BGIOSGA027565
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027565 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027565, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0054L03.39-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027565-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027565-PA |
| Length |
9679 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:4667954..4677632 |
| Sequence Coding Region |
4677487..4677632,4676298..4677015),complement(4675694..4675891,4673035..4673702),complement(4671350..4671779 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:4667954..4677632 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:4667954..4677632 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGTGGCGCCGCCGCTGCCGCCGGCACCGGCGCGGCAGCTACGGCGGTTGCAGGGGTCTTCGCCGCGGCCACCGCCGTGGCTGTCCTCTCCCTTCCGCCGCACCCGCTACTTGTCGCGCCCGACCTTCGCCGCGGGAGGAAGGCAAGATTATTCTCCTAGTTCAGGCATGGGGGTTAGCAAAACCGGTGCTTTCAGGCTTGGATTATATGGCAACTTGAATGTACAAAGTAGCGTGCAAGAATGGGTTGATGAAACCAAGAGGTTATTTTTCCTCAGGACCACAAACAATGTCAGAAACAACATCACTAATGGCACTACTCCTCTGCGGGTTGGAAATCTGCGTCATGATCCCTCAGAAGATACCAGGAGTTCGAACTATCCTTCCTTGTATAATCAAAGAGAAAGAGGACCATCTAATTCAATTGTAAATAGACATGTCGATACAGATTTGGCTAAGCATCGTGTGATGTATCAGTCAGCACATGCTGTGCCTGCCCCATTCAGTGTTGTTAATAATGATATCAAACCACTGAACATGCTTGATGGCTCCAAGGAGGCAATTCCTTGGCACGATTCCGTTACGGTGGAATCTTCTCTGCCTAAAGTTTCCAAGTCAGAGACAACTTTGGTGGTTGATAAAGCTATCCCAGACAAAAAGGAGCACAAACGCATTACAAGGAAGGTGACGCCAAATGTCCCGGACAAAGCTTCCTTGTCCACTGAGTCAAAAAATGCACGGAAGTTGCTTGCTACCATCTATGACAAAGTTTTGGTTGTCGACAATGTTGAGTCAGCTAGGAGTGTTGTTAAACTGCTTACTACAAAGTACAAAGGCTTTATTCATGCATGTGACACGGAGGTGGCAAATATTGATGTCAAAGAAGAGACACCAGTTGGTCACGGAGAAGTAATATGCTTTAGCATCTGTTCAGGAAATTCTGATGGGGAGGCTGATTTTGGAAATGGCAAAACATGCATATGGGTGGATGTGCTAGATGGTGGAAGGGATGTTCTAATGGAGTTTGCTCCTTTCTTTGAGGACCCATCTATCAAAAAGGTTTGGCATAACTATAGTTTTGATAGCCATGTCATTGAGAACTGTGGAATCAAGGTTGCTGGATTTCATGCTGATACGATGCATCTTGCACGCCTGTGGGATTCTTCCAGGAGAACTGATGGTGGATATTCACTTGAAGGACTAACAAATGATCACAGAGTCATGGATGCTGTTGTAAAGGACATACCTAAAACTGGGAAGGTGTCAATGAAAACTATCTTTGGCCGGAAAAAGGTTAGAAAAGATGGATCTGAAGGGAAAACCATATCTATCGAGCCAGTCGAAAAGTTACAAAGGGAGGATAGAGAGTTGTGGATTTGCTATTCCTCACTAGATTCAATGAGTACATTAAAGCTTTATGAAAGCTTGAAAAACAAGCTTGAAGCAAAGGAATGGATTTTCGATGATTGTCCTAGAGGAACAATGTATGATTTCTACGAAGAGTATTGGCGTCCCTTTGGTGCTCTTCTTGTAAAGATGGAAACAGAGGGAGTGCTTGTTGACCGTGCATACCTTTCGGAGATTGAGAAAGCTGCTGTTACTGAACGAGAATTAGCAGCGGATAAGTTTCGGAAATGGGCATCTAAGCATTGTCCTGATGCCAAGTACATGAATGTGAATAGTGATAATCAAATTCGCCAACTTTTCTTTGGTGGCATCGAAAATAGAAATAAGCGTGGTGAAACTTGGCCACAAAGTAAAACTTTTAAAGTGCCAAATGATGAAGGCATAACTACAGAGGGCAAGAAGACTCCAAAGTCTCGCACAATCAAACTTTTCACTATTGTGGAAGATCTTAAAATTGATATGTTCACCCCGACTGGTTGGCCTTCAGTCAGCGGGGATGTTTTAAGGAGTTTGGCTGGTAAAATACCCACAAATCGTATATATAAAATTGATGATGGCCAAGAGTTTGATGAAGATGGGAGCAGTTTGGAACTTCCTGAGCAGGATATAGAAGACACTTCCCTATATGGAACTGCATATGAAGCGTTTGGTGGAGGAAATAAGGGAAGGGAAGCATGTCATGCCATTGCTGCTCTATGTGAAGTCTTTTCTATTGACAAGTTGATATCCGGCTTCATTGTTCCATTGCAGGGAGATCGTATATCATGCAAGGAAGGGCGCATTCACTGTTCATTAAATATCAATACTGAAACAGGACGCTTGTCAGCAAGAACACCAAACTTACAGAATCAACCTGCTCTTGAAAAGGATAGGTACAAGATTCGCCAAGCTTTTGTCGCAGCTCCAGGGAACACTCTTATTGTTGCTGATTATGGCCAACTGGAACTGAGGATCTTGGCGCATCTTACTAATTGTAAAAGCATGCTGGAAGCTTTCAAGGCTGGTGGTGACTTTCATTCTAGGACAGCCATGAATATGTACCAGCATGTTCGTGATGCTGTTGAAGAAAAGAAAGTTCTGCTTGAATGGCATCCTCAACCAGGTCAAGAGAAACCCCCAGTGCCATTATTGAAGGATGCTTTTGGCGCTGAGAGGAGGAAGGCCAAAATGCTTAATTTTTCCATTGCATATGGGAAGACTGCTGTTGGTCTATCTTGGGATTGGAAGGTTGAAGTTAGGGAAGCAAGGGATACACTCAAACTTTGGTATAGGGATAGAAAGGAAGTTTCAGCTTGGCAAAAGAAGCAGAAAGCCTTTGCACTTGAAAAGTGCGAAGTCTACACTTTGCTCGGGCGATCACGCCAATTTCCTAATATGACTCATGCGGGTCCTGGTCAAAAGGGTCACGTCGAGCGTGCTGCTATAAATGCACCAGTGCAGGGCAGTGCAGCAGATGTTGCTATGTGTGCAATGCTTGAGATAGAAAGAAACGCTCGCCTTAAGGAGCTTGGTTGGAGACTCCTATTGCAGGTGCATGATGAAGTAATCTTGGAGGGGCCTACAGAATCTGCCGAGGAAGCCAAGACCATCGTTGTGGAGTGCATGTCCAAGCCTTTCTATGGAACCAACATCCTCAAGGTCGACCTAGCTGTCGACGCCAAGTACGCGAAGAGCTGGTATGCTGCCAAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVAPPLPPAPARQLRRLQGSSPRPPPWLSSPFRRTRYLSRPTFAAGGRQDYSPSSGMGVSKTGAFRLGLYGNLNVQSSVQEWVDETKRLFFLRTTNNVRNNITNGTTPLRVGNLRHDPSEDTRSSNYPSLYNQRERGPSNSIVNRHVDTDLAKHRVMYQSAHAVPAPFSVVNNDIKPLNMLDGSKEAIPWHDSVTVESSLPKVSKSETTLVVDKAIPDKKEHKRITRKVTPNVPDKASLSTESKNARKLLATIYDKVLVVDNVESARSVVKLLTTKYKGFIHACDTEVANIDVKEETPVGHGEVICFSICSGNSDGEADFGNGKTCIWVDVLDGGRDVLMEFAPFFEDPSIKKVWHNYSFDSHVIENCGIKVAGFHADTMHLARLWDSSRRTDGGYSLEGLTNDHRVMDAVVKDIPKTGKVSMKTIFGRKKVRKDGSEGKTISIEPVEKLQREDRELWICYSSLDSMSTLKLYESLKNKLEAKEWIFDDCPRGTMYDFYEEYWRPFGALLVKMETEGVLVDRAYLSEIEKAAVTERELAADKFRKWASKHCPDAKYMNVNSDNQIRQLFFGGIENRNKRGETWPQSKTFKVPNDEGITTEGKKTPKSRTIKLFTIVEDLKIDMFTPTGWPSVSGDVLRSLAGKIPTNRIYKIDDGQEFDEDGSSLELPEQDIEDTSLYGTAYEAFGGGNKGREACHAIAALCEVFSIDKLISGFIVPLQGDRISCKEGRIHCSLNINTETGRLSARTPNLQNQPALEKDRYKIRQAFVAAPGNTLIVADYGQLELRILAHLTNCKSMLEAFKAGGDFHSRTAMNMYQHVRDAVEEKKVLLEWHPQPGQEKPPVPLLKDAFGAERRKAKMLNFSIAYGKTAVGLSWDWKVEVREARDTLKLWYRDRKEVSAWQKKQKAFALEKCEVYTLLGRSRQFPNMTHAGPGQKGHVERAAINAPVQGSAADVAMCAMLEIERNARLKELGWRLLLQVHDEVILEGPTESAEEAKTIVVECMSKPFYGTNILKVDLAVDAKYAKSWYAAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..146#618..1335#1742..1939#3931..4598#5854..6283#6820..6915#7734..7826#7909..8103#8656..8748#8929..9141#9219..9308#9518..9679#ATGGCGGTGGCGCCGCCGCTGCCGCCGGCACCGGCGCGGCAGCTACGGCGGTTGCAGGGGTCTTCGCCGCGGCCACCGCCGTGGCTGTCCTCTCCCTTCCGCCGCACCCGCTACTTGTCGCGCCCGACCTTCGCCGCGGGAGGAAGGTAGCCGTACTGTTTATTTGTGTGTGTTGCATAAGCTTTTTCTTTTTCTAGTAGTAGTTAAGATGTCCCTATCATGGTGGTGGGAGAAAGCTCTGTTCCGTAGTGCCTAATTCGTGATGAAAAATAATACTCCCTCCGTTTCTAAATATTCGATACTGTTGACTTTTTAGCACGACCGTTCGTCTTATTCAAAACTTTTGTGAAATATGTAAAACTATACGTATACATATATATATATTTTTGTTTTGTTTTAAGAGATCTAAGCATTCCTTATGTAGTCACATTCCACTTCTTATAGCCATACAATTATTACTACAGAAGTACGAATTGCCCGATAATAGTAATCTGCCAAAGAGTAACTAGGTTCTACTGACTATTCTGAATGTCACGCTTTTGCCTTATTACTTGATGATTTCACATTGCTTGGGATCTTGGGTGCTTCTGAACTTTGCAAATGGTTCTTGTTGGCAGGCAAGATTATTCTCCTAGTTCAGGCATGGGGGTTAGCAAAACCGGTGCTTTCAGGCTTGGATTATATGGCAACTTGAATGTACAAAGTAGCGTGCAAGAATGGGTTGATGAAACCAAGAGGTTATTTTTCCTCAGGACCACAAACAATGTCAGAAACAACATCACTAATGGCACTACTCCTCTGCGGGTTGGAAATCTGCGTCATGATCCCTCAGAAGATACCAGGAGTTCGAACTATCCTTCCTTGTATAATCAAAGAGAAAGAGGACCATCTAATTCAATTGTAAATAGACATGTCGATACAGATTTGGCTAAGCATCGTGTGATGTATCAGTCAGCACATGCTGTGCCTGCCCCATTCAGTGTTGTTAATAATGATATCAAACCACTGAACATGCTTGATGGCTCCAAGGAGGCAATTCCTTGGCACGATTCCGTTACGGTGGAATCTTCTCTGCCTAAAGTTTCCAAGTCAGAGACAACTTTGGTGGTTGATAAAGCTATCCCAGACAAAAAGGAGCACAAACGCATTACAAGGAAGGTGACGCCAAATGTCCCGGACAAAGCTTCCTTGTCCACTGAGTCAAAAAATGCACGGAAGTTGCTTGCTACCATCTATGACAAAGTTTTGGTTGTCGACAATGTTGAGTCAGCTAGGAGTGTTGTTAAACTGCTTACTACAAAGTACAAAGGCTTTATTCATGCATGTGACACGGAGGTATTTCGCCAAACCCTGCTTGAGTTCTATCATCGGTATATCAGTTTGTTATTTAGGTTTTCCCTCATAATTGTGAGAGTATCAATAAGAAGTATATTTCTGATAGGTGATACTATAGTATCTTGTTTGGTCATCAATTATTGCTGACCTCAAGTGTTTGTTGTTAGTGCCTTTTTTCCCTATGTATCTTCTCTGAAAATGTAAGTTGCAGAGTTTACAGGAGATGTCATGAAGAATGTAAAATATTAAATGCTAATGCTAATTATTGGTTTCTTCTAGTTACATGGTTTGACATGCTCATAGTCTACTTCTGTGGTAGCAAGCTCTGCTCAGAACTATTTACAGTTTTGTTACATATCAAGCTCCAAACATACATTCTAATTTAGGATAGTACAATATTACGCAGGTGGCAAATATTGATGTCAAAGAAGAGACACCAGTTGGTCACGGAGAAGTAATATGCTTTAGCATCTGTTCAGGAAATTCTGATGGGGAGGCTGATTTTGGAAATGGCAAAACATGCATATGGGTGGATGTGCTAGATGGTGGAAGGGATGTTCTAATGGAGTTTGCTCCTTTCTTTGAGGACCCATCTATCAAAAAGGTTCACTTCGATTCCTCATTTATCGTGGAGTAAATTTATAGTGGTTATCTTCTCCCTTTTTGTGTTGGATGAAATATATTAGTGCAATAGTTCCCTTTTCCTCTTCTATTATACTACTGTAATTACATTACTTCTTTTAGATTAGGCCTTAGTTTGGCAGCAAACTGCACTAAACACAATTTCCTATCACTCATAAACTTATACTTCAACATTGAAAATAACTAGATATAGATCACTATTTTATAATTATGCATTTTACCTGATTGTCAGCACCATAAAGTTGTGGGTTTATAACCAAAAAAAGAAAAAAAACCTACCTGGCTACCTGCTAAACCCTACCCAAGAGTGATAATGTAAATGGACTACCTTAAGATTGCTGTTTTAGACAGACCCTTCTGTGCTCTGACATACTGCCTTTATATGTTCCATTTTTCCCTGACTAGAAAAGTTGCCTGTGCGTTGCAACGAGTGAAGGCAACTTGCAAATAACTGAACAAAATTAACTGTTTATCCTAGGCTGTAGCTACCGGTCCATCACCTAATGAACTATGAAATCATGTGGGTATGATCGATGAATATAATTGTAACTAAAAAATGACATCATTTCTAACACGGTGATGGTGTTTAGTTTTGAAGTTATGGAGTGTATTTCTTTCGTGCAATAGCGCATGTGTGCTTGCGTCGTCCAACATGAGTCAGGTCATAAAAAATCTTGGTATGGTAGTCTATTTGATTTGTAGGAGGCTTGGAGTAAATCTTAGTTAATAGCGAGGACTTGGACTACACTAAