Os01g0551900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0551900 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001049844.1 GI:115437493 GeneID:4325848 |
| Length |
4893 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0551900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22374207..22379099 |
| Sequence Coding Region |
22374537..22374650,22374779..22374957,22375031..22375291,22375957..22376090,22376174..22376397 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:22374207..22379099 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaattgctttcctttaaacagcattagtttaacacgatcctggaaggctatgacagaagctacattagttgagtctgaaaataattttgctcaaagaagtgaagaaaatcgtgacaatttaagttccaagaacaacgagaaaatacagagatcaattgacaataccccttatggtgtggaagtcactcttgaacctaaaaggaaaggtttaattgcagattttgaaagacccagagaacttgtaaggagaaatggtgaacttcttgaggcaatatgtctcaactctatcaatgagcaacaaggtgctatcgccaccaatcggaagggccttgttttcttcaactggaatgacaagcaagataacaaaaatttagcagagtatatatgggcaggatctgattggcccttggatgggtgggctggttgcgaatctacacctacttcaacttctttttctcctagtgttggtcttggcagaagaaaaggatcccatcttagttcaggtggaccaactattagtttaggttcattggcaaaacctggaagggacttaactggtggtggagcatttggaattccaggttatgctggtatcggcgcatctggatttgggtggggggaacctgacgaattcgaagatttcgttgatcctccagcaacactcgagaacatccattcaagagcattgtctcgccacccatctttgccattgttgctagttgggtcaagcaatactcatgtttatttatgggagtttggcaaagacagtgccatggctacctatggtgttctccctgctgctaatatcccaccaccttatgcccttgcttccatatcagctgttcaatttgattattatgggcagcggtttgctactgctgcattagatggtacagtttgtacatggcaagttgaggtgggtggaagaagcaatgtgcatcctaccgagtcatccctgtgctttaacacccacgcatcggatgtcgcatttctgactgcaagtggatcagttcttgctgcagctggatgcagttcaaatggtgcaaatgttgttatttgggatacattggcgccaccatccacttgtcaaacttctattatgtgtcatgaaggaggagttcgttctctttctgtgttcgatagaaatataggctgtggatctatctcaccgctgattgtaactggtgggaaaagtggagatgtaactttgcatgattttcggttcatctctactggaaagactaagcatcacagaagttccaacgagcatgatgttaaggcatcttcaacttcaatgcatgacactaagtctggaacttccaacggtgttagcaacagtgggatgatctggcatataccaaaggcgcatacaggtagtgtcagcagtgtatcaaccatcccaaataccagtttgttcttaactggaagcaaagatggagatgtgaagctttgggatgccaaaagttctcagctagtcttccattggcaaaagttgcacgagcggcacaccttttttcaaccaacttctaggggctttggtggtgttgttagggctgctgtaacagacatccaagtcttacctaatggttttgtctcgtgcggtggggatggttctgtgaaacttgtgcaggtaaaaaatgattttgcagatgtacgcccacattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNCFPLNSISLTRSWKAMTEATLVESENNFAQRSEENRDNLSSK NNEKIQRSIDNTPYGVEVTLEPKRKGLIADFERPRELVRRNGELLEAICLNSINEQQG AIATNRKGLVFFNWNDKQDNKNLAEYIWAGSDWPLDGWAGCESTPTSTSFSPSVGLGR RKGSHLSSGGPTISLGSLAKPGRDLTGGGAFGIPGYAGIGASGFGWGEPDEFEDFVDP PATLENIHSRALSRHPSLPLLLVGSSNTHVYLWEFGKDSAMATYGVLPAANIPPPYAL ASISAVQFDYYGQRFATAALDGTVCTWQVEVGGRSNVHPTESSLCFNTHASDVAFLTA SGSVLAAAGCSSNGANVVIWDTLAPPSTCQTSIMCHEGGVRSLSVFDRNIGCGSISPL IVTGGKSGDVTLHDFRFISTGKTKHHRSSNEHDVKASSTSMHDTKSGTSNGVSNSGMI WHIPKAHTGSVSSVSTIPNTSLFLTGSKDGDVKLWDAKSSQLVFHWQKLHERHTFFQP TSRGFGGVVRAAVTDIQVLPNGFVSCGGDGSVKLVQVKNDFADVRPH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4450..4563#4143..4321#3809..4069#3010..3143#2703..2926#1502..1930#580..636#224..493#agtaaaattgcatgcttcatttttcagagagaaagtactgaagaagtcaaattcaagtgtgcttttctggttatctcagccaaggtccaacaacaatagccatgagcagttctcaagtatttttcagcttgctaacagtgagaacatcgaagtcttttttgatactttgtgggaaatatctgctcatcctgtggatatctgcactgcttttgtggatgaagaaatgaattgctttcctttaaacagcattagtttaacacgatcctggaaggctatgacagaagctacattagttgagtctgaaaataattttgctcaaagaagtgaagaaaatcgtgacaatttaagttccaagaacaacgagaaaatacagagatcaattgacaataccccttatggtgtggaagtcactcttgaacctaaaaggaaaggtttaattgcagattttgaaagacccagagaacttgtaaggagaaatggtgaacttcttgaggtatttaccatcagcatattgacagtatagatgctaatcattttgcttccctttcttttactgcattttaatcctttgcggtgcaggcaatatgtctcaactctatcaatgagcaacaaggtgctatcgccaccaatcggaaggtactatttttcaatcattcattatttatgcattctggatttaaattgttacttatattgactatttatttgaaattgtttatctagtggttagtgaatctgtgaatttgaggaaattgtttgagtgaacacctttcctcagttattttccttccttgcatttcctctttgtttccccctttttttttgcattttttctttcttgtgtttccttggtcattaacattgaaaaataactattctattttattaaattttacaacgaaagtgtagttttcaaaactgtagatttacatgttttcagtgtttctttgaacaggtgtaaaatttttaaaaatggtttgatattcacccatttgttaagaggtgaatgtgtatatccattccaacagtgaagatgtgttccgttattttcttgcattagattattagtagtgccaatactaagatataattgaaatggggcatgctgcttcagcttttgtggttgaaatgaaataaccaaagtagcaggtggttttttttatggatgataaataggactttatgcaaacaatgtaaagaattgtatttggtgtaacgacttctttgtaacatgaggttagctgcctaacattaagtcggggtgtattgagtgttggttccctagacaccagaaagatcgaagatcttttaatcagatatttgtaagaatttttggttacccacattgaatgaaggttatgattgtcttttctatctcagacaatctacttgctactccataaggggctcttcattgaagtaccatgtggactgtttgtctccttaagtaacatataattatgccgtgcatcaattttactgtgtggttatccattttcagggccttgttttcttcaactggaatgacaagcaagataacaaaaatttagcagagtatatatgggcaggatctgattggcccttggatgggtgggctggttgcgaatctacacctacttcaacttctttttctcctagtgttggtcttggcagaagaaaaggatcccatcttagttcaggtggaccaactattagtttaggttcattggcaaaacctggaagggacttaactggtggtggagcatttggaattccaggttatgctggtatcggcgcatctggatttgggtggggggaacctgacgaattcgaagatttcgttgatcctccagcaacactcgagaacatccattcaagagcattgtctcgccacccatctttgccattgttgctagttgggtcaagcaatactcatgtttatttatgggaggtaaactttccttaaaaaaatactctataaatttgtctactacttcacattggactgggttttacttgttagcatatctgtttattgttgatgccttgatttacagaaggagggcaatgaatttcgctgctccaattttaccctttatcatagacaatcagtgattataaacctttccttgtataaattaaaatattgtgtgctaaggatcatgcaagtaaacagttgacacaactgaagacattaatttaaaggactggaatcttggtcagcagaacacatggttgatgacatgagaagggccttggtgaatctattcttaaattctttttcccttcatggaaaataggaaaatcgttggattgcaaccatcggtgcttgtaattttcactctaagcttgactttaccatattttttgatagattgatgtttatgatgcttgatgcgtacacatctagtgcagagtgcagactctcattttggttatatgatatatcatgctaactattttggttgaggaaccacagaaacttaaaggaaatctaaaaggacagcacctcaatttaatgtaccatcgcataatttttttgaccccaagctcaatctgttctggaagggaaaaaaaaaagagctgaactttgctgatctgttaattttttttactattttttagttcagtcaaaagagtaaatatgatacctagagagggttttgcactagatttgccgccatgtttaattatccattaatatcatctgttcttttttacagtttggcaaagacagtgccatggctacctatggtgttctccctgctgctaatatcccaccaccttatgcccttgcttccatatcagctgttcaatttgattattatgggcagcggtttgctactgctgcattagatggtacagtttgtacatggcaagttgaggtgggtggaagaagcaatgtgcatcctaccgagtcatccctgtgctttaacacccacgcatcgtacgtgaaacaaactttctgaatggaatggtcattgcttgatagagctcccaaccttaccagtctattcttattgatcacagggatgtcgcatttctgactgcaagtggatcagttcttgctgcagctggatgcagttcaaatggtgcaaatgttgttatttgggatacattggcgccaccatccacttgtcaaacttctattatgtgtcatgaaggtattccactgattgatgctttgttccatttggaactataatcatgaaaacaatgcatatggatgttggtttctagtagtctaatgcagaaataggaatgagaacaagttcagtttttagtatctaatcacacagttgtcagtaggatagagaggatagctacgtcatgggtttggagaaagaagcaaaggttaatttcttttcaagtccaatgttaccacacaatatttgttgcataaaaatttccacatggttaaaacacaaaatttgctaatctagtttcctctaaagtttaagcaacaaccatgctaatgagataaatagtgtgactaaaccttcttgtcttaaattttattgcacatggggccacgacagctgtaaaagatcaacataagtaaatttttaatttgatcatctaataaatagaagtcttcagcaccaccctgccaagctgacaatgttgtccacactttcaactaaaactaaataacaaacacagaaaattcattgaccttgtaagtggtgagctgagaaggcattaaggattacattgtatgtatgcgtgtccaaaggggtagctatattcactgctatcatccctccaatgccccttgtgtagaatttaggatatatggctgaggctgaccatggacttcatctttcaggaggagttcgttctctttctgtgttcgatagaaatataggctgtggatctatctcaccgctgattgtaactggtgggaaaagtggagatgtaactttgcatgattttcggttcatctctactggaaagactaagcatcacagaagttccaacgagcatgatgttaaggcatcttcaacttcaatgcatgacactaagtctggaacttccaacggtgttagcaacagtgggatgatctggcatataccaaaggcgcatacaggtaagttttgtgatattaccatggtacttttcgagttggtttttctacctgatctcttctgttctatctgcaggtagtgtcagcagtgtatcaaccatcccaaataccagtttgttcttaactggaagcaaagatggagatgtgaagctttgggatgccaaaagttctcagctagtcttccattggcaaaagttgcacgagcggcacaccttttttcaaccaacttctaggggctttggtggtgttgttagggtatgccatactaagtagatcctaatatataatcttgactgatctcattgggacttttttatcatgttgtgataagacaagtatatgacagttttatctcgctaatacatctatatgtttgattacaggctgctgtaacagacatccaagtcttacctaatggttttgtctcgtgcggtggggatggttctgtgaaacttgtgcaggtaaaaaatgattttgcagatgtacgcccacattagaacaaacagaagggaggagatatgctagcgatggttttgttgtggtgggttcagattgttcctttgatcaattgatcttattctgcaattttgttttcccatgagatgttttgctgttgcaagggatggcatagcaagaatgtagccataaagtaagagctgggcagaatctgaacagtttaatgggatttgtatacaaaggtactcctgttagctgtctggatgtggggcatggaactcgcgtcttgtatgcggtaggtcatgtaggtgtcgatttttgtttgtccatgcatgtccattatatatacaaggaaatgcaaaattttccat</dnaseqi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