Os01g0502400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0502400

Description

Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain containing protein

Version

NM_001049670.1 GI:115436783 GeneID:4324480

Length

10116 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0502400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:19051149..19061264

Sequence Coding Region

19051306..19051629,19054887..19054934,19055959..19056135,19056227..19056377,19056477..19056563
,19057971..19058095,19058343..19058461,19060706..19060817,19060923..19060958

Expression

GEO Profiles:Os01g0502400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MALDGPAERRDEAQAAMGNGNGVAPPPLRPAGRPSGAPACADRR LRLNPNMEHKPQDYSDVRGEYAPAVYSALERHLPPSVLDANREIKLQLMREVLGHYWP HGERNKVQRHREYRQRILNHYKPLHKELYKMRPSSFFLPTFLEAIRTNTEESFRSIMT EPVPGVYSFAMLQPNFCEMLLQEVENFEKWVHTMKFKIMRPNTMNKYGAVLDDFGLEV MLNQFMEQFIAPMSTVLYPEVGGGTLDTHHAFVVEYGKDRDVELGFHVDDSEVTLNVC LGKQFSGGELYFRGIRCENHVNSETQHEEMFDYSHVPGRAVLHRGRHRHGARPTSSGL RINLLLWCRSSVFREMKKYQKDFSGWCGECKREKKERQIHAVKATKLAFLRGAGGATI </aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>158..481#3739..3786#4811..4987#5079..5229#5329..5415#6823..6947#7195..7313#9558..9669#9775..9810#aatccagtgtcatttgactcatttcctcttcctgccctcggggagtacgtgaggacctaaaagtacctcgcccccaaaccctagaaccccacaccacacccaattcgcccacccaaaccctagtcctcccgatgctgtgatccgccgcgcgtgccccatggctctagacggccccgcggagcgacgggacgaggcccaggccgcgatgggtaatggcaacggcgtggccccgccgccgttgcggccggccggccggccctccggggcgccggcgtgcgcagatcggcggctgcggttgaaccccaacatggagcacaagccgcaggactacagcgacgtccgcggcgagtacgcaccagctgtatacagtgcacttgagaggcacctcccacccagtgtccttgatgccaaccgggaaatcaagctgcagctcatgcgagaggtcctcgggcactattggccccatggtgagcgcaacaaggtgaggttgtggatcttgttagatagaaatatatatgggccttgcgtgtttttttaagtgtttgctgtggcccttttgtcgatagaattttgttttgtttttttttttttactacggactctgaaattagagattcagaatgggcgatggtgaagaaagtaactgctgagttgtatgcccattaggtggaataatgtggttcttgtgccagcaacttctggcaggcaggtgttgtggctggagaagggtacgaggtgcagccacaaatgctggactaaatccaataaccaaaagatttgtctgttcattttgcataagacaagctgtagccagcccagacaataccagacaattgctgtgaaaaatttgatctggatttggcatacctgctgttaatatgtgccaatgccccaatctagtacaccctttctaggtataactggatgcatgtgatgatggaagatcctatttaagaatgcatgcaattttgtaacttatattagatgaacataagggactaattaaccatgggcaagtttggtttgatgcgaaatattgccctaccctttatttggtagcttcaaactcttgctagctatttggattggatccccccctcccccgaaaaaaaaaatcttgccaaatcaatataattgatacaactttaccctaccaaaaatttggtagtgccaaagcttgcccaaaggtttggcattaccaatggtttggtagagtagagaaccaaactcaccctaaatacatacacaatttgggttagagacaaaatattgtgataatcacttcctttctaaataattgtctctatgggttaatcactaggcttttccttacctaatcgtcacttggtccaccttaaaggtgtcataatatccttctgtttgcctttatctgctagttatgccatggcactttccttgatcaacctgtgcttatgaaaaatgtttggtggaagcctatctcttgcttgatctgcttgattgatacaacattatggattggctgtttctaggacatcctaaaattagtcttgttcaatacttatattatgacgccatcgatccgaactaatctatcttgaactgcaatttggatctatgcagtactgtactaattgaacttcattctataaaggattctaaaaaatcatattgtttatctgtagcttaagagttctttttccttgtagcatggcaaattgcatgatatatcttggttgtcttggaattcgaaatttgattttagttttggtgattgagaaaaaaaaagagtaaattcgactggcagtatataaacttttaagatttggtgcaaaacaaggccaaaatgaccacatgggcaaatctggctgacttgacaaggattccatctagctgagcagtggaccctggagttttcaggagccaaatcaaagtcttcatgcacataaatacaattagggtccttattcatgaaaagtgaagtacaaataggtcaaatagtcttacataacacaaacaaacgtttagtcatttcgggctttttttcatggcatataaatgcttgattacatcccgagaaagatgatcatatattcagaggaagtgaaaaggtgaaagaccacctggtcatctggtgttgcctgttgccaccttcagttgctggttgcgtgctacccagggatgctacgcttgcaggccatgagttgcagccctgtcaggcatcgtcgccagtactccatgctcagggggttggggctcagctgttcaggggccattctgcaagggagtgctattggctttgctagactctaactcactggcagttccacttcacacgcgcctccaacggaaaccctcaagatgttgaaaggctttgttgcatgtgcactcccgcattgacgcaagcacacgcatggtcttccggtgggtgactgcacctaggcttcttgggctttggtttactacatcctttttcctttttgcaaatttgttgggtatgccagtgtccacgtagcatcccatgggtccgcccctgtagatgaggtgtacttcattggttagttgttccttgatattgctgtagaaacgaaagcatgctatgttatggagcttcttgtgttgttccggctaacttgtaatcgaagaatgggattgaagataaggatgtgaatcttatcccgtgtaaatagatggtacgtacccggataaggtgggatccggatacctctcaatagccagttccctgtgtctatataaagggaaccgggaaccctaaagcaggtgatcactacacgctactcctaatgtcgtattgcgaacccctacacagatctaatccacataagtggactaaggtattacctctccctaagggcctgaaccagtatccctgtgtcaccatccctccatgatcttttgcaccccataaatattattgctaatccgtagaattgacaaggtgagtcaacgtggctgaacccataccaggatagctcacaacacaaaccatcacttggttgtcatccttgttaacaccaaggcaaccagatttgccttcttggattgtgtttgtcttggttcgcacctatgagtctatcatattttgctagttattgcactaatgtgtatcctccattcaagtttgtttaccacaagtgcaatcatatttgttaaaatataaagtgtatttggtatgaagcatataatttatgcaaattttgaggtaataggagcaaagttgcagaaagaaaagatagccatttaaattctgctgatattacttgcatttgcaagactagaatggattggtatcacgggaaacggatgcaaaaattaagcaatgcttaacatcaatatatattttattgtttacaataaactttgatgttatgcctagtggtaggactttttagtataagtttatgatgttcaaagaagctgttactgcataccacagagatcaggtcaaaatatttgtggctgcttcagatatttgtaattgcatattaatttcatgtattaaatttaattcgtcatgagatgctataccttagttttgcaacgacgagggagtttgagctggaacatgtcaaaagaaaacacatgtagtggtttaatttttccttaagtagtatgagtgaacaaagaagggtcacctcgaattattttttgcatttccagagtttcaaccttcccattttctgcagctgtaagattagttctgttgagattgtcatatgaagtgttcttttattgcaggttcaaaggcacagagaatacagacagagaatactcaaccattataaggttagcgtttcagcatagctgacattattcgaattatctctaaatattttgaaatgggggaatatgcatgttttttcttgtgcataactatatttgcacatagaaatatgcagtccaggaattcaggaattatatcatatattgtatgatttgttatttcttttgagcgttaagcagggtgtgatatgagatgtttatggaacaattgtattggtcctgtacgaccagccatatgtgatttcccaggtgattgcatgagcaaaatctttgttcttgaagagtgcagctggttcctggtacaaaagggcacaattggttggacaagaggtccgtgaagagtgtagggtggtaggatactggaagatcatagataaaagaattacaatccaggcatccagtatgcgctagtaattcaatatttacaactgtttgaatcaagtatgcatgactgtgacagagcactacaggtaccatgaataatttagttatggagagccttccgagatttggttatccaatcagcatttcctgtgttggttgccttgtgtgcatgatcttagaaagctgcttatggaatatttatcttattatgtcaaacgaatttggaattaaatttctatgtttacatggcaaaatataaaaaaatatacttcttttattaaatgaagtatacttcttttttattaaaaaatatacttctttctatgtcgatatggcaaaataaatttctatggcatgagcggtaatgaatccccagacaggagaattaaatgaattgtgagctgacgtgggtttcagtcaacaatatgtgggttccttgatttcactaacagctagagctcaagcaagtggaaatatcaatgaaactaaatggcaccatgtgtttgttacagttcattcatgtgtacactacagttgtagtgtatggactggaagtcatcaatcttattgagaaattgaaactaaatctatttgttttttgtgctagtaataataacttatattttttttattttcctgacagccacttcataaagagctatacaaaatgcgcccttcatcgttctttttaccaacattccttgaagctattaggaccaata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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0502400, RefSeq:Os01g0502400