Os01g0303200

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0303200

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001049367.1 GI:115436147 GeneID:4323900

Length

9559 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0303200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:11259811..11269369

Sequence Coding Region

11260054..11260172,11261515..11261632,11262306..11262402,11263054..11263160,11263645..11263767
,11263935..11264088,11264462..11264522,11264628..11264983,11266415..11267936
,11268049..11268295

Expression

GEO Profiles:Os01g0303200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggcgacggtggaggagcagatggtggtcaaggccatccgggaggagtgcccatgggagtcgctccccaagcgcctccagtccacgctccacaccaaggaggaatggcaccgcaggattgtggattactgcatccgaaaacgattacaatggaatacttgttttgctcgtagagtgtgcagggaaggggagtactatgaggaaatgatgaaatacctccggaggaatcttgcattatacccgtatcatcttgcagactatatctgccgagtttcgaggatctcaccatttagatattattgtgacatcttgtttgaagctatgaagaatgagcaaccatatgacagtattccaaacttcactgctgctgatgccttgaggcttactggcgttggaagaaatgagttcattgatattatgaacaaatgcagatcaaagaaactaatgtggaagctgaataagtcaattgcaaaagaattattgcctacacagcctgttgacttcccaatcgatccttggtggggagtttgtcttgtgaacttcactatagaagagtttaagaaactttcagaggaagagactgcaacaatagacaaaatatgcaaagaagaagccaattcctatgttctatttgacccaaaggtcatagatggcctttataaaagaggtttagtgtattttgatgtgcctgtttaccctgacgaccgctttaaagtttccaggctcgaaggttttgtttctaacaaggatcaatcatatgaagacccaatcgaagagctactttatgctgtatttgttgtgtcaagtgccaatgctactgtagctgaattggctgcaactctactagctgacctttatcagctgcaagcagctgcgtcgtttgcttgtcgactgggctgggctgtaaaacttatggatgctgactctgtacttgaagatgcacccacttttcccagtaacattctgagtgatgatgaagaaggttcaaatgcaagcatcaattcagaaaagtctggccaacagttgctcagtgttgatgctggaccaaggaaaatatctggaactgcccatgtagcgttggttgtggatgcgaatgttacttcgtacttgatgatgggctcattgtcaccaggtttaaaatctcatgctgtcacactatacgaagctggaaaattaggtgattcttgcattgcagaactatgcagtgatctggctagtttggaagggaagaagtttgagggtgtgcttgaggagtttgctaatcatgcattcagtcttcgatgcttcctggagtgtttacaatctggtggagtttctaccaatgtgaatattgataaagctggtgaagcaaagcttacaacaagctccttgcaagataatgttactgcccatttgaccaagataaacattgaggacactgatgaaatgccccagcagaagcactctggtttaaatagtagtgatgggaaaatgttgacttcatcagcgactttattggaaagtggagaaggcatggagggaaatgatgttgagggtagtggcaccactgaactagatggctcaactgacatcaatgtggttaagactaaaaggaagtacagagttgatatcctccgatgtgagagcttagcttcacttccaccagcaacactggaacggttgtttctccgggactatgacatcattgtgtctatggttcctcttccttcttcatcagttcttcctggttcgtcaggcccaattcattttggtccaccctcatactcttccatgacaccttggatgaagctggttttgtatacagcaggggattgtggaccattatctgctgttttcatgaaaggacaacgcattagattgcttcctaaacctttagccggttgtgagaaggcactgatatggtcttgggatagctctgtggtaggtgggctaggagggaagtttgaagggaacttagtcaagggcaacctgttgttgcattgcttgaactcaatgcttaaacaatcagctgttatggtgcaaccacttagtgtaaatgatcttaatgcatcaggaaaccttgtcacagtggatatccctttgcccctgaagagtgatgatcagtcaattgcatctgtgatagctcaaactaatttgccacaagaacaggtcttaaatttggcctctgtattaaaagacctgtccagtaaatttgagttgagtacacttggctaccttcggttattaagacttcataggcttactgaatcggatgaatcacacctagaaaatggaagttaccagtgggtgcctttgagcttggagtttggaatccccttgttcagtccaaaattatgtgagcggatttgcgaaagggtggtcgaatcctgtatacttcaaaaagaggatctcgctgaacattatgatgtgatgcaaactgtaaggcggcggctaagagaactttgcagtgaatatcaggcaactggtccagttgctaagttgttcaacaagcgaggaagctcaaaggatttgccccgtgttttaatcaacaccatcagtggcagatggaatccagttaatgatccttcagcaccaagtgaacatgagaggctgaaacttgctggacggcagagatgccaaacagaagtcgtgggatttgatgggacctttatcaggtcatatgcacttcctcctgagcacgatgaggctggcaccaaatctttatctgaagaacaatcatcagctcacgatggaaaaccagacacagaagatgcagatagcaaggatgtactcttaccaggtgtaaacctcatatttgatggagctgaattgcatccattcgacatcagtgcttgccttcaagcacgtcaacctctctggctcatagctgaggcgtcagctgcttcatcgaccatgatataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAATVEEQMVVKAIREECPWESLPKRLQSTLHTKEEWHRRIVDY