Os01g0248400
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0248400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Isocitrate dehydrogenase (Fragment) |
| Version |
NM_001049118.1 GI:115435649 GeneID:4327213 |
| Length |
5595 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0248400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:8169289..8174883 |
| Sequence Coding Region |
8169485..8169533,8170375..8170418,8170613..8170722,8170940..8170977,8171089..8171166 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:8169289..8174883 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgttcgagaagatcgtcgtggccaaccccgtcgtcgagatggacggtgatgagatgactcgagttatttggaaatggatcaaagataagcttatattccctttcttggacttggacataaaatactatgacttaggtctacctaatcgtgacgctactggggacaaagttacaatagagagtgcagaagcgaccctaaagtataatgtagccatcaaatgtgcaactataactccagatgaaggacgcgtgaaagagtttaatttaagtgcaatgtggaagagtccaaatgggacaataaggaacattttgaatggaactgttttccgagaaccaatcatctgcaagaatattcctcggcttgtacctgggtggataaagcccatatgcattggacgacatgcatttggtgatcaataccgagcaacagatacagttattaaaggtcctgggaagttgaagttagtatttgatggcagagaggaacaaatagagttggatgtgttcaactttactggtgctggtggagtagccttgtctatgtataatactgacgagtctatttgggcattcgctgaagcttccatgaacatggcttaccagaaaagatggccactttatcttagcaccaaaaacacgatcctcaaaaaatacgatggaaggtttaaagatatatttcaggagaactatgaaacaaaatggagagccaagtttgatgatgcaggaatatggtacgaacatcggctgattgatgatatggtggcctatgcccttaagagtgaaggtggctatgtttgggcttgcaagaactatgatggagatgtgcagagcgatctaattgctcaaggttttggatcgctaggtctaatgacatcagttctggtgtgccctgatggtagaaccattgaagctgaagctgctcatggtacagtcacacgccattacagagttcaccaaaaaggaggcgaaactagtacaaatagcattgcttcaatatttgcttggacaaccggactaggacatagggcaaagctcgatgacaataaaagactgttagattttgtacaaaaacttgaagctgcttgtgtgggaacagtggaatctggaaagatgacaaaggatctagctcttcttgtacatgggccaaatgttagccgagataagtatcttaacactgttgagttcatcgatgctgttgctgaggatttaagaacaagattgtcagtaacatccaagttatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFEKIVVANPVVEMDGDEMTRVIWKWIKDKLIFPFLDLDIKYY DLGLPNRDATGDKVTIESAEATLKYNVAIKCATITPDEGRVKEFNLSAMWKSPNGTIR NILNGTVFREPIICKNIPRLVPGWIKPICIGRHAFGDQYRATDTVIKGPGKLKLVFDG REEQIELDVFNFTGAGGVALSMYNTDESIWAFAEASMNMAYQKRWPLYLSTKNTILKK YDGRFKDIFQENYETKWRAKFDDAGIWYEHRLIDDMVAYALKSEGGYVWACKNYDGDV QSDLIAQGFGSLGLMTSVLVCPDGRTIEAEAAHGTVTRHYRVHQKGGETSTNSIASIF AWTTGLGHRAKLDDNKRLLDFVQKLEAACVGTVESGKMTKDLALLVHGPNVSRDKYLN TVEFIDAVAEDLRTRLSVTSKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>197..245#1087..1130#1325..1434#1652..1689#1801..1878#1990..2043#2116..2217#3371..3456#3562..3665#3748..3816#3902..4017#4112..4146#4329..4471#4797..4919#4997..5090#ggccgaacgcccgcgccgtgtctgcttatgatgcttcgttctctccgcgctccgtgtccgaccttcttcagacttcacacctcgcgcgccgccgcagctccgatcggaagaagctcgattcgtctccgactccgacgaccagaagctaccggcgacgcgagcggagaagcgcggaggggagggggcgcgcgccgccatggcgttcgagaagatcgtcgtggccaaccccgtcgtcgagatggacggtgagaacccccacctcccctctccttcccccccgcttccgatcggaactcgctcgtgattagcctcgctatctccgctgatatctacggggggagcctttgcctcttgtctggtgccgtgattgctttggttctgctataccattggtggtgggatggattaggctgctctacgtactggatctaaaatttgtaggtgtttggaggaagaaggggagtcgtcctgagtagaacgtgcggctgaaattagctaaatggtcctgttttgtgggaacagagttcaacacatttgatgtgctgaaagctgctctacttggcctttctgaaattctaggtgttacaaggaatagtggtagtcatccttaggcgtagaaagtgtgctgaaattagttaaatagccatcttcttgggaggacaaaatgttcaaccttagatgcgcggaatagtcggttttaaagggtaaatctaaaataactgttttagtgcattgtcattggtaaaaaagaaaagattattcatgtgaagaatatagtaaaaaaataaagaataaaattgaacccacagcatcgcttagttacaagttccaaggtgaactgtatcagtaaacacatatgccaatttcagaacttatcatctacaatgttcaagtgggctgaaaagtttttctgttgacagtctttctgcttcatttgaagttctgtgctgaaaagttccatcatcgaacttaagtaactttaaattgcatatttagaaagtataccatacttttggctagcccaatcatcctttgcttacctcagattgtagtggttatatatgactgtatgtgctttttacttaggtgatgagatgactcgagttatttggaaatggatcaaagataaggtcaggttcttgtaacaatatatgttttttattcttgattttgatgattgtttgtctagcattgtactctgcagctcctttttttttcacgttacatgttcattttttttactttgttatgcttttggtgctgcttcatcccttaatgcgggcatcgttaagaattatgttggatatctgttttgatcatgcagcttatattccctttcttggacttggacataaaatactatgacttaggtctacctaatcgtgacgctactggggacaaagttacaatagagagtgcagaagcgaccctaaagtaagcctgtaagcctcagttgtttgacgtcacagttctggtccattatttcttctattacttttttccatctaagttatgcttttgttatataattggtgctttaagctgaacctgtttaccctgtagtctcagttagaatacataatgtttactttttgtgatttctattataacgtttacattaggttgcttcagtattctatttttttttcaggtataatgtagccatcaaatgtgcaactataactccaggtgatgttcagcagaattgagctcattgacagatgagcatgatgtgttaacaagtagttttggacactcaatttaaatttgattttggccgcactattcatgagcctacagatgaaggacgcgtgaaagagtttaatttaagtgcaatgtggaagagtccaaatgggacaataaggaacattttgaatggtaaacctttaattggtcacatgtctatatggttctattttgaactttcatcaagtgcagctgttgctgttctcttatacttacttcagcagaactaattgactcctgcaggaactgttttccgagaaccaatcatctgcaagaatattcctcggcttgtacctggtacgaagtctgtatcaaaaataccgatagtagaattcattggtagttacactattttttttatgcttccagggtggataaagcccatatgcattggacgacatgcatttggtgatcaataccgagcaacagatacagttattaaaggtcctgggaagttgaagttagtatttggtatgtctcaataaagctaatgtcatgatagtggctgcagatctgaacttgtagcagccaggattaaattaatatttagctttgtctccctagtgtttatcctactaggaatgacaaggacttctaccttttcttttcatatgggcatcattggctttggctatagaaaagctgttctaaaaatttggggcttaattatttgtatagtcatcatatgccaccatattggcaaatagacttggtaatcattcttgtcagtttatttacttcagaacctattaaatggttaatagcctgatatatgttaatgctgagcagcgaacagaatatgttttttttttatggcagatcaatatattgacccggctttagaaaaaagcccaagaacaaaaacagagtcttatacaagacctggaaaataaaagaaacacaaagagatagctggggaacaaccagtttttcagagacaaaaggaacgtactcccaacctaaccacacccttacagaaaaaactgaaactcagactaaagtagctattctatagctatgcaggtagcacatgaggcctgacttgattcagctttatcctgattgcttcacaccatcctcccagcagctcctggtcttcctcctttagcaaaatgcgccacttctgtatgaaagacagcgatttataaaccacataaaggggagacttgacaagaatattttcaaacacccagtcgtttctaatgatccaaatagcccaacaaacccccccaattaaagagatccaaggtttaaactttttcctatctttgagcagactcatacactcccatagattattaggtaaagaaaccagattcaaagcatccctaataacacaccaaccaaaaacagctaagggacatttaaacaagatatgattagtagtttcagttttgccacagagcttgcaatattgaccaatttaaacagaatatgtttctgtcagtaagaagagcttttatatatgtaaacatacttcactgatttgtggtgtcatcacatcaatatccaagcatcagggaataagcttagtcagtttactaaaattgctaactataaattaacctttgtgtcaatgttatccactcatccttacactatcttctcctcaaaactggtatagatggcagagaggaacaaatagagttggatgtgttcaactttactggtgctggtggagtagccttgtctatgtataatactgacgaggtttgtttatgataccctttatcagggtagcttaattttgatactctgtatttttaaacagggttttaaacttgacaacctctattttatgtttgttgcaaatagtctatttgggcattcgctgaagcttccatgaacatggcttaccagaaaagatggccactttatcttagcaccaaaaacacgatcctcaaaaaatacgatggaaggtcaatagtcaatcgtcgtatgctatttgtttcttttaatagacatgtatgtccatattgaaatattacttttatatatcaggtttaaagatatatttcaggagaactatgaaacaaaatggagagccaagtttgatgatgcaggaatatggtacagctatcttctatctaccttactgtaggaacatggagccttattttcctcctttatgtcctaatcatttctgctgtggcaggtacgaacatcggctgattgatgatatggtggcctatgcccttaagagtgaaggtggctatgtttgggcttgcaagaactatgatggagatgtgcagagcgatctaattgctcaaggtttttgcttattatatgtgtatactctcttctgaccttttatttggagaaaaatgaagtctttgctaagagcaggatgattttacttgtacaggttttggatcgctaggtctaatgacatcagttctggtgagtgttctccctgctgaactgttatctgtttatctgaaagttcaaatgtagaacaattgttaatgctatctagaacaattgtagattccaatatgctgatggtgtaacctctatttaaaaaatatgttctgattagattaatcttctgaatttaacaaataagttctgcattgccttaggtgtgccctgatggtagaaccattgaagctgaagctgctcatggtacagtcacacgccattacagagttcaccaaaaaggaggcgaaactagtacaaatagcattgcttcaatatttgcttggacaaccggactaggacataggtatgagcttgaattaaaccatagtaactaagatcgatgagcttgcttttcacttaattagtttggctctaaatgatgaaatctatatgctcagttttcccatcatggttaatgctattctattgtagtacatcatcttttagtccttttgttagtgctcagagcagaaaattttgtcatctaaaagttagggagagtttctgttcttaaagaaatttattctgctccttatatttcctgctttttgttgtaaatattaagtatgctacataaataattaagagttgtaagtcttgtgacttgactgttgaacacaccacaacagggcaaagctcgatgacaataaaagact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|
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