Os01g0601625
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os01g0601625 |
|---|---|
| Description |
Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001185522.1 GI:297720178 GeneID:9266262 |
| Length |
3387 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0601625, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:25288835..25292221 |
| Sequence Coding Region |
25288835..25292221 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:25288835..25292221 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:25288835..25292221 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtctaaactggcgctcctcctccgaggagctgcaatgatcttgtggctactcatctcgcagacaccatctacctgttgtgttcatgcgagatgcgtcaccggcgagcgtgatgcgctgctctccttcaaggcaagccttctggacccttctggcaggctgtcgtcatggcagggtgacgactgctgccagtggaagggagtccggtgcagcaacagaactggcaatatcgttgcgcttaacctccgcaacactaataatttctggtacgatttctatgatgctgatgggttgaacctattgagaggcggtgacttgagcctattgggaggtgaattgagctcctctttgattgctttacatcatctgaggcatctcgatctgagttgcaatttcttcaacggaacgagcatacctgttttcatgggctctttcaagaacttgagatatctcaacctctcctgggcaggtttcggtgggaaaataccttcgcaaattggtaatatttccagcttacaataccttgatgttagctcgaattatttcttccatgaacagaacacgtttttcatgtcttcaactgatctttcttggttgccacgtctcacctttttgaggcatgttgacatgactgacgttgacctcagttccgtgagggattgggttcacatggtgaacatgcttcctgctcttcaagttcttcgtttgtccgagtgtggccttaaccatactgtatctaaactatcccattcaaacctcacaaatcttgaggtccttgatctatcattcaatcaatttagctacacgccactccgacacaactggttttgggatctcactagcctcgaggagctttatctctcagaatatgcatggtttgcacctgcagaacctatccctgatagattgggtaacatgtctgccctacgtgtcttagatctaagttacagttctattgttggtttgtttccgaagaccttagagaatatgtgtaatttgcaagtattgctaatggatggcaacaatattgatgcggacttaagggaattcatggaacggttgccaatgtgctcgttgaattctttggaagagttgaatttagaatacacaaatatgagtggaacattcccaacgttcattcacaaaatgagcaatctcagcgttcttctattgtttggaaacaagttggttggcgagctacctgctggtgtcggagcgctgggtaatttgaaaatattggctcttagcaacaataacttcagaggtctagtgccgcttgaaacagtaagtagtttggatactttgtatcttaacaacaacaagttcaacggttttgtgcctcttgaagttggagcagtaagtaacttgaaaaagttgtttcttgcgtacaatactttcagcggccctgcaccatcatggattggaacactaggtaatttgacaatattggatcttagctacaataacctcagtggtccagtaccgcttgagattggagctgtaaatttgaaaattttgtatcttaacaacaataagttcagcggttttgtgcctcttggaattggagcagtaagtcatttgaaagtgttgtatcttagctacaataatttcagcggccctgcaccatcgtgggttggagcattaggtaatttacaaattttggatctttcccacaatagcttcagtggacctgtaccaccagggattggatcactcagtaatttgacaacattggatcttagctataacaggttccaaggcgtaatctctaaggatcatgttgaacatttatctcgtctgaagtatctggatttgtcagacaacttcttgaaaatagatatacatacaaattcttctccgccattcaaactaagaaacgcagctttccgatcatgtcagctggggccgcgctttccattgtggcttagatggcagactgacattgatgttcttgttcttgaaaatacaaaattggatgatgttattccggattggttctgggtgacattttcccgagcttcattcttgcaagcatcaggaaataagttgcatggctcattaccgccaagtctagaacacatctcagttggtcgcatatatctcggttccaacttgttgacaggtcaagttcctcaactccctataagtatgactcgcttgaatttgtcttcaaactttttgtcagggccattgccatctctcaaagctccactgctggaggagctgttgcttgccaataataatattacaggcagcatcccaccatccatgtgccaattgactggtttgaaacgtttggacctgtcaggaaacaaaataacaggagatcttgaacaaatgcaatgctggaaacagtcagatatgaccaatacaaactctgcagataaatttggttctagtatgctcagtcttgccttgaaccacaatgaactttcaggtatatttcctcaatttcttcaaaatgcctcacaattattgttcctggatctttcacacaacaggttttttggaagtttgccaaagtggttaccagaaagaatgccaaacttgcaaatcttgaggttgcggtcaaatattttccatggccatattcccaagaacattatttaccttggtaaacttcattttctggacatagcacacaacaacatatcaggatccataccagactccttagcaaacttcaaagcaatgactgttatagctcagaatagtgaggactatatttttgaagagagcataccagtaatcacgaaagatcaacagcgtgactacacctttgaaatctacaatcaggtggttaatcttgatttttcatgtaacaagttaacagggcatattccagaagaaatacatttacttattggacttaccaatttaaatttatcaagtaatcagttcagtggaacaatccatgatcaaattggtgatttgaagcagttggaatcccttgacttgtcctacaatgaattatctggtgaaatccccccaagtttgtcagctctaacttctctaagccacttgaacctatcatacaacaatttatcaggcacaataccatcaggatcacagctacaagcactcgatgaccagatttatatatatgttggaaatcctggtctttgtgggcctcctctcttgaagaactgttcaactaatggtacacaacaaagtttctatgaagatagaagccatatgagatctctctacctcgggatgagcataggatttgtgattggtctatggactgtgttttgcaccatgatgatgaagagaacctggatgatggcttactttcggatcattgacaatttatatgataaggcctatgtacaagtggctataagctggagtcgcttgatgcggaaaaaccaagatgcagcgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSKLALLLRGAAMILWLLISQTPSTCCVHARCVTGERDALLSFK ASLLDPSGRLSSWQGDDCCQWKGVRCSNRTGNIVALNLRNTNNFWYDFYDADGLNLLR GGDLSLLGGELSSSLIALHHLRHLDLSCNFFNGTSIPVFMGSFKNLRYLNLSWAGFGG KIPSQIGNISSLQYLDVSSNYFFHEQNTFFMSSTDLSWLPRLTFLRHVDMTDVDLSSV RDWVHMVNMLPALQVLRLSECGLNHTVSKLSHSNLTNLEVLDLSFNQFSYTPLRHNWF WDLTSLEELYLSEYAWFAPAEPIPDRLGNMSALRVLDLSYSSIVGLFPKTLENMCNLQ VLLMDGNNIDADLREFMERLPMCSLNSLEELNLEYTNMSGTFPTFIHKMSNLSVLLLF GNKLVGELPAGVGALGNLKILALSNNNFRGLVPLETVSSLDTLYLNNNKFNGFVPLEV GAVSNLKKLFLAYNTFSGPAPSWIGTLGNLTILDLSYNNLSGPVPLEIGAVNLKILYL NNNKFSGFVPLGIGAVSHLKVLYLSYNNFSGPAPSWVGALGNLQILDLSHNSFSGPVP PGIGSLSNLTTLDLSYNRFQGVISKDHVEHLSRLKYLDLSDNFLKIDIHTNSSPPFKL RNAAFRSCQLGPRFPLWLRWQTDIDVLVLENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASGNK LHGSLPPSLEHISVGRIYLGSNLLTGQVPQLPISMTRLNLSSNFLSGPLPSLKAPLLE ELLLANNNITGSIPPSMCQLTGLKRLDLSGNKITGDLEQMQCWKQSDMTNTNSADKFG SSMLSLALNHNELSGIFPQFLQNASQLLFLDLSHNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLR SNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESI PVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTGHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIH DQIGDLKQLESLDLSYNELSGEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDD QIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSFYEDRSHMRSLYLGMSIGFVIGLWTVFCTM MMKRTWMMAYFRIIDNLYDKAYVQVAISWSRLMRKNQDAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3387#atgtctaaactggcgctcctcctccgaggagctgcaatgatcttgtggctactcatctcgcagacaccatctacctgttgtgttcatgcgagatgcgtcaccggcgagcgtgatgcgctgctctccttcaaggcaagccttctggacccttctggcaggctgtcgtcatggcagggtgacgactgctgccagtggaagggagtccggtgcagcaacagaactggcaatatcgttgcgcttaacctccgcaacactaataatttctggtacgatttctatgatgctgatgggttgaacctattgagaggcggtgacttgagcctattgggaggtgaattgagctcctctttgattgctttacatcatctgaggcatctcgatctgagttgcaatttcttcaacggaacgagcatacctgttttcatgggctctttcaagaacttgagatatctcaacctctcctgggcaggtttcggtgggaaaataccttcgcaaattggtaatatttccagcttacaataccttgatgttagctcgaattatttcttccatgaacagaacacgtttttcatgtcttcaactgatctttcttggttgccacgtctcacctttttgaggcatgttgacatgactgacgttgacctcagttccgtgagggattgggttcacatggtgaacatgcttcctgctcttcaagttcttcgtttgtccgagtgtggccttaaccatactgtatctaaactatcccattcaaacctcacaaatcttgaggtccttgatctatcattcaatcaatttagctacacgccactccgacacaactggttttgggatctcactagcctcgaggagctttatctctcagaatatgcatggtttgcacctgcagaacctatccctgatagattgggtaacatgtctgccctacgtgtcttagatctaagttacagttctattgttggtttgtttccgaagaccttagagaatatgtgtaatttgcaagtattgctaatggatggcaacaatattgatgcggacttaagggaattcatggaacggttgccaatgtgctcgttgaattctttggaagagttgaatttagaatacacaaatatgagtggaacattcccaacgttcattcacaaaatgagcaatctcagcgttcttctattgtttggaaacaagttggttggcgagctacctgctggtgtcggagcgctgggtaatttgaaaatattggctcttagcaacaataacttcagaggtctagtgccgcttgaaacagtaagtagtttggatactttgtatcttaacaacaacaagttcaacggttttgtgcctcttgaagttggagcagtaagtaacttgaaaaagttgtttcttgcgtacaatactttcagcggccctgcaccatcatggattggaacactaggtaatttgacaatattggatcttagctacaataacctcagtggtccagtaccgcttgagattggagctgtaaatttgaaaattttgtatcttaacaacaataagttcagcggttttgtgcctcttggaattggagcagtaagtcatttgaaagtgttgtatcttagctacaataatttcagcggccctgcaccatcgtgggttggagcattaggtaatttacaaattttggatctttcccacaatagcttcagtggacctgtaccaccagggattggatcactcagtaatttgacaacattggatcttagctataacaggttccaaggcgtaatctctaaggatcatgttgaacatttatctcgtctgaagtatctggatttgtcagacaacttcttgaaaatagatatacatacaaattcttctccgccattcaaactaagaaacgcagctttccgatcatgtcagctggggccgcgctttccattgtggcttagatggcagactgacattgatgttcttgttcttgaaaatacaaaattggatgatgttattccggattggttctgggtgacattttcccgagcttcattcttgcaagcatcaggaaataagttgcatggctcattaccgccaagtctagaacacatctcagttggtcgcatatatctcggttccaacttgttgacaggtcaagttcctcaactccctataagtatgactcgcttgaatttgtcttcaaactttttgtcagggccattgccatctctcaaagctccactgctggaggagctgttgcttgccaataataatattacaggcagcatcccaccatccatgtgccaattgactggtttgaaacgtttggacctgtcaggaaacaaaataacaggagatcttgaacaaatgcaatgctggaaacagtcagatatgaccaatacaaactctgcagataaatttggttctagtatgctcagtcttgccttgaaccacaatgaactttcaggtatatttcctcaatttcttcaaaatgcctcacaattattgttcctggatctttcacacaacaggttttttggaagtttgccaaagtggttaccagaaagaatgccaaacttgcaaatcttgaggttgcggtcaaatattttccatggccatattcccaagaacattatttaccttggtaaacttcattttctggacatagcacacaacaacatatcaggatccataccagactccttagcaaacttcaaagcaatgactgttatagctcagaatagtgaggactatatttttgaagagagcataccagtaatcacgaaagatcaacagcgtgactacacctttgaaatctacaatcaggtggttaatcttgatttttcatgtaacaagttaacagggcatattccagaagaaatacatttacttattggacttaccaatttaaatttatcaagtaatcagttcagtggaacaatccatgatcaaattggtgatttgaagcagttggaatcccttgacttgtcctacaatgaattatctggtgaaatccccccaagtttgtcagctctaacttctctaagccacttgaacctatcatacaacaatttatcaggcacaataccatcaggatcacagctacaagcactcgatgaccagatttatatatatgttggaaatcctggtctttgtgggcctcctctcttgaagaactgttcaactaatggtacacaacaaagtttctatgaagatagaagccatatgagatctctctacctcgggatgagcataggatttgtgattggtctatggactgtgttttgcaccatgatgatgaagagaacctggatgatggcttactttcggatcattgacaatttatatgataaggcctatgtacaagtggctataagctggagtcgcttgatgcggaaaaaccaagatgcagcgtga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
