Os11g0131900
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0131900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Arabinoxylan arabinofuranohydrolase isoenzyme AXAH-II |
| Version |
NM_001072192.1 GI:115483996 GeneID:4349683 |
| Length |
6005 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0131900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1435657..1441661 |
| Sequence Coding Region |
1436225..1436407,1436587..1436641,1437005..1437201,1437440..1437561,1437649..1437796 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:1435657..1441661 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MASRESFMSTIFFFLLLFSLGCKCIASELHLHATQTAVLKVDAS PQLARQIPDTLFGIFFEEINHAGAGGIWAELVSNRGFEAGGPHTPSNIDPWSIIGDDS SIFVATDRTSCFSRNTVALRMEVLCDNCPAGGVGIYNPGFWGMNIEDGKIYNLVMYVK SPETVELTVSLTSSDGSQNLASTTIPVSGASNWTKLEQKLVAQGTNRTSRLQITTNKK GVVWFDQVSLMPADTYKGHGFRTELISMMLDLKPRFLRFPGGCFVEGEWLRNAFRWRE SIGPWEERPGHFGDVWHYWTDDGLGYYEFLQLSEDLGAAPIWVFNNGISHNDEVDTAA IAPFVKDVLDSLEFARGNADSTWGSVRAAMGHPEPFPVKYVAIGNEDCGKKFYRGNYL KFYNAIREAYPDIQMISNCDASSSPLDHPADLYDFHVYTDSKTLFSMKNTFDRSSRNG PKAFVSEYAVWRSDAGRGSLLASLAEAAFLTGLEKNSDVVQMASYAPLFVNNNDQTWN PDAIVFNSWQQYGTPSYWMQTLFGESSGAMFHPVTITSSYSGSLAASAITWQDSENSF LRVKIINFGSDPVSLTISATGLQARVNALGSTATVLTSSNVMDENSFSNPNKVVPVKS QLSNAAEQMQVTLAPHSFSSFDLALAQSKLVAEM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>569..751#931..985#1349..1545#1784..1905#1993..2140#2289..2358#2461..2606#2720..2765#2844..2896#3441..3585#4202..4320#4428..4499#4806..4909#5051..5107#5194..5386#5469..5612#5725..5847#acttaacaccaaagcctcggtctgtgtctgtccgccccccaacgcctcgccggcgcccagcttctcttccttccttccttgttgaggtctgaggtcttggatggtggccttatggtgagcgattttggtgaaatcgtttactgctcccccctgcttgacttcttttgtttccaattttgtttctttggttatgcaaacgaccagttcgatgaaatgaccgagtagaaggcaattgattggtttttgtgtttgtttaccctgatgatgagatcatttgaaacctcagctttcctaatccttgccaaattgtctggcgtcaacgcttttgtgattttctaaacaaagcaaatgatttggttatcttgtaagcatggttttggacatatcactgtcttgtctatgtttgcctttcgtttcttctaatggtatcgctgttttcatgccatctagtaatagcatctacttgtccgatgcctatcttccttagttgacttctcatactgtatcatcttctggctttatttgttcaacagacacacggcctgcactagtgtttacagctccaagtatggcttccagagaatccttcatgagtaccattttcttcttcttgcttctgttctccctcggctgcaagtgtatagcttcagagttacacttacatgcgacccagactgcggtcctcaaggttgatgcctcaccgcaacttgctcgacagatccctgacacactatttggaatattttttgaggtaagccgtgagacatatacagtaattctgtttttcacaattgcactgtatcactatatcctttcctctggcacttttttgttaggatgctcaagtgcattagcatgcccagaataatccaggtagattatacatgttccaccatgtcctgatgataatgatcttggctaatattgtaggaaatcaaccatgcaggggctggtggaatatgggctgaacttgttagtaacagaggtacttcagttatttttgttgtaatatatgcacttattttgatcgatcttccagataaaacataatttgcttctgaatggacatgaataaattcttctgcagtctgctggaacacaaacatggcttacgaaaaaaaaatccttttgttattttgtctttaatcgaaaattctccatactatctgattaactaaattatgttttccccataaactttaaacatagttatctttttagtactgtaaacttgacacacaaaactttgattaagagcataaactcgatggaaaataatatgccctttttttgaagttatattgacatttagggtttagtataaccaacttatgagttttatgcacaggttttgaagctggaggccctcataccccatcaaacattgatccatggtccataattggtgatgactcttccatatttgtggcgactgatcgaacgtcatgttttagtcggaatactgttgctctaaggatggaggttctctgtgataattgcccagctggtggtgttggcatttataacccagggttctggggcatggtatgggcttatatatcgttgttctttagtttgttttcctcacagtattgctgccattttctttccttttctcataaaattaacaagtaaatcatggacctccacatgttctgtttcgatttttcatgtagtgatagctcttttgtgcacttgtgttagtaaacatttgctttcctaacttttgcaatgcttcttttccaatactctgatcacccgtaattgtcatatcaacccgcagaacatagaagatggaaagatctacaatttagtgatgtatgttaaatcaccagaaactgtggagttgacagtttccttaacaagttctgatgggtcgcaaaatttggcttcaactaccataccgttagtgccttttctctcaatactgggacaggagaacaaggatgtttgcccattcccattagttttgaaaggattatattgttgcagggtttctggtgcatcgaattggacaaaactggagcagaagttggttgctcaaggaacaaatagaacctcaaggcttcaaataacaactaacaagaagggagttgtatggtttgatcaagtatcgctcatgcctgcagacacttacaaggtacattatattttgttgtcaaacttcattactggaaaaggaaaacgatgccatgggctttttatgctatctatgtatagtgtatgataacactttaagtcttcatgggctttttcaagtgcttccaacatttcttttacacatacagggacatggttttcgcacagaacttatatctatgatgttggacttaaaaccacgattcttgagattccctggtatgagctatattttcccattgaaaatcaagttcttgatatgtacatatatgccagacatgtctgggataattgacttgatttacattcaaacaattgtaggaggttgctttgtggagggggaatggttaaggaacgcattcaggtggagggaatctattggtccatgggaagagaggcctggacactttggggatgtttggcattactggactgatgatggccttggatattatgaatttctccaggtactagtttacttgacattattcctgcctttcattttcttatcacgtcctaatcatatattgcctttgagttctatatttttctaatgaaaactttgaactccacatcaaagctttctgaggatctgggtgctgccccaatctgggtgttcaacaatggtaataattgccatattttttatatcttgatcaccacagctgacctcctgaatcgacactaaactctttaaatatcaggaatcagccataatgatgaagttgatactgctgcgattgctccttttgtaaaagtatgttctgaactctctattttattttctgtcaggtcagatgcaccttgatttgttaaatagtttccactttagaattcacctgtaacgtcctagctatggctgcacttccatggatatggcatgtgagaaaactgatactatctttactgccatcatagtagtgttccatcttttatctttgcatatctaaatattaaagatcctaagaatgtaactgcatatgatgtgtctcattgaatgatgctaaaactcttgccttattttctcactattgaaatagagctgattatttgtgtaaaaaaggagatggttttgggcttgttcttttactctattagttctcaaagttcttttcaaaaaaattaattcacaatgttcacaaggagtgatgatgtttaacctgaatttgcattctggtatacttacagataacaatgtacctaccaagaaaatactaaatatcttttcttgaattgaagctatgttacttgtcgtaacaccagttttttgtttgggaacatctcttgttgtctctctacaggacgtattggacagtctagaatttgcaagggggaatgcagattcaacatggggttctgttagagctgcaatggggcaccccgaaccattccctgtcaaatacgtcgcaattggaaatgaagattgtgggaaaaaattttaccgcggtgcattcctcaattactttcttattttatcacttcaccatataactgcataaattgaagagccttgtctggaataaattaaggtgtatgatcgaataaaagatatgtacatggaccatgctaatcctgtaattttttttatgaaggtagtcactcaactcactctgtaaataaaggccgcaacttctttatgcagttgtacctgtttccttagaagtggttcattaatttagtcacataaatctccatagcaaaaccttacagggagacatttgttttcactattttaatctgcatataatattactttttttatgccctatgttctccttttcctctgctgtacttcgccaagccaatggtacttgtagtaatatatgttctatttttttgttgttgcaaataaactaggattagtaacacataaaaacaattcctggtagcaaacatactaaaatgtgattattttcatttttagaaaatttgggatgtaaatcatttatatttgatcataatctccaatgataaggcacatgtttgacttgaattgtgtggagaacaactgttgaattctcattttaggtacatgcatgatattctcttatccattatacaggtaattacctcaagttttataatgctataagggaggcctatccagacattcaaatgatttcaaattgtgatgcttcatcaagtccacttgaccatcctgctgatttatatgatttccatgtaaactactcatcctcttgagttgtgttctccagcacttctcattctttgtcacaaatgtcaaggcttttcccatttattaaattgaaacaattccttttttctaggtctatactgattctaagactttgttttcaatgaagaatacatttgatagatcatctcgtaatgggcccaaggtacgttgtatgcccggacttccattgtcgtggaccttttttcatttgtggatatgcttgtagaatagcactgtgaaatctcccatcttcatctaatattttacattaataatccaggatttcatgacatctctcgtatatttgtaggatgaccttggtcatctatttctcaacaataattcagtaatgtccacagttcatctatgtcatgtgtgatgatgtttacatgttttggataatcttggaacctcattgcatctcttgcttattcacttctatctttcttcatatatgttttggttgcaggcttttgtcagtgaatatgctgtttggagaagtgatgcaggtagaggaagtctacttgcttcattggcagaggcagctttccttactggactggagaagaataggtgatctttccttgaaacaatcttttctttctgggtcttgtgacagatcacatttgagctttcctctgggtagggctttattaagatctactaacaaatgcaacaagatattcattgtaacttcttgttggttctttgcagtgatgttgttcagatggcaagttatgcaccactcttcgtgaacaacaatgatcaaacgttagttttgatgactccatggtttctttatttgtgtttttgtttatttaacaagtactgtaataatgcttcaatcaaacaatcaggtggaacccagacgccattgtatttaactcctggcaacaatatggaactcctagttactggatgcagactcttttcggtgaatctagcggtgctatgtttcatccagttacaatcacttccagctactctggttctctggcagcatctgcaattacttggcaggattctgaaaatagcttcttaagagtaaaggtaagaaattttgttctaaacctactctacatctgtaggagattgcgtacctcatgaattgatcttgaaatctcctgtgcagattataaactttgggtctgatccagtgagcctcacgatctctgcaactgggcttcaggcccgtgttaatgcactgggatcaactgccactgttctcacatccagtaatgtgatggatgagaactcttttagtaacccgaataaggtaagcaaacatttctgacttcttactggatgtaatgcacatatcaatgtctagtagagtttgtggttttggtcatctgaagccaaagctttgctcatgacaaccaatgcaggttgttcctgtcaaaagccagctttccaatgcagcagagcagatgcaagtcacgcttgctcctcactctttctcctcattcgatcttgcgcttgcccagtccaaactcgtggcagagatgtgaagcagcaacacaaggttagcgacagaaacacaagaaatacacgagatgtgatatgcgaataccagaatgctgtccatatatgtgcatgtatcttgaagcactactgtatagtgtaatacacagggaatgatgaataaaattcactcctggcttacttc</dnaseqindica> |
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