Os01g0856600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0856600

Description

Nsp1-like, C-terminal family protein

Version

NM_001051382.1 GI:115441134 GeneID:4324750

Length

7770 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0856600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:38761595..38769364

Sequence Coding Region

38762219..38762311,38762832..38762930,38763001..38763088,38763950..38764009,38768534..38768682
,38769118..38769363

Expression

GEO Profiles:Os01g0856600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:38761595..38769364 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>agccccaaacccctccttccccttcctctcaagccggcgcggccgacgagcccgcggcaaaaccacgcaaaaaatctgccaaaagaagatcccccaaatccgccaccgcgctcacgccggcgcagccatggcgacctccttctctttcggctcttccgccgcgtcgggatccaccggctcctccccattctccttctccaccggcaccgccccatcagccttctccttctctcagcccgccgccgcacccggtctgttcggggccgccgcgtccgctgcttccgcgccaagccttttctctggcgccgccacgggctttggctttggctcagctgcgtcgggcaccaccactgccgcgaccgctgctgcctcgacaccgtctttcggcttcgggtattccaggatgaacggctgttgcttcgtgaagatgaggctgcttctgcaagagatacaatgtttgagcaatctgaaactgtggagaatgaattgcaacatatgacagaacaagtgaagtccatcattcagacattgaatgctactcagggtgctgagtttgagactgctgatagtatgacaccatttgatgttgctgtccggatactggataatcaactgcgttctttaatgtggatcgatgagaaggctaatgagttctcaagtagaatacagaggctacctaacaacagtgctgcagctgaacgtgactctggaatgccaaggttttggttaagctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SPKPLLPLPLKPARPTSPRQNHAKNLPKEDPPNPPPRSRRRSHG DLLLFRLFRRVGIHRLLPILLLHRHRPISLLLLSARRRTRSVRGRRVRCFRAKPFLWR RHGLWLWLSCVGHHHCRDRCCLDTVFRLRVFQDERLLLREDEAASARDTMFEQSETVE NELQHMTEQVKSIIQTLNATQGAEFETADSMTPFDVAVRILDNQLRSLMWIDEKANEF SSRIQRLPNNSAAAERDSGMPRFWLS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7054..7146#6435..6533#6277..6364#5356..5415#683..831#2..247#aagccccaaacccctccttccccttcctctcaagccggcgcggccgacgagcccgcggcaaaaccacgcaaaaaatctgccaaaagaagatcccccaaatccgccaccgcgctcacgccggcgcagccatggcgacctccttctctttcggctcttccgccgcgtcgggatccaccggctcctccccattctccttctccaccggcaccgccccatcagccttctccttctctcagcccgccgccgccgccgccgccgccgccgcctcctcccctgcccccgcctccgccccagccttcggctcctccctcttctcctcctcctcctccgccgccgctcccacttttggctcctccctattcgggtccgcccccgccgcctccgccgccgcccctgccacctcctcatccccatctccgtttggcttcggatccaccggcttctcgttcggccaatccaccgccgccgccgcgtccgccccatccatcttcggcgcgtcctccacccccgccaccgcgaccacccctagcgtattcggcgccgcatcatccgcggcatccacccccaacatcttcggcggcgccacctcctccccggcgaccaccccgagcttattcggcggtgcttcctccgcggctaccgcacccagtcctttcggcgccacctccgccgccgccgccgcacccggtctgttcggggccgccgcgtccgctgcttccgcgccaagccttttctctggcgccgccacgggctttggctttggctcagctgcgtcgggcaccaccactgccgcgaccgctgctgcctcgacaccgtctttcggcttcgggttgaacaccggggccgctgcatcgagtaccaccactacttcggcttcctctccggctctagggtttggagcaggcaccggctcggcgctgtttggatccactacctctgcaccactcttcagcaccaccaccgcctcgtccccagcgaccacggccacgaccacggcgtcctttggcttctcatcgtcgccagcgaccgccgcctctgctccgtcgttcggcttcacaccgtcatcggcaaccaccacgaccgcgagcaccgcccctgccttgttctcttctgcatcttccgctcccgccttctccttcacgaagagtagctctgctgctcccaccacgccagcgtctgctccatctactggcttctccttggccacttcgccggcagcacctgctccctcattgttctctaacaccagtgcagcagcaagctcgtctgccacttctctcagctttccgtttggctcatcttctgcttctgcaccggcatttgcttctgcttctgcaacgagcgcatccacaccgtcagcagctactgcttcccccgcgacatcagggtcattgttctcagtgccagcacctgcttcttctgctggtggtttcagtttcacagtagtaccatcgtcatcatcagctgcggctactacagctactaccacaacagtcacaagtgcatcgacatctgcagccatgacaacgccggctccttcagcaacaacaactgctacactatttagccagcagagaactacaccagcttctgcctcagctccatcaacacagacacagtcaatattgtcattcggtgagtgctcatgttcttgttaaaactattgttttattttcagtctaatttgaccataccatttacataccttgatttaccggcagtgaacaattaaatgtcaccctcatgcaagtaaccatttagctcataacatcgcaaataacttatttgtatcatcatttgaggacccgatcattgtgcatttgcctttcctatgcaatacaggaaattgttgttgtaacgcactgttttgactataatcattaccttgcaatctgtttcctaaatcttgaggtgatcacttttcagtctattttgattatcacttttcagtctattttgatgatgtccagatttatgttaagcgggtattttcaacaggtgtttctactgtagctgcaagtacttcaaccaccatcacaagcactagtcaggcaacttcctcagctgttcaagctagcagcactgggtttgtacaaatcccgtcgatttatctctagcatacttattaaagggtctgggctacaagatattgaccttgttcatggcctccctgttcttttggtgcagtcctacaactactgctatcactccagtagcatcacaggcacctaagctaccatcagaaattgttgggaaaaatgttgagcaggtactgcacctattctttgcggttataaggtgttgttttctactgcaacacttactttctagtttgactttgcattgtcttgttaattaccttgagcaacacagtaatattttaccgacgaacttatctatattgtagattattagggactggaataatgaacttcaagatcgcactgcgaagttccggaagcatgccactgcaatatctgaatgggacaggagaattctgcagaacaggactgttcttataaggcttgaggtatgttcttatttttacattttacagctcttcttttctagttctgttcatatgaacttttgcagctagatcaatatcagaagatttgatggttatatatttacttctttattgctgatttggttttgcaaagtcatttgcataaagacaatatttatgaaaaatgattacaattagttgaaagcagggtagaaggaagcctggttggatttgaatagccatgcttaccctatggactctagaatttatcactggtaatgcaaacttacaaagacttggaggtttcattcttagcagtagttttaaattgaacatgaaacatgaataattatttgattatctagtagatgattgtcttgcgcaatgcatgttgatttgacttattcatgtaaagccgatgtattgttgcttttaaaagtgtacatgattttttttatttatcctcacccttttgcatatattttatgtaatttagttttgattattgatggaatgagaaattaggaaaatgaaaaactaggaagtctgaaagtgaacgaactgctttttccttgctgttcactggtgagctttatcagtcgaatgtaaagcagggaaatgtgtatatcaatgccctatcactagtcagactgtgattgaagatgtaaaaactatgccaatattctgcctttgcgaaatacatgtgcaatgctacctctgatccaaataacttgtttcagctcccctaacttgattcaaatacttcacatgtgatatctcctatagttttttctaggatgctcttggtaaatattgatagctatgatgatctccctctcagctgcctatcgttcacattagattaatgcgagaagatatgttcatttcatgaatttcttcgtttagtactaattaagttagtgctgatgttgtcttcccaccattatcacctcttgagctggtgcttttctggatagatgtgtgttagcatgcatacatgtttatattactcaaaagaactttatataattagatcatttgctgtgatttaaaataaattttatgtcccttgcaggctgaggtggctaaagttgttgaaacacaaacaagcttggagaggcaacttgagttaatagaaactcaccagaaagaggtgggtatggatgcatatatttcatgtcttctgcatactctagttatgacttttgtttttgttgcatgcttgtttgctctttcatttgctgatccccatggatgacatcataatattgactagtgaattgctttcctgtaagctcattatttatatgctatgctgccagggatgcatcatatttcggctgtcatctccttttttacacaattgcgcacaatatggttaatgaagataggttgactgattttttttttaaggatgacaagctttcaactgccaagctgcattttagaatgcattaatatggaatgccttttctaagttttatgtcatctagaatacattacaattcttatattttataatcgtctctcataagctgggttattggtatggaggaattttttttccatggcatcgtgattatcctccctctggatggtaagatgatcttaagggggctactaaagtggcaagatgtgcagaggtgttgtcgctctgccttgcctcgcaggagaaagaaagggtgaaatggtaagatgttcaaggacagttgagtgttgatagttcaggtccatctcttccttgctccctccagcttagtgtcgcagaacttgcaccagtgccatcagactagctctagatcgctgccactgtatcatttctggcagtggcagtggtggacagctagacaagcggatgcattgaagctccacgaccggtaggcaaagatgtcaggctcccttgccaaggtggccagcagaagagtgcatattgatcttgtcagtggcctagtgctcttctcatagctgggagcgcacatgtctcaatgccgtcttttggtccaatggtttttttttccttttattttctctttcgcttgttaatttctttcccattttctcccataaccaggctgtgcagccactttatgtgtcatcgctttgccttatgcctcgcataatttggtgttgaggcagtgatatgttacctcatctagctttaacaccttaacaatcaggattgttccctatggttcaatgttcacggtttcatagatttgatgtgaccatcacatgctaaattcatcaaaactcttatttgaaattctggtagtatgggaaatccacgaattgaggtttcttcttaatgaaaagctgtggcccatgggggcagtcattcccccactggttgagtttttttaaatttctgtccgtatggccttttgggggcaatgtaaaccttgtacatgacatgtgatgcttttttgtttttgcttaagactaaattctgactatggtttaatgtgcaaagaaatttcttcgagaataatttgttgcagtgctaacagagttatgttttggttgtttacccagtgatgattgcagttgccatttaaaagttctgctgtagcctgtagtaatatgtttgttgtttgcttccatagttccatactatgatgctttggtctgacctctttaagtgggaaaaaaattaatcgcatatgctgtttgaacttcattgctacaaactgaactatcaatcaaaattttggtgttccataatttggtacttggctaaactgtgactattccgatattaaccaccaggtactggctagtgaacaactcgttatataattgcaggttgacaaggctctgcagagcatggaggaggaagcagagcgggtattccaggatgaacggctgttgcttcgtgaagatgaggctgcttctgcaagagatacaatgttagtcaccatttggattcagctacttccatctgtttgtatttagtaacagtaatgcaaataaatagtgcaccacacttcgggaacaaaaattaagacaattgctttaaaacgatttaggatgcattgaaatgtttgattggacagattatggatgattgcttatcgggatgaatttaaatattatatattgtaaagataacaaatggcttagaacaagttgtctagggctgaattcgtttgttgcagttgggaactaatctcctgtgcacgcaaaatggtgtaactcattagcacatgattaattaagtattagctatttttatttttgaaaaatggattaatatgattttttaaagcaacttccgtatataatttttttttgcaaaaaacgcaccgtttagcagtttgaaaagagtgcatgcggaaaacgagggaggtgagttgggaaagataacaaacgaacacagcctaggcatttaagcaattctgaaggcgacagtttttggagaagttccttttggaaacgtggcatgaataatctgcacatgatctaaaataaatgcagcttaagctaagtaaatgctgtgcattgcttaaaaatattcctgaatcgaataacatacgatattctttgtttcctgagtggcctgtctcaatagtggtgttattactcgaaatatgtgcataatctattctgccccactcagttgcttagcttggtttttctttttttgaggaattgccaaattggctgacaaagctgtttttttttgtttgtgaggacaaatgattatgttaatgttttattatatcataatatacatcatcagcttaacagaataattttgcaatgccaaggtttgagcaatctgaaactgtggagaatgaattgcaacatatgacagaacaagtgaagtccatcattcagacattgaatgctactcaggtaagtattctggttgcagtacttgtctagtgatgacttgtgtcttagacatcagcctcctccaatccagggtgctgagtttgagactgctgatagtatgacaccatttgatgttgctgtccggatactggataatcaactgcgttctttaatgtggatcgatgagaaggttggtaactcaagtataccactttatgctcatatttttgaggtggctttagttacttatcgcaggcttacagcctcacagtttgtgagggtatttgtgctactgtgctaggctgcaagcaataatattgatttgacgcagaatgatatttccagattttatgctaggctttagtagaatcctttcggcttaggaacttgatccccttttattgcactgttacatagaatcttgcctttgaccaaataatgaaagcatatccttctgcttttatatactgtcctgttgaatcttgtttttttttacctatgctctacttttcgcatggtttggtgaatcttacctttgctttgagcaaaagtgcaaaaccagagaaacttgatcccaattgtttttttcttcctttaagtgatatttggtgtatcaatgccacatgttttgcatagtgattatttggtggaattagttttcagtctttttttgcaaagtctgtaattgaccctttgtccatttttcataggctaatgagttctcaagtagaatacagaggctacctaacaacagtgctgcagctgaacgtgactctggaatgccaaggttttggttaagctgatgatccaatcctggatggacatttgcatcttgttctgatcgaagccagtaaacatgctatttttcggtggatgtgttgccccccagcaaaagtttcactgttcctctcattcaagtacatgatgtaccgaactgatgttattcgttgggattttaactgctgatgttaacaatgccttgtaacagtcgcgtacattggcttcagcaatcagtgaactgtttcaactcactttggtctttggacgaggaaacaagaggctttgcgagataccgttcattattggttccaggtgtgttcagatctgttgagctgaaaagtagatgctatatgatgcgttgggtgggctaagtacctggctacctgcatcaattgagctacgccttatgagcttcttaccagggaccagcggatatcttgagccttttcttgcgatcctgtaatctcaaatcgctgtcctccagttgcactagaaagcttcggggtcctgtaagattgcacgatttgcatttctaaactacatgctatatgttcgcctaactacttgtgcatggcgcgtgttcatgatctgccattatcagatcaagattgcgcctatacaagaaagataatataattctttacctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0856600, RefSeq:Os01g0856600