Os10g0392700
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0392700 |
|---|---|
| Description |
Initiation factor 2B related family protein |
| Version |
NM_001071051.1 GI:115481845 GeneID:4348536 |
| Length |
5594 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0392700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:13448535..13454128 |
| Sequence Coding Region |
13448858..13448951,13449319..13449512,13450332..13450457,13450540..13450560 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:13448535..13454128 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatctcccgtgttaacatggtcatagttggagcccatgcaattatggcaaatggtggagttattgcaccagtaggaatgaacatggttgctcttgctgctcaaaggcatgctgttccctttgttgtggttgctggcagtcacaagctatgtcctttgtatccacacaacccagaggttttactgaatgaacttaaatcaccatctgatctgctcgactttggcgagttctcaagttgcatgaacttcagtactcaggatggcactcctcttctgaatgttgtcaatccaacgtttgactatgtgccaccaaagcttgtgagccttttcatcactgatacgggagggcacagtccatcatacatgtaccgccttatcgctgagtattactcagctgatgatttggtagtgcggcggaagtcgacatcttcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MISRVNMVIVGAHAIMANGGVIAPVGMNMVALAAQRHAVPFVVV AGSHKLCPLYPHNPEVLLNELKSPSDLLDFGEFSSCMNFSTQDGTPLLNVVNPTFDYV PPKLVSLFITDTGGHSPSYMYRLIAEYYSADDLVVRRKSTSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5178..5271#4617..4810#3672..3797#3569..3589#gtaaaatttccgcactgttgtagacagcatatctctctcgttccccttttgctctccgaaaaccctaacccctcgccgccgatccggccctcctccgccgctggccgccatgccggacgtgcagccgctcgtcagcgagttcgtcctcaagctcaagcgccggtaagcagagctccccccctgtctctccctccgtttttcgtttgcctcgattggccttttcgcatgttgacgcgctcgtgggggtgtgggggtggtgcggggcagcaaggtggaggggtcccatgccgtggcgcggcagacggcggagctgctgcggtcggtggtgtcgcagcaccggatgggcagcaccaaccaggcggcggcgcttgcggacgccgtccgcggcgtcggggagcagctcatcgccgccaaccccatcggtgcgccccaaagaaaattccaccctgtttgaggacttgtgattgactcctgtgcttattatgatatttctgtttctgatatatctgttggcgtggtttaccttaattctgtagaattattgatgcttgtttttgctagataatgtatggttctagttaactgagggcttgcagaatagatgaatttcctcggaaatagagtgcttgagcttgaatttgagaggttttgttttattgtctatgtttggtctctcaaacagaagtggcagtcaaaatactactagacaagaaccatgtattggaattgtacaacatttatcttgcaatatatcttaaatttttagtttactagcgcactgtatttcttttctacatgtgaaatgtctagtctgtcactaccaataccatgcactgactgtatctgaatgttatagaatataaatttgatcaaacatgtgttcagttttatgactatcacattagatatatgagatacaaatggagagatcctagacctagcattcctgggaaatttcaagtccttccacgggagcatgtatattcataagctccacctggctttttttttccagaagagagaatattagttcttggtatgtcagtctcatgaatctaacttattcattttaatgacatgttaatgaaatccatatctcctctttatctgtcaatacgtaggtctagtactgtaatacgttggatttttgtcagctaatacagttaaatgttccttgctataaaatcatctatagatagaaaattatttatagatggatgtcagccatcaagatttatgagttatccagttgcttaatggatctttggatgtcagaaataatgtcttttcccagaccatactgtatagtgactaatgagtacagggtgataactcctattccgtttcaatttagtgtatagcagattagcaggcactatgcaagtggctaatagctagatctactgcttaaacttttggtaacataagatacaccactcatccttttaatcctaagcccaatgcaagctgttaatcaatcgggataaactcccttttgcagaacttgctgttggaaacattgtgagacgtgttttgcatataataaaagaagaggatatatcttctacagcagttggtattgaaggcctttctgtcaccgctgagagcgatgatgaatatgacagtggaaatgatgatcaccctaccttatctgctgctgtccttgctgcccatgctagaaatgcccttcgggcaccttcattgcagacacttctggaagatattcctgtgagcactgcgctttcacgttccgcatcgtcggctggggactctgatggaaaatgtaattttttttctcacaaattctctttcactattcatgttgaacctgaacaagtgattcatgactttctaaaattatttttgagtcatgtagtctttaagaaaaaaaaataaatttccaatttattgttcagtttgtgtttccttgttagggcctgtgcattcatttatgttactgttggcactgaaattctacatgttccacttaagcagctggagataagagctcaaaatctcggaaactcaagcatgatgttattgcagccattggtgatctaattgatgaaattgatacgtgctatgaccagatctctgagcaagccgtggaacatattcaccagaagtatgatttcgttcacaacagtacagtgttattgctattaatctaaattaatgtcatctacgcttcttgtatgaggtatttacatgatgaaaattgcttttaagctgtttcataggatagggatccttggcatatttgttcaggaaagcattcatcgaattgtgaatggttattggctttccatcctctaaaactaacaatctctcatctttaccatttgttgtttactctatcttcatctctcactagaatttatcaaacaagcaaagcctaattgtattctgtagttgtttgtatctaaacatatagtccctcttgtcccataaacatgttttgggctggtcctgaaaatgcagctttggccactaatttctattgcaaaatatttgaaaaaactgataatattatgcaagtacctattgagacaaatatatacgctattttcttgatcctatctaaatattaaacaactatatatattttgagaaatctagtttattaagatcttgatgttcactgttttaaagtttgacttgaaacatgtccaaaattacatgttatgacttgagggtatagttaagaaagcagtctgcgcctatggcacagcggaaattattactacatgatattaacccaagtaatatttttgaacgtagttcagttggtacattctcagtggagagaacgactgaccgcgggttcaatccctgattgactcacgggcctcacaggggtttttccccgtttcctgggatcaacttcagttggtccctattaggtaatagggtacacacacgtgtgcgcgttcagtggtactgcatgtttcccgtgcactgaggcttaggacctcaaatctctttcctagcgtgtgttagggacgcgctcgcttgtgtgcgtgtgtgttgtggtgtgagtgtgatgtgtgttctcgtgtttttcctgagttgtaccctctaaaaaaagtaatatttctgaaggacttctctgtattattttgtttaaataagagtctgacagttattatgcatgtgtatttattaagataacaatttgatcctatggtccttttaacacctaaggaccctctgaatatatatagcttgcttattcaaatgctaatgtagctgactactgcttttctttgctacagtgaagtaattctaactctaggccgctctagaacggtgaaagagtttctgtatgctgccaaagagaaaaagcgatcttttcgtgtatttgttgctgaaggtgctcccaggtatctgctctttgccaactttgatatggactgaatagttcttacggataggaattaggatctccttttgcttcatattttgtcatttcaatgtttggatcagatataagggtcatgttcttgcaaaagagctggttgagaagggtgtacaaactactgttataacagactctgcagtttttgctatgatctcccgtgttaacatggtatgtctgcagggtgattattattgttcagatgtccttgtatttattagaaatatattaacactcccgatttatcttacaggtcatagttggagcccatgcaattatggcaaatggtggagttattgcaccagtaggaatgaacatggttgctcttgctgctcaaaggcatgctgttccctttgttgtggttgctggcagtcacaaggttgatttctgtatactgtgcatttaattatgacatcgataaccagaggttgctttctgagcaattaaatacaacatatgttctatttcttgaaggcatagattatgtcatgctgtcattagcctgatattatcattctgtgcatcttatgttattaacccaaaatcatttttctttagctactattattcccactttattatttttagtacttcttgttttggctcacatggttcgatttcggttcatctccagcccaccccaacttgggactaaaggcttaagttgttattgctgttgttgtcatgttattacacttgtccctatgtagtattagctggacaaagtaggctcaattggtcatgatataatgcaatcattatacgataggataccaattatgctttaaccagatatttctactttattaaattcaacacaaaacatttgttatcacctgctgctcctcacaaatcccctagtcacctctgccttagactcaaagtatatgctaccaagtcattcattcttgttgtttattttagttccgtgacaagataccttgtccttgtgaggattagccctgtggcctctgagttgaaaatagtgaccagcatttgactgagatcccacttatatgctcaagagaagtcatttctgccttcgaagctatagatattttcttaagcgattattcattcataacaagagctgttatttgatgtttgaacatttgggtcacctggtatcactaataatgatttgaaacactatatctttgggtagaaacttaataatatttcttcattcacatcgcagctatgtcctttgtatccacacaacccagaggttttactgaatgaacttaaatcaccatctgatctgctcgactttggcgagttctcaagttgcatgaacttcagtactcaggatggcactcctcttctgaatgttgtcaatccaacgtttgactatgtgccaccaaagcttgtgagccttttcatcactgatacgtaagttatctacactgtttcttcttatccattaacaatgcttgattttgcttgcattaacaattgggtatggtagagcacatacaccattaactaaactggatgatatgtctgcctcataagctatgtttg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|
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