgatggtgtgaagcctggtgaagtcagcctggagatcggcatgaccgtgccgccgccagcaccgagctgcaacgcctgcagccgtcaggccctgatgtaccccaactcgacggcgaggaccttcctgtacaggccagcgatgctgaccgtgatgggcatcgccgtcatctgcgtctgcgtcggcctgctactccacacctgtccaaaggtttatgcagctcctacattcagatgggagctgttagaacgtggaccaatgtgaggaggagcttagaatggaataagtgtagttgtgttttacgtaagtcgagagcttagtgtgctggctaagatcaaaataacagtactatgtgaggaggatgatcctttgtatttaaagcaggatcgtttcgtttatataaaagcttacataccgtcattattaattattattgattagttattattatttatattatatttaccgcctaacatgtaaacagaacatatgttccataaaattcatggtgtggttgtagaattcattctttccagagcttcttgttggagccatgcttctggctgctttcggttcattctagacttctagttttgtggctacaagattttgtcggtgttgtattgttgtaaactcggaataaaacttttttttttcgtcagcgttgtattgttgtaaactcagaataaaacatttttttc</dnaseqindica> 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