BGIOSGA027374

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA027374

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027374, complete gene.

LocusTag

OJ1033_B09.17

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA027374-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA027374-PA

Length

7804

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:9643546..9651349

Sequence Coding Region

9650709..9651349,9649835..9650005),complement(9649369..9649630,9649195..9649272),complement(9648922..9649042
,9648622..9648770),complement(9646793..9646887,9646460..9646575),complement(9646237..9646383
,9645775..9645908),complement(9645300..9645431,9645027..9645161),complement(9644313..9644425
,9643546..9643717

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:9643546..9651349 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCTCCGCCTCCTCCGCCACGCTCGCCGCCACTCCACCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCCCCTCACCTCGCCGGCCTTCGCCGTCTTCGGCGCCAACACGGGCGTCGGCAAGACGCTCGTCTCCGCGGGCCTCGTCGCCTCCCTTCTCGCCTCCCCCTCCCCTTCCCCTTCCACCGTCGCCTACCTCAAGCCGCTCCAGACCGGCTTCCCCGATGACTCCGACGCGCGCTTCGTCTTCGACCGGGCCCCCGCGCTCCTCCGCCGCCTCCGCCTCGCCGGCGGCGGCGCCTCCACCCGCCTCGTCGCGTCCAACCACACCCTCTTCCCTTCCCCCGCCGTGGATCCCCTCCCCGAGCGCCAGGACACGGTGGTGAACTACGGCGGTGAGGAGGGGGTGGAGGAGAAGGCGCTCGTGTGCAGGACGGTGTACGCGTGGCGGGAGCCCGTGTCGCCGCACCTGGCGGCGGAGAGGGAGGGGATGCCGGTGGAGGACGAGGAGGTCAGGTGGCTCGTGGACCGGTGGCTGGCGGAGGAGGACGGGGGTGGGGAGGTGTGGAAGGTGCTCGAGACGGCCGGCGGCGTCGCCAGCCCTGGCCCTTCTGGCACGCTCCAATGTGATCTCTATCGGTCCTCTAGGTTACCTGCAGTTCTTGTTGGAGATGGTCGTCTAGGTGGTATTTCATCTACTTTATCTGCCTACGAAACTCTGTTGCTCAGAGGATATGATGTGGGCTCAGTTATTTTGGAAGATCGTGGCTTGTCGAATGACAGATTCCTGCTCTCATACTTGAGAAAGAGGGTACCTGTGCATGTCCTGCCACCAATTCCTGAGGATCCCAAAGACGACCTAACTGATTGGTTTTCTGAGTCATCCTCAGCTTTTAGTTCACTTAAAGATAGTCTGCAATCTTTTCATTCACGAAGAGTTCAAAGGCTAAACAGTATGCAGAGAAAATCAAAGTATTTGTTGTGGTGGCCTTTCACTCAGCATGATCTTGTACCTGTAGATTCTGTTACAGTTATTGATTCGCGTTTTGGTGAGAATTTCTCAGCATACAAGGTTAAAGACAAAACGATTGTTCCCCAGTTTGATGCATGTGCTAGTTGGTGGACACAAGGACCTGATTCTAACTTACAGATTGAACTTGCAAGAGATATGGGTTATGCTGCTGCAAGGTATGGTCATGTGATGTTTCCAGAGAATGTTCATGAACCTGCTCTTCGTTGTGCAGAACTTTTGCTTGGTGGTGTTGGTAAAGATTGGGCTTCTCGAGTTTATTTTTCAGACAATGGATCTACTGCAATTGAAATTGCTTTGAAGATGGCATTTCGTAAATATGCATGTGACCATGGGATTATAGTGGACAGCGAAAAAGATATCAGAAGTGAAGGAAGTGTTCATTTTAAGGTCCTTGCTTTAAATGGTTCCTACCACGGGGATACTTTGGGTGCTATGGAAGCACAAGCTCCATCAGCTTACACATCTTTTCTTCAGCAGCCATGGTACTCGGGGCGAGGACTTTTTCTAGATCCTCCTACAGTGTACATTAAAAACAAAAGCGCCAACCTTTCTCTTCCCCCATCGATAATGCATGATCAACTGAGTTCTTGTGATACATGTTTTTCCTCATTAACTGAAGTTTTTTGCAAGACCAGGGACACATCGTCTGCTGCTAATGTATATGTTTCATACATATCACAACAACTATCACAGTATGCTATGTCAAATAATTCAGAGCATATTGCAGCATTAATTATAGAGCCAGTAATACAAGGTGCAGGGGGAATGCATTTGATAGATCCCCTTTTCCAGAGATTACTTGTCAAAGAGTGTAAAAATCGAAAAATTCCTGTCATATTTGATGAGGTATTTACAGGATTTTGGCGTCTCGGTGTGGAGTCTGCTTCAGAGTTGCTTGGCTGTTTTCCTGATATCTCTTGTTATGCTAAATTGATGACTGGTGGCATTGTACCATTGGCTGCAACTTTAGCTACAGAGCCTATTTTTGAAGCCTTCAGAAGTGACTCTAAGCTAACAGCACTCTTGCATGGCCATTCCTATACCGCGCATCCCATGGGCTGTACCGCAGCAGTAAAAGCTATCCAATGGTATAAAGATCCCTCCACCAATTCAAATATTGATCTTGATCGTATGAAGCTGAAGGAGCTATGGGATAGTGCACTAGTGAACCATTTATCGTCCCTGCCAAATGTGAAAAGAGTGGTGTCCTTAGGAACTCTGTGTGCAATCGAGCTAAAGGCTGAGGGATCAGATGCTGGGTACGCATCACTTTATGCGAGCTCCTTAATCCGACAACTTCGTGAGGAGGATAACATCTACGCTCGGCCCCTGGGTAATGTGATATACCTTATGTGTGGTCCATGCACAACTCAAGATATCTGCACTCGCCAGCTCGCCAAAGTGCATCGTAGACTTCAAAAGTTGAATTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLRLLRHARRHSTSSSSSAAAAAVPLTSPAFAVFGANTGVGKTLVSAGLVASLLASPSPSPSTVAYLKPLQTGFPDDSDARFVFDRAPALLRRLRLAGGGASTRLVASNHTLFPSPAVDPLPERQDTVVNYGGEEGVEEKALVCRTVYAWREPVSPHLAAEREGMPVEDEEVRWLVDRWLAEEDGGGEVWKVLETAGGVASPGPSGTLQCDLYRSSRLPAVLVGDGRLGGISSTLSAYETLLLRGYDVGSVILEDRGLSNDRFLLSYLRKRVPVHVLPPIPEDPKDDLTDWFSESSSAFSSLKDSLQSFHSRRVQRLNSMQRKSKYLLWWPFTQHDLVPVDSVTVIDSRFGENFSAYKVKDKTIVPQFDACASWWTQGPDSNLQIELARDMGYAAARYGHVMFPENVHEPALRCAELLLGGVGKDWASRVYFSDNGSTAIEIALKMAFRKYACDHGIIVDSEKDIRSEGSVHFKVLALNGSYHGDTLGAMEAQAPSAYTSFLQQPWYSGRGLFLDPPTVYIKNKSANLSLPPSIMHDQLSSCDTCFSSLTEVFCKTRDTSSAANVYVSYISQQLSQYAMSNNSEHIAALIIEPVIQGAGGMHLIDPLFQRLLVKECKNRKIPVIFDEVFTGFWRLGVESASELLGCFPDISCYAKLMTGGIVPLAATLATEPIFEAFRSDSKLTALLHGHSYTAHPMGCTAAVKAIQWYKDPSTNSNIDLDRMKLKELWDSALVNHLSSLPNVKRVVSLGTLCAIELKAEGSDAGYASLYASSLIRQLREEDNIYARPLGNVIYLMCGPCTTQDICTRQLAKVHRRLQKLN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..641#1345..1515#1720..1981#2078..2155#2308..2428#2580..2728#4463..4557#4775..4890#4967..5113#5442..5575#5919..6050#6189..6323#6925..7037#7633..7804#ATGCTCCGCCTCCTCCGCCACGCTCGCCGCCACTCCACCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCCCCTCACCTCGCCGGCCTTCGCCGTCTTCGGCGCCAACACGGGCGTCGGCAAGACGCTCGTCTCCGCGGGCCTCGTCGCCTCCCTTCTCGCCTCCCCCTCCCCTTCCCCTTCCACCGTCGCCTACCTCAAGCCGCTCCAGACCGGCTTCCCCGATGACTCCGACGCGCGCTTCGTCTTCGACCGGGCCCCCGCGCTCCTCCGCCGCCTCCGCCTCGCCGGCGGCGGCGCCTCCACCCGCCTCGTCGCGTCCAACCACACCCTCTTCCCTTCCCCCGCCGTGGATCCCCTCCCCGAGCGCCAGGACACGGTGGTGAACTACGGCGGTGAGGAGGGGGTGGAGGAGAAGGCGCTCGTGTGCAGGACGGTGTACGCGTGGCGGGAGCCCGTGTCGCCGCACCTGGCGGCGGAGAGGGAGGGGATGCCGGTGGAGGACGAGGAGGTCAGGTGGCTCGTGGACCGGTGGCTGGCGGAGGAGGACGGGGGTGGGGAGGTGTGGAAGGTGCTCGAGACGGCCGGCGGCGTCGCCAGCCCTGGCCCTTCTGGCACGCTCCAATGTGATCTCTATCGGTGCGCGCGGTTCAGCTTCTGATTTATGTCATTCTTCATTTTTGGCTAGTCGTAGTGAATTCAAGTACTTGAATGTGTATGCGTTCGTTCAAGTAGAAATTAAATTGGGTACATTTGATTACTTTAGCATGTTTTGTTTCGTGCATATTATTCATTCAATGACATTTGCTTGGTCGAGCTAATTGATGTGATGCTTGCGCTGTATAGTTCCTCTACTTAGGAGAGCTCAACGCTAGCAAATTTCATCTGCCTCTTACAGATGTAAGAGAGTAATGTGCACGTTGTGAATGAACATATTAGCTATGCTAAATTGTGGCGAGCAATCTTGTTGTTTTAATATTTTGTGAGGTTTTATGTTCTGTACATGTTAGGATTTTTCATTTGAGTAGTTGATATTCATGAGCTGAGTAAATATTCATGTCCTACATCAATTTCTATGTTCAATTTACACTACTGTACACAGTGGCATATCCATTTGTCACTTCTTTTAATATATGTTTTATTCGTTCAGAAGTTATCACCTGTGGTGAACTGGCAATGCCACCTAATATTTCTTATCATGCATTAAAGTACCGTAGATACCTTGAATTTCTTAGAATGATTTATGGAGAACCTTGTAATATGTCAAAGTTAAACTTTGGCATCTCTACATGCTGGTTTGCTTTACTTTCTGGTGTAATTGATCACATACAACTCTTAACAGGTCCTCTAGGTTACCTGCAGTTCTTGTTGGAGATGGTCGTCTAGGTGGTATTTCATCTACTTTATCTGCCTACGAAACTCTGTTGCTCAGAGGATATGATGTGGGCTCAGTTATTTTGGAAGATCGTGGCTTGTCGAATGACAGATTCCTGCTCTCATACTTGAGAAAGAGGTGATTAATGCCTTTCTGTTCTTTGTCAAATCACTCTGAAAGTGTGCAGGAGCATAGAAGCATCTCTTTTATTTTAATTATATTATCCTGTTAATAATAATTATTTCAGTCTTTCATTTGGATATATGATAAACCTACTGCAACTTGCTTGTATTGTTTCTGTATTTCAATGTATGACTGATTTGTGCTATTTCTGTTATTTAGGGTACCTGTGCATGTCCTGCCACCAATTCCTGAGGATCCCAAAGACGACCTAACTGATTGGTTTTCTGAGTCATCCTCAGCTTTTAGTTCACTTAAAGATAGTCTGCAATCTTTTCATTCACGAAGAGTTCAAAGGCTAAACAGTATGCAGAGAAAATCAAAGTATTTGTTGTGGTGGCCTTTCACTCAGCATGATCTTGTACCTGTAGATTCTGTTACAGTTATTGATTCGCGTTTTGGTGAGAATTTCTCAGCATACAAGGTTTGCCAAGCATCTAGGACTATTTTGTAAAAAGGAAAATTATGATGAAAATCTAATAGAATTTTAGTTACATTGTTGCTCATTCTTTTGGTGCAGGTTAAAGACAAAACGATTGTTCCCCAGTTTGATGCATGTGCTAGTTGGTGGACACAAGGACCTGATTCTAACTTACAGGTTATTGTCTACACATCTTCCATCATCCGTGAAATTTCTTGTCTTCTCGTTTGCTAAGGGAACTATTGTTAGTAGTGTTTTATTTCTAAAGCTCTGTATGTTGAACTTTTGACAGGCAATTTTTGTAGCCTAAATTTCTCTTTGCTCATTAGATTGAACTTGCAAGAGATATGGGTTATGCTGCTGCAAGGTATGGTCATGTGATGTTTCCAGAGAATGTTCATGAACCTGCTCTTCGTTGTGCAGAACTTTTGCTTGGTGGTGTTGGTAAAGGTATGTGCTGTAACTTCACTATGATTTTGCATAATTATTATCACTGACAAATTCTAAGTACAGCTGTTGTTTAATGTTACTTTTATGTTACTATACAAGTCACGTTGTTGAGAAACACTTCATTCATTAGACACCTTCTCTTGTATGTTAGATTGGGCTTCTCGAGTTTATTTTTCAGACAATGGATCTACTGCAATTGAAATTGCTTTGAAGATGGCATTTCGTAAATATGCATGTGACCATGGGATTATAGTGGACAGCGAAAAAGATATCAGAAGTGAAGGAAGTGTTCATTTTAAGGTCTGTTCTGGTTATATCGAATATCCTTGTCAATCTACTTTGTTTTTTCAACTATATTAAAGTTCACTGCAAGAAATTTTTTTTTTCCCTATAGTCCATAGATGTTGAATCGACATGATCTCTATATGCATTGATGGCTTGATGCACTGTTGTTTCTTATGCTTTTAGTTGAATGCTGGGCAATATCTGCATAGTAACTTCAATAATCATCCAGCTACTCGAATTTGGCAATACATTTTCTAAACCACCAGTTATTTTGTATATTTTCTTAGTGACAAATGAACAAAGTAGATTTTTTGCACATGTTTGTGTGGATTTGATGTTTAATTCATTATATTTTCTATGCAATGATCAATGGTGTGGAATTGTTTTTATTTTTATTTTTATTTGACATGATGAATGTGTGCATTGACTGGAGCGCAGCATCAGTCTTAAGTGTGTAATGCATGCTAAATTTACCTTTTGATTGATTCAGGAAATGCATTTAAAATCGAGTAAATTGTTTAGGAATGAACCCTTTTTGTAACAGTGCCCAAATTTCCACGTGGCAGATCGCCACTGTAGAATAGTACAGGCATCAATTTTCCTTATTTACCTATACCTGTTGGACCCCTACATGCATTCTATTTTCTTCCTCCCTGGCTCAGTGCGCTCCCTCTTCCCCATTCCCCTCCAATTCTTATGCCATCCTTGCTGATCTCGACAATCTGTAATGCTGATGTCCTTTCATCCCTCTGTGTGATCTGATACAAGTCTATTTAAGTGTCCATGGAAGATCATGGATGGACATGGTTAATGCATACTGCAGTAGTTGATGGTTTCACCATTATAGCTATCAGGGCCAACGTCTAGGCCCACCAGAGAGCGGAGTTTTCCAGCGACATGGCTATGTTCCTGGACAGCTGTAGGGCCAGCAGTTTTCACCCCTCTAGATGCTTTAACTCTGATTTAGTGGCCTCTTCTTCTTGCTTATCCTCCTGGCGAGTTCTTGCAAGGCATTAGAAACTGTTGTATCTGAGCTGCTCCTTTACATTTCCTGATTTCACAATACCTCATCACTTGCCACGTCTAGCAGATTTTTCATCTGTGCTGTGGTCATTGGCATGGCTTAGATATAGCTCTCATAAAACGTGGTGAATGTTGTGGTCATCTACCCATCCACACTGGCAGATATTTTGTATCAGGAAAATCAAGTTAGTAGAACCAGAACTCCAAAAGACTGAAATATGGAGTAAAACTCAAAGTATCATGAAGTAGTTACACCTCCAGCTCAACAAGTAAGCTGATTTCTGTGCACTATTCTGTTCTTTTCTTTTCTTATCCACCACCATGCTCATTTGATCACAGTGAACTGCCTATATTAAACTGACTCTTGGGGAGAGGTGCCCCACAAGGCTTTGAGCTCAGATCGAGAAAGCCCCGAACACTGACTACCAAGGTGCTTTTCGTGTATGACTCTGAAAGCAGCTATCTCAGCGAGGATCTTTTTTGGTGTGACCCAGGAATCGAACCCTGGTTAGCAGCCCCATAACTAGGTGGCTTACCGCCATGCTATTCACGTGTTCTCAGTGAACTACATATGCTGACCTTGCATTTTTAAAGGAAAACCTGTATTTACAGTTCATCTCACCATTTTGTAGTTAATACTAATATGATGAAGAAATAATGCAATGTGGAATTCTTGCTCCATGTTTCTTCTTTTGATATATGCATTTTTAATTGAATCCTCTCTAGGTCCTTGCTTTAAATGGTTCCTACCACGGGGATACTTTGGGTGCTATGGAAGCACAAGCTCCATCAGCTTACACATCTTTTCTTCAGCAGCCATGGTAACCATGAATTTCATGTGCATTGATGTATCTGTAGCCTTCTTAAGTGATTTGCTATAGCAACTTTGTTTATCTGTTTATATGGCCTAGTAGAGATTTCTTATCTTGTCGTTAAAGCATGGTGCATATTTTTTTCCTGTACTGGAAGCATTATCATTGAATTTTCACTTCTGAAATCAATAAAGCTGAGATCATTCACTTGAGTTTTGTTCTGTAGGTACTCGGGGCGAGGACTTTTTCTAGATCCTCCTACAGTGTACATTAAAAACAAAAGCGCCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA027374