BGIOSGA031619

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA031619

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031619, complete gene.

LocusTag

OsI_34174

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA031619-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA031619-PA

Length

11485

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:17774612..17786096

Sequence Coding Region

17785947..17786096,17784345..17784421,17784016..17784079,17783837..17783907,17783636..17783713
,17783500..17783545,17782905..17783085,17782766..17782818,17782607..17782680
,17782397..17782514,17781545..17781629,17780217..17780329,17779202..17779329
,17779047..17779126,17778758..17778957,17778462..17778626,17778222..17778386
,17778025..17778099,17777347..17777450,17777189..17777264,17776443..17776565
,17776190..17776333,17775664..17775876,17775259..17775492,17774612..17775055

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:17774612..17786096 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCCGGGAAGAGCTCGTCGGCCTCCAAGGAGGACCAGTACGCGGCGCTGCGGGAGCTGTACCGGCCGCACATCGACTCGTTCGACTACTTCATCGACGAGGGGCTCGACAAGATGCTTCAGTCCATCCGCCCCGTGGAGATCACCTCAAAGCTTTGCCATCTAAGAGGTGCAGATTCTGAAAAATTGATTTTCCATGGTGAAGAGGCAACAGAAATGGGCGGGTACTTCATATGTGGTGGGATGGAGAGACTTGTACGGATTCTTATTTTACAAAAACGTAACTATCCTATGGGCCTGATCCGTGGCTCTTTCGTTAATCGTGGTGCTGGGTACACTGACAAAGCAGTGATCATAAGATGTGTCCAAGATGATCAGTCCAGTGTGACAATAAAGCTGTATTACCTCCTAAATGGCAGTGCAAGGCTTGGGTTCTGGTTGGGAGGCAGAGAATTTCTCCTTCCTGTTGGGATTGTTCTCAAGGCCCTAATTGATACTAGTGACCGGGAAATATTTACAAGCTTGACATGCTGCTACAGTGATCATTATGAAAGAGGAAAGGGAGTTGTCAGCACTCAACTTATTGGTGAAAGGGCACAAATAATTCTTGATGAAGTCAGAGACCTGTCTCTTTTTACTCGCACAGAATGCTTGTTGCATCTTGGAAAGTACTTCCGATCTGTGATGGAAGGATTTGAGAAAGATGATTTTGAAACTGTTGCTGAGGCAGTTCTTAAGGACTATATTTTTGTTCACCTGCAAAACAACCATGACAAATTTAATTTATTGATATTTATGCTGCAGAAACTTTATGCGATTGTAGATCAAACTGCGTCACCTGATAAAGCTGATGCTCTACAGTACCAGGAAGTTCTCTTGCCTGGCCACCTGATAACAGTTTTTCTAAAGGATAGACTTCAAGATTGGTTGAGAAAGTCCAAACGGTTAATTGTTGAAGAGGCTACAAAAAATAAAAGCTTTGATCTCAATGACTCACAGGAGGTCAGGAAATTTCTCAGTAAAACTTCAGCATATGTTGGCAAAGCTATTCAGAGTATGATAAAGGTCGGAAAAGTAAATTCACAATCAGGGCTAGATCTGCCACAGCGAGATGGGATGACCATTCATGCTGAACGGCTCAACTTTCATCGTTATATTTCGCATTTCCGGTCTGTGCATAGGGGTTCTAGTTTTGCTAAAATGCGTACGACATCTGTGAGGAAGTTGCTTCCAGAGTCATGGGGTTTCCTCTGTCCTGTTCATACACCTGATGGAGAGCCTTGTGGTTTACTGAACCATATGACTTCCACATGCCGTATTTCATCCTTTTACAACTCAGAAGGGGCAACTAAAGATTTTCAGAAAATAAAGATGTCACTTATTGCTCGTTTGGTTGGCGCTGGAATGGCCCAACTGTTGCCGAGGATAGAGCGAACTGGTCCTCCAGAAGTCCTACATGTCCATGTGGATGGATGCATTGTTGGTTCCATCGCTTCTGCTAAGATTGAAGAAGTAATTCCAGAGGATTTGGAAGTGGGTTATGTACCCTTAAGCCATGGTGGGGCTTATCCTGGACTATACCTTTTCACCAATCCAGCTAGATTTCTTCGTCCGGTCAGAAGTCTCTTAGGTCTATCCAATGGAGGGCCAAATATTGAGCTGATTGGACCATTTGAACAGGCATTCATGGAAATACGATGCCCTGATGGTGGGGATGGTGGAAGAAACAAATTATTTCCTGCAACTCATGAAGAAATCCACCCTACAGCCATTCTTAGTGTAGTTGCAAATTTGACACCTTGGTCTGATCACAATCAAAGTCCTCGGAACATGTACCAATGTCAGATGGCAAAGCAAACCATGGGATTCTGTGGCCAAGCTCTAAAATTCCGTACTGATGTAAAAGCATTTCATCTACAGACCCCTCAGACACCAATTGTCCGGACAGCTACATATAGCAAGTATTGCATGGATGAGTTCCCATCCGGAACAAATGCTATTGTTGCGGTGCTATCATACACAGGGTATGATATGGAGGATGCCATGATTTTGAATAAATCCGCTGTTGATCGTGGGATGTTCCGTGGGCATATTTTCCAGACTGAGTGCATTGATTTATCAGCAAAAAGTAGAGATAATGTTACGGAGTTCTTTTGCAAGAGTAATCTTTCGAGGGACACTACCGCTGCAATCGAATCAGATGGCCTTCCTCGGATTGGAGAGAACATATTTCCAAATGAGCAGTACTACAGCGTCTGTAACAATCTCACTGGTACAGTAAGGCCTATCAAACTGAAGGGCTCAGAACCTGCAGCTATTGATTATGTTGCTGTCAATGGGACAAATTTTAAGGATCGTCTACAAAAGGCTAATATTCGTCTGCGTCGCGTGAGAAATCCTATAATTGGTGACAAGTTCAGCAGCAGACATGGTCAAAAGGGAGTTTGTTCGCAGTTGTGGCCTGATATTGATATGCCATTCTCTGCTAATACTGGGATGAGGCCAGATCTCATCATTAATCCCCATGCATTTCCTTCACGAATGACTATAGCAATGCTCTTAGAGTCGATAGCAGCAAAGGCCGGAAGTCTGAAAGGGAAGTTCATTGATGCAACGCCTTTTGCAAGCTCAGTTAAAGAGAGATCAAATTCCATTGTGGATGAACTGGGACCCATGCTTGCTTCTTATGGATTTAATTACCATGGAACAGAAATTCTATATAGTGGAGTTTTTGGCACTGAGATGAAATGTGAGATTTTCCTTGGACCTGTATATTATCAACGCCTTCGTCATATGGTCTCAGACAAATTTCAGGTTCGTACCACAGGGCGAATAGATCAGATCACAAGACAGCCAATAGGAGGAAGGAAATACGGTGGAGGGATTCGGTTCGGTGAGATGGAGCGAGACGCGCTTCTCGCTCATGGTGCCTCTTACCTCCTACATGACAGGCTCCATTCCTGCTCCGACTACCATATCGCGGACGTGTGCTCCATCTGTGGGAGCTTGCTGACGGCGACGGTGATCAAATCCGAAAGCCAGAAGAAAGCCAAGCGCGACATGCTCGGGCTCCCCACCGTAAAACCTCCCAAGAACTTTGCCTGCCAGGCCTGCAAAACAAGCAGAGGGATGGAGACCGTCGCCATGCCTTACGTCTTCAGATACCTGGCCTCCGAGTTGGCGGCCATGAACATAAAGTTGGAGCTTCGGCTCAGCAATAGAACAGAGCATCCTACTACTACCAGCGAAGAATCCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAGKSSSASKEDQYAALRELYRPHIDSFDYFIDEGLDKMLQSIRPVEITSKLCHLRGADSEKLIFHGEEATEMGGYFICGGMERLVRILILQKRNYPMGLIRGSFVNRGAGYTDKAVIIRCVQDDQSSVTIKLYYLLNGSARLGFWLGGREFLLPVGIVLKALIDTSDREIFTSLTCCYSDHYERGKGVVSTQLIGERAQIILDEVRDLSLFTRTECLLHLGKYFRSVMEGFEKDDFETVAEAVLKDYIFVHLQNNHDKFNLLIFMLQKLYAIVDQTASPDKADALQYQEVLLPGHLITVFLKDRLQDWLRKSKRLIVEEATKNKSFDLNDSQEVRKFLSKTSAYVGKAIQSMIKVGKVNSQSGLDLPQRDGMTIHAERLNFHRYISHFRSVHRGSSFAKMRTTSVRKLLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLLNHMTSTCRISSFYNSEGATKDFQKIKMSLIARLVGAGMAQLLPRIERTGPPEVLHVHVDGCIVGSIASAKIEEVIPEDLEVGYVPLSHGGAYPGLYLFTNPARFLRPVRSLLGLSNGGPNIELIGPFEQAFMEIRCPDGGDGGRNKLFPATHEEIHPTAILSVVANLTPWSDHNQSPRNMYQCQMAKQTMGFCGQALKFRTDVKAFHLQTPQTPIVRTATYSKYCMDEFPSGTNAIVAVLSYTGYDMEDAMILNKSAVDRGMFRGHIFQTECIDLSAKSRDNVTEFFCKSNLSRDTTAAIESDGLPRIGENIFPNEQYYSVCNNLTGTVRPIKLKGSEPAAIDYVAVNGTNFKDRLQKANIRLRRVRNPIIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPDIDMPFSANTGMRPDLIINPHAFPSRMTIAMLLESIAAKAGSLKGKFIDATPFASSVKERSNSIVDELGPMLASYGFNYHGTEILYSGVFGTEMKCEIFLGPVYYQRLRHMVSDKFQVRTTGRIDQITRQPIGGRKYGGGIRFGEMERDALLAHGASYLLHDRLHSCSDYHIADVCSICGSLLTATVIKSESQKKAKRDMLGLPTVKPPKNFACQACKTSRGMETVAMPYVFRYLASELAAMNIKLELRLSNRTEHPTTTSEES</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..150#1676..1752#2018..2081#2190..2260#2384..2461#2552..2597#3012..3192#3279..3331#3417..3490#3583..3700#4468..4552#5768..5880#6768..6895#6971..7050#7140..7339#7471..7635#7711..7875#7998..8072#8647..8750#8833..8908#9532..9654#9764..9907#10221..10433#10605..10838#11042..11485#ATGGCGGCCGGGAAGAGCTCGTCGGCCTCCAAGGAGGACCAGTACGCGGCGCTGCGGGAGCTGTACCGGCCGCACATCGACTCGTTCGACTACTTCATCGACGAGGGGCTCGACAAGATGCTTCAGTCCATCCGCCCCGTGGAGATCACCGTCCCCAACTCCCCCACCACCCTCAGAAATATCCTTCCTGCTTTTTTTTTTTTTACCTTTTGCTCGTCGCTTACAGTTCAGTGGACCAGTTTTTTGTGTGCTAGTACGAATTTACCAGTTTTTCCCCACCCAGCATCCAAAATTCAATTCTTATGTGCTACGAATTTACCTTAAGACAGCTCTCGTGCTTTCCGAACTTAGCTGACAAGTTGTTAATAAAGCCAACACCCAGTAGTTCCAACATAGAGTTACTAAGGCGCAGGTTTGAATTCGTTTTCACTCTCTTACGAGGACACCAATAGATGAGGTTTGGAAGGACTGCTATATTTGTGGATGCTAATTGTTTGTGTACGGAATGAACTATGGAAGTAACTTGGTTATCATCTCATTTTCCCTTAACCGTCGTCTATACTATCCTTGGAGAAAGGTCATCTGTTCCCACCAAAGAGGGATGGTCGGTTGGATGCACCGCTCTACCCCCAGCAGGTTTTGCTATATGGACTTATCAAATCCCTTTACATATCATTTTCATTTTAAACACAAGACATTTGTTTAATCTATTGAAAACTTTGGACGTTCTTTCCTGTTTTTCTTTGGATGAGCAGTGCAGGCAGGCACGGACGACGTATCATGGGGAATTTAAAGTGGATACTTTCATCCAATGTAATGACGGACCAGCTGTCAGGCAAACCTTCAATTTTGGTTACTTGCCTATTATGTTAATGGTTGTTACCCCTTCTTTGTTGTACTTCTTATCACATTTTTTTCGTAAGAACTTCTCTAGGTGGATTTTGGAACTTGAATGAGCGGCTGACAGCTTAGTTGAGTAGTAGCATCCACATATGAGTGCAGCTTGTTATCTGCTTTTAGGATCTAGCTTGTGTTTCTACAATTTTACATTAGTCTGGCACCCCAATAAGTCTTGGTTAAGTTCACCTGTCTCTTTGGTACAAAAGCTACTTCTGCTTCTTCAAGTCAAAAAATGAAAACTAAGCTATCTAATATGATATAGTTACCTGGAAAAAAAAGAGACTTTTCTCTATCAGTTGGGTGGAAAGAATCAAACATTATGCACTTTATTAGTGTCATGATGTTTTGTCAGTTTATAGCTTTATAATAGGCCAAAAATCTAAATTAATAAGCATGATTATGCAGTTTTTGCGGTTCAGTGCTGCTTTACAATTCTGACACTAAAATGATAAATAATAGCTGCTTTGAATAATTTATAATCAGTTGTTCGTGAAAGCTGATCTGCAATTCTGCATGCATCATACTATGCTGCAATTCTGTAGAGTTAGGAACACCCAAAGCATCGATATTAAAAAAAGTGCAGATACATCACATTTTGGTGGTAGCCATAGACAACTATTATTGTTTCTTCCTTCTGGAAGCTATGCAGGATTCATTTCACGTTCCACTTCTCTCTACACCACCTTATTTGTTCTTATTTGACTGATGGTTTTGATTTAATTAGTGTGAATTGTATTCTATTCTTGTTTATGATTTTATGCTCATGCAATTCCAGTCAAAGCTTTGCCATCTAAGAGGTGCAGATTCTGAAAAATTGATTTTCCATGGTGAAGAGGCAACAGAAATGGGCGGGTGAGTATGTTATGAACTTGTTTATTTGTTTACATTCTCTTAATTATGTCATCTTCTTCCCTTTCTATCATTTCTTAGTACACCGATCATTTAGTCTAGTCATTCAACTTGTTAAGACTACCTGTGGATCTTATTGATCGATTCATTGTGTTATGATTATATCACATTCACTCTTGATTCTTCTACTGTTACTGAACAAATTTTTTGACACTGTTTCCTATGTTAGTGTATTCATTCTGATGCATTTTGTAAAATTTTCTTTCAGGTACTTCATATGTGGTGGGATGGAGAGACTTGTACGGATTCTTATTTTACAAAAACGTAACTATGTAAGATTACTCAGCTTTTCTTTTAGATTTATGTTGCAAGGCTAATATTAGAAAAAAAAAACCCAGAGAACATTATGGCAATGAATGGTTTGGTGTGAATTTTTTCAGCCTATGGGCCTGATCCGTGGCTCTTTCGTTAATCGTGGTGCTGGGTACACTGACAAAGCAGTGATCATAAGGTGCCATATACTTGTCTATAGCTGCTTATGTTACTGAGTTTTTTTGCTGTTGCAAGTATACTTGTCTGTGTATCTAGTTGTACCTTTTTTATGTTATAATCCATATCTAGTTTTTTTTGACAGATGTGTCCAAGATGATCAGTCCAGTGTGACAATAAAGCTGTATTACCTCCTAAATGGCAGTGCAAGGCTTGGGTTCTGGTAAGTTCTGCACTGGCAAATTGTGAGTGGAAATGCTTGAGTTTCTTTTTAGTTTTTGGAACTTGATTCTTGAATTTGTGCAAAATTCAGGTTGGGAGGCAGAGAATTTCTCCTTCCTGTTGGGATTGTTCTCAAGGTATATATTTCCTTCATGGGGCTTATTGTTTTCTAACTGGAAATTGAGTTAATAAGCTTTCTTTGTGCATGATCAAGTTTTACAAATCATTGCTACTATATATTGTTGGATGATGATGCAATCTACAGTGACGACCTCAAGCCCTTTCTTGAAATATTCCATATTTTTCATTTATTGAGTAATTAAGCTGTATTTTACAAACTTTTTTTTTGTTCTAAGCGTTTCATTAATCTTTCCTCTTTCTGTAGTTTATTCTGTTACCTTACCAGATAATTTGATTTATACTCTCACTATTTTATTTAAAAAGTAATATTTTGATTGTGCTTCTATTCTTTGATATTTAGTGTAGGTTGGCAGTATTCTTAATGTAACTTTAACAGTACATTGACCTGATTGTGAATTTACAAATGATAGGCCCTAATTGATACTAGTGACCGGGAAATATTTACAAGCTTGACATGCTGCTACAGTGATCATTATGAAAGAGGAAAGGGAGTTGTCAGCACTCAACTTATTGGTGAAAGGGCACAAATAATTCTTGATGAAGTCAGAGACCTGTCTCTTTTTACTCGCACAGAATGCTTGTTGCATCTTGGTATCTGAGAGTTTAATTTGTTCTATTTGCACAAATTTTTGAATCCTTCTTAGTCACTGACATCGATAATTATCTTTGAAATGCAGGAAAGTACTTCCGATCTGTGATGGAAGGATTTGAGAAAGATGATTTTGAAACTGTAATATTGGATGTTTAATCTGCATTTGTCTTTGCATGTTGTTGAAATTTGGATCGCTTCACTTTGGTCATTCCACATTGTGTAGGTTGCTGAGGCAGTTCTTAAGGACTATATTTTTGTTCACCTGCAAAACAACCATGACAAATTTAATTTATTGATGTAAGTTGAAGTTTTATTGCTCTTTTCTGTGAATTTCTATCCTTTTGAACCTCTTTAATGATGTGTATCTCTTATTACTTTTCACTTCTTAGATTTATGCTGCAGAAACTTTATGCGATTGTAGATCAAACTGCGTCACCTGATAAAGCTGATGCTCTACAGTACCAGGAAGTTCTCTTGCCTGGCCACCTGATAACAGTTTTTCTAAAGGTCACTAAACCCTCTGCCGTCAAGCTCATGACCTTTTTTTTTTCCTTTTTGAAAATCAACTCCATAGTACTACAAAAATGGCATTCAATGTTATGTGCTTAGTAAAAACAATACTATAACATAAAATAGCATAAGTTTTTTGTCTTAACCTTTCTACCCTTGTTCAATTCTCTGCCTCTACCTTCTCTGTTACATATTTGCATGGACTGCTGGACCATGACCAATTGACCAGTGTTAGTTACAAGATGGATGTTTTTAAACTGCTTGGAGCTGGTGCTGATGTGTTCCTTCAAGCATAGGTGCTAAGGTAGAACAGGTCATCCAGCACATACTATGTTGACAGCTTGAGCTAGTAGTCCTTTGCGTGCATATTGACTACTACCTCCGTCCCAAAATATAAGGGATTTTGGAATCCCTTATACTTTGGAACGGAGGTAGTACTTATTTCACGCTCCTAGTATGGTACAGAAGATCTAGGTTATTAACAGTGTAGGCATGGTAGTGGTTACAGGTAGTACGAAGATGTTTTTCACCCAATTTTGCTAAGGTAGTGAGTTAAGTCATATTTTGCTTCGCACTTTTGCTGTGCCTTTGAGCTTATTTTTTTATTCTATTTGTTTCATCTTTGTTCCCTGTGAGCATCGCTTGACGCTGGTTCTTTGATGTCCTATTTTATGGCTGAGATTTTGTTGGTGTTGCTTTTGATTTCTTTTCTGACATCCAGTTCTGTTTTCCTAACTCTTGTTTTTCTTTCCTATCATCTCCAGGATAGACTTCAAGATTGGTTGAGAAAGTCCAAACGGTTAATTGTTGAAGAGGCTACAAAAAATAAAAGCTTTGATCTCAATGACTGTATGTTTACTCTATCCATGTTTTTATACAGGAACCCTTTTTAGTTGACCTGTGTTTCTGAAGTATACTACATCGATACTAGAATCCACTAATGATCCATCAGCGAGTGAATGCTAGTGATCTTTGCATTCATATGATCCAACAAGTCTTCATATGG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EnsemblPlants:BGIOSGA031619