Os01g0100100
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0100100 |
|---|---|
| Description |
RabGAP/TBC domain containing protein |
| Version |
NM_001048268.2 GI:297595880 GeneID:4326813 |
| Length |
7585 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0100100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:2167..9751 |
| Sequence Coding Region |
2449..2616,3357..3455,4457..4560,6136..6997 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:2167..9751 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:2167..9751 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcgtcggccgcgggccaagacaacggagataccgctggggactacatcaagtggatgtgcggcgccggtggccgtgcgggcggcgccatggccaacctccagcgcggcgttggctccctcgtccgtgacattggcgacccctgcctcaacccatcccccgttaaggggagcaaaatgctcaaaccggaaaaatggcacacatgttttgataatgatggaaaggtcataggtttccgtaaagccctaaaattcattgtcttagggggtgtggatcccactattcgagctgaagtttgggaatttcttcttggctgctatgccttgagtagtacctcagagtataggaggaaactaagagctgttagaagggaaaaatatcaaattttagttagacagtgccagagcatgcacccaagcattggtacaggtgagcttgcttacgctgttggatcaaagctaatggatgtcaggactatgtcaaaagaaacccacattgcagaagaagttagcacaagtcaacaaacttcacaaaatacagctggcagtttagtagaagattcagattatggccccggtggtgcacagcagtcacaaaaaagggaaagctgtagtaaatcagctgaactagttggtttcaacgtacataatgatacctctctttatgattcttccaattttattgtgtcttctacagaagtgaataattgctcaaaagattctcaggattacaatgacatgggtgaaccaagatatgacactgagaccttcgatgattatccttctctacctgttacaaattttttctcaactgatggtgtgggcagcaatggagttgataaaaatcattgtagtttctcagttcctgaagatagattaaggcaccgtgatgaacgtatgcacagcttccaaatcaataataacatagatctcattatagagtcaaattcatgctccagtgatgtgtttagggctagcaacagtgattcagccatctttcactcagatgcatacaagcaggatagatggttagatgataatggctataacagggaagttatagattccttgaggatatctgatgcaccagaagcagattttgttgatggaaccaaatccaacagtgtggttgccagcaaagatcgagtctctgaatggctttggacactgcaccgaattggtatgctctattttttcttcacttcatcatgcaattacagtggtatcttgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSAAGQDNGDTAGDYIKWMCGAGGRAGGAMANLQRGVGSLVRD IGDPCLNPSPVKGSKMLKPEKWHTCFDNDGKVIGFRKALKFIVLGGVDPTIRAEVWEF LLGCYALSSTSEYRRKLRAVRREKYQILVRQCQSMHPSIGTGELAYAVGSKLMDVRTM SKETHIAEEVSTSQQTSQNTAGSLVEDSDYGPGGAQQSQKRESCSKSAELVGFNVHND TSLYDSSNFIVSSTEVNNCSKDSQDYNDMGEPRYDTETFDDYPSLPVTNFFSTDGVGS NGVDKNHCSFSVPEDRLRHRDERMHSFQINNNIDLIIESNSCSSDVFRASNSDSAIFH SDAYKQDRWLDDNGYNREVIDSLRISDAPEADFVDGTKSNSVVASKDRVSEWLWTLHR IGMLYFFFTSSCNYSGIL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>283..450#1191..1289#2291..2394#3970..4831#caaggagtcctcgctgaggaagctttggatccacgacgcagctatggcctccccgcccaccaggccgccagccacaaccagctgactaggtaggcttcctaggtagggatcccatcccttcgattccctactccctcccccgattgatttgatttgatttgatttaattcgattgcctgcttttcaggtcgcatgcatcatcagatttcaatctcccttcgttccctgtccctaatccaataccaatagggagcaatcagctgctcctcgacggcgagggagatgtcgtcggccgcgggccaagacaacggagataccgctggggactacatcaagtggatgtgcggcgccggtggccgtgcgggcggcgccatggccaacctccagcgcggcgttggctccctcgtccgtgacattggcgacccctgcctcaacccatcccccgttaaggttcgcctactcctactctagctccatatggatatggattcgattagctgtctacattctatgccatcaatttgttttccatcacttctcattatacatctccattgctctctaaattaaggcttctctagctctatcctatatatatactagtactccgtatatgattctgcttcatcacttatttattcatcatcataccgtgaagctgtataagtcctgttatttgtcatttggcatatgttgtatagataacactttcagcccagggactttctattgccacttttatacatatacaatcaacatttagcatatgtatatcctgtaccgctcagttgtactgctgctttgaagataatgtttgcaaaacatatgagctcacacacgaggctagatgctgcataggctgcacaatggggtagccattttgatacttcttaatgctatttatgctggtccaaatgttcattggtagcctcaggcagagaattttagggagatattatgtcaaactccctggattcactatgattatacaatattacccattcaatccattcaaataaatttccaggtcaactcacatattgtactgaaagaagactaatttgcactaatcatatccttttatccaccagagtatatgagattgtcttctatatgcaatttacttcatatcgacatttttctgcagaattgcaaaactgacgccttgttttccatctggaattgtgcaggggagcaaaatgctcaaaccggaaaaatggcacacatgttttgataatgatggaaaggtcataggtttccgtaaagccctaaaattcattgtcttaggggtgagttaattgtttcttttgtgcttcaaaaacttgttttttcatgtattttagctgttgaagggtgtggatttttttttcagtcttaatacattaccttttagagcatgatgccccacgcgccatttgtgaatgtgtaaaatagggaagatcaaatagaacgtgacaactgtttattttattaccatgatcattgttctctttgagagtgtctgctttggaaatttcaaagaaattaatgcatatgattgcgtagctctagtttttcttaaaaaaataagcggctaggctctttatactattatgtcacagagtgtttgccttttacctgtgtatgtagctaggcataaacatttgtttgtgggtaaatacaaaaaaaaatccaatgtgtagaaactgcttataaatacataaaagttacataaatacataactgcttcaaataagcaagatttgaacataccttcacataagctttcccctaactgaaaagccatttggtataaccttatagaaattagatatagtggagatgtggaatgagctgctatcaagtcttgtttcgtgaaagcaaactgacacggtctccacagcaaacacgtccacagctttgcaattagtatctttataggaaggtcaatcagagttcattggccatatcttggaaaaaaaaggcatcagattttagtttaattatgtctatattttaggcatggattattgatcatttttgcagcagactaagtttaatgcatgtagttattttccttgattagtgattagtgttgttattttctatacaccactggcactgatagatgtgctccatgctttgcaatgcatcaaaattatcatatcgtgcctaactcatgctttgcacagatatcatttttttgtgttctggcactatctaaagaattgtctataaactaggaacaataagatcgcatcgtactattcttcacattaaaacatttcttacccccaaaattgatgtgcagggtgtggatcccactattcgagctgaagtttgggaatttcttcttggctgctatgccttgagtagtacctcagagtataggaggaaactaagagctgttagaaggtttgacactttcctgttttcagtaccaggataccttttttgtacaagcataagaccgtaagagcataaatgaattgcatttattatctagaataaaatcatgaatgttacagttatgtagtactccctccattccaatatataaggatttcaaggattcaaattttgtaccacaatataaggatttctgcactgattcccataatacccatcatttcagtgattcccaaaccaatcaaatgcatagaaagggaaaagaatcttttgacctaaccttggtattggctaaacaacctagaaatctttatattttggaaaggagggagtaggtattaatttgtttgttttttgtttattgtactaaaactgaacttctaggtaaatattcctatcctttacattttccttgtgttatttataaccatgtgtgcagaatggaaaatgatattaaaagtttaaaacaaatgtgttgctatgtttatctggagtaccaatctcaatctttttcaggcactcaaagtaacttgattagggtttagggtttaccccttttcattgtgctacctcctatacacattgttggggggatgaattggtggcatcagtactcatagtttgtctatgtaacatctacttgtgctgatgttgtatgatccatttggtttagatggcttgataagtaccccgtgcctgcacacaacaatatgacagattatatcaatacatctagggtagaggtaaatgaaagactgagattctagatattgcatacaattcctaggtatttgtggtcatggcctgtgggtgatatcgggttggatatgatccaccaaacctggagcagaaaatttctaagactagttgccagaatagaattctcttggaaatttaacagttccaaacagcctgttcacaaacccattatccattcactagcaggtgctggacagaaaatatgttgttcataggggtttgaacctgggacattaaattctgtagtacgtggtagccaacagtgccaatggctctttctttgtaatggaaggatgcgtattaaagaaattaagtagatgggttggcattgcacactaattagtaatgcaaatataccttagtttattgtgatctctgtaattataattgcatatttatattcctttttatgtctaactatcgaagcgtacctgtgctattacagataaacttattacgtcatatgttcatgttgaattgattggcgtgcgattagtcctttctgtttgcatctgcttgttttattcacttgtgaccaacaaatttataaccaacatcatgtatgccatccataccaattgttgtgcgagaaattctacgttttgcctttgttaccgattctactaattgttgctgatgaatgcgaattccgtgaaatgccatcgcacaagtgtttttattcctttgtttccatttctacggagcagggcaatcagtacagttctgaaattcttgctgagtgttctttcttttgaaagtttttacacctgtgggacaattatggaagcctgtaacctcgtttatttcttcgcttctatgcagggaaaaatatcaaattttagttagacagtgccagagcatgcacccaagcattggtacaggtgagcttgcttacgctgttggatcaaagctaatggatgtcaggactatgtcaaaagaaacccacattgcagaagaagttagcacaagtcaacaaacttcacaaaatacagctggcagtttagtagaagattcagattatggccccggtggtgcacagcagtcacaaaaaagggaaagctgtagtaaatcagctgaactagttggtttcaacgtacataatgatacctctctttatgattcttccaattttattgtgtcttctacagaagtgaataattgctcaaaagattctcaggattacaatgacatgggtgaaccaagatatgacactgagaccttcgatgattatccttctctacctgttacaaattttttctcaactgatggtgtgggcagcaatggagttgataaaaatcattgtagtttctcagttcctgaagatagattaaggcaccgtgatgaacgtatgcacagcttccaaatcaataataacatagatctcattatagagtcaaattcatgctccagtgatgtgtttagggctagcaacagtgattcagccatctttcactcagatgcatacaagcaggatagatggttagatgataatggctataacagggaagttatagattccttgaggatatctgatgcaccagaagcagattttgttgatggaaccaaatccaacagtgtggttgccagcaaagatcgagtctctgaatggctttggacactgcaccgaattggtatgctctattttttcttcacttcatcatgcaattacagtggtatcttgtgattatgttctaatttgcaaaacctattacagtggttgatgtggttagaacggatagtcatcttgatttctatggagaatcaagaaatatggctaggatgtcagatatacttgca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