CIRKRLQWNTCFARRVCREGEYYEEMMKYLRRNLALYPYHLADYICRVSRISPFRYYC DILFEAMKNEQPYDSIPNFTAADALRLTGVGRNEFIDIMNKCRSKKLMWKLNKSIAKE LLPTQPVDFPIDPWWGVCLVNFTIEEFKKLSEEETATIDKICKEEANSYVLFDPKVID GLYKRGLVYFDVPVYPDDRFKVSRLEGFVSNKDQSYEDPIEELLYAVFVVSSANATVA ELAATLLADLYQLQAAASFACRLGWAVKLMDADSVLEDAPTFPSNILSDDEEGSNASI NSEKSGQQLLSVDAGPRKISGTAHVALVVDANVTSYLMMGSLSPGLKSHAVTLYEAGK LGDSCIAELCSDLASLEGKKFEGVLEEFANHAFSLRCFLECLQSGGVSTNVNIDKAGE AKLTTSSLQDNVTAHLTKINIEDTDEMPQQKHSGLNSSDGKMLTSSATLLESGEGMEG NDVEGSGTTELDGSTDINVVKTKRKYRVDILRCESLASLPPATLERLFLRDYDIIVSM VPLPSSSVLPGSSGPIHFGPPSYSSMTPWMKLVLYTAGDCGPLSAVFMKGQRIRLLPK PLAGCEKALIWSWDSSVVGGLGGKFEGNLVKGNLLLHCLNSMLKQSAVMVQPLSVNDL NASGNLVTVDIPLPLKSDDQSIASVIAQTNLPQEQVLNLASVLKDLSSKFELSTLGYL RLLRLHRLTESDESHLENGSYQWVPLSLEFGIPLFSPKLCERICERVVESCILQKEDL AEHYDVMQTVRRRLRELCSEYQATGPVAKLFNKRGSSKDLPRVLINTISGRWNPVNDP SAPSEHERLKLAGRQRCQTEVVGFDGTFIRSYALPPEHDEAGTKSLSEEQSSAHDGKP DTEDADSKDVLLPGVNLIFDGAELHPFDISACLQARQPLWLIAEASAASSTMI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>244..362#1705..1822#2496..2592#3244..3350#3835..3957#4125..4278#4652..4712#4818..5173#6605..8126#8239..8485#gcggactgcggttttaccccacggagaaaaaggccgcccctcccgccccagccacagcgacgaaccaccgccccggaggccgccggcgtcgagctcccctcgcccacagcgtgctccaccgagctccccccccctcgtctcctccaccagatcggtgatctgatccccgcctccaccatacagccagatccgtcgccccgccgcccccctccgacctacccgtcccgaggcggcggggagtggatggcggcgacggtggaggagcagatggtggtcaaggccatccgggaggagtgcccatgggagtcgctccccaagcgcctccagtccacgctccacaccaaggaggaatggcaccgcaggtttacttgcctcgcctctactctcttccatggatttttgatcctgctgcttgcttcgacgcagcttgtggtagtttactactagtcggcctccgagatctagggagatatacaccagtagaggcaatgccgtttggagttcttgcctcagactgattaaagctcgttgcaccagctggaagctcttgcctagatctcgcccatttgctagccgcatttgggcaggagcactcacttcggagatgcttgtgttgatctcaattgtggtgggggactagacaatcgctgggttgtcctataggatagccggatagatggatccctgtgcacctgtagttacttctagacaacacttatgaagcttttgcattcgtaaatagtacttgataggtagtggggattgaagaattccaagcttcaattgattctgagtgaggtcaggaactccgagatctagaaagcacgtgatatccagtttttagaaatgagcagcgcattggatttgattggtctttcaccctgtatgatcttctgcttagttatcactacgacacttgctagtatactggatgttggtgatgattatactgattggaatttatcgtgttcatcttatttagcatgcaaataacaattcttcatgggttaaagcacatgatatccattgaaaggatgcaggaaagtccgttaataacctgaattgatggcaatcattagtgaaatgtttgtccctttcaaagttacctccttgaaaatgtgctgagaatagacagtctcaaatgccaattctatagatcatgtatcgcaaggtgataaaagagaaaaccttgcacttcccagtccctataggtctatcgaaagagctgaattatttttgtcatgtctgcgaaaacaattcacataactgatgatgatcactataaggggagttacaaacgtaggggatttacaattaatcatcacaactcatttccacttggcttacaccgaagtacatttggagttgcaatgtgactttgtagaaactaagtagaaaggaatctaatcgtgtaaatcaacaaacatacttccatcaccatcgatggcattcagatcacataaataaaagaaattaatggctcaatgaagggagaaaattacatttgtatatcagcaaaaaaatccttttgagctaatgtacacacatacatcctggtgcattccttataaaggccttcttggatgactgtgttcaagtacttaggtgtattaaactatgaaagtatgaattgctttcctattacttttgttgatgtagagtaaaatttactggcctaatctccagttaataatttgatggcaggattgtggattactgcatccgaaaacgattacaatggaatacttgttttgctcgtagagtgtgcagggaaggggagtactatgaggaaatgatgaaatacctccggaggaatcttgcagtatgttcctgaatactacctcttgcatggtaccattttgagataatccatgaaatgccattgacaagcatctaagtcccagaaatgccatcgacaagtgtgagttccaagaaatgccatcgtaaaagcgattttgtcccaaaaataccatcgccgttagggttccgtccattccgcgccgttaaatacactgttcatcctatagaacttaacgacgtggaatggacggaaccctaacggcgatggcatttttgggacaaaatcgtttgtacgatggcatttcttggaactcacacttgtcgatggcatttctgggacttggacgcttgtcaatggcattttatggattatctctataattttaggttagcatattcagcaattatgcaaaagtatggttgtacctcttggggccatgattcattcttctattgataatcaccccctagctagcattattatatccgtgttttgatagtcgagatactttgcttgaccatatctgttattttttctatggagggttctctaattatttctgcaagcttctgtagctgttctattgacgtgctaaattagtatagaagaaaagcaatggtcttgtatatttgaagagtttgtgcaaaagttctgatgatcctcacctgatacacaatatcacaacgttttgcagttatacccgtatcatcttgcagactatatctgccgagtttcgaggatctcaccatttagatattattgtgacatcttgtttgaagctatgaagaatggtaatctcttgttaatagaaatagtttctttcatgtcatttatgtatttgtttagcatcctcgtataaagatcacatttaattggttaattattttatgtcttatttgacatataataacaataaaaaaggtattacattggtttctattttatgttactacaacatcgggcaattcctggcctaagggggttttcttttagttgcagaacagggcaatgtattgatagacaattcttccatctagttttactattaagttctatgggtacctcagggtgtacagagtccctgtgcaggcaactattatgtacaaagttgcataattgttttttgtttcatcctattttgtgatagttttgtgtaatctatgtcgtttttagttgaatacctctgtaacagcatggaaacaatataaataagcttttatttttgccaaattacaagaaatgtgattttactcttttaggtttgttcagcatagctcttagaattagcctttatcttcaactgattatttctgatggcaataatttagtaatcactttgaaacatggaggtgactatcataaatgagtatacttccacctgctttattcatcgatgttgttcctgtttatagttctgacatgttttggttatgttattgcagagcaaccatatgacagtattccaaacttcactgctgctgatgccttgaggcttactggcgttggaagaaatgagttcattgatattatgaacaaatgcagatcaaaggtagtatccattctcatggctttttgcacattaccacctgctcttaccttgaaaaccgtaaattgttttcaaatagttcactgtttgacttctggagtaatctgctacacactgaaacaatattggacaatttggaagctcgcaagaaataataaaaacattggaataatggatattaccttgaacatatctcaactaagcagtaactgaatcctaaaccattaagcttactattgtttagatgcacttctgcagtgtcaggctgaatttgagttatgaaatataacgattctgtgtaaacaatgatgtgcaattgtgctaactagttagtccagttcatgagaaaagtcatgaatgcactaccaggttaccttttctttttttcagtatgaatctagagtggtttttcatgatgtagtagtactattttgtagcaagatcgattaccctagcaaataatactatttcttgctgaattcttcagaaactaatgtggaagctgaataagtcaattgcaaaagaattattgcctacacagcctgttgacttcccaatcgatccttggtggggagtttgtcttgtgaacttcactatagaagagtttaaggtcaggtttgccccactctctatatgctgtacatatcacaatatgtatatcaatgcggtgaaactgcttttgttagcttggaagataaacgaatttctcgagtttttgtttctatatgaagctattatttcttgatgaaatctttacatctcattggttgattgtagaaactttcagaggaagagactgcaacaatagacaaaatatgcaaagaagaagccaattcctatgttctatttgacccaaaggtcatagatggcctttataaaagaggtttagtgtattttgatgtgcctgtttaccctgacgaccgctttaaaggtattgaccgttttaaatgatcttttctagtgaaaatccagtaaaattaagctaattggttggcactattttcttttgtattgtatctagattctatactcatgagtttaccttgtttaatactttaatgtcaacaagtatgatatgagtatactcttgtcttgtaactactgactgccaaggaatgtttgagacactccttatttcgtcatcttataatgagcttcctatgtaagaataacttataaactgtgcatgtagttttattccttcttttactatagtaagcatgtgtttttctgttttcaactaggaaaacttgtatttatgttacttctctagttttaaaagatgttatattgttctgtttcagtttccaggctcgaaggttttgtttctaacaaggatcaatcatatgaagacccaatcgaagagtatgtactagtagtgctttcagttgatattcaaatcaattttacttgtaattttgtgctgccatcaaagtgagtactgcttaccttttttttcttttatttcaggctactttatgctgtatttgttgtgtcaagtgccaatgctactgtagctgaattggctgca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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0303200, RefSeq:Os01g0303200