BGIOSGA032512

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA032512

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA032512, complete gene.

LocusTag

OS10G0140200

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA032512-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA032512-PA

Length

12125

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:2308301..2320425

Sequence Coding Region

2308301..2308504,2308676..2308759,2310962..2311050,2311127..2311301,2311613..2311732
,2311853..2311936,2312020..2312091,2312193..2312306,2312703..2312803
,2312875..2312968,2313116..2313283,2313390..2313467,2313759..2313824
,2313903..2313959,2314204..2314423,2314718..2314854,2316590..2316658
,2316744..2316803,2317224..2317295,2317377..2317424,2317528..2317653
,2317828..2317893,2318355..2318467,2319195..2319279,2319384..2319494
,2319729..2319824,2319911..2319958,2320034..2320102,2320237..2320425

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:2308301..2320425 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:2308301..2320425 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGTCGTCGTCGTCGGCGCTGGTGGTGGTGGTGGCGGTTCTTGCGTTGGCGGAGGCGGCGGTGGCGTTCTCGGGGTACAACACGAGCGCCGGGGCGGTGGCCGGGAAGCTGAACGTGCACCTGGTGCCTCACTCCCACGACGACGTCGGGTGGCTCAAGACCATCGACCAGTACTTCGTCGGCACCAACAACTCCATCCAGGGCGCGTGCGTGATGAACACGCTCGACTCCGTGGTGGACGCGCTCATCCTGGACCCCGCGCGCAAGTTCGTCTTCGCAGAGCAGGCTTTCTTCCAAAGATGGTGGGCAGAGAAAAGCCCAAAAATCCAGGCCATAGTCCACAAGCTAGTTGATTCTGGTCAGCTAGAGTTCATAAATGGTGGGTGGTGTATGCATGATGAAGCCGCCGTCCATTATATTGACATGATTGATCAGACCACACTTGGTCATCGGGTAATCAAGAAACAGTTTAACAAGATCCCAAGAGCTGGCTGGCAAATTGATCCTTTTGGTCATTCTGCAGTTCAAGGTTATTTGCTTGGGGCAGAGCTTGGTTTCGATTCTATGCATTTTGCGAGAATCGATTACCAAGATAGAGCAAAGCGTAAAGGAGACAAAGGCCTAGAGGTTATATGGCGCGGCTCAAGAACATTTGGTTCATCTTCTCAGATCTTCACAAATGCATTTCCTGTCCATTATAGCCCTCCAGATGGCTTCGGCTTCGAAATTTTCGATGATTTTGTACCTGTACAGGATGACATGTTGCTGTTTGACTACAATCTTAAAGAACGTGTGAATGATTTTGTTGCTGCAGCCTTAAAACAGGCAAATGTTACGCGCACAAATCACATAATGTGGACTATGGGGGACGATTTTAATTACCAGTATGCTGAGTCTTGGTTCCGGAACATGGACAGGCTTATCAATTATGTGAACAAGGATGGCCGTGTGCATGCACTGTACTCTACTCCATCTATTTACACAGATGCAAAACATGCGTCGAATGAATCATGGCCACTCAAATACGATGATTATTTCCCGTATGCTGATGCAAAAAATGCTTACTGGACTGGATATTTTACAAGCCGTCCAACTTTCAAGCGATATATTCGAATGATCAGTGGATATTACCTGGCTGCGCGTCAATTGGAATTTTTGGTGGGTAGAAGTTCCTTAGGATTGTTTACTTCTAGCTTGGAAGATCCACTGGGGATTGCCCAACATCATGATGCAGTCTCAGGAACGGCAAAGCAACACACAACTGATGATTATTCGAAACGCCTTGCGATTGGGGTTTCTCAGGTTGAGAAAGGTGTTAATACTGCTCTAAGTTGTCTCACAAGTTCCAAAGGAACATGTACAGCAACAAAATTTAGTCAGTGCCAACTTCTCAATATTAGCTACTGCCCTTCAACTGAGGAAGGAATTTCATCCGCAAAGAGTTTAGTTATAGTTGTTTATAATCCTCTTGGATGGGAACGTAGTGACTTTGTAAGAGTTCCAGTAAATGATGCCAACTTAATTGTAAAAACCTCTGATGGAACTTCTCTGGAGTCACAACTAGTTGAAGTTGATATCGTGACAGCACGTTTAAGGAAGTTATACATAAAGGCTTATCTTGGAATCACGTCCGATAAACCCCCAAAGTATTGGCTAGTTTTTCAAGCTTCTGTACCACCACTCGGATGGAACACCTACTTCATATCAAAATCTACTGGAACAGGATCTAATGGAATGGGGTATGTCTCAACCATGGTTTCTCCAAGTAATGACACAATAGAAATTGGACCAGGGCCTCTGAAGATGTCCTATTCATCAAAATCTGGACAACTCAAGAGAATGTTCAATTCTATCTCTGCAGTGGATTTGCCAATTCAACAGAGCTTTCTTTGGTATGCTTCAAGCACGGGAGATTCTGAAGATTCACAGGCATCCGGAGCATATATTTTCAGACCAAATAGGACTACACCGACTATAGTTTCAGGAATGGCGCCATTGAAAGTTATCCATGGACCTCTTGTTGACGAAGTCCACCAACAGTTCAGCTCATGGATTTATCAGGTCACGAGACTCTACAAGAATAAGGAGCACGCTGAAGTTGAATATACTATTGGACCAATACCTGTTGATGATGATGATGACATAGGAAAGGAGGTTGTTACCAGACTGACAACAAATATGGCCACCAACAAAATATTTTATACAGATTCTAATGGAAGAGATTTCCTCGAAAGGGTGAGAAACCACAGGGATGATTGGGACCTTAATTTGACTCAACCTGTTGCAGGAAATTACTACCCGGTCAATCAAGGAATATATGTAGCAGATGGGAAATATGAACTATCTGTCCTTGTGGATCATGCTGTTGGAGCTTCGAGTATTCAAGATGGTCAGATTGAAGTTATGCTCCACAGGCGTCTTTCTGCAGACGATGGCAGAGGAGTTGGGGAACCACTTAATGAAGTAGTATGTGTGGATCAAAAGTGCGATGGGCTAGTGGCCAGGGCAACTTACTATATCAATGTCAATAAGAAAGGACATGGAGCTCATTGGCGCCGAACATATAGCCAACAAGTTTATTCACCGTTCCTTGTTGCTTTTGCACATGAGGACGAACGCAGTTGGAAATCCAACAATATTGCAAAAGCAAGTACGGTAGAAGGAAACTATAGTCTTCCTGATAATGTTGCAATCATCACCTTGCAGAGTCTTGATGATGGCACCACACTCCTTCGATTGGCGCATCTTTTTCAGGCTCAAGAGGACACACAATATTCAGTAATGGCAAAGGTTGAATTGAGAAAGCTGTTTGGAAAGAGGATAATCAAAGATTTGACTGAGACTAGCCTATCTGCAAACCAAAAGAAGTCAGAGATGAAGAAGCTCAATTGGAGAGTAACCGGGGAGAGCAAAACTGATCCTGCACCATTGAAGGGTGGCCCAGTTGACAGCCACGCCCTTGTTGTTGAGCTTGGACCGATGGAGATACGCACATTCTTGCTGAAATTCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASSSSALVVVVAVLALAEAAVAFSGYNTSAGAVAGKLNVHLVPHSHDDVGWLKTIDQYFVGTNNSIQGACVMNTLDSVVDALILDPARKFVFAEQAFFQRWWAEKSPKIQAIVHKLVDSGQLEFINGGWCMHDEAAVHYIDMIDQTTLGHRVIKKQFNKIPRAGWQIDPFGHSAVQGYLLGAELGFDSMHFARIDYQDRAKRKGDKGLEVIWRGSRTFGSSSQIFTNAFPVHYSPPDGFGFEIFDDFVPVQDDMLLFDYNLKERVNDFVAAALKQANVTRTNHIMWTMGDDFNYQYAESWFRNMDRLINYVNKDGRVHALYSTPSIYTDAKHASNESWPLKYDDYFPYADAKNAYWTGYFTSRPTFKRYIRMISGYYLAARQLEFLVGRSSLGLFTSSLEDPLGIAQHHDAVSGTAKQHTTDDYSKRLAIGVSQVEKGVNTALSCLTSSKGTCTATKFSQCQLLNISYCPSTEEGISSAKSLVIVVYNPLGWERSDFVRVPVNDANLIVKTSDGTSLESQLVEVDIVTARLRKLYIKAYLGITSDKPPKYWLVFQASVPPLGWNTYFISKSTGTGSNGMGYVSTMVSPSNDTIEIGPGPLKMSYSSKSGQLKRMFNSISAVDLPIQQSFLWYASSTGDSEDSQASGAYIFRPNRTTPTIVSGMAPLKVIHGPLVDEVHQQFSSWIYQVTRLYKNKEHAEVEYTIGPIPVDDDDDIGKEVVTRLTTNMATNKIFYTDSNGRDFLERVRNHRDDWDLNLTQPVAGNYYPVNQGIYVADGKYELSVLVDHAVGASSIQDGQIEVMLHRRLSADDGRGVGEPLNEVVCVDQKCDGLVARATYYINVNKKGHGAHWRRTYSQQVYSPFLVAFAHEDERSWKSNNIAKASTVEGNYSLPDNVAIITLQSLDDGTTLLRLAHLFQAQEDTQYSVMAKVELRKLFGKRIIKDLTETSLSANQKKSEMKKLNWRVTGESKTDPAPLKGGPVDSHALVVELGPMEIRTFLLKF</aaseq>

Gene Sequence

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