Os01g0881000

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Structured Information

Gene Name	Os01g0881000
Description	Zinc finger, FYVE/PHD-type domain containing protein
Version	NM_001051531.1 GI:115441432 GeneID:4324846
Length	8417 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0881000, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:39984659..39993075
Sequence Coding Region	39984659..39985296,39985383..39985410,39985538..39985658,39985794..39985906,39986012..39986094 ,39986456..39986518,39986688..39986842,39986999..39987168,39987689..39987777 ,39987892..39988084,39988243..39988367,39988657..39989063,39989443..39989507 ,39990002..39990280,39990360..39990433,39990829..39990880,39990954..39991061 ,39991459..39991560,39991688..39991761,39991850..39992023,39992255..39992359 ,39992455..39992565,39992952..39993075
Expression	GEO Profiles:Os01g0881000
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:39984659..39993075 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:39984659..39993075 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgccgccggcgagaggcgggaggcgtgggagggggcgaggtaggcgaggtggacgcggaggcgccgcctctagggcgcgaggcgagaacgtcgtagacgtcgagccgatcaagctcggtgatgatgatgcgaaggtagatccacagacgaagtcacctaacgaagaaataacaagcgcggaggtttgcgaggtggagacctctgaggctagcccgcttggtgccccggaggaagatgaggggaagccaggttccactaggaacctgaagcgtcttcggaagacgatcacgatcgattccgcagccgctgaggagcatggggcagagagtgacgatgaagagtttgatgttcttgccacagcaagttgccaagagttggctccatgcagaaggtccaagcgcctaaggtgcaaaccaactaggaagaggtccaaaccaactgggaagagggatttgggtggcaaggagagtgaagatgatgtatttgcaaatagctcgagcagttcccaggatgacgccgggaagttagcttctagaagatcaaagcgtctcagggagaggcttacatctgattattttgatggtgatatgaaaattgttcggctccccgccgaggatcaaaacgccttcggaacagactgggccccagaaatatttcatatgctgatgatgatagcgacaccgatgatacatgttacattaactactgaaattaccacagatcgcaagaagattgtcccatgcaggagaacgtcaaagcgcctacaggagaagcggaaagctcatgatgtttcagaggagagttacactgaagcttcgtcttgcatgttgtcgacttcttcttcatcagatgatgaattattgcacaattctataaaacctggcagacgtaattcgggtggacctagttgttcgatctgtaagattggaattgcctgctctttcctcatcaaatgcaagaattccacttgttctcgtagcttccacaccttttgtcttgatcctcctttgcaagagattataggcacctgggaatgttcttggtgcaaaagcaatgcagcaccagcagtcaaggtgacagaagtgttaacatcaaaaaaaatccaaagacttgttggccacagacgaattcttcaggaggcagatttccagtatcaattcctcgtgaaatggcaatctctttctcatcatcatgactgctgggttccgcttgaatggcttcatgtatctgatcctttacgagtacagagctatctaaacaagaactgcttgcctaaggaagtttattcagaggatcaaaggaagcttgagtggtttgaagtagatcatgccattgcatgtcggaggaagttccatcatgaaggtttatgtgatgtcttggctactttccaggataaccaagatttcgacgggtatgagttccttgtgaaatggaagggccttgattactgtgaagctacatgggagccatgttgtaccgatggtgtgcaacaggctgtttctatgcttgtcaggaggcataaaaatgcttcaaaaagagttaacatcagccaaacatgtctagatggatcaaaaatagaagaggtgcactgtggtgctctatatgactatcaacttcaaggtttacaatggttaatagataacttcaaaactaggagaagcgttattcttgctgatgaaatgggtcttgggaaaaccgttcaagttgtttgctttctgtaccacattattaaggaaagtttgactgcatccccagcattgatccttgctccaaagagcatcctcctgcaatgggaaaaggaattttgccagtgggctagtgatcttaatgttattgtttatcaaggagacagagactctcgaaagtgtatccaagtccatgaaatgtactcttctgatgggaaacctttatttgatgctctagtgacgagttatgagtttgtccaaattgacaaggcagttctacagaaattcaagtggtctacaattgtcattgacgaggctcacagaatgaagaagcttgactgcaaccttgcagcttgcctaaaacgatactgctctgaatttcggttgctccttacgggaacaccgttacaaaataacatcatggaactgttttctttgcttcattatattgatccggatgagttctctgatccaaaggctgatggattgttctcaccaattgaatctggaagggatttgacaatggatgaaaaagttgctaggattcacaatattttaaagcccaggatgttgcggagaatgaaatctgatgttctaacagattctatgccagtaaagaagtgggttgaagttccatgtgcacttgcagattcccagagagaactttacattaatattttagagaggaattactcaaagcttaacagtgccattcggaatggcagaaaactttctctgaacaacatacttatggaactcagaaaatgctgcaatcatccagtaggacttgaagttggacagcaagcaactgaagatgtgtttttatcacttattgcttcatcaggcaaacttcaacttcttcataagttgctcccaagattgaaagaaaggggaaatcgtgtactgattttctcgcagatgaccaggatgcttgacattcttgaggattttctttgttccctgggatacaaatatgcacgcatcgatgggcagacatcactctctgctaggcaggagagcatagaagagtacaaaaacattgatagtgaaacatttattttcttgatgtcaactcgtgctggtggcatgggagttgacctgcctggtgcagatagggtaattatatacgatcctgacttcaatccatttatggacttgcaagcacaatctcgggctcatcggatcgggcagacaagaccagtggttgtttaccaactcattacaaagtgttctgtcgaggaaaagatactgcagaagtcaaagcagaagttggccatcgaaaatatgttgatgaactcttccaagaagccaagtgctgatgagttgcagtctatattactccatggagcaaagacaattgtggacaggaagatcagtgcaacatccatccattatgacaatgaagccattgagaatctcctcaagttagacccttccactggtgagaaatgctcgtcggatgataacggttatcttggcagcattgtgagctttgctcatggcgtcgaggatgaagcaccttcttccccaaaggttgaggatctgaaagttctcaagcctgctactcccaaggttgatctcggccgtgggaagaggcaaaggaaagtcgtgaactacgctgacgaggttgagaatgaagacagtgatgatatgtatgccccggaaggttcgtcgacttccgaattcagcagttcgtcctccgatgatgaaactgacagcgctctgcagctgcaaatagttacagtaccggacattgatgcagattag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MPPARGGRRGRGRGRRGGRGGAASRARGENVVDVEPIKLGDDDA KVDPQTKSPNEEITSAEVCEVETSEASPLGAPEEDEGKPGSTRNLKRLRKTITIDSAA AEEHGAESDDEEFDVLATASCQELAPCRRSKRLRCKPTRKRSKPTGKRDLGGKESEDD VFANSSSSSQDDAGKLASRRSKRLRERLTSDYFDGDMKIVRLPAEDQNAFGTDWAPEI FHMLMMIATPMIHVTLTTEITTDRKKIVPCRRTSKRLQEKRKAHDVSEESYTEASSCM LSTSSSSDDELLHNSIKPGRRNSGGPSCSICKIGIACSFLIKCKNSTCSRSFHTFCLD PPLQEIIGTWECSWCKSNAAPAVKVTEVLTSKKIQRLVGHRRILQEADFQYQFLVKWQ SLSHHHDCWVPLEWLHVSDPLRVQSYLNKNCLPKEVYSEDQRKLEWFEVDHAIACRRK FHHEGLCDVLATFQDNQDFDGYEFLVKWKGLDYCEATWEPCCTDGVQQAVSMLVRRHK NASKRVNISQTCLDGSKIEEVHCGALYDYQLQGLQWLIDNFKTRRSVILADEMGLGKT VQVVCFLYHIIKESLTASPALILAPKSILLQWEKEFCQWASDLNVIVYQGDRDSRKCI QVHEMYSSDGKPLFDALVTSYEFVQIDKAVLQKFKWSTIVIDEAHRMKKLDCNLAACL KRYCSEFRLLLTGTPLQNNIMELFSLLHYIDPDEFSDPKADGLFSPIESGRDLTMDEK VARIHNILKPRMLRRMKSDVLTDSMPVKKWVEVPCALADSQRELYINILERNYSKLNS AIRNGRKLSLNNILMELRKCCNHPVGLEVGQQATEDVFLSLIASSGKLQLLHKLLPRL