BGIOSGA030821

From RiceWiki
Revision as of 17:25, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA030821

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030821, complete gene.

LocusTag

OsI_31499

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030821-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030821-PA

Length

7659

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:14574625..14582283

Sequence Coding Region

14574625..14574709,14574808..14574828,14575085..14575216,14575350..14575477,14575566..14575850
,14576034..14576164,14578339..14578439,14579411..14579543,14579759..14579810
,14580670..14580762,14581410..14581433,14581531..14581596,14581694..14581776
,14581852..14581964,14582237..14582283

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:14574625..14582283 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:14574625..14582283 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGAAACAACCAAAGCACACAAGTAGAAGGAGCAAGCACAACTAAGAAGCGGAAGACCTCATACTCTAACTCCAACAGAGAAGATTTGTCACCAGTTGTGGATGATGGTATGCACATGGTGAATAACTTTGAAGAATCTTTTGGAGACTTGGATGACTGCAATGAAGAATACAACAAAGTTAATTTAGTTGCTCTAAGAATATCTCAGTCCGTTGTCTCACTTGCTTCGTTTAAGGGGCGAACGAGGCTGTTTGCATGCACGGGTACAATTATGGAGTATGGACCAGCTAAAATGAGCATTCTAACTTCCGCTAGTTTAGTTAGATGCACTAAAGATGAAAACAAGACAGATGAAAAATTGAAGATTAAGGTGCGCCTACCCAATGGCAAGCTTACTGAAGGAAAACTGTGGAACTATGATTTATATTATAATATTGCTGTTGTCAAAATCAAGTATTTCCCAGAACTTAGTACTGCACAGATACATAATCAAGGGCAACCTAATGTGAAATTATCTCAAAGTAAACTGGTCGCTGTTGGACGTGGCTTTGAATCTGGAGAACTAATGGCTACAGGTGGGACACTGCTGTACAAACCTAGCGAACTTGACTGCAAGGAACTCATGACCTCCACTTGTAAGATCACAAAGGCTGGGATTGGTGGTCCCCTTGTTGGGTTTGATGGAAACTTTGTTGGCATGAACTTTTGCGATAAGAAGGATACTCCTTTCTTACCAATCAATATAATTCGGAAATGTTTAAAGCACTTTGATATGTTTGGGAGAGTTGTTCAGCCATGGCTTGGCCTGAGGATTGGATCACTGAAACATGAAAAACTGGATATCCGTGAACAAATACATGGAAGCTTCTCCAACACAGGTGACAACGACAATTCATGGGCCATTAAAAGACTTCTTGCTTTCTGGCTTACAAGGCACCATGGTGGTTCCTATTTTTGGCTTAGAGAATGGACAAGTATCCCAGTAGTTTCATTTCAGCAACATTTCAGTCTAAGGAGTATGGGAATTGTTACCCTGTTTGTCTTGATTGGTGTCTATGCTGAGACAGTTTTTGATGGATCCCCAGCAGCAGATTCTGGAATCAACGTTGGTGATGTTATTACCAAGCTTGATGGAGTCGATCTATTCCATGCACAAGAGGCAATAGAAGGTCAAAATGTGCTGTTCTATGAGCTTATTTTGGGGAAATCAGAAGATATTTTGCGACGTGATGAAGAGATGCTTTTCAAGGTGTCTATTCTAAGGCCAAGTAACGGTGTAACGTTCGGTGCAATTGTCAATGCTGATGTGGTTGACATGAGTAGGAAGAACAGATGGCCTGTACCCAAGGCGGAGTGGCTATATCCATGTACGGATGATAGATGTGATGAAATTGCCGTGCCTGATCCGATAGTTATTCGAACCTGTGAAGATAGCTATTATTTACCCGCCCTTGATGAGTCTGAACTAAGACTATATTACGGTGAAGAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRNNQSTQVEGASTTKKRKTSYSNSNREDLSPVVDDGMHMVNNFEESFGDLDDCNEEYNKVNLVALRISQSVVSLASFKGRTRLFACTGTIMEYGPAKMSILTSASLVRCTKDENKTDEKLKIKVRLPNGKLTEGKLWNYDLYYNIAVVKIKYFPELSTAQIHNQGQPNVKLSQSKLVAVGRGFESGELMATGGTLLYKPSELDCKELMTSTCKITKAGIGGPLVGFDGNFVGMNFCDKKDTPFLPINIIRKCLKHFDMFGRVVQPWLGLRIGSLKHEKLDIREQIHGSFSNTGDNDNSWAIKRLLAFWLTRHHGGSYFWLREWTSIPVVSFQQHFSLRSMGIVTLFVLIGVYAETVFDGSPAADSGINVGDVITKLDGVDLFHAQEAIEGQNVLFYELILGKSEDILRRDEEMLFKVSILRPSNGVTFGAIVNADVVDMSRKNRWPVPKAEWLYPCTDDRCDEIAVPDPIVIRTCEDSYYLPALDESELRLYYGEE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..85#184..204#461..592#726..853#942..1226#1410..1540#3715..3815#4787..4919#5135..5186#6046..6138#6786..6809#6907..6972#7070..7152#7228..7340#7613..7659#ATGAGAAACAACCAAAGCACACAAGTAGAAGGAGCAAGCACAACTAAGAAGCGGAAGACCTCATACTCTAACTCCAACAGAGAAGGTGAACAAAGTGCAATCACTTCGGGCTCTTATAAATTATTAACTTTTCCACAACTAATTCCAATTAGTGTTAATACTCTTTGTTGTCATTATTTGCAGATTTGTCACCAGTTGTGGATGGTATGTTTTATTTTGGCACATTTCATCTATCTACTTGTATATGGCTTTTTATTATTAATCGTGTCACCTTTTCACCCTGTTGCACCAGGCCTCACACGCATATTGCGCAGAAATCTTCTCCCCCGTGGTTATCCTATGCCATCTGAGTTCACTGGCAAGTACTTGTGTTTTGATCCTTCACTTCCTTTCTTTATTTTGATATATGTTTCTTGGAACTAGTTACATAACACATGTTATCCCGTGTTTCTTTGACTAGATGGTATGCACATGGTGAATAACTTTGAAGAATCTTTTGGAGACTTGGATGACTGCAATGAAGAATACAACAAAGTTAATTTAGTTGCTCTAAGAATATCTCAGTCCGTTGTCTCACTTGCTTCGTTTAAGGGTAATGATTCACTGTCTCAGCATAGACACCAATCAAGACAAACAGGGTAACCTACACAGAGGGGAGGGGATAAGGAGATCCCATCTGTGTAGTTCCATCACAAATTAGTAATTTAAATGTTAGTCCTGTACAGGGCGAACGAGGCTGTTTGCATGCACGGGTACAATTATGGAGTATGGACCAGCTAAAATGAGCATTCTAACTTCCGCTAGTTTAGTTAGATGCACTAAAGATGAAAACAAGACAGATGAAAAATTGAAGGTCCGCACTCAGCCATATTTTCTCTTCTGTTACTTCTTTATTTATGGTCTTAGCTTCATGAGATGATATTGTTGTCACTTGGTTGTAGATTAAGGTGCGCCTACCCAATGGCAAGCTTACTGAAGGAAAACTGTGGAACTATGATTTATATTATAATATTGCTGTTGTCAAAATCAAGTATTTCCCAGAACTTAGTACTGCACAGATACATAATCAAGGGCAACCTAATGTGAAATTATCTCAAAGTAAACTGGTCGCTGTTGGACGTGGCTTTGAATCTGGAGAACTAATGGCTACAGGTGGGACACTGCTGTACAAACCTAGCGAACTTGACTGCAAGGAACTCATGACCTCCACTTGTAAGATCACAAAGGTATTAACTCTCATTTAGTACTATGGATAGATTATGATTGTGGTTGGTTTATATTATTTATATGCATCTTATTCACGTTGAACCGCCTTTAAAAAAATGATCATATGGAAAGACATTTATAGTGCTGTTTAAAATGGAATCTGTTATGCAGCAGTTGTTCACCATCATTTTATTTTGTTACAGGCTGGGATTGGTGGTCCCCTTGTTGGGTTTGATGGAAACTTTGTTGGCATGAACTTTTGCGATAAGAAGGATACTCCTTTCTTACCAATCAATATAATTCGGAAATGTTTAAAGCACTTTGATATGTTTGGGTATGTTTTCTAGTTCTTATTAATGTACTTCCAATAATCTTCACTTGCAATCATGTGTGCTAATGGACAAATTTGTTCTCCTTGACCGTCCACTCTTTGAAGACTAGCTTGATTGTGGAGAGATAATGTTAGGACTCGTGATGGAAAGACTTGGTGGCTTGTTTAGTTGATTCTTAGACTGGTAGTTTATTGCTTGAATAATTTGGATAGGTCAACTCAAAACCAACATTTTAAGATGAGTCATCATATCCTGATCAATCAAATTTGCATTGCCCTTTTCTTTTAAGCGAAATACCTCTCCAAACTGAAGATCTTTAATGGAGTGAGTTGTAGTGAATGCAAAAAATTTATATTGGATAAATGCTGTGAGCTCCTCAGTTTCCTTTCAACTGTCAGAACCATTTTTACTAAGCAAGAATAATGAATTACTATGCAGTATGACTCAAAAGCTGACCAACCTTAGTTTCATGGCTTCATCTTTCCCCTAAGATCCATCCACCCTTGAGTCGTTGCCATCTGGCACTACTCAGTGCAATGTTTATGCCGATTATGAATTAGACCATTTTGGTTGGTACTTGGTCTGAAAGATGAAAAGTTTACAAATACCATCGCACGTGTGATTGACATGTGGGCCCTGGTCCAAAGTGTCATTCTCACATGCAATGGTATTTACATCGTTGTGATACTCGCCTATTTTTCTCAATGAATGATTTTCATAACATTTGGTATCTGAGCAGTTGATTCATGGCATTTGGTATCTGAGCAGTTGATCCTGCACTCCCTCTACTGCTAATTATCCCTTTGATAAAGCCTTGGATGTATGCAGAATGCGCAAATGGCCATGCCATGGCTGCCACTATGTTGGGATTTGAGGATTCCTGAGTTTGACTTATTGCATGTCTCGATTTCCTTTAATGTGCCAATAAGTTATATACAACATTAAGATGAATTTACACAATAGCATGAATAAACAAAGACAAGCTTCTATAATTTTTTGGTCACATATGGTCGAATTCGGCAACCAAAGTTTACATGTTTTCCTATATGTCATGGAATATGGTTCAATATATTTTTCCTGTGAAATTCCTACTAAATGAAACCAATCAGGGGTTCAGGACTAATAGAGACCCCCAGTGTGTTACAGAAGAGCATGAATAAATAAATATAAATTTCTGTAAAATTTGGCCAGATATGGTCGAATTTGGCAACAAAGTTTATATGTTATCCTATATGTCATGGTACATGGTTTACTATTTTTCTTTTTGTAAAGTTTCTACTAGTTGAAACCAATCAGGGTTTCAGCCTTTCAGGACTCAGAGAGTACCCCAGTGTGTTAAATACTTCAGTAAGCTTCAAGCAAGTGAGATGTCTCATATTATTTCGTTTTTCACTTTGGCTAGAAATTCGATTTATCATGACGGGAGCTGATTTTTATCTTGTTTCATTGATTATCAAATGTATAAAATGTGATATTGCTTGTGCATTACATGCTTTCTGTGGTGGATGTACCAAGATTTTTTTTATGGTACAACTGTTGCATTGTTGCGGTGCAATTGTACAGCCCTGTGAGATGCCACCCCATGGTTTGACTTGGACAATGCTGTTCAGGGGTTCATTTGTTGGGTCCAAAATTAGTGATAGGTGATCCATCGCATCACAATTTACAACAAGCAGGACATAAAGATATAATTTTCCTGCTACCTCAGTTTTCCCTCTGTGATGGGATCTACATCCATAAACATCAGCAGCACACTGCACTGCCACCTTCTCGGATGTTCAGCAATGCCACAATCGCTGCATAGCAGGCTCATTGGACTGCCAACTACTGAGAAGAGGACCGACAATACTCATAATCTCCATAATTACATTCTATTAATCTGAGCCACCAGACTCAGCTGTTTCTCCAAGCCATTAGCAGTCATCAAGTGTAGTTGCAGTCCCCGAGCAAATCACTGTTCCTCCAGCAGTCCGCTAGTCCCAAAACTGCTTTTATTAGCCTGGTTCTGTACTTATGCGGGTCATTTGCACAAAATCTATTTGATGTGTTGAACCTATATGCAATTTTGTATAGTTATGTTTTCTGTATTGCTAGCTTATTTTAAAATTATTCAATGTAGTCCGAGTGCCTCAGTCTAAATATTTCAATCATCTGCGAAATTTTGAGATATATGCAGGAGAGTTGTTCAGCCATGGCTTGGCCTGAGGATTGGATCACTGAAACATGAAAAACTGGATATCCGTGAACAAATACATGGAAGCTTCTCCAACACAGGTGGTATTTATGTAAAAGAGGTGAATATCCATTCAATATATTCGACATACACCAGTTTGCTGCAATTTTGTTATAATATTTCTTTTTTGTCCTATTATCTTCGTTACACTGCTTATTAGGACCAAAATTCAATTTCTCAGAAAGGAACCTTTAGTGTATTCCAATTACTCGCTTTTACTTAAATTATATCTCAAGTCTAATCCATAGCAATAGCAAAATACATTTTTATAAGGCACGATTAACACAAGCAAGAACCATCAGCAAGCATCAATAAAAAATCATTAAATAACTAGGGCACCATGGTGCCTCTGTACACAGAAAGTAGGTATTTTTTTTTCCTAGGAATCATGCTATAGAAATTTGTTTCTTTTTTGGTTCTGGGTATAAAGTTTAACCTGTTTAGAAGTTAGTTCAAGCAAGTTTGATATGAACTTTAGAACTATAGCGCCTTCTTTTAGTGAGTGTTGGTTTGTAAGTATATGCTGATTTGTTTATAAAAACAATGAATTCTTGAAAACTCTTTCAATGCAGATATATTTTTTCAAAGGTACATGTTCAATTGAACTGTTATACCCAAGGTTGTCAAGTCCTAAAGTCTAGTTGAGTCAGCCCTCTACAGACTTGCCTGACTATCAAAGACTAGTTGTTGATTGACTTGTCTTAGGCTATTACTACAAATGCAATACTACATATGTACCAGTTGCCTCTATTAATCTGATGTCCTCTCCTCACCTTTCCACCAGGCCTCTCCCAAGTGAGGCCCAGTTTGCTCCTTAGCGGCTCATTGTTTCTGCCTTTGCTCCATAGCGTCTTCTGCTGTCAACAAGTCAAGTTGTGGCCCTCAAGTTGTGCCCCCCTGGCTGTGTGTATACCCTAACAAAGAGAAATCTAAAAGTTATAGTCAAATCTGAGTTGAATGTGCACATTTGATGTCATGTTGCCACCTGTCAGCTTTCTTGTATTCCATAATCCAGACAACGACAATTCATGGGCCATTAAAAGACTTCTTGCTTTCTGGCTTACAAGGCACCATGGTGGTTCCTATTTTTGGCTTAGAGAATGGACAAGTATCCCAGTAGTTTCATTTCAGCAACATTTCAGTCTAAGGTACCTACAAGTGGGAACATGCTTACTGGTGGATTTAGGGAGTTGTGATATTGGCATGATTAGCTGAAAACTTTAATCCTTAAAAGAGGGTTAACTTGAGATGAGATGAATCATCAAGGGGGAGATCTGTTAATGGTGAATAATTTCATGCTTGCATTCCAGGCCTGAGGAAGGGATGTAACACATATGATTGACATAGTTGCTGATATATTTAGGAGTATGGGAATTGTTACCCTGTTTGTCTTGATTGGTGTCTATGCTGAGACAGTGAGACATAAAAGATGAATTTTGCTTGGTGTGCAACTGTCTGAACTAGGAGTGATATTCCTGGGGTCGCTGTAGTTATTTTCTTGTACTTACATCACTCACATCCAATACATGAATGTGGCATGCTATAGAACACTTGCATAAGATGAGGCGGTGAGAAGCAGCATGGTTTATGAATGAGTTTGATATTGATTGATAAAAAATTCAGTGGTAGAAAGTTGGGTCATTGCACTGATCTGGTGAGGGGATCTTGTGGAAACTGGCAGATTACTTGTTTTGAATTCAATGGAATATTTTAGTAGTGACCAGTCAATAGCCAGCGAACCACTACCTGGCCTTTTGTGTGGGTAGTCTGGTTTCATATATAACACTCTGGTTGGTACTGTTCATTGGGTTCCCTTATGTGTATCTCTTTTTTTTAGGTTTGCTTTTATCTGAGATCATAGCTGCAATGTGGTAGAAAACTTTTCTGCTTTCTGATGATGGATGGCCATTTTTTAATTGCTCCTATTGGTTCTCATACAAATTTCGATCATTTATCCAAATCATTTTTGTTGTTTCCCTCAAGATGGTATATTTAATTTAACTTGCAGAATCTATTTCATGGGCTATTTAAACATTCATAACTTTCTTGGTTAAATATTAGCTTTTCATAACTTTGTTTGAACAATGATCAAATGAGGTATCCATGTTAGCTTTGATTCCTTGGCAAATGCTATGCTAAATCCTACTTGAGTTAGAACAAAAAAAGGTTTAGCAACTATATTGTCCAAATAAGCTTCATTTTGGGGTTGACTATGTGTTTAATTAGGGCTTCTATATTTTTTGTGTAGTACTTACTTCAAAATTTACTCGATAGGTTTTTGATGGATCCCCAGCAGCAGATTCTGGAATCAACGTTGGTGATGTTATTACCAAGCTTGATGGAGTCGATCTATTCCATGCACAAGAGGTTCTGTTTCAAAAGTTCTTTGCCTGCAAATTCTAGTAGTTAATCTTAAAATTGTTCTGGAAAATCAAACTGATTTTTCATTGTGGTTCTTCTGACTAAACCATTTGCATTTTGTCCCAAGCAAAATCTACTAGCCAAACTGTTATAGTGCTATTGCCTGTTCCTTCCATTTTATTATTCACATCCAATAATTTTCACTATGTGAAAACTATACTGTTAAGAGTTCACTGTGATAATATATTGTTTTGGTGAACATGTGAAAGATAATTTCTTTTCATGATTTGAAGTTTCACTGTTAGTAGATCGCTGCAGGATTCCAGGATGTAACAAAATGAAAAAAAATCCATCTTGTCATAACTCTTATTCAGTGCATGTGTATAATCTGTTCTAGCATAATGTTTACTGCAGGCTAGAGTTTTCTTTTCAGTGCATGTTGTCTTTTTGTTGGATATTTTCTTCTTAATTCAATTTATTATGTTTACTTTCGTAAGTGAGTTACAACTTACAAGTTCAGAGTAAAACCTAGCATGATGACTTAGTGTTTTCCATCTTTTTAAAATAGCTCAATTAGTATCTGGCACCATTGCAATAATCTTAATTTGCATGTCCGCATTTTTTTTTTGGGTACCATTTATTTTGTAATGTAGGCAATAGAAGGTCAAAATGTGCTGGTAAGATAAGGTAGTAACGATGTCTTTACTTGCTGTATGTATGCAAAACAGAATAATTCCCTTTTTGATGGATTTCAGCTCTAATTTTTCTTACCAGTTCTATGAGCTTATTTTGGGGAAATCAGAAGATATTTTGCGACGTGATGAAGAGATGCTTTTCAAGGTTAGCTGCAGTGCATGTTCTATGGATTTGTTAATTGTTATGCTTCAACATGCGTACATTAATTATTTTTTATGGCATTCTATTGCATATGGAATAGGTGTCTATTCTAAGGCCAAGTAACGGTGTAACGTTCGGTGCAATTGTCAATGCTGATGTGGTTGACATGAGTAGGAAGAACAGGTTTATCCTAACGCTCCACAGCTAGTCTTGCAAATTTATGTTCTAATGTTTGCCATTATGTCTCTTAATTGACAGATGGCCTGTACCCAAGGCGGAGTGGCTATATCCATGTACGGATGATAGATGTGATGAAATTGCCGTGCCTGATCCGATAGTTATTCGAACCTGTGAAGATAGCTATTATTTACGTAAGATCTTATTTCTCTCTTTTCACCATGTTATAAAAGATTAATGAACTAAAATGCGTCAAATATATAACATTGATATGTTCAATTTGGATGAATTTAGTCTGTACTGCAGCTTATAAAGCTGTCCCATATTATCAGTCTAACCTGCAGGAAAACCACACTATGTGTTTCTCAACATTTTTTTCTTGTGACATGACGTTAATGTTTTACAATTTGTTCAAACACTATTCTTTACAATTTGTTCAAACACTATTCTTTGCCATATCTTTCAGCCGCCCTTGATGAGTCTGAACTAAGACTATATTACGGTGAAGAATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030821