Os01g0868300
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0868300 |
|---|---|
| Description |
Similar to DNA polymerase alpha catalytic subunit (EC 2.7.7.7) |
| Version |
NM_001051455.1 GI:115441280 GeneID:4325052 |
| Length |
9347 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0868300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39381667..39391013 |
| Sequence Coding Region |
39382003..39382149,39382237..39382311,39382388..39382507,39382662..39382715,39382792..39383014 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:39381667..39391013 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gagaaggtgcatcgtctgaatgctaagattaagacggaggacagccggaatggggatatggctagtgcaacagcagggtggatgaagatatgcggggatggggacaatgcaggaggtgagggagcggtggctgctaacagcaacaccggcgtggatgaaagctcagaatttgagctgaaggatggagcgctgccattctacatattggatgcatacgaggagccttttggtgctaattcgggcacagtatatttgtttggaaaggttgaagtaggcaagcggttccacagttgttgtgtggttgtaaagaatatgcaaaggtgcatatatgctattccaagcagttcaatcttcccaagggacaccatatcaaggctagagaagaattccactacttctgattcttctccatcacttcgagcaagtctacatgagttagcatcaggattgaagagcgaaatagctgataagttgtcagacttcaacgtgtcaaattttgcaatgactccagtcaagaggaactatgcatttgagaggactgatctaccaaatggggagcagtatgtcttgaagataaattacccatataaggatccggcgctacctacagaccttcgaggtcaacatttccatgcattacttgggacgaacaatagtgctcttgaattgcttctcatcaaaaggaagatcaaggggccttcatggctttcgatctccaaatttttggcatgtccagctactcagcgggtcagctggtgtaaatttgaagttacagttgatagtcccaaagacatatctgttttgatgacaagtaccacgttagaagttcctcctgtcgtggttgcagcagttaatcttaaaactatcataaatgagaaacacaatgtgcatgaaattgtgtcagcatcagtcatatgctgtcaccgtgtgaaaatagatagtccaatgcgttctgaagattggcagaaacggggaatgctcagccattttactgttatgcgcaagcttgaaggcagtatatttcctataggcctctccaaggaatcctctgataggaaccagaaggctggtagcaatgtgctggcactcgagagcagtgaacgtgcattgttaaaccgcttgatgatcgagcttagcaaacttgattgcgatgtacttgtgggacacaatatttctggatttgacttggacgtccttttgcaccgtgcacagacttgcaaagtaccaagcaatatgtggtccaagattggtcgtcttaggcgctcagtaatgcccagactcaccaaagggaacacactttatgggtctggggcaagtccaggaattatgtcctgcattgctggtcgtctcctctgtgatacctacttatgctctcgcgatctcctgaaggaggtgagttattctttgacacaacttgcagaaacacaattgaaaaaggagaggaaagaggtctctccacatgatattcccccaatgttccaatcttcaggagcacttctcaagctggttgaatatggcgagactgatgcatgtcttgctttggagctcatgtttcatttgagtgttctcccgcttacacgccaattgacaaatatcagcggtaacctgtggggaaaaactctccagggttctagagctcaaagggtagagtatctgctgttgcatgcattccatgcaagaaaatttattgtaccggacaagtttgcacgcagtaaagagtttaactctacaaaacgaaaaatgaaccctgataccgaggctgcaagacctgatgaagctgatccttcaattgatgacgagggacatcatgttgatcaaggtaaaacgaaaaaaggtccttcatatgctggtggcttggttttggagcctaaaaagggtctatatgacaagtatgtgctacttctggactttaacagcctttacccttcgataattcaggaatacaatatctgctttactactgttgaccgttctgctgatggcaatgtccctaatttgcccgcttcaaagaccactggtgttttgcctgagttgctaaagagtttggtggagaggagaagaatggttaaatcatggcttaagactgcttctggtctcaaaaggcagcagtttgacatccaacagcaagctttgaagcttaccgcaaatagcatgtatggctgcttgggcttttccaattccaggttttatgcaaagccacttgctgagcttattacactgcaaggaagagagatattgcaaaacactgttgatctggttcagaataacttaaatttggaggttatctacggtgacacagactctataatgatacatactggtctggatgacatctccagggcaaaaggaattgcaggaaaagtcattcaggaggtgaataaaaaataccgctgtctggagattgatcttgatggtatatacaaaagaatgctgcttctcaaaaagaagaaatatgctgccattaaagttgcattagatggtagcttacgagagaacattgagcgcaagggacttgatatggtcagacgtgactggagtttgctgtcaaaagaaattggagatttttgcctgaatcaaattttgtctggagggtcatgtgatgacgttatcgagtcaatccatagttctctcgtgcaggtgcaagagcagatgagaggtggccaaacagaattagaaaaatatatcattacaaagagcttaacaaaagcaccagaagattatccagatgctaaaaaccaacctcatgttcaggttgctttaagactgaagcaaaatggttattctgggtgctctgcaggtgatacagttccctatataatttgctctcaacaggattcagagagtacacattcaggaggaatagctcaaagagctagacatccagaggagctgaaaagaaaccctgacaaatggatgattgatattgactactatttatcgcagcagattcatcctgtagtttcccgtctgtgtgcttcgatccagggcaccagcccagctcgcctggctgaatgccttgggcttgattcatccaagttccaatcaagattgactgagtctgataatcaagatacgtctagcatgctcttgtctgtaattgatgatgaagatgagagatatcgtggttgtgagcccctgcgattatcatgcccaagctgttctactacctttgactgcccccctgtgtctagtctgattattggttctagctctggaaatgtatcaaatccaaatgaaggaaatgatgcttccattaatttttggcgtcggatgcggtgcccaagatgtccagatgacactgatgagtccagagtttctcctgcagtacttgcaaaccagatgaaaaggcaggctgatagtttcatcaatctatattataaaggtttactgatgtgtgatgatgagggttgcaaatactcaacgcacagtgtgaaccttagagtgatgggggactctgagagaggaaccatctgccccaactacccacgctgcaatggccacctagtgagacagtatacggaggcagatctatacaggcaattgtcatacttttgctatgtagttgatgcaactcgatgtcttgagaagttggaccagaaggcgcggcttccttttgagaaagaatttgcggcattaagccaaactattaacttggcattaatggaggttcagaaaatccgagacagatgtgcatttggctgggttcagttgaaggatcttgcaatatcaatctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>EKVHRLNAKIKTEDSRNGDMASATAGWMKICGDGDNAGGEGAVA ANSNTGVDESSEFELKDGALPFYILDAYEEPFGANSGTVYLFGKVEVGKRFHSCCVVV KNMQRCIYAIPSSSIFPRDTISRLEKNSTTSDSSPSLRASLHELASGLKSEIADKLSD FNVSNFAMTPVKRNYAFERTDLPNGEQYVLKINYPYKDPALPTDLRGQHFHALLGTNN SALELLLIKRKIKGPSWLSISKFLACPATQRVSWCKFEVTVDSPKDISVLMTSTTLEV PPVVVAAVNLKTIINEKHNVHEIVSASVICCHRVKIDSPMRSEDWQKRGMLSHFTVMR KLEGSIFPIGLSKESSDRNQKAGSNVLALESSERALLNRLMIELSKLDCDVLVGHNIS GFDLDVLLHRAQTCKVPSNMWSKIGRLRRSVMPRLTKGNTLYGSGASPGIMSCIAGRL LCDTYLCSRDLLKEVSYSLTQLAETQLKKERKEVSPHDIPPMFQSSGALLKLVEYGET DACLALELMFHLSVLPLTRQLTNISGNLWGKTLQGSRAQRVEYLLLHAFHARKFIVPD KFARSKEFNSTKRKMNPDTEAARPDEADPSIDDEGHHVDQGKTKKGPSYAGGLVLEPK KGLYDKYVLLLDFNSLYPSIIQEYNICFTTVDRSADGNVPNLPASKTTGVLPELLKSL VERRRMVKSWLKTASGLKRQQFDIQQQALKLTANSMYGCLGFSNSRFYAKPLAELITL QGREILQNTVDLVQNNLNLEVIYGDTDSIMIHTGLDDISRAKGIAGKVIQEVNKKYRC LEIDLDGIYKRMLLLKKKKYAAIKVALDGSLRENIERKGLDMVRRDWSLLSKEIGDFC LNQILSGGSCDDVIESIHSSLVQVQEQMRGGQTELEKYIITKSLTKAPEDYPDAKNQP HVQVALRLKQNGYSGCSAGDTVPYIICSQQDSESTHSGGIAQRARHPEELKRNPDKWM IDIDYYLSQQIHPVVSRLCASIQGTSPARLAECLGLDSSKFQSRLTESDNQDTSSMLL SVIDDEDERYRGCEPLRLSCPSCSTTFDCPPVSSLIIGSSSGNVSNPNEGNDASINFW RRMRCPRCPDDTDESRVSPAVLANQMKRQADSFINLYYKGLLMCDDEGCKYSTHSVNL RVMGDSERGTICPNYPRCNGHLVRQYTEADLYRQLSYFCYVVDATRCLEKLDQKARLP FEKEFAALSQTINLALMEVQKIRDRCAFGWVQLKDLAISI</aaseq> |
| Gene Sequence |
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|
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