Os09g0298400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0298400

Description

WD40-like domain containing protein

Version

NM_001069344.1 GI:115478427 GeneID:4346657

Length

5541 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0298400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:7836940..7842480

Sequence Coding Region

7837162..7837272,7837926..7838021,7838542..7838671,7839037..7839125,7839664..7839732
,7840129..7840186,7840274..7840385,7841379..7841465,7841697..7841775
,7841868..7842000,7842254..7842288

Expression

GEO Profiles:Os09g0298400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:7836940..7842480 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggggaaagaagacgacagacggcggggcggcggtggcggaagctcgacgccggggatgaacctgaagaacctggtgtcgagggagtatttcggccacaagaagaaggtgcactctgtagcatggaactgcctaggcatgaagcttgcttcaggctctattgatcatactgcacgtgtatggagtatcgatccccatggccattccaaggttaaagacattgaattgaaaggccacacagattgtgtagatcagctctgctgggatccgaagcatcctgatacagttgctacagcagctgctgacaagtcaattcgcctctgggatgcacggagtggaaaatgtcaagtcgtcgaacttagtggagaaaacatcaatatcacttataaacatggtggtactcaaatagctgttggaaacaaggaggatgagttgacaatagtggatgttcggaagctaaaagcccttcacaaatttaagtttaattatgagataaatgagattgcatggaacaaaactggagatttattcttcatcactactggacttggaaatgttgaggtatttggtgatccttcccttgatgacacccttcatgtggttggcaaattgaatgctcatacagcgggttgttattgcattggaatggatccccttgataggtattttgctgttggaagtgcagattcacttgtcagtctttgggatgtcaaagagctcctttgcattaaaacctttaccaaactcgagtggcctgtaagaacagttagcttcaatcatactggagagtttcttgcatatgctagcgaagatcccttcattgacattgccaatgttcaaactggacgatcgattcatcagattccatgcaaggcagctatgaatagtgttgaatggaaccccaagtacaacctcctggcttacgcaggagacgacaagaacaagtaccaggctgatgaaggtgttttccgaatatttggctttgaaagcacataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEGKEDDRRRGGGGGSSTPGMNLKNLVSREYFGHKKKVHSVAWN CLGMKLASGSIDHTARVWSIDPHGHSKVKDIELKGHTDCVDQLCWDPKHPDTVATAAA DKSIRLWDARSGKCQVVELSGENINITYKHGGTQIAVGNKEDELTIVDVRKLKALHKF KFNYEINEIAWNKTGDLFFITTGLGNVEVFGDPSLDDTLHVVGKLNAHTAGCYCIGMD PLDRYFAVGSADSLVSLWDVKELLCIKTFTKLEWPVRTVSFNHTGEFLAYASEDPFID IANVQTGRSIHQIPCKAAMNSVEWNPKYNLLAYAGDDKNKYQADEGVFRIFGFEST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>223..333#987..1082#1603..1732#2098..2186#2725..2793#3190..3247#3335..3446#4440..4526#4758..4836#4929..5061#5315..5349#ggtaaggataacgcatgaacttgtggcatgaataaacaaaaaagtagaaggacgtttctgcgaaaaccctctcctcttccccgccgacgccgtccccggctctccctcctccgtctcgcgcccgccgccgccgccaccgccaccgccgccgccgccttgcgcctcgtgacgcggtgagtggggaatagcaaaaccagacccgtgccccagtccgcggggacaatggaggggaaagaagacgacagacggcggggcggcggtggcggaagctcgacgccggggatgaacctgaagaacctggtgtcgagggagtatttcggccacaagaagaaggtaaccttttcgattcccccctcaccaatcctacgcggggataagtttttttctcatgaggtcctaaaccctcaaaagtcctgcgagggggaagccctaaaatccggatgttacaagcaaaaattaggacgaaaatgcatccatctttggttcacacgtacggttttgtttctaattctagagcaggatatagtgattgattcctcgcgttcatgccgtatatatgctgattcttttgctctagggctaagccatgttgagattgaatgaagctttggttggttgctttccttctgggagctggtgaatgagcgcattgtcaaatatgattcctggtcataattactcctaatttttgaaggaatttggtttcacgaaaagggacttcttgtctgactttgtaaagttgctactcctctgaggggaagaattcaaagggaaaaaaaaatcttacttgcagaaagaatcatagtacaacgatatttctctgtttctttcttgaattctgtttcttgtttttctaaataatccttccacacatggaggtgcagcatttaactggttctgtcgctttttgccttcttttttatctatcttacatacataatcagccttaaattttgtataattctgatcttttgttttactgttaggtgcactctgtagcatggaactgcctaggcatgaagcttgcttcaggctctattgatcatactgcacgtgtatggagtatcgatccccatggccatgtaaacattctctcctttcctgattgcaaacaaaataaccttcattgttattatggaattattagataaacgcatttattgtcattcactatgaataactgtcaccctttttttatgaacatttctataaatttgaaagataagcatgatgattaattggaaatatctcccgctgtataatttaaaattatagaaactcagacagtaatcacacttaagcataccatagcctgtgtctctgagacatatgtttgagctatttaatgtgaaattgtgaatgatttcttagctaggggttcttttggatccctcagttgtacttatttcttcttcttaatgaaaggaagcgcagccctcctgcggttttgaggaaaataaattctaagctaaattatattgttttgagaacactaagacatttttggttggaacgtaggaggggaaaaaaccccagatggtttctatttccctggaagtaccaagtcagtactgtgctgattagggtttttatattgcacagtccaaggttaaagacattgaattgaaaggccacacagattgtgtagatcagctctgctgggatccgaagcatcctgatacagttgctacagcagctgctgacaagtcaattcgcctctgggatgcacggagtaagtggttcccttcatctttgaaggttaaagaactaagatatccacagttgtgttcagcattctcagcttctctctgaaattgatgaatccctttttgtcactttgttcaatccctatgttccatttacaatgaacttgttgttaccagacaagatgtcttattcttttgtgtagtgactctacctgaaagttagtttcagaatttttttagttgtacttcgatttttttcataggattgtacatcatacttttgattctctatttataactctacaagatttgggcctgcagtttgccttttaaaattatattatttatttgacccgctatttctcaaactgtttgacgtgttcttttccaggtggaaaatgtcaagtcgtcgaacttagtggagaaaacatcaatatcacttataaacatggtggtactcaaatagctgttggaaacaaggtatgtattgcctaggctgttatccctgttaacttcaagaacggtagtcatttatgactaaggaactggttttgatttgcatatatcatgccagaagagggttacaatattttgaaaggaatttataaaattctttccaaagagaaatgtgtaactataatctgatttatattagattgagtgatgagttatttggcaaattagcatctaaattgcaatgttcattcttgtgtttgacatgctctctgtataagtatcaatacaacatagctcagtatggacacacttgaatatatacatattgatcctaaattagatggaattatttactttttttgctatgcaaagttagtaaagtgttattgagcatggggactggggagtggtgtgtaaattttataataattgtagtaaacctatttttataaagtttacaagttagttcgcaaggtcccgcgtacaccaatgtgtttactttgtgagttctagttttataaaattgtacaagtgtagtaacagctgtcactatgatttgcaggaggatgagttgacaatagtggatgttcggaagctaaaagcccttcacaaatttaagtttaattatgaggtactttccacttgaaggtttgaattgttgaaacattcttctagcaattttcttcttccttttggaatctttcgctgctctgaatgaacatgcacatatagtcatataccttttgagaaaaagtagagtgggcataagtcggcagcatgtgcatctttgtctggaacaggaaaattgcctgctggtatttgaattagtactgactactgagtgtgaattacctaactattcgatgtactttaatttcatttgctgcattacttatgttgcagttttgtaaattttctatttcaactagctaaatgcccgtacacctgctactgataaaaatgaatcatatagctcctcagatcagttaacttttctgaagtaaattattgatttgttgttcctcagataaatgagattgcatggaacaaaactggagatttattcttcatcactactggacttggtaagatacaaaacccatatgttgttttaagtttcaatatcacaccagttggtatcagtgtaattacattgtttgctgtttatgtaggaaatgttgaggtatttggtgatccttcccttgatgacacccttcatgtggttggcaaattgaatgctcatacagcgggttgttattgcattggaatggatccccttgataggtgatgattttttctgtcttcgctcatttgttcaacatcaactcacatctcagccaatgacatttcattgtaactacattatcttttgaactttatgctataatcattaggttctctatatgctgtttgacttcgctttgaactctaattctcttaatgccttatactgatgctagttgttttatgtagttaacgattttttttatttcaaggtaatataaagcataggcatgagtgaagttatttgacatactatattttgggtattactaatgttgtattctatctcggtcttttgacagttgatagtgatactggtatatgtaaaaaaaagaactttctgtccaagctacctttaagtgaatctcacctgtgatagcacctagccataagtgattctatgatgacccatgcctaaatataaatgggacactgaattcagtgtttctctactactctgaaaggcaagtttcgttcgtctgtgcatgcttcctatcaggagtgaagttttgtttacccgcagaaaaaaaaaaacagccctccaaaagaagtggacccacatataaaaacgccccactggtaaaaaactgggatagaaaaactgaatagcacgtccttcccccatctcccgttgcaactaacaggcacctttactagcatgtaaaagaaagggtgcaaaatagtttgccacttgttgccttctactccatgtaaaagaatggattatttgctatacaccattgcaagtcttcatgttaatgtttggagatttgagctgctacatgaacctcaacaaaatttattgtggaaaagtatcatgttcttgttcgcatggatatagtggtatacaaacatgtttcatgcattagtgtagctatgccaaagtattgtacatttgttctcaattatctggtgaatattttgtttctttgagccctaaatggagcttaaaatgattttgacaaggatacttacagaatgtgttgatgccaggtattttgctgttggaagtgcagattcacttgtcagtctttgggatgtcaaagagctcctttgcattaaaacctttaccaaactcgagtatgtttcgctgcttttaaaccatacctttttttttctctccaatgtatctaaaatattgccatgaatatttggacaaaaagttatgtttagctaattttgctattttctccacacctcatattggaaatagtcattcaaagaaacaaagattaattagagtataccttcagttgcaagatgcttagaaacatgtactttcttcatcttttctttttgttctttttccaggtggcctgtaagaacagttagcttcaatcatactggagagtttcttgcatatgctagcgaagatcccttcattgacattgtgagtagttcaacatactgtaattctaatat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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0298400, RefSeq:Os09g0298400