Os03g0849700
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0849700 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001058434.1 GI:115456596 GeneID:4334787 |
| Length |
6344 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0849700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:36592563..36598906 |
| Sequence Coding Region |
36595516..36597446,36597907..36598143,36598451..36598457 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:36592563..36598906 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtctgtcatcatcgacgtccgcaactgcatccaactcctccgctcctgcagtgccgtggccggccagcagctgcaccagctccttctcaagtctggccatgtcccatcatcgctgccgccctctaactccttgctcctcatgtatgcgcgctgctccccactccaccagcacgacgcccgccgcctgtttgacgaaatgcccgtcaagaactgcttctcctacaactctgttatcacctcccacctcaattccagagaccaccatgcagcgcttaatatcttccgatccatgcccgagaggaacaccttctcatggaatacaatcataactggcattgtgtccacaggcaatctcgacatggcccgttcactgctgattgaaatgcctgtcaaggatcctgtggcttgcaatgctgttttgcataggtatgtccggcgtggccgggcggatgaggcgtttgcattactcaggacggttggtcaatgcagtggtgcagatgcctcttctccatggaatgacccttttgtgcttgcgacaattgttggtgcttgtgctgattggatgaagtatgattttgggaggcaggctcatgctcggatggtggtttccaagattgaacaggatttggtgttgagttgcgcattagttaacatgtactgcaaatgtggggatttggattctgctcgctatgtccttaatggtttaactcaggttgatgagttctcactttctgcactcatatatggctatgcttcttgtggacatttgcatgaggcgatacgactttttgacagaaaggaggaaccaagcattgctatgtggaattctcttatcagtggctgtgcatttgcctgttgtggaaatgatgcttttgctctttttgcaaggatgatgcgatcagatgtgttacctgattcttcaacttatgccagcattttgaatgtatgtggtttttcagtcatggtgaatcctgggcaacagattcatgggtgtggtctaaaatgtggagcagtcaatgacataatagtagcaagtgcactcattgatttctactcaaaatgtggcctctgggaggatgcttgcagagcttttagagagcttaggtttcatgataccatagtgctcaactcaatgatcactgtttactcaaactgtgggcagatagaagaggcgagaagaatttttgatatgatcactggtaagagtgtgatctcatggaattctatggtggttgggttgagccagaatgggcatgctagggatgcacttgggttattctgtgagatgcatcggcttggtttgcggcttgacaaggttgctatagccagtgctctgagtgcatcgagcagcatttgctctatcagttttggagagcagatcttttctctagccactgttcttggtttgcaatctgatcatgttgttgcgtcttcactcattgatctgtattgcaaatgtggaagcctagcaaatgggtgcaggatctttgaagaaatcgataagccagacgaggtcttatggaactcaatgctgattggtcatgcttccaatgggtatggacatgaagcattggaactcttggagttgatgaaaactaagggcataaaaccaagtgaacgaacatttattgctgtcctttctgcatgctgccactctggactcgtgaaagagggactgacatggtttcaccggatgcaagcggacttcagtgtgagtccatcagctgagcattacgcatgtgtgactgatctcttagtccgcgcaggtcggctagaggaatcagttgaattcattgaaaatatgccctttgaagctgatgcggttagctggacaactgttattggtggatgcaaagctcagggcaatgaggccatgatgcggaaggtggcgaagaagctgatggagatggaatcgtcacatcccagcttcacacttagttacttccatgtgttgtgttgtcaacctattcctggcccccatgttggtggaagtgctgcagcaaaggatgtgaacaagtggcttgatgagattattggaggctatgattcctctatcagggagttccatggaggagatgatcagaagttgcttatttcactgcttaaaatattgtgccgacactatggaagctccgttcaccttttgggtctgatccatcgcaggagggtatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSVIIDVRNCIQLLRSCSAVAGQQLHQLLLKSGHVPSSLPPSNS LLLMYARCSPLHQHDARRLFDEMPVKNCFSYNSVITSHLNSRDHHAALNIFRSMPERN