KERGNRVLIFSQMTRMLDILEDFLCSLGYKYARIDGQTSLSARQESIEEYKNIDSETF IFLMSTRAGGMGVDLPGADRVIIYDPDFNPFMDLQAQSRAHRIGQTRPVVVYQLITKC SVEEKILQKSKQKLAIENMLMNSSKKPSADELQSILLHGAKTIVDRKISATSIHYDNE AIENLLKLDPSTGEKCSSDDNGYLGSIVSFAHGVEDEAPSSPKVEDLKVLKPATPKVD LGRGKRQRKVVNYADEVENEDSDDMYAPEGSSTSEFSSSSSDDETDSALQLQIVTVPD IDAD</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>7780..8417#7666..7693#7418..7538#7170..7282#6982..7064#6558..6620#6234..6388#5908..6077#5299..5387#4992..5184#4709..4833#4013..4419#3569..3633#2796..3074#2643..2716#2196..2247#2015..2122#1516..1617#1315..1388#1053..1226#717..821#511..621#1..124#atgccgccggcgagaggcgggaggcgtgggagggggcgaggtaggcgaggtggacgcggaggcgccgcctctagggcgcgaggcgagaacgtcgtagacgtcgagccgatcaagctcggtgatggtgagtaggctggatctgggttctggacgcgatcggttttgggggattttgttcgggctagtgatcgatctgggggttttgggggtttttgttactgtgcgtttggttggttcgagagtttgtaaaatcaaaccgttggggattcggattttattaggggatttctggtggattttttttgggttcaggattgtaaggaagtagcattgctgtttttacgtcctccgatcggttcttgatgaggctgggaacggtttcccccctccatttgtgtgctcttcgcgtatttggaggagagcgctatattctgtggcggaagtatgaaatacatttttgatcaaggcgttcgaaactccgtaacattctgatccccacatatttggcagatgatgcgaaggtagatccacagacgaagtcacctaacgaagaaataacaagcgcggaggtttgcgaggtggagacctctgaggctagcccgcttggtgccccggaggaaggtgagattgaaagttcaaacttctcggacggcacggggttggtaatttgttatacccttatcgtttcggcttaatcccggtttcgatttatgcagatgaggggaagccaggttccactaggaacctgaagcgtcttcggaagacgatcacgatcgattccgcagccgctgaggagcatggggcagagagtgacgatgaaggtgagtgacggagtttgcttagctgacaatttctcggaattacgggtgccgcttgtcctgttaatgtgtagtacggttgtttgcattgtgttcaccttggttgtgctcagttttgatttgttttggcaaaatgaacactatataaaactccagatgttggtatttgcaatattagtctagaatgttgtatagctagtcattattattgtttgttttgacctgttgatttagagtttgatgttcttgccacagcaagttgccaagagttggctccatgcagaaggtccaagcgcctaaggtgcaaaccaactaggaagaggtccaaaccaactgggaagagggatttgggtggcaaggagagtgaagatgatgtatttgcaaatagctcgagcagttcccaggatggtaacagtgttatttacaatatattctgtcttgctgatcctaataaatttgtttggttgaagatttattccagattgatattttacagacgccgggaagttagcttctagaagatcaaagcgtctcagggagaggcttacatctgattattttgatggtgatgtgggtgaagacagacaccctgggaagtagctctgatgattatggtattgttacaattctcaactattgcatgatttctgatatgctgccagtctgctactacaaatgtaaaatttgcattatgtagatgaaaattgttcggctccccgccgaggatcaaaacgccttcggaacagactgggccccagaaatatttcatatgctgatgatgatagcgacaccgatgatagtaagtgggcaccctttgttatggcttgacataattgacccttttgtttgcagatcatgtgattttgtaattaacttcaatccagtttatttgggaaattggataacttgtagtttctcttctgctagaaagtcttaattgacataattaaaaaatactttgaaatattgtttaaccaaggatgcatttaaaacaatgtgaatagagtttttttacggaatggaagaaactatctattttcctcaatgcattctttttcaatatatatcttcattgatttgtgcactatgtgaaacttgcacctttcctatttacacgagcagaaagattaggacctaacagttgaatttattcccttctgtatagctaatatacaaataacataaccttgtttaagcatgttacattaactactgaaattaccacagatcgcaagaagattgtcccatgcaggagaacgtcaaagcgcctacaggagaagcggaaagctcatgatgtttcagaggtaagttaactaacaaaagaactcgacctactgttcttcatgaagtaataaatatctcatcgaaccttttcaggagagttacactgaagcttcgtcttgcatgttgtcgacttcttcttcatcaggtaataactaatcattttatgatcgataaatgtatcacctactttataatttaatatgattttgtggtcaagagattattgcaatcttgcattgtgcacaattaattaatatcaccgtacaaatatgtaaaatacctaggaaatattttgttttttactcctacctgttatacatggaagtgcgaagcatcaatgatccagagtcacatctaaacacattcaatattgttgatcacctttattcaatgcatttgttgttgcttgcatctataatatcgcatgaattgacaaccattccttctgtgcttcttaatgatttgtgtggaacctcagaatgcttgtcgtaaagttgatattacgtcgtgcatgtttcgctaatgacttgtgtctttcagatgatgaattattgcacaattctataaaacctggcagacgtaattcgggtggacctagttgttcgatctgtaaggtttgtcagcagttctgatttattaattttctacccccccccaatctttacatgaaatcctaactgattttttttgcagattggaattgcctgctctttcctcatcaaatgcaagaattccacttgttctcgtagcttccacaccttttgtcttgatcctcctttgcaagagattataggcacctgggaatgttcttggtgcaaaagcaatgcagcaccagcagtcaaggtgacagaagtgttaacatcaaaaaaaatccaaagacttgttggccacagacgaattcttcaggaggcagatttccagtatcaattcctcgtgaaatggcaatctctttctcatcatcatgactgctgggtatgttaaccttcttgctcaatctatatttggtgtctttttgaatgacttatctttgctgtctttttttttctttttctgtaaggcaataggtgtttgacttttcctttttctgtaaggcatacttgctagggaacctccctctaccaacacctttcttgtttgtagcagtacattatattgagtttctttgaactggtaccttgcattgtatatttcatttctttcaagtcatgaaactttgtattagcccttgctgctacaactaaaaaaatgtcatgctgcagctgctacactttgatttctattttaatgcaaacatacacatatttggcgtattcacaaaaaaaaaaacggcatcttcctaatgtttgtttatgatgttagaattgtatcctgccacactttgcctaatatttattatgtaattgctatacttgatgtggaccatgcaaatattgttccctagacacttaattatctactctctgtaggttccgcttgaatggcttcatgtatctgatcctttacgagtacagagctatctaaacaagaactggtaaatcttctcagtttcatgtttttctgtctaccgcctccagtgtaaagtttcttgtgttattttcttgttacatgtatttatcttttataattttttttgtgttcgtcaatgttgctaaattttttcttggatatactagttgcacataatctcgtacctgagtaatcgttgttcatatcattagcaaattaataatatgagcccctactaattttctaccttttttttcattaatcattactgagctattctggttgaacaccatgttgatgtttgccatttttaaaacaatcttgtttgtttataatcttaccagctgtgttctctagtgcaccatagtgcttatttttgttcttgtttgtgaacattgcaacagcttgcctaaggaagtttattcagaggatcaaaggaagcttgagtggtttgaagtagatcatgccattgcatgtcggaggaagttccatcatgaaggtttatgtgatgtcttggctactttccaggataaccaagatttcgacgggtatgagttccttgtgaaatggaagggccttgattactgtgaagctacatgggagccatgttgtaccgatggtgtgcaacaggctgtttctatgcttgtcaggaggcataaaaatgcttcaaaaagagttaacatcagccaaacatgtctagatggatcaaaaatagaagaggtgcactgtggtgctctatatgactatcaacttcaaggtttacaatggttaatagataacttcaaaactaggagaagcgttattcttgctggtatgtacataaactctaaatacataatccatgatgcacttgtacagttgtaccttaccaaattataatgcaccaataatacacatgtaaagaattatgctgatcagtttttattttgttgttttgagataatctgatttatcatgatgcttgtgaactgtataattatgtagcgtctctttgatgttttctttatttgtttggcattgtcttgatggaaaaatagcttgtacaactcttatttcatgacaaaactatgataatggggtatgttctgctctattggcagatgaaatgggtcttgggaaaaccg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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0881000, RefSeq:Os01g0881000