Os01g0654200
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0654200 |
|---|---|
| Description |
Peptidase M50 family protein |
| Version |
NM_001050281.1 GI:115438932 GeneID:4324173 |
| Length |
4518 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0654200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:28278630..28283147 |
| Sequence Coding Region |
28278974..28279150,28279608..28279937,28280062..28280493,28280569..28280625 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:28278630..28283147 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcattattactacctgtggtgctgtatcctctctttgtgactggtggtcttatgattacaggagtcccagaagcatctcctctgtcaggatacttgtctgctcacaattttatcctttctgtggatggattgaacataacaagagctgatgaatggatgaaaatgcttactcaggacaatgtagtacaaataagcagccgtgatctccttgaaggctctgaaggctatcgtgccactggttctagaaagggttactgtgttcccaactcatggatggatgcaagcaagaatctttggcagataaatgacaagctatcttgcccagatgatctggtagcctttcaaagaatgagtgagaaaggtattggcaagaaggaagttgaagacaaatattgtttgattgcaaaagatgttgtcaagcttaaaaaatgtggaaatggatggcggggggccgaagatggcagaagcaactttgcatgtttggaggatgagtactgtttggtgcctgttctaggccctgggatttcatggatagagatctcttatgccagaccttattctttggagtgcttacagaaagaaaggaactcatcattgctgcatgatggaaataataaccctggattgggtccttgccagggaacttttgtttatgcgggtgatctgttatcagcagcacattctattaagttatcctcttaccgacctcgatggcctctcttgcttttcattgcagatgttcctcgtatcttgcaagatggtttaagttgtttatttcgtgtgtctgcagcattggctgtagtcaattgcttaccagtgtactttcttgacggggaagcgattttggagactatgttaagctacttttcttggtttactcggagacagcagcgcaatattcttaaggtttgccgctttttgtggacgatcttgtccattgttttgttctcaagaaccctgtattccatgacactatattatggctttgtataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALLLPVVLYPLFVTGGLMITGVPEASPLSGYLSAHNFILSVDG LNITRADEWMKMLTQDNVVQISSRDLLEGSEGYRATGSRKGYCVPNSWMDASKNLWQI NDKLSCPDDLVAFQRMSEKGIGKKEVEDKYCLIAKDVVKLKKCGNGWRGAEDGRSNFA CLEDEYCLVPVLGPGISWIEISYARPYSLECLQKERNSSLLHDGNNNPGLGPCQGTFV YAGDLLSAAHSIKLSSYRPRWPLLLFIADVPRILQDGLSCLFRVSAALAVVNCLPVYF LDGEAILETMLSYFSWFTRRQQRNILKVCRFLWTILSIVLFSRTLYSMTLYYGFV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3998..4174#3211..3540#2655..3086#2523..2579#tgtccaagccgtcgccgtcgccgctggaatgatcggcggcgtcggccgcagcaggcggcgtggccgtgcgccgccagttctgccctcgagcgccgccgcccgccgcgccgagcactccgtctcttgctggtcagtgaagtagagagattctgactcaaaaccgctcgatctagtcagattttagtagtactagttagcttcttaccctcaccaaaccctaagtcgcggctaaatcgagcctatgcttgcgttcttcgtaattattttcccagtacttttacattggtttcttgtagagcagagcttgatttagagcttgtaggatgcgggcaaccgttaggcgaaattataaagcttgatttggaaatttaacatgggttggcaatgttgtagtttccattcttctagtagtacactttcaacagttggtgaaaattcgatttgtgtgttgtatcgatttaccaaatttcagtgatgtatcctgttgggttcactggttcagacctgctgttgggatacaccattcatcctcagccctaatcctgataaattgaattgtctcccctgcatctagccatccgcagaatggttttaattttcaggacaacaagtttctctgttccttttaaatctgcttatcagcttatcatggaaaaattgcattcgactctatatagtactgcatgagatgttggacacgtattttatctttcatttattcttcaatttcttgtatatttcaatgcagtttactcctgtcattttgtattagtggaggcaatgattattatattcacttactgtgcttatacaaaatttaggtactgtgactgcaaaatatattccttcaatgacatcatatttaatttgggatggagatatgctaggtatgctttatcttaacttttgaccttttatcttctttaattactcagtgtttctttgatgtgcatattgtaccctttttccccgcgaaaagaggaatatatttatataattacccatggacttttacatactataaacaagaatatagccaagttagcaccttatttcatttttgtacataagatgcaaaggtttcttttctttaaaaagaatgagaaaaaatgcactctaggagccatctgtaccatttggagttaaatttcttcgctgttgctgaaagttttagctcatgcccctttggggaggtgtaatctgatggggtaaccatattgatagtttccttgctgctcactatgctgatgccaagatatttgaagttatggtaaattagttaactttctttttggcagatacatgagagcatggttttctgcaggggtttatttctctgttgttgctttagttggaatatcagtggtaagttcagtgtcgaataattaccaatactctgaaatacgtatgccaactaaaaaatgttcattaccttacctatatcatgaatctgttgacattgttgcttaaatcgttagaacagccagcacaccctatcaatctcgacatttgtttttatgaactgtgtaggatatcactgggatagtagtggtcttcatcctttctttaaaattttggaaagtttcatatgttgtacttgccttgaaatgtgcacgtttatgtactgtggtctgttgcatgtttcagatgctattgtgggactcaattggtgcagtttatttcagtggtcggtcatttagtacctggctacaaaatctactggtgactacaatttgtcccttcatttttcaacttctaacatcaaccattcagcatgcccttaatctattgcaggcttccagctttggcatatcaataatggacatcgcagcaatcatagcatcaacagttttttctattgcttttcacgaatttggacatgctgttgcagctgcaaggtccttatttgctgacctacattttctacgagatgttctgcatgtgtttgcattcatttgcagaaggcatactttatatgttgacttacaatattaactttcacccgcttacagtattcctttcgcacattgctgacacattcattgctaaatatgcaacagcgagggcatacagattgagtatgttgcggtattcgtagctgcactttttcctggggcattaattgctctgaactgtgaccagctgcaaaatttacctcttttttctatgcttcggatttattgtgcagggatttggcataatgttatggtaagtaacgctggcgtgcatggattatttttttttaaaaaagaagtaaaatatcttgattttatttgaccatatatttctattccttttaattttaaagcgcatttccatctattttcagtatttgtggcatgcatgctaacctatagagaccagaagttgtgaattaaaaaaaggagcacatttgagaaatgccagttcggcagttctgcattactgctgcagcttcttatcatatttttgtaagcacgttcattcataatgatgtttatttatgatttcatgtctaatagttatgtggagtatgtgtcatcatggcattattactacctgtggtgctgtatcctctctttgtgactggtggtcttatggtaagtctgtttctttgaacttgtccttatttagatctccatgatccttcatgttctaaaaggctgtcagaacagattacaggagtcccagaagcatctcctctgtcaggatacttgtctgctcacaattttatcctttctgtggatggattgaacataacaagagctgatgaatggatgaaaatgcttactcaggacaatgtagtacaaataagcagccgtgatctccttgaaggctctgaaggctatcgtgccactggttctagaaagggttactgtgttcccaactcatggatggatgcaagcaagaatctttggcagataaatgacaagctatcttgcccagatgatctggtagcctttcaaagaatgagtgagaaaggtattggcaagaaggaagttgaagacaaatattgtttgattgcaaaagatgttgtcaagcttaaaaaatgtggaaatggatggcggggggccgaagatggcagaagcaactttgcatgtttggaggtaaaataacactgaattagagcccttaggaataatcctggaggattggttccttattatagtatcgcttatccttttgcattacctttctcttatttatacattttttgatcgattctgacaggatgagtactgtttggtgcctgttctaggccctgggatttcatggatagagatctcttatgccagaccttattctttggagtgcttacagaaagaaaggaactcatcattgctgcatgatggaaataataaccctggattgggtccttgccagggaacttttgtttatgcgggtgatctgttatcagcagcacattctattaagttatcctcttaccgacctcgatggcctctcttgcttttcattgcagatgttcctcgtatcttgcaagatggtttaagttgtttatttcgtgtgtctgcagcattggctgtagtcaattgcttaccagtatgttctctattgaagtttcattctttattgttcatcttacattctcacatcatgcctcagtgcctcatgacattgccctacatgtaggatttccttctttttttatcttattctttgcagcaaaggaatttggcaaataatttgagaaaagtaaaaacatgcatgatatgatagttgaaagttgaaagctgaaacccttgaagtactgatatttgctagaaacctgccgtttggcctattgttgttgctatttgcttaagctcctccttgtattcttctgaaaccccaacatatacaaatcaattggttacagaatgctttagctttctatgctcttcttttctgaagtcacttcgattttgtagcacctggcttaaatttacactgcattaaagtaacatactgcgtgcacagtatagtactttttttagcacctaaccatgaaacgctgcaggtgtactttcttgacggggaagcgattttggagactatgttaagctacttttcttggtttactcggagacagcagcgcaatattcttaaggtttgccgctttttgtggacgatcttgtccattgttttgttctcaagaaccctgtattccatgacactatattatggctttgtataactcctttatatggaaatgtctcttttttttttttgagtttatcttatcataataccatagatctgatcaactgtatgagatcatacacaatactggtaatatgtaagacggatgctctcctggtctcctgacaaaattgcaggccagcattgttacagaacaaagtggccttaactttagtgagtttatgattaaaatttagacaattcccgagccctcatgcttgtagaatattttgacccaagatatgagtgggtttgtgggtatgcacctcactgttgtaagttaaaacgggaatatcaaatttcaattgatctcaacatgtttcggtggagatctgtttg</dnaseqindica> |
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