TFSWNTIITGIVSTGNLDMARSLLIEMPVKDPVACNAVLHRYVRRGRADEAFALLRTV GQCSGADASSPWNDPFVLATIVGACADWMKYDFGRQAHARMVVSKIEQDLVLSCALVN MYCKCGDLDSARYVLNGLTQVDEFSLSALIYGYASCGHLHEAIRLFDRKEEPSIAMWN SLISGCAFACCGNDAFALFARMMRSDVLPDSSTYASILNVCGFSVMVNPGQQIHGCGL KCGAVNDIIVASALIDFYSKCGLWEDACRAFRELRFHDTIVLNSMITVYSNCGQIEEA RRIFDMITGKSVISWNSMVVGLSQNGHARDALGLFCEMHRLGLRLDKVAIASALSASS SICSISFGEQIFSLATVLGLQSDHVVASSLIDLYCKCGSLANGCRIFEEIDKPDEVLW NSMLIGHASNGYGHEALELLELMKTKGIKPSERTFIAVLSACCHSGLVKEGLTWFHRM QADFSVSPSAEHYACVTDLLVRAGRLEESVEFIENMPFEADAVSWTTVIGGCKAQGNE AMMRKVAKKLMEMESSHPSFTLSYFHVLCCQPIPGPHVGGSAAAKDVNKWLDEIIGGY DSSIREFHGGDDQKLLISLLKILCRHYGSSVHLLGLIHRRRV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2954..4884#5345..5581#5889..5895#accttccctgctcggggaggtcggggtcgctggttggatccaagaaacggtagctttcgttgttggttcttgttttgagggaatcgtatgcgtgtgcagaggaaggggatttcttcatctggacagtcgaggtgcgcacctgcgggctccctcccgtcttcttcttcttcttccccgactaatctgtgttcggttgctgatttcgcggaaatttaggggctttctcgttgctcatttcagctgggtgagctttagtttggggaatttatggtaggggatttgtggggagggggacatttgatatgacggtctttcagtttgcagttgttccgttagtttgtagctttagaatgcttgttcgaatttgtgggtggacttgtggaaacctaattttagcgttacattttttattatgctgttaattgccagactttttcttagtcagttcataagctgttgctgtggttagatatttataaatcttttatgtgattttgtaatacagttccttgtacttcctgcatatctgtatgctttgtttcggggaggtttcagttgttggattgagcaatacttgtttttgcccttgttattctgtaaatcattgatcttttagctttataaagcttctgatggttctgttgtgttgatggcattgtgcttgactgcttgtgttaggaaacccatcataccatatatgtgtttcgtgcgatcgagtgcgagtttttgtgcaatgatgttatgtgaagttcagttaactgggacactcttttgctttgtaggacaatagcgttttctttttggggcccatatgggataatacatctcttatatgatactgatttgcgttgcaatgagcagaaatgcaacttttgagacaattataaactgtctgactggatacattacctatcttgaggtagagcgcctaaacaaaggataactaatctgattgtaaatattatagtgcaatcattcagacttgatctttttagggaccaaattgggcctatgttcaattcagtttaagccccgctaaattcatagcaacctgagcccccaatatagctcctgccaagacaaattttgattaagggccaacctacaaggctagcccaagtttgattcatgatgaggagcagcccagactagagttttacccttgtccaactcaagaaatgtttagtattacttggttgagtaatattgctctattggctgaaatgtgacaagcatcatagatagtactaactactaacttcgtgttttagttcaaaaaattaaacaatctatacctaattaaaaaatgcgtaagccttctgggagatttttcatccgtagtctttgtcatccgcacagtacgcgattttttgttcgagcaaaacggactctactacgcgagaccatcgttagtatcctgtgcacattccaatatgtcccaatgaaaacagaataaaatagatataaaaattgaagaaccatatacatagatgtgagattggactcgatggaaacacacaagttgaatttcaatcgaattgaataaagatcgaagaaccatacacttgacgagaacaaaaggttggaaagaagcaggcatggaaggatgaggacaatgtccttgacaagcacagatcaaggcctaccgtgccctccggctctcaaatcctcatcctgcaccgtctccctcacagcccacagggttctcctccctctccacttctgcctcaacccaaataccaggagggtcctgcccctggctgtcgcggcgtcgccattggctgccgacctgctgttcctgtcactgtcaagtcctgtcctcttgggaagacgacgacccagctcttgcaggttatacctctagcagtctagctcatagcttcattattctcattgagttattgtgtttgaactttctgccacttgcctttactatttgccaatttgtagttactgaatgtgctgttgatttgctgccattgtagtttgaggaatagggatattgctatcgaactatgtatattgtaatgtttgcacattttgaacctgcttgtcaaatttagtcgattattgattttataagatgttattgctatatttgtataactttttaactaaatttattctcatatatgggatttgcggtgtttgaaaattctggcatgtgatgtgaagtaggactacccaaccaaaaattccttggccacgccactgctccttagagctgtatgtattctcctaaacattatcaattctcagatattcagatcaaatatggacagtaagcctggcatttgggaagttaatattataaacttgaaaactaatcaaagctatgtgtttactttctttttcattgtgagtagatatttaggaatactatcagaacaaaataatgggttatcaattatcaagtaccttttttaaaatgaaatgtggcactgggctctaatattttaatttcttgagttgataatactttaggacttggtaatatgctgatcagttccaacttactttcttactgtggttttgatatataatttgtggacataaggcaattgctttccttttttttctctgtgtgtagggactctgttggcgagaggggtcagagagcgagggataatgcattaggccgtgtttagtttcccccatattcccaactttccatcatatcatatcacatcaaaaactttcctacacacataaactttcaacttttttttcatactcccaactttcttcaaactttcaacttttttcaggaactaaacacacccttagtgcacttccccactgcaagagtccatcataagtaatgttttgtcctaggtcctccatggcagctatgatctcgacaaggtggtggccagtggctaaggatatggtgattcagtgaaggcagaacaacagcttgcttccagggcctcctgtcctgttcagtttctccatgtctgtcatcatcgacgtccgcaactgcatccaactcctccgctcctgcagtgccgtggccggccagcagctgcaccagctccttctcaagtctggccatgtcccatcatcgctgccgccctctaactccttgctcctcatgtatgcgcgctgctccccactccaccagcacgacgcccgccgcctgtttgacgaaatgcccgtcaagaactgcttctcctacaactctgttatcacctcccacctcaattccagagaccaccatgcagcgcttaatatcttccgatccatgcccgagaggaacaccttctcatggaatacaatcataactggcattgtgtccacaggcaatctcgacatggcccgttcactgctgattgaaatgcctgtcaaggatcctgtggcttgcaatgctgttttgcataggtatgtccggcgtggccgggcggatgaggcgtttgcattactcaggacggttggtcaatgcagtggtgcagatgcctcttctccatggaatgacccttttgtgcttgcgacaattgttggtgcttgtgctgattggatgaagtatgattttgggaggcaggctcatgctcggatggtggtttccaagattgaacaggatttggtgttgagttgcgcattagttaacatgtactgcaaatgtggggatttggattctgctcgctatgtccttaatggtttaactcaggttgatgagttctcactttctgcactcatatatggctatgcttcttgtggacatttgcatgaggcgatacgactttttgacagaaaggaggaaccaagcattgctatgtggaattctcttatcagtggctgtgcatttgcctgttgtggaaatgatgcttttgctctttttgcaaggatgatgcgatcagatgtgttacctgattcttcaacttatgccagcattttgaatgtatgtggtttttcagtcatggtgaatcctgggcaacagattcatgggtgtggtctaaaatgtggagcagtcaatgacataatagtagcaagtgcactcattgatttctactcaaaatgtggcctctgggaggatgcttgcagagcttttagagagcttaggtttcatgataccatagtgctcaactcaatgatcactgtttactcaaactgtgggcagatagaagaggcgagaagaatttttgatatgatcactggtaagagtgtgatctcatggaattctatggtggttgggttgagccagaatgggcatgctagggatgcacttgggttattctgtgagatgcatcggcttggtttgcggcttgacaaggttgctatagccagtgctctgagtgcatcgagcagcatttgctctatcagttttggagagcagatcttttctctagccactgttcttggtttgcaatctgatcatgttgttgcgtcttcactcattgatctgtattgcaaatgtggaagcctagcaaatgggtgcaggatctttgaagaaatcgataagccagacgaggtcttatggaactcaatgctgattggtcatgcttccaatgggtatggacatgaagcattggaactcttggagttgatgaaaactaagggcataaaaccaagtgaacgaacatttattgctgtcctttctgcatgctgccactctggactcgtgaaagagggactgacatggtttcaccggatgcaagcggacttcagtgtgagtccatcagctgagcattacgcatgtgtgactgatctcttagtccgcgcaggtcggctagaggaatcagttgaattcattgaaaatatgccctttgaagctgatgcggttagctggacaactgttattggtggatgcaaagctcagggcaatgaggccatgatgcggaaggtggcgaagaagctgatggagatggaatcgtcacatcccagcttgtatgtgcaactgtccagtgggcttgcttctctaggggattggactaaatcagcagaaataaggagtat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|
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