Os01g0977600
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0977600 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001052110.1 GI:115442590 GeneID:4327816 |
| Length |
12684 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0977600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:44997407..45010090 |
| Sequence Coding Region |
44997583..44997810,44997896..44998126,44998622..44999077,44999152..45000215,45000301..45000991 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:44997407..45010090 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggaagcacaagggccgagctgccagcagcggcttggcggcgtcgctgctgccgcatgcgcagggtgccgtccccatcgttggtttcgggggttaccatggcgcctcccgtgttgagcccgccgcgccttcgtcctcgaccgaccccgatgcctcgattctcctccctcccgatgtggacagtgaggtgctgcagcacctaaggagattaggaaggaaggatccaacaacaaagctcaaggcattatctacgctctctatgctctttgcacaaaaacctggtcaggaagttgtgcaaattgttccacaatgggcattcgagtacaagaggctgctgcttgactataacagagaagttcgtcgtgctactcacgataccatgtctagcctcgtcaaaactgtcaagaagggtcttgctccgcatcttaaggctttgatgggtccttggtggttttctcagtttgaccctgctcttgaggttgcacaggctgctcggcattcgtttgaggctgccttcccacaatcagataaaaggttggatgctttaatgttatgtgtgaaggaaacatttcttcacttgaacgagaatttgaagttaacaacacaagcattgtctgacaaggctacaccaatggatgaactagaagatatgcaccagagggtaatatcatcatcattgttagcaatggcaactctgattgacattttgctaggtgtaaaattacaaaattgtgtccgtgacaattccagttctgaaaatacgagtctttcaaaagttctatctggcacattgtcttctgctgaatctgcattttctatgaataaatattttcttgatttcctcaagtcaaaaagtgcgattatacggtctgccacatactcactgcttgcaagttatatcaaacatgtttctcatgttttcaatgaagaagccatgaaggtactatctcctgctttacttggtgccttcaatgaaaaggacccatcatgtcactcctctatgtgggatgcatttcttgctttctctagaaggtttccagaggcttggtcatattgcaacattcacaaggttgttttcagccggttttggcactttctacaaaatggatgctatggatccaagcaagcctcataccctctcctggttcagtttttggagtctataccatctaaagctgtaactacagagcaatttgtttttgacttcttacataatctctgggctggaagaaaccagaggcaattatcagctgctgacagtttggcattctttactacctttaaacagagtttcttgtggcttctaaaagttctaccgagacattctggaggaggttcttcggatgatattcctatcaagctcataacttactttcttgcaaaagttgtttggcatgattaccttcgaataccatcttccaaaaaccaggatattagtttgagtggattgtctgatgaagcaatcagtggtgattgtcagttatctcataaggagtcactgttggcatcaagcacacgctacccaacttattatcttcaggatttggggaaatgcatcattgaaatattggatgagatttcagctatggaaaatcatttgttaaatattgcttgtgagactctattgaaggactgtttggatataatccatcaaagggagagtttgccaaattttcagtatcatgtggaacaagttgtgtccttttttatttcgttggatcagctcattgtacagaaaggtaaaacatggccattggaaagcttagcaagaccactgattgaacaatctgtgccagctatcaagtctatggacactccaattgttgttaaacttctatcagttttggttgaaatattcaggcctgtccctttgttcttgaagaattcacagaaagagagtgaggaatctgtccaaggttatctggatgtgttcaatggtgactttgtcccctggtgtttggataggaaatatagtacttgtagctcaaagatcgatctgttgctctctttaattatagatgagtgcttctttgaccagtggtgtacgattattaaatatactagtgctaagcaaaagcaccctgttgataataagaactcacacgttgatgaccaatttgaattgctgacacttatacttcaaaaggtaagagaaagaattgctgggggcaagttgagaaatttgcagaaaaatggctctctaccagaacattggcggcatgacctattagattctgctgcagaatctgtcttctgtgatttgcctgctacagattcccatgtccattatgtatgtgctgcacttggtggctcagatcaagatgaccaaatttgttttctttctgctgatactgtccacaaaatgctcgggtccattttgaagtgtttgacatcagtactcatgacatcaacttttgagtgggcaaggtttgcatatgtggtgttattgcctactgaaccaaaggactcgaaggttataggagcacaatccttttcatcaaacattaagatggctcattttgctttcaaagttcttgagggtagcttatttgccctgagaagactagaggaagattctttatttccttctgttctggcagctctgtttatcattgaatgggaatatagcatggccttaacactcgatgaagaacatgacttgaaaggttataaagaagatattgatgttgggtcttctgcatgcaacagttcagatgatcatttggatgagggaatacatttgaaagctaaccttgcagagagtatacataccttttgccaaagcttaagtccatccttttggagtgatcttcatccattcaccttgaataatttgttaaatattttagctcaatctgtcaggtgtgctttatttcagacactagagttgccaactgagagcacatcagtcttatgctcagagtggatggtgaacatgttgaagctcatctctcttgatcacacaaaattgcagagttttttttatcttcttttatctgagggagaatattggccactctgggtgaaaccatctttacaaaatgagaatgcaccagtgaagatcaaatttgagccagttattacaaatgaaacgggactgaaacaccatcaatttgttgcttttgttgacaagcttgttcttaaccttggctttggtgaagtgatcttaggtgttccaggaaatacatgttacaacacatcacaatcaattgatactacttcaactgttccttcattgtctagagcatgggttgctgctgagattctttgcacttggaaatggaaaggggggagtgtattcagcacattcttgccttctatgattcagcacttgaaaatggaatcatgtgcagaggtcagcatattgtccatattgcttgacacattgttggaaggagcttttcatgagtgtaaccagtgggtactgttcaatgcttggcacatttctgacaatgagattgagaaaattcaagatcattttctacgtgctcttgtggctttgctatttagtatcaatagcatcaatgagtgtatttggagagaatccgaggcacttgtattttttgagaaactactgagcaatctttttattggttccacagtaaatagaaaatgtgtaaagactcttccctttgtcatgagtacaatcatcaaaccgttgtcaggcaaactgaaattaaatgaagcttcttgttacactgatttggtggggcaaaacatactgagttggcttgatgtagccatctcttgcctatcatccagcccgagggaagtacttcaacaagacattgttgattggatgcaagtggtgttgtcttgcttcccgttgaatataacatgtggaacccagaaactagaagttaagattgaacgagagatcagtgatacagaaagatcattattgctgactctttttcagaagtacaagattttctgtgccattgaagctccgtcgctgtccaccagtggaactaccctgtcaacaatggttgaactattgggggtgaaactgatagcagttatggttggctattgctggacagaacttcaggaaaatgatttgcattttgtgtttcatacagtacagaagtggattgaatcagctgttttgcttgtggaagaaatgacagatgccatcaatgatgctgtaataaaccagaaatcaaatgaagatactttggagaagcttaaattagtggttagctctatagatgagttaactttaagcttcggtgaattcgctttggttacactgtgtcacctcaaccatctcgtggatatccaagaaacggagaacttccagagtttgcaaattattaaatcaggggattttgctgatagaaataacaatatgatggaaagtatgcttcgtttgttcttggcttctggtgtttcagaggcaattgcaaagtcttcttgtgaagaggcttcatccatcatagcttccagtcgcgttgcttatatgcatttctgggaacttgtggcatcatttgtcatttatgcttcaccacagactagaagatgtgcactggagtcgatggaactgtgggggctcgcgaagggctcagtcagtgggctatattcaattttgttctcttcacagccaatctctcatctgcagtttgctgcttattctctacttctttctgaacccctctgtcaattttcactaataaaggagtgttctctgggatcaaatagaccactgactcaggaatcttgcatgggacaaagtattgagttgatgccagattcagagaagacactagatctgagagaagaactctcatcgttaattgagatgcctacttctgaacttctccagacagatctgttagcccatgatagggttgatgccttcattgcctggtcattgttgttgtcccacctgcaattactaccaccagcttccattactagggaaagggtacttcaatatatacaagataagattagtccatgtatattggattgcattttccagcatat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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MGKHKGRAASSGLAASLLPHAQGAVPIVGFGGYHGASRVEPAAP SSSTDPDASILLPPDVDSEVLQHLRRLGRKDPTTKLKALSTLSMLFAQKPGQEVVQIV PQWAFEYKRLLLDYNREVRRATHDTMSSLVKTVKKGLAPHLKALMGPWWFSQFDPALE VAQAARHSFEAAFPQSDKRLDALMLCVKETFLHLNENLKLTTQALSDKATPMDELEDM HQRVISSSLLAMATLIDILLGVKLQNCVRDNSSSENTSLSKVLSGTLSSAESAFSMNK YFLDFLKSKSAIIRSATYSLLASYIKHVSHVFNEEAMKVLSPALLGAFNEKDPSCHSS MWDAFLAFSRRFPEAWSYCNIHKVVFSRFWHFLQNGCYGSKQASYPLLVQFLESIPSK AVTTEQFVFDFLHNLWAGRNQRQLSAADSLAFFTTFKQSFLWLLKVLPRHSGGGSSDD IPIKLITYFLAKVVWHDYLRIPSSKNQDISLSGLSDEAISGDCQLSHKESLLASSTRY PTYYLQDLGKCIIEILDEISAMENHLLNIACETLLKDCLDIIHQRESLPNFQYHVEQV VSFFISLDQLIVQKGKTWPLESLARPLIEQSVPAIKSMDTPIVVKLLSVLVEIFRPVP LFLKNSQKESEESVQGYLDVFNGDFVPWCLDRKYSTCSSKIDLLLSLIIDECFFDQWC TIIKYTSAKQKHPVDNKNSHVDDQFELLTLILQKVRERIAGGKLRNLQKNGSLPEHWR HDLLDSAAESVFCDLPATDSHVHYVCAALGGSDQDDQICFLSADTVHKMLGSILKCLT SVLMTSTFEWARFAYVVLLPTEPKDSKVIGAQSFSSNIKMAHFAFKVLEGSLFALRRL EEDSLFPSVLAALFIIEWEYSMALTLDEEHDLKGYKEDIDVGSSACNSSDDHLDEGIH LKANLAESIHTFCQSLSPSFWSDLHPFTLNNLLNILAQSVRCALFQTLELPTESTSVL CSEWMVNMLKLISLDHTKLQSFFYLLLSEGEYWPLWVKPSLQNENAPVKIKFEPVITN ETGLKHHQFVAFVDKLVLNLGFGEVILGVPGNTCYNTSQSIDTTSTVPSLSRAWVAAE ILCTWKWKGGSVFSTFLPSMIQHLKMESCAEVSILSILLDTLLEGAFHECNQWVLFNA WHISDNEIEKIQDHFLRALVALLFSINSINECIWRESEALVFFEKLLSNLFIGSTVNR KCVKTLPFVMSTIIKPLSGKLKLNEASCYTDLVGQNILSWLDVAISCLSSSPREVLQQ DIVDWMQVVLSCFPLNITCGTQKLEVKIEREISDTERSLLLTLFQKYKIFCAIEAPSL STSGTTLSTMVELLGVKLIAVMVGYCWTELQENDLHFVFHTVQKWIESAVLLVEEMTD AINDAVINQKSNEDTLEKLKLVVSSIDELTLSFGEFALVTLCHLNHLVDIQETENFQS LQIIKSGDFADRNNNMMESMLRLFLASGVSEAIAKSSCEEASSIIASSRVAYMHFWEL VASFVIYASPQTRRCALESMELWGLAKGSVSGLYSILFSSQPISHLQFAAYSLLLSEP LCQFSLIKECSLGSNRPLTQESCMGQSIELMPDSEKTLDLREELSSLIEMPTSELLQT DLLAHDRVDAFIAWSLLLSHLQLLPPASITRERVLQYIQDKISPCILDCIFQHIPLRT GAPCGKKKDAELMPEAEVAAQASKNAIITCSLLPCIESLWPVGTWQMASLAGGLYGMM IRLLPSYVRTWFTSLRDRSLSSSIESFTRAWCSPPLLLDEFSQVKDSLYADDNFSVSV NRSAYEIVATYKKEETGIDLVIRLPSCYPLRHVDVECTRSLGISEVKCRKWLLSLTAF VRNQNGAIAEAIHTWKSNFDKEFEGVEECPICYSILHTSNHSLPRLACKTCRHKFHGA CLYKWFSTSNKSTCPLCQTPF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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