Os01g0253100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0253100

Description

Similar to Avr9/Cf-9 induced kinase 1

Version

NM_001049144.1 GI:115435701 GeneID:4327115

Length

8213 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0253100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:8366169..8374381

Sequence Coding Region

8366455..8366823,8367383..8367530,8367610..8367853,8368016..8368387,8368619..8368831
,8369590..8369964,8371764..8371844,8371938..8372228,8374033..8374066

Expression

GEO Profiles:Os01g0253100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MARIRRASSGRGLLEDARRKTFLNFLAVVFTLELITRINLIAQT SALNVVAPAISPSQSWRPVRSMLSKAKVDISISVSEQRRKKLYSSPATLSVHPPMSAP SYSSISDAAPPDAASNTSAAPSGLVQPPVSPHNACCSHNMVQKRGSQDCHCVYPVRVE LFLRNVSLTSNWSDEFLGELASQLSLRVTQFEIVNFYVVGASGLNITMYIAPHTGISF SADQVTAMNYSLSQHTVQINPVLVGDYNLLNLTWFRPLVLAPAPTFTISPKPSPSQAS TVPRHSADTSNEKHMSLITIICIFIGALIAVLVIAMFICFCKLRKGKRKVPPVETPKQ RTPDAVSAVDSLPRPTSTRFLAYDELKEATNNFDPSSMLGEGGFGRVFKGVLTDGTAV AIKKLTSGGHQGDKEFLVEVEMLSRLHHRNLVKLIGYYSNRESSQNLLCYELVPNGSL EAWLHGTLGASRPLDWDTRMRIALDAARGLAYLHEDSQPCVIHRDFKASNILLEDDFH AKVSDFGLAKQAPEGCTNYLSTRVMGTFGYVAPEYAMTGHLLVKSDVYSYGVVLLELL TGRRPVDMSQPSGQENLVTWARPILRDKDTLEELADPKLGGQYPKDDFVRVCTIAAAC VSPEASQRPTMGEVVQSLKMVQRSEFQESIPTPPARPNVRQSSTTYESDGTSSMFSSG PFSGLSPFETENISRTAFSEDLHEGR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7559..7927#6852..6999#6529..6772#5995..6366#5551..5763#4418..4792#2538..2618#2154..2444#316..349#agcgagaggagagaggagaggggggcgcaggcgcaaaaagcaagctaccaccgcagcccagctcgaggccaccaccaccaccaccaccacggcacggcgaaaggggaagaagaagaggaaaggaaaaaaaaaaaattccgcagctgctacctctcgccgccttcgccgccgccgccgcgagaaacccagcggcgtcccgggaaaccctagccccatcccccaccccgccgcgcgccctcatggggcgtccgcgtcggcgccagtagtagacaggagcggggggcccgccccgtcgccgacgaggggcatccaacgatggcgcggatacggcgcgcgagctccggacgaggttagtgtggcccgatctgagctgagctctccctcccgcgcttgctttgctgctggctttagctaggtggtgtcgtgtggtctcggtgttcgcgctatagctaagcgtagagagcaatccgagggtttagctttcgcggcacggcggcggcggctcgtgcctgtgcggcgaggtgatgcggcgaggggttgggcttgaggggagaaggtgcgtgatgtcggctaatcaactactgtggtggcggtgggggggttggcgggtttgttccaggatcttagtcgtcgccgcttgttcggtagctcaactctcaggccgtgagaatttgggtttggtgtcgcgggaatggtggtcatactactatgtaggattcagtgctctctgctgccgtggcgatactggatatctggaatctgatcgaagaagtggggcttagcttaggttatcaattatacaaatccatgccttggatagctcttggttctcttgtattgagcttttctatgttgattacttaaagctgtaaggcggttttctaccacagaagcactatacattttctggaccttccatgtcaaattgcaccagttcggagataacaaccattgctatacagaacaagtactttttagtctagttcatctaggatttgtatcgaccaaaaatatacgatgagcagctggatgtccctagttcagcatacattgggttttaaaatagtcaaaattgacattagtctgtatttgttgtagcctctgatctaagtttgagtcactacaaatggatttgtgatattgattatcaaattcaggccaatggatcctcctttacaagaaaatggtcattactgaactcttgttactggaatgatgagaattcctgcattgctgggtttgcggaaagtatctactttatgcagagaaaataggcaacatcatgtttaccatgtttggccttttctgggaaagttattataagttttaatttgtgtttatggcttcttatggaaggaagctctttcgttttcttgcaataacttgtctttctagaactaattagctcaagtcaaaaaaatgtttaatccaccaccatagccatgttaattagattatgctttcatgcagggtaataaacatcattataggttgaacatataccatcactgtctctgctgagtttatcaactggagataaacactttgaaaatagctgtcatactatttctggttctttatagctaaataatggtggtttatcgaaatatttacatggtctgtaaaatctttaactacacatgccatgaggtcttatgaaatcctctttgctattgatttacactatctttacttatacttggaaacatctgtgaatgcatataaatatatgcttgtgaacttttgttcaactactccctttgattccaattataagtcgctttagacttgtggacacaaagtaagaaaacagctcaaatgacttagttgacttcattggaaaagatgagccatttatttgtgagaggggtatcatttatttagcaagggcaaattgggaagaataactgcagaaagtgcctagaagttccataacttcttacatttaggaaagagttgagaatgctaaagcgacttatatttggaattggagggaatatttgatttatgtgttagagtgactatcttgaaaggtgattctgtacatcttttgagtgttcatattcattagttgcacctgaccagtgtcaatgtacatacatattctttaaggcgttgacttgttgattcttcattgtactgtttcttggcagggcttttggaagatgctcgaaggaaaaccttcttaaattttttggctgtggtatttactctggaattgattaccagaatcaatttgattgcccaaacatcagctctaaatgtggttgcccctgctatatctccatctcaaagttggagaccagttcgctccatgttgtcaaaagctaaagttgacattagtatttcagtcagcgaacaaagacgaaagaagctatattcatcaccagctactctatctgtgcaccctccaatgtcagcgccaagctatagctccatttctggtgattctgatctctccttttattcttcagacatgtcagataatttggtgcagcataacagacgctcagaagcagaaatttctactcatgtagatgctgcgcctcctgatgcagcctcaaatactagtgcagctccttctggattagtacaacctccagtatctcctcacaatggtatgtttgattgttagagccttggaatcatctaatttatatgattttcattattcaagcatgacttgaaattatatggtgtaaatacaatgcgtaaagggccatctggttattcgagtagatacacaaaatgatgcctgtgtggttatttctgatttgcctttccaagaatttgttctttgattgcacctcaaccgtaggcatttgagtaaattgtgcaattcttttaccaatcaaccaagtgatatcaacataaattattcaattgcaatttgcttattaatagttaattagaaatgttaactctattgtgcatatccacattcacattggaatgtacaaagcttttacttagatctgtgtggtatcatggtgcaccttgatgattcggatcaacattttggagatcaatgctttggatgtttctatgatcgcaaacgccggcaacagaaaacgcgcaaagaaccagaattaagctgaggggataaagctccatcattatcttgcttaagttttgttggtcattatcttttaagttagtcgtcatctttagttcactatctcaagattgttagccatttatctccaagtttgttaggcgtgtcaaatcccttgatctagaaaagggtatccgggtgtaaggaataattaagtaagattaatctaatcaagtttaggcatgtttagagcctctcgctctcgggggaagagccctgcctcccgccagaggatgatcgcgagtttcgcccctaccccctccaaaatcatccactcgagcattcactgctctgacagccgctgcaacaccatcaccatcgtgcgcgtatcactgcatacttgaagcatactgaaatgctcagtgcctgcgatccttttggccaaatccaattctctgaatactggtgtcagatgtgaaactggctggttgttttgtaacctgtttggttggcattgtaccagctttcaataaaggcttgcagcgagcacatggaactttgcaaagtccatgtatgcggtctaagccaatttataagctaggtctcgcttgtgctatttgtcactctgctttttcctgtcatgtgagctattgctattgacttgaacaactggcttctgtgattaagcttactctcattgatcttaacttttactgctcctaattttggcttatctgcctgatcacttgagaactctatagtatgtccagcttatgtggcctaaccacaacccttttttatgctcacattaaacaataagatacaaaatacatgtggtaagtaaacattggtatttttgttgttatcttgtgtaaaataattaatgaattatgtgaagagtgttatatgaaattatagtatggataatatcttctacaataatctgttttatttgaaacatgatagtattctgttgttatcctatttgcagtttattctgacttgcttattgaacatggcccccaaatattgtgggacttcagcttagttttcttcatcccttagtaatactgaagtacacattattgttgtgctgtctgcctaagaaacgtttatgctacaatatggcatcttttctctctcagttatttccagctctctaagatagctcagtgagatttaaccttactgttttccccatttattttgcatttggaattttctcatgtccttggttttggcctatttgatccaaatattttagtcacagatttgttgttaaccattatttgatttgtagtattctctaacagctatagatatgctgttactcacattataatttaccttctgttttaccagcatgttgttcacataacatggtacaaaagagagggagccaagattgccattgtgtttacccagtaagagttgagctttttctccgaaatgtttcactgacgtcaaattggagcgatgaatttctgggggaacttgcttctcaactcagtctgagggttactcagtttgagattgtaaatttctatgttgttggggcttctgggctaaacatcacaatgtatatagctccccatacaggaattagtttctcagccgaccaagttaccgcaatgaattattcacttagtcagcatacagttcagatcaaccctgtactagttggtgactacaatcttcttaatttaacctggttcaggccactggttctagctcctggtaatgctaactgatcttgactttgctctatatattacaatgccgcagtttattttagtgttaaggtagagaacactgtaagactacttcagttttt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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0253100, RefSeq:Os01g0253100