Os01g0871100

From RiceWiki
Revision as of 19:02, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os01g0871100

Description

Esterase/lipase/thioesterase domain containing protein

Version

NM_001051469.1 GI:115441308 GeneID:4324939

Length

6971 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0871100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:39519279..39526249

Sequence Coding Region

39519460..39519725,39519906..39519995,39521469..39521536,39521609..39521691,39521814..39521903
,39522108..39522230,39523319..39523396,39524020..39524105,39524247..39524295
,39524738..39524794,39525107..39525237,39525319..39525402,39525522..39525588
,39525686..39526162

Expression

GEO Profiles:Os01g0871100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:39519279..39526249 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:39519279..39526249 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggcggtcgccggcggcggaggcggaggcggaggggagtcggtcggggagctgctgctccgcgcggcggcgatggtgccagcggagcactacgcgctcgcggcgctcgccgtggtgtcggtcctcgcgtacgggttcctggagctgcacttcctcggggacctcctccgcgggttccgcggcggccgcgtcgagctcaccttccacccggcctccgagatctaccaccgcgtagcctccaagtgccgctccctccacggcaggtatctggcgacgccttggctcgccagcccacatttgcagacactgttcctgggtatctccgggaggccaccttcgttcacatacaaaaggcaattgtacacagtacatgatggtgggaccattgctttggactggctgcttgccactgattcaaagggttcagatgggatcctttctgaggatgcttcagcaccacttgtagttattgtacctggattaactagtgattctgctgctgcttatgtaaaacacatggcttattccatggcaacgaaggggtgtaacactgttgtaagcaatcacaggggtcttggtggtgtgtccattacttcagattgcctctacaatgctggatggacagaagatctccgagaagtcattaattatctccatcacaaatatccaaaggctccaatgctctgtgttggtacaagcataggggccaacattgtggtcaaatatcttggagaagaaggtgagaatactcctgtggctggtgctgcatctatttgttctccctgggatctggtggtgggcgaccgatttatttcccgcaagcttgtgcagcggttttacgacaaagcccttgcctttggtcttaagggatatgcaaagctgcatgaacctgtgttggttcgacttgcaaattgggaaggtattaaaaagtcacgctctatccgggaatttgaccaccatgccacttgcatggttgcaaaatatgagacagtagatacctactaccgccgttgcagcagtgccagttatgttggtaatgtgtcagttcccttgctatgtgtcaatgctttggatgaccccctctgcacaagggaggccatcccttgggatgagtgcagggccaacaagaacattgttttggctactactccgaatggcggtcatcttgcattctttcaaggactaactgctggaagactatggtgggtcggagctgtttctgagttcctcttcgctctgcttgacagtaaatacatgcatcagcaaaaggcacaagaccatattttgcgttcttccttggagtcgtccatcgataagagcccatatgtcaacgtcatggaagatggaatgatagctccggtgacagatgatggcccttgtgatgatatcaccccttctcaccaggttaatgacataaaacaagataatggggattttacgcaacagaatgaacacaccagggaagtagatgataaaaatatcacagaagtaaatgcaatgccttcccaaagccctgaacagtctgcaggacagcaagtagaggaacactacgttggtaagtttcatgaggccattgctccagttaagagatccataaaccaactcactcggtaccagggtaagtcagtctggttgcttgcttatattgcttttgtaacatcatggccactccttggttccttagcttttatcgcatttaggaaaaagttcaggaataatttgctagctaagtggctgagaagataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAVAGGGGGGGGESVGELLLRAAAMVPAEHYALAALAVVSVLA