Os10g0497000
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0497000 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001071491.1 GI:115482725 GeneID:4349005 |
| Length |
8779 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0497000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:19363724..19372502 |
| Sequence Coding Region |
19364074..19364555,19365881..19365980,19366334..19366667,19366938..19367050,19367619..19367747 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:19363724..19372502 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:19363724..19372502 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatcgtgcgcacctacggccgcagatcccgctccttctccgacgggggaggaggggagcgcggcggcggcggtgggttctcgtcgtcgcaagacgcgttcgaattcgacggggaggaggaggacgacctcgtcctgctggggtcgtcgtcgcagtcgtcgcacccgcccgcgccgtcgcaggagtcgtcgtcgatgtgggacttcgacgaggacccgccgccgccgccccggcggcggcgggggaggggtgggggtggggactacgcggagcccgccacggcggcggcggcggcggcggcggccacctcgctcatggaggcggaggagtacggcgagatgatggagagcgtggacgaggcgaacttcgcgctcgacgggctgcgcgccaccgcgccgaggcgggtgcgccgggccagcttcctcgcgctgctcgggatctgcgcctccgcgccgcgccgccgcgtcctccgggcccagggattggtgcaacaaattattgatgcaattttggttttgaacattgatgatcctccctgcactattggtgcagctgctcttctattcgttttggcaagtgatgttcaagaaaatcatttgttggattcagaatcttgtgtccattttcttcttaaattattaaatcctccagtgaatcttgttgattccaaagcaccatcgataggttccaaacttcttggaatcagtaaagttcaaatgcttaatggatcaaataaggattctgactgcatttcagaggaaatcctttcaaaagttgaagagattctcttaagctgtcaagagatcaagtcgctcgacaaagatgacaagaaaacaacaaggccagaactgtgtccaaagtggcttgctttgttgacaatggaaaaggcatgcttgtctgctgtttcagtggaggagacttctgacactgtgtccagagtcggaggaaattttaaagagacattaagggagttgggcggtcttgatagtatttttgacgttatgatggattgccattcaacattggagaatctcataaaggatacctcaacttcagctttggacctaaatgaaggaacatctttgcaaagtgccgctctcctcttgaaatgtttgaaaatattggaaaatgccacatttctaagcgatgataacaagacccatttgcttaatatgagtagaaaattgtacccgaaacgctcctcgctttcttttgttggtgtcattatcagtattattgagttattatcagctctttcaatactgcagaattcttctgttgtttccagctctacatatccgaaatcgtctaaagtctctcaacagagttgctctgatgtcatggggggaacttcatttaatgatggaaagcgcaagaactcgaagaaaaaaaaccttttgtcgaaccagacacgccatagttgcttatcttcaaaatcagaagtttctcatattactatatcttctggtagtgatgctggtctgtcacagaaggcattcaattgttctccatctatatcaagcaatggggcatcaagtggttcattaggcgagagacatagcaatggtggtgctttgaagttgaatataaaaaaggatcgtggcaatgcaaatccaattagaggctcaagtgggtggatttcaataagagcgcacagttctgatgggaactccagagaaatggcaaaaagacgccgtctatctgaaaatgtaatcaccgacagtggtggcggtgatgacccttttgcttttgatgatgttgatcaggagccttcaaattgggaactgcttggtccaaaaaagaaatcgcctcagaaacatcaagacaaatcaggaaatggagtgctagttgcaagtcatgaaccagaccaacctgaagatcttaatcagtcgggtacaacatctctttttagtgctaaagatgaatccagtcttttggaagactgcctcttggcatcagttaaggttcttatgaacttagcaaatgacaacccatctggttgtgaattgattgcgtcatgtggtggacttaacaccatggcctccttgatcatgaagcatttcccctcattttgttttgtcgtggacaacaactataacacgagagatgtcaatcttgatcatgagttatcatcttctcaaaacagcaaggcacaccaggtcaaaattaagcaattgcgagatcatgaacttgattttctggttgccatattgggcttgcttgttaaccttgtagagaaggatagccttaatagggtacggctttcatctgcccgtgttcctgttgatctatctcagaatccacagagtgaagagacacagagagatgtcatagcactcctctgttctgtattcttagcaagtcaaggtgctagtgaagcttctggaactatatcaccggatgatgaggagtctttgatgcaaggagcacgggaagctgaaatgatgatcgtagaggcctatgcagcccttcttcttgcgtttctttcaactgaaagcatgaaggttcgtggagccatttccagctgccttccaaataacagcttaaaaatccttgtgcctgcgctagagaaatttgtgtcgttccatctgcagctcaatatgatcacagaggaaacgcactcagctgtcacagaagttatcgagaaatgcaaactttcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIVRTYGRRSRSFSDGGGGERGGGGGFSSSQDAFEFDGEEEDDL VLLGSSSQSSHPPAPSQESSSMWDFDEDPPPPPRRRRGRGGGGDYAEPATAAAAAAAA TSLMEAEEYGEMMESVDEANFALDGLRATAPRRVRRASFLALLGICASAPRRRVLRAQ GLVQQIIDAILVLNIDDPPCTIGAAALLFVLASDVQENHLLDSESCVHFLLKLLNPPV NLVDSKAPSIGSKLLGISKVQMLNGSNKDSDCISEEILSKVEEILLSCQEIKSLDKDD KKTTRPELCPKWLALLTMEKACLSAVSVEETSDTVSRVGGNFKETLRELGGLDSIFDV MMDCHSTLENLIKDTSTSALDLNEGTSLQSAALLLKCLKILENATFLSDDNKTHLLNM SRKLYPKRSSLSFVGVIISIIELLSALSILQNSSVVSSSTYPKSSKVSQQSCSDVMGG TSFNDGKRKNSKKKNLLSNQTRHSCLSSKSEVSHITISSGSDAGLSQKAFNCSPSISS NGASSGSLGERHSNGGALKLNIKKDRGNANPIRGSSGWISIRAHSSDGNSREMAKRRR LSENVITDSGGGDDPFAFDDVDQEPSNWELLGPKKKSPQKHQDKSGNGVLVASHEPDQ PEDLNQSGTTSLFSAKDESSLLEDCLLASVKVLMNLANDNPSGCELIASCGGLNTMAS LIMKHFPSFCFVVDNNYNTRDVNLDHELSSSQNSKAHQVKIKQLRDHELDFLVAILGL LVNLVEKDSLNRVRLSSARVPVDLSQNPQSEETQRDVIALLCSVFLASQGASEASGTI SPDDEESLMQGAREAEMMIVEAYAALLLAFLSTESMKVRGAISSCLPNNSLKILVPAL EKFVSFHLQLNMITEETHSAVTEVIEKCKLS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>351..832#2158..2257#2611..2944#3215..3327#3896..4024#4205..4298#4401..4484#4727..5355#6121..6410#6557..6701#7335..7432#7534..7615#8304..8387#gagcacatccggagccaagccgagctcagcgcctcagctccccctcctcctcgtcccattcccggtttcctcctccgatttcccccaaatccgcacgcctctcccctccgcctccatttttcccgattcccaattcccaaatccggatcagccgcagccgcagcagcaaaaaatttcgaaatccaaatccaaacccatcccccccacgacgacgtcacccacatccccacccccgcgagacgagacgagacgactcccaaatctctctctcctctctcctatgcgcgccgccgccgccgccgcagcagcagcagctaggaggcggagcagcagcagcagcagcagctgagatgatcgtgcgcacctacggccgcagatcccgctccttctccgacgggggaggaggggagcgcggcggcggcggtgggttctcgtcgtcgcaagacgcgttcgaattcgacggggaggaggaggacgacctcgtcctgctggggtcgtcgtcgcagtcgtcgcacccgcccgcgccgtcgcaggagtcgtcgtcgatgtgggacttcgacgaggacccgccgccgccgccccggcggcggcgggggaggggtgggggtggggactacgcggagcccgccacggcggcggcggcggcggcggcggccacctcgctcatggaggcggaggagtacggcgagatgatggagagcgtggacgaggcgaacttcgcgctcgacgggctgcgcgccaccgcgccgaggcgggtgcgccgggccagcttcctcgcgctgctcgggatctgcgcctccgcgccgcgccgccgcgtcctccgggcccaggggtcggtacaccaaagaaccctccttttttttttcttacttgtctgcgctgtaagtaaagaataacaattcgcgttcttgctcttgcttcgcgggcaatcttggtgaggaatcttgttagggttatgaaattgggcagccagttcttgtttcttctgcgtaatcttggcggaaacagtgggattttgtacgattatggctccgtaatcggcatttctgtgggaaatgaaccacctttagggcatttgaccttcgaacagcatgcttggtgttgcaatccgtagctattgccttcatcttaggcacaagaacttgttctgaattatgatttaccaacttgtgtttgttttcttgttctgagttttcttgcttggttagggttagggttatcaccgtggtggtgcagaattagatgttcgctacttgtcttaacctctgccttgcccaatttggtaccgagtgttacagctgggtttaggaagtgtgatctttgagcatttctagcatgttggtctctttattttgctaatctcacatggttgtagaggaaggaagcatagtgactgatgatgaatgcctagatactagaaatacatctttattaactgaattaggattgcttgggtatctatgtagatatgactgtagaatgttactgctggaaatgctatccaatatccattgatctctagcctaatatatctctcgaggccaagagatcagtcaattttgaactttcaggagagtttctatttggtacttaatctcttttatttgttacttttggtgcctggctctcttttcatgattgctaagtagacaggtaaagttctacctaaaattattcttaaaagttcaaaatcgctttagattaaggagtgccagccagagccttaggcagagtcttataaaccaaaagcacaatgctacaatgttcacaaaacttttgtggaatttccacttgagctgtataaacatcgcaatctactgtgaataaaagaagcacttgatggaagttcatgttagcaaatgacatgttttctgtgaggaggttgattgcttgaactgttatggactcttgcaactttttattttacttcgtacccatttatgctaatgtgcacaaataaaattgctgagagtaaaaatgtacaacttgttacgcaccagcacacttcctatttgtatccattttcctgttgaatttcaaatgtattcaattgctgaaattgttccattcaacaaacacatattccgttaatgaaattattatacattgcgttttgttttcttactcacaagtgtcctcttttcttatatcctatagattggtgcaacaaattattgatgcaattttggttttgaacattgatgatcctccctgcactattggtgcagctgctcttctattcgttttggcaagtgatgtgagtacctctcaatcccatccttgtgcttctgtgcatgcttcattctattttttacgcatatcgattgttttcttttatataacagcccataaaaataatcacatcatggcaaagttatttatttctccagtacagttatataagtattcaccacttttccatgaatatcttggcatgtgattacaaagaagattatttaagaaagtccatgcttttatttcatcattttgtttgaagttgaactttaatttatggtgtaaatttcagttaatattgctagcagctcgtattctttaatggcataacttcacttgtgcttattctccaatatctcccttcttgttgttcaggttcaagaaaatcatttgttggattcagaatcttgtgtccattttcttcttaaattattaaatcctccagtgaatcttgttgattccaaagcaccatcgataggttccaaacttcttggaatcagtaaagttcaaatgcttaatggatcaaataaggattctgactgcatttcagaggaaatcctttcaaaagttgaagagattctcttaagctgtcaagagatcaagtcgctcgacaaagatgacaagaaaacaacaaggccagaactgtgtccaaagtggcttgctttgttgacaatggaaaaggcatgcttgtctgctgtttcagtggagggtaagttttaatcaaatttcttggtcatgatttccctttatgaccattataattatttttatgagccaaataagcagttgccataagttacatagcacctgtttacaatattcatgggtggtttgcttagccctttgcttcacctgcctttgattgatgacttccatccgtgttgcacaactgaattggagtaattgactgcactagaagcacctatggccattgtcatactaggaaggttttcccttatcaaatatttgattgttacagagacttctgacactgtgtccagagtcggaggaaattttaaagagacattaagggagttgggcggtcttgatagtatttttgacgttatgatggattgccattcaacattggaggtgagatctcgctaacatcgcatattttacacttcctttgttcaactctaaaggatggtgcaagttttgttcctttttgccattttagctttaatgtgcttgaagccacatgaaagcaatgcttgtccagatacatagccaaaggttgttatattttgggacatggaaaatgcttgaggtagtaactattttcatcaggacatggaaaattggctgcatcacaaattatgttgtttcatgttgcaaaatagttttttaatacttttttattctgcatgtggtgttagtgtcttacagtgattcctctgatgattatatcccccacgataataatacttgacatatctacaccaagtggacattattcatttggatgttacttttccagctatacttgctgttcttgcataaactttggagtaaattgcgtatccctttaagagataaactgcttggtgctcctatctgtgtactttttatgcccccaactaataatgcaatcatattacgctgataaactgaataaataaattaacaatatacttctggtggaaaccttgtgtatcagaatctcataaaggatacctcaacttcagctttggacctaaatgaaggaacatctttgcaaagtgccgctctcctcttgaaatgtttgaaaatattggaaaatgccacatttctaagcgatgataacaaggtaatgttccttatatattctgtttcagtttagtacccattttcttcttctgtaccatcttctcccctcatttgttctgtgcaaaatgtgcaaacagtgtgactttgtatttctgcttaacatttttctttttttcctgaaaagcagtataaactcttacactcattttgcttcttgcagacccatttgcttaatatgagtagaaaattgtacccgaaacgctcctcgctttcttttgttggtgtcattatcagtattattgagttattatcaggtatttttcttaataatacaatatgtccgctaacacaataaaatgttttaaacatccagtatgttaaagttgcagtctgacgcctattttgttttgctgcagctctttcaatactgcagaattcttctgttgtttccagctctacatatccgaaatcgtctaaagtctctcaacagagttgctctggtaataacaaacaccaaatttgtttgatcaactcgttggcttttctgtgcactgtttcaatatagtttggtcgccattcaagtctcactacagatgttgaacttgacctgacacggtggcaccaatatttataaaacgctacctgatatttttaatatttcatgtttcctgacccagattatcttgttggttcctcatataagtttaattagtgtcgttcttgaaactttgttatgcagcagatgtcatggggggaacttcatttaatgatggaaagcgcaagaactcgaagaaaaaaaaccttttgtcgaaccagacacgccatagttgcttatcttcaaaatcagaagtttctcatattactatatcttctggtagtgatgctggtctgtcacagaaggcattcaattgttctccatctatatcaagcaatggggcatcaagtggttcattaggcgagagacatagcaatggtggtgctttgaagttgaatataaaaaaggatcgtggcaatgcaaatccaattagaggctcaagtgggtggatttcaataagagcgcacagttctgatgggaactccagagaaatggcaaaaagacgccgtctatctgaaaatgtaatcaccgacagtggtggcggtgatgacccttttgcttttgatgatgttgatcaggagccttcaaattgggaactgcttggtccaaaaaagaaatcgcctcagaaacatcaagacaaatcaggaaatggagtgctagttgcaagtcatgaaccagaccaacctgaagatcttaatcagtcgggtacaacatctctttttagtgctaaagatgaatccagtcttttggaagactgcctcttggcatcagttaaggtaattaaatatgtttccttctgatctttcttgtttcttcttcaagagaatatacattcttgggtcacagtttctcggtttgtctttgtgactttgttgagtgacatattttgaattcacaaaatttccttttcaatatggctcctcaatctatagcatctgtcgtgtatgtattctgtacaaaatagtattgtaacatctcctagaagaaattggcaccatccatatcatacagtagcaatttatgagacgtgatcctgattggaggtttaggacagagcctcgagctaaattgctattgtattgtatctactatcttttagtacatgatatgtgctgggcactctgtgtctgagtgtagtgagtgcttaagtttacatagttcagctaacatgcatatgtaagacagtttatgattaaatttaagtgtagaaagaaggtactttcaaaagatttttaaggacaatataattgtttcaccgggactcatgcttgttctgactgtgagcctaatgttacctttacatgcccttacattgtctattttttatcgttttatgagatcttccaaacaacttgatctgtcttaatgtttttttgctagctcctttcttggatatctggtaaatggttaggccgaagtatgaactttgccttattgtttcaaagaaaatgtaacaactcctggaaaagtctaattttggttgccctttattttgctgaccgtattggcacacatctaattctgctgttcctttctggcaggttcttatgaacttagcaaatgacaacccatctggttgtgaattgattgcgtcatgtggtggacttaacaccatggcctccttgatcatgaagcatttcccctcattttgttttgtcgtggacaacaactataacacgagagatgtcaatcttgatcatgagttatcatcttctcaaaacagcaaggcacaccaggtcaaaattaagcaattgcgagatcatgaacttgattttctggttgccatattgggcttgcttgttaaccttgtagagaaggatagccttaataggtaagtccctcacatgcttccttccatttgctcaattcatatcagtgttactgttctggcagttccttggggtcaggactcagaaacatccaattaatgttcatgttctcttaacgactcagaaatactttataacctctccacagggtacggctttcatctgcccgtgttcctgttgatctatctcagaatccacagagtgaagagacacagagagatgtcatagcactcctctgttctgtattcttagcaagtcaaggtgctagtgaagcttctggaactatatcaccggtaattcaaaattcttcaagttccttttgtatgtagattatatctttgtaaaactcggcatttattacctgctctttgtttcaaaaagcagtattttattttgctccttagcataggtcagcagaacagttgatcttattcagaaaacaatattttgcatgtaacatactgttatctatgagatgaaaattaatgcatgtgtaataatgtcaatgataaatatttgctatctgaatccagtctaccaactctagttagaccgaaattactgaggttctatttcaaagaataatttagtgcaccatttgttcaactactatgaagtaaaatggtattcccttctattgacatcgggttagaagtgaaaggccatcttaatgcaatgttctcaatgccacaaacccacaaatttcattaacacatacagattattattaacatagctataaattggatttccagaagcttgagttgaatttattttgttacaattgaaagcactgggaacattagcatttttttttagttcttggttattgcaatttataatgttatacagaactgtgtacctcacaatgcattcattatgacattctatgaaccatttgattgactgttgcttgtaaacaacaggatgatgaggagtctttgatgcaaggagcacgggaagctgaaatgatgatcgtagaggcctatgcagcccttcttcttgcgtttctttcaactgaaaggtttgcaatctgtagttgatggattgttttattaatgtctaactacttgcataatgtcagcactatggcatttaacttatactgtctgttaactgcaacagcatgaaggttcgtggagccatttccagctgccttccaaataacagcttaaaaatccttgtgcctgcgctagagaaatttgtggtatgtctccataattcttgaactactgtttgtataaaaaagtatggatgatctttgaatttactccattttggaaatcattaatttttcatgtctgaggtgtgaggtgtcaccataattgtacttcccatccaggaagcctgtttgcaaaatttcacataaataaggaaaatttgaacttgtttcaagtttgaatagtaacaggatgttttatttctcaactggagaaaacattccggctgggacttttaacccttaaaatgctagtgtgctcccactgtaagattgtctgctgtcacatttgaaactttgtgtaatacctttatcactacccttgagatgagagacacaatctggtaccgagttaagttattgataactcccagttgaagtacagcaccaaatcaagccaacatgttggctacgtaattaaatgttctcttacaacagatagaggtaaaaagggagtttctaagtatctaacctcttaccctcttggcttagcactccaggcacaactctttcttaacttgcgatttaggacttgactctgagaatattgtgtgcccacactggttgagtgcatgcctatctaagctgctagtttttgttcattttgattaactctgaagctgcctgagcttattctgcttccatcatttattaatccatcatgtttctctttcagtcgttccatctgcagctcaatatgatcacagaggaaacgcactcagctgtcacagaagttatcgagaaatgcaaactttcatagaaagagtgaagaggggcctgtacagatcaactaacaacctctttgcagcaaaaaagcatacacacaagtgtttgtcttggcctggggctctgcagatggactgatactctgacctgcagtgggcttgggagctaacaatggtttcattctttttttttttatgttttcccctgttgtttttgctcatgttttgtgtaattttttcttctcatctagcgatgttatttttcttagcatgatgggagtagccctccttttttttttctctaattaagtgtaaagtagcaacagcatagggatgaatgttcagtgtagtgtgtggtgtttcagttattcagagacgtccatacagtttgtaccttgtgaccacacgtcttaatctgatgaagctt</dnaseqindica> |
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