Os01g0779100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0779100

Description

Peptidase M16, C-terminal domain containing protein

Version

NM_001050966.2 GI:297597730 GeneID:4326434

Length

9324 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0779100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:34740894..34750217

Sequence Coding Region

34740894..34741022,34741158..34741233,34741912..34741979,34742456..34742547,34742709..34742782
,34742960..34743003,34743340..34743391,34743788..34743907,34743979..34744091
,34744262..34744349,34744732..34744817,34745420..34745506,34745737..34745840
,34746195..34746297,34746449..34746544,34746655..34746844,34746940..34747001
,34747148..34747252,34747751..34747952,34748061..34748269,34749001..34749125
,34749232..34749283,34749360..34749446,34749713..34749835,34749963..34750217

Expression

GEO Profiles:Os01g0779100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:34740894..34750217 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgtcggcggcggcggcggcgagcaatgtggagttcatccgctcgcgcagcgacaagcgggagtaccgccgggtggtgctccccaatgcgctcgagtgcctcctcatcagcgactccgacaccgacaaggcggcggcgtgtatggaggtcggcgtgggctcgttcagcgacccggaggggctcgagggcctcgcccactttctcgaacacatgctattttatgccagtgagaaataccctggggaaaatgattactcgaagtatatgatagagcacggtggctattgcgatgcctatacatattcagagacaacaactttctttttttatgtcaatgcggccaattttgaagaagcattagacagatttgcacagttttttattaagccattgatgtcgcaagatgctgttcttagagagattaaggctgttgattctgaacacaagaaaaacttgttgtctgatagctggagaatgtatcagctccaaaaacatctggcttcaaaggatcacccttatcataaattcaatattgggagctgtgaaacgctagaaacaaaaccaaaagagaggggattggacattagacaggagcttctgaagttctatgagaattattcagcaaaccttatgcaccttgttgtttatggaaaggagagcctggattgcatccaaagctttgttgagcacatgtttagtgacatcaaaaacactgatcagagaagcttcaaatgcccaagtcaacctctttcagaagagcatatgcagcttgttatcaaagctatcccgatatctgaaggcgattacctaaacatatcatggcctgttacacctaacatccacttttacaaagaagaacacatggaagacatcattggcttggtcttcaaatatattcttctactaaaagaaaatgggatccatgagtggatctatgatgagcttgtggcgataaatgaaacggaattccattatcaggacaaagttcatccaatcagctatgtgacagatattgtaacaaccatgcggtcattcccaccagaagaatggctggttggagcatcattgccgtccaagtatgctccaaatagaataaatatgatacttgatgagttgtcagctgaaagagtaaggatactctgggaatctaaaaagtttgaaggaacaactgattctgttgagccatggtattgtacagcttattctgttgaaaatgtcactccttccatgatacagcaatggattcaaaaagctcctactgagaagctctgtatcccaaagcctaacattttcattccaaaagatttttcactcaaagaagcgcatgaaaaggttaaatttccagcaatattgagaaagacaccgctttcacggttgtggtatatgcccgacatgctgttctccactccaaaggttcacattgtaattgatttccactgtccgttaacaagccattcccccgaagcagtcatttctacgagtctctttgttgatttgttggcagattacttgaatgcatatgcgtatgatgctcaaattgctggtttattctattcaatatatcgcacttctgctggattccaggtctcagtaggtggttacaatgacaaaatgcggattctgctagatgccattatgaagcatatatctaactttgaagttaaaccgaacagattttgtgccttgaaggaaactgctgtcaaggactaccaaaatttcaagttcagccaaccgtactatcaagcttcaaactatctctccttgatattggaggatcaaaattggccttgggttgagaaacttgaagctctttctaagcttgaaccagattctcttgcaaagttcataccacatttgctatcgaagacatttttggaatgctatattcaagggaacattgaaccaaatgatgctacatctattgtccaggagattgaagatactatattcaatacccctaagtctgtgttcaaatcaatgtctccatcacaatatctgattagaagggttatcacccttgaaaatgagttaaagtgctaccaccaaattgagggcttaaatcagaagaatgagaattcatcagtagtccaacatattcaggttcatctggatgatgctctttcaaatatcaaacttcaactgttcgctttaattgcgaggcagcctgccgccaaccagctacgaactattgagcagcttggctatatagcagatctttatgtaagatctgataggggagtcagggcactcgagattgttattcagtccacagtaaaggatccttcatatcttgatgctagagttgatgaattcttcaagatgtttgaaaacaaaatccatgaattgtcagacaaggattttaagaggtatgtaaaatcacttattgattcgaaactggagaagtccaaaaatttgtgggaggaatccgacttctattgggcagagattgaggcaggaactctccagtttgatagaggaaggtctgaggtatctctcctaagagagctcaagaaagaagaattcatcgaattttttgatcagtacataagaattggtgcacctcaacggaagacattaagcgtacaagtcttcggcggcaaacatttggcagaattcaagaaggctattgccgaagctgatgcacccaaaacttaccgaatcactgacatattcggcttcaagcgatccaggcctctgtaccgctcactgaagggagggccaggccggatcacaatggactga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSAAAAASNVEFIRSRSDKREYRRVVLPNALECLLISDSDTDKA AACMEVGVGSFSDPEGLEGLAHFLEHMLFYASEKYPGENDYSKYMIEHGGYCDAYTYS ETTTFFFYVNAANFEEALDRFAQFFIKPLMSQDAVLREIKAVDSEHKKNLLSDSWRMY QLQKHLASKDHPYHKFNIGSCETLETKPKERGLDIRQELLKFYENYSANLMHLVVYGK ESLDCIQSFVEHMFSDIKNTDQRSFKCPSQPLSEEHMQLVIKAIPISEGDYLNISWPV TPNIHFYKEEHMEDIIGLVFKYILLLKENGIHEWIYDELVAINETEFHYQDKVHPISY VTDIVTTMRSFPPEEWLVGASLPSKYAPNRINMILDELSAERVRILWESKKFEGTTDS VEPWYCTAYSVENVTPSMIQQWIQKAPTEKLCIPKPNIFIPKDFSLKEAHEKVKFPAI LRKTPLSRLWYMPDMLFSTPKVHIVIDFHCPLTSHSPEAVISTSLFVDLLADYLNAYA YDAQIAGLFYSIYRTSAGFQVSVGGYNDKMRILLDAIMKHISNFEVKPNRFCALKETA VKDYQNFKFSQPYYQASNYLSLILEDQNWPWVEKLEALSKLEPDSLAKFIPHLLSKTF LECYIQGNIEPNDATSIVQEIEDTIFNTPKSVFKSMSPSQYLIRRVITLENELKCYHQ IEGLNQKNENSSVVQHIQVHLDDALSNIKLQLFALIARQPAANQLRTIEQLGYIADLY VRSDRGVRALEIVIQSTVKDPSYLDARVDEFFKMFENKIHELSDKDFKRYVKSLIDSK LEKSKNLWEESDFYWAEIEAGTLQFDRGRSEVSLLRELKKEEFIEFFDQYIRIGAPQR KTLSVQVFGGKHLAEFKKAIAEADAPKTYRITDIFGFKRSRPLYRSLKGGPGRITMD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..129#265..340#1019..1086#1563..1654#1816..1889#2067..2110#2447..2498#2895..3014#3086..3198#3369..3456#3839..3924#4527..4613#4844..4947#5302..5404#5556..5651#5762..5951#6047..6108#6255..6359#6858..7059#7168..7376#8108..8232#8339..8390#8467..8553#8820..8942#9070..9324#atgtcggcggcggcggcggcgagcaatgtggagttcatccgctcgcgcagcgacaagcgggagtaccgccgggtggtgctccccaatgcgctcgagtgcctcctcatcagcgactccgacaccgacaaggtctcgatctccctccccgatcgctctcgcctgcagaatgctcgtcggttcatcggcgactctcgcgtgatttggtggtgtggtgcgtatgcgtgcgtgtgtgtttaactaacccctaattcctcggcgttgcaggcggcggcgtgtatggaggtcggcgtgggctcgttcagcgacccggaggggctcgagggcctcgcccactttctcggtcagtccaccgttcgcttcctctctcccgacctcgtccccttcatctccgcggggaagtctagttcgcgaacttagcgagaaaatctcgggaaaagttccgagttccgactgctgtcgtcctttcttagtttctaaatgaaaaaggctatgtctaatgacgctagaaaaaaaatcccctaatgatttccacctattaccgacagttataaccagcccggtgcaagcttttattttatttttctggtttcaagtctgtttggattggactctactttttttttttaaaaaaaggcaaagaatatccacttagctttctaaattgtaaatataatttctaaataatgtatatagagagagagagattaaatacataaagtctatactagctaatacatatatatagaaagagagattaaatcaaatttgactgtaatcaaagcaaaaatgtcgccataattatagcaaaaccacttatttttgtgaagaaaatgctgacttgttcaaaattcagtaaccgtttaggcctcttttggaacacatagatttcacagaaattatatagtatttcacacaatttaagtttaattcctgcaggaattaagaaaaaaatcctgcattgaccatagttttttatctgttctcttgtcttgatttattgtcatggtcttgtttgcagaacacatgctattttatgccagtgagaaataccctggggaaaatgattactcgaagtatatgatagaggtacttgttttatttaatccaccattgaatatttttatagtatatttgttttgtgttgaaaatattggtacatttatttttctatgaacttagtcaagtttgaagaagtttgacctagaacaaatccaaaacgacttctaatatggaatactgtgagtaatctatgctatgactggtttgcatgtgtgcacactggcaaactgcagaccaaatgctatttatccgtggtcgtgaccctaaagtcatgttatatcccattgtgttcccctgaagctaatgtccatgcttgccagcatggcattatgtgcggtgctgtttaagcggaaggacaatgtcctgatgagcaatagcattgtaatcctcatcctatcatatgccacaagttgttaaagagctacacacataacaaaaatattataatgcttggaaatacctaggctatgtttttgacaatgggttgatgtaaaaaatatcagcacggtggctattgcgatgcctatacatattcagagacaacaactttctttttttatgtcaatgcggccaattttgaagaagcattagacaggtaagaccttttttttaatacttttagttcatttaatgtatgtatgtgtgcacacgtgtatttatcgtgtgagttgaatatggtggtggtttttgttctgaagatttttcatgctttttgttagaaaataacaatttgcattggtggtttcggttgtgcagatttgcacagttttttattaagccattgatgtcgcaagatgctgttcttagagagattaaggctgttgattctggtaagttctgattattcactttacacatggtgattttttatgctatttgtatctaacatcgtgttatgcttttttggtgtgggtggttaacattacattacacttcaaaactcacagtttgatttggagagtagtaaaaagcatattttggctaactttgcttttttttcgtcctagaacacaagaaaaacttgttgtctgatagctggagaatgtatcaggtactgcaacattccaaatttggtagttgatatgttatgtattcttccatgcgcgctgccaaatatgtatgactgtattagaagctgcaacattaaagcataggatcatgcatccttttcactcacagatcaatatgtgtttattctttatttacaaggcgtgtttccttatataaatatatctataaacaattggtgagactataggcacgtaaatggtcctccaataaaaaagaaagtaaaaaatagcatgcacagtactttccattcctttgctatgaatctcatagcacatgcttcactgttacctaattttccactttttcccccatccagctccaaaaacatctggcttcaaaggatcacccttatcataaattcaatattggtaagcaaatagttatgttcagaaattgtggatatcttaccagtcatcttgctagctgttaagattactgggttgcatttcttgtgagaaaacaaagtgaagatccaaacaggctaaaatctagctgttatattggttttgcagaccacaattttcttcaggtcacattgaaatatgaacaaactttcatgaaaattgacatgtcaattctgaaatctaaattcatatcatacaatggttcagttctcccaacagttgtgctttgtaattagctacttttctgcagtgattgtatatcccgtttgcatgaaatactattccaattttttttaaaaaaaacaagttaaaatgttttatatttttattattatgctaatttgtcatttaatgcatcagggagctgtgaaacgctagaaacaaaaccaaaagagaggggattggacattagacaggagcttctgaagttctatgagaattattcagcaaaccttatgcaccttgttgtttatggaaagggtaaatattactggttagtccattctcatacaaacttatctgttactgagattatttatttattttggtagagagcctggattgcatccaaagctttgttgagcacatgtttagtgacatcaaaaacactgatcagagaagcttcaaatgcccaagtcaacctctttcagaagagcatatgcaggtagaaacttgaagcaacaccaattgtggaaaatggagaagatggaatacttgcaacaatcactaaaaataaaatatatgtgatggttcggtcaaatatatatatatatatatatatatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgatggtagatgacatgaaatttgctgtgcagcttgttatcaaagctatcccgatatctgaaggcgattacctaaacatatcatggcctgttacacctaacatccacttttacaaagaaggtccttcccattatttgagtcacttaattgagcatgaaggcgagggatccatcttccatatcataaaggaactaggcaagtacattcaccagttgattgctgtacaactcttttgcctcccttatctactcatagtcactctagtttattctttctacatgtgaaatatgctcaattttgactactttaggatgggctatgaatttgtcggccggggagggcagtgacagtgcccaatactccttttttttcaattagcatgaggctcactgatgctggtcatggtcagcttctatctttaattataactaacatggctattttgttttaagcacattttgttattatttaagcctcttgcgtgcacatgcaatgatttcagaacacatggaagacatcattggcttggtcttcaaatatattcttctactaaaagaaaatgggatccatgagtggatctatgatgaggtaattgcaaagaacatggcttacgcagtgtgtaaatccatgttttatggttagaagttctgatacttctacgacttctgatcttttcctctagagttcccaaactacccaaacaagagttattccacataattgagtttctgatcttttcatatcttgattggaaaagttttctttaggaacgtcagttgacctttgttgggaatattttacaggttttaatcattcagtgaattctataaggaatataaattttggttaacaaatgggatatttaccgaataggagtataggacctgttagttttgagaacttatgagggttcaggacagatgtgcttctaattctggacaatagactctatcaactacactacaaccatttgcatacaagtcacgttccaaaaaaaaagaaacatttgcatatgagtcgtactttcttttagcaagatctcattatgtttcaagttatcatctcatcatcaacaaattcaaacatcacttatttatagtatcaagctttttctacatgtcttgagcatattgggattgatttaaatagataaacttaatgtgatggtaacatgtttttgaatgtgttagcttgtggcgataaatgaaacggaattccattatcaggacaaagttcatccaatcagctatgtgacagatattgtaacaaccatgcgggtatacttctcaatacctcattaagtacataatgtatggtttgcaattccatatgatcaattctattcattgctgatacacctcccgcaaagcattatgtgata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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0779100, RefSeq:Os01g0779100