YGFLELHFLGDLLRGFRGGRVELTFHPASEIYHRVASKCRSLHGRYLATPWLASPHLQ TLFLGISGRPPSFTYKRQLYTVHDGGTIALDWLLATDSKGSDGILSEDASAPLVVIVP GLTSDSAAAYVKHMAYSMATKGCNTVVSNHRGLGGVSITSDCLYNAGWTEDLREVINY LHHKYPKAPMLCVGTSIGANIVVKYLGEEGENTPVAGAASICSPWDLVVGDRFISRKL VQRFYDKALAFGLKGYAKLHEPVLVRLANWEGIKKSRSIREFDHHATCMVAKYETVDT YYRRCSSASYVGNVSVPLLCVNALDDPLCTREAIPWDECRANKNIVLATTPNGGHLAF FQGLTAGRLWWVGAVSEFLFALLDSKYMHQQKAQDHILRSSLESSIDKSPYVNVMEDG MIAPVTDDGPCDDITPSHQVNDIKQDNGDFTQQNEHTREVDDKNITEVNAMPSQSPEQ SAGQQVEEHYVGKFHEAIAPVKRSINQLTRYQGKSVWLLAYIAFVTSWPLLGSLAFIA FRKKFRNNLLAKWLRR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>182..447#628..717#2191..2258#2331..2413#2536..2625#2830..2952#4041..4118#4742..4827#4969..5017#5460..5516#5829..5959#6041..6124#6244..6310#6408..6884#atcccacaacgtccgtgaatcgccctctcctcgaaactgccgctcgaattgcttcgtcgtcctcgcctccggtctccgcgcgcgacgcgccgcctcttcccgtcggctcgtcggcgccgcggccgcacccgaggcctagagagcgcgcggggtcgcggcctcgacggggttttcctcccccatggaggcggtcgccggcggcggaggcggaggcggaggggagtcggtcggggagctgctgctccgcgcggcggcgatggtgccagcggagcactacgcgctcgcggcgctcgccgtggtgtcggtcctcgcgtacgggttcctggagctgcacttcctcggggacctcctccgcgggttccgcggcggccgcgtcgagctcaccttccacccggcctccgagatctaccaccgcgtagcctccaagtgccgctccctccacggcaggtttgtgtggccttctcatgtctcgatcggatcgtgtgatgataattcgtactcacaccgtctgcaattttgtgggtggaagcagcagcattgcttgctcgggctcctgaataatgggagcggttactttcgttgcgcatatttggatgttaatgacggatttgtggtgtcgtgatgcaggtatctggcgacgccttggctcgccagcccacatttgcagacactgttcctgggtatctccgggaggccaccttcgttcacatacaaaaggtcagactcgattcacgtgaagctgagttgcattctagacttattgtagattggtgtatttgagtttaatgttttcacatataattcaattcggtaaattcggtatgcacaagaacgtattatgctgcactagattcatgtacctccacttaagagaaatgtcaacgtttggtcactttagtgtgggtgtacttcaactaccttccaaacatgtgtaaaacatttatagcattattaacatggcaatgcccttcttgctaaaaaaatatagaaagaattctagaattggcctttgctagagtgaaggtacctatcgtaccatccaagcactgtagaccatagaaaaagagtatcaacgtacgagaagcccttaacaacgcgtataggttttcactaatgttgctacctgatacatgcctctttcgaagaccaaagatacacaaaacctgagaatatttcataagggcgcattgtctgtccaaacctatatgttttttgatggttcgatgagaatatcatatgttcagattttactacaaagttcagcccaccagtagtctatggcaatgatgagaaaattaactgaaatatacatgaggaagacgggatgcagggtcatagcctttctcctttggcttaactgcaggtctgcagcactcatgaatgaataggcagccagaaaccccacaccagtgtgactgtcactacgatgatctagtatgacacttcctcagaatgcaaattgagctccaacatccagaggttacaggtatagccaagaagactgaagctctgaatgaggatgatgtgcctgtccacaatcaaaacattaaggatttgtcaccttcgcaccaacaaaacagtgaaacaaacatgcacctgttgcttctctgcccatacgcccatgaaatctggaaaacagtcctatatgggcaaaatgcaccatcatgacgacagccaaacgtcgatactttgacattctagaggatttgtggcatcaagattgctcatgcttgcaaaaggagtggaggtgcaggtaaatgaccttgtgatttacacaagttgggtaatttggaaggagcagaataggctgatttttcagtaccagagacttcagccacaagacattgcctacaagattttctagcataatttgcgcgaattttccttttatccccctttcatacaataggcagagctcctgctctttcgttaaaattaaataaaagcagagtgtatgctgctttgttattcaatctctgctgtgttactaaaagcagtgatgtggccatttggaaactgggagtgtgattcaggatgaaattaaatgtttcaaccatgttgtgcaagctctgaaatgatttttgggcatgcacatacctccgtttctagctacatttctagcaattaatctattgaatttgttcagaatttaattcaatacttatcaggcaatttgtgcattgataataggcaattgtacacagtacatgatggtgggaccattgctttggactggctgcttgccactgattcaaagggtatcaggcacatatagtatgttaaattctatgtcatacactgtgagatctaacttatttactacatggcaggttcagatgggatcctttctgaggatgcttcagcaccacttgtagttattgtacctggattaactagtgattctgctgctgctgttagtcactaacttatttctgatgatattttcacacattttaaagagctcttggatttattgttgcataacctattggtatatagatctgttggtaattctgatgatgctgctatctgcagtatgtaaaacacatggcttattccatggcaacgaaggggtgtaacactgttgtaagcaatcacaggggtcttggtggtgtgtccattactgtaagttaactgacgtattgatttttttactccctctgcagtttatactttccttatacacttgatccctctaaaatttgtagcatgttataatttctctgtcgatactgcagcaagaagtttatgaggcaccgaattttaacaaatgtcttatttaggaataagaaccatcactcacctcataatatttatttcccttggcagtcagattgcctctacaatgctggatggacagaagatctccgagaagtcattaattatctccatcacaaatatccaaaggctccaatgctctgtgttggtacaagcataggggccaacattgtggtacataattttacctcgtcataatctgaaacttattatgttctgcgtattcaagatgtgatagttatgagtttacgacagttcattctttttgccattgatcattcagaagtttatccacttagctacctacaccaatgagactgaaatgcttctcatgccattgtttcctgatgaagagacgtcagtggtttctcgctcagtgtagtcatgtactaggacaaacttaaaatttacaagtttgattcagtttccaaccatgtcaagtttataattcaccaataaccattaaccagaatgaactggctagtgaggaaggggctgaatccatctaacatctttccttgctgcatatacactttttttttcaagtatgctccttttggttcaaatctgttgtttgcaaatatctgaagattcttaagcatcaatttgctgaagctttgtaaattgtaattagttgatcaaccatgcatttttacctgcacccatttgttgacctgcttggttcatcgtctctttctttattctctttgagcttgctattaaccacataagttggtaatatcggtttggttttggcttgtggatgctgacatggtagctcattctcaatttctaatctatttttgatcttcattcttttgacaatcgtggttagattcatcattaaggctgtgttctatagtcagggttaccaacccctctccttcgttttccgcgcgtacgcttttcaaactgctaaacggtgcgttttttgtaaaaagtttctatacgaaagttgcttaaaaaaatcatattgatccatttttgaaaaaaaaatatagcaaatacttaattgatcacgcactaatggaccgctccgttttccgtgccggagggttgggttcccaatccaggggaacgaacgcagcctaaataatgctggctttcttaatttagtgtgcttcaaccctcgtgcctgttttgctcattatccttgacccaacaccaaagtcatgcactcatgcctgcagtataccattggatttcaatatcatactgcatttgatgaactgacaatatatgtaatcatatcttttatacaggtcaaatatcttggagaagaaggtgagaatactcctgtggctggtgctgcatctatttgttctccctgggatctggtggttagttgctggacattattcactgaaatacagatacatataattcatgattgtattatctgattttttttttaccaatttttaactcagttcttatgccaccttctcaattattgatgatctgctgtgctcacagatccatgttggtttttacaattcatgaaacagtttgatgtgttactgagtgataatgtaggtttccatttgtcattctcgactttctaaaaatgcttttgcaaggatgatcttcaccttctcttgtaccgagttagaccccaggagagagcttttaattgcctggctttggatctcataaatttattttctttgttttgtacatataacaccttatttcaggggcctcccgcagtggtttaagtaaaaaaaaaaaactcttgctttactatttcctttttttctacagaaacttgcattactatttctggacatattaactaattcccaatttctggacattactatttcgtttgaattataaaatattctttctactatattagcatggattgtctatgggactatataagttagtttccaacagtttttttccacaacacaacatagcaacaccaacatgtccattaacctctcttgttttgtaggtgggcgaccgatttatttcccgcaagcttgtgcagcggttttacgacaaagcccttgcctttggtcttaagggatatgcaaagctgtaagtacccattctcaccatggtagtattcctgcacatactcgcaggttatcataacaagtgatccaaattataacttgaaatagttgacattgtaatcaaatagtgtgaatctttacctgcctttttattcccttacaggcatgaacctgtgttggttcgacttgcaaattgggaaggtattaaaaaggtctgatttgttcaactgtgttttttttgggtactgaactgacagatgtatcagtttatatatttatgatatttacgggcctgttcagattgtagccaaaataaaccttaccaaattttggcaatgccaaaattttggcaatattaattttggcaagatggcaatattgccaaaattttggtaggatttcttatgtatttaccaaatttggcaacaaactaaacgtagacattttttggcaactttgccaaaaaaaaattggtatggttgaaaatggcatcaatctgagcagccccgttatgtataatttctataagttttagtctatttcatttcaaaaaacaatcttcgatttcaggctgccaactgtttgtctactcctgtacttcataagttcatgacttgtgatattcatatatttattttatttctatattaccagtcacgctctatccgggaatttgaccaccatgccacttgcatggttgcaaaatatgaggtacctgtcatgcattcatgccacttggctcttctatcccttatcaatgagcacgcttgtttgtctgttactgtgccttgcgtgtcatttcactgcttcaataatacaatgacaactgctgctgtagtgactaatgttgtcatgtactccctctatcccataaaaaacaaacctattacgggatgtgacataccctagctgtctagattcgtagtactaggatgtcacatccgtactaggcttgttttttatgggacggtgggagtaaagtacagtatatcatcactcatgtaatgactaattattttacagacagtagatacctactaccgccgttgcagcagtgccagttatgttggtaatgtgtcagttcccttgctatgtgtcaatgctttggatgaccccctctgcacaagggaggccatcccttgggatgagtgcaggttttttttttttgtaaaattcattttcccaaagtactctggtttttgtattaagtagaagatgtttttcatttgaattagggccaacaagaacattgttttggctactactccgaatggcggtcatcttgcattctttcaaggactaactgctggaagactatggtatggtgcctgtgttttgtctaagatctattctattcaatattcatgtttattttatgtcttatatgtgtatctgctattgatggcattcagaactcagggccttttatattttgtaggtgggtcggagctgtttctgagttcctcttcgctctgcttgacagtaaatacatgcatcagcaaaaggttttcttactataatatgaatgaaaaatcccatctcagccacatgcattttgaaatggtggttactttgttgtttcatatcataattgaattgcaggcacaagaccatattttgcgttcttccttggagtcgtccatcgataagagcccatatgtcaacgtcatggaagatggaatgatagctccggtgacagatgatggcccttgtgatgatatcaccccttctcaccaggttaatgacataaaacaagataatggggattttacgcaacagaatgaacacaccagggaagtagatgataaaaatatcacagaagtaaatgcaatgccttcccaaagccctgaacagtctgcaggacagcaagtagaggaacactacgttggtaagtttcatgaggccattgctccagttaagagatccataaaccaactcactcggtaccagggtaagtcagtctggttgcttgcttatattgcttttgtaacatcatggccactccttggttccttagcttttatcgcatttaggaaaaagttcaggaataatttgctagctaagtggctgagaagataaataagttgtgttccaacagtttttttttttcatttgcatcatgtaaaactcagaattgtttaaaggcttgaaaagccattcgatctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0871100, RefSeq:Os01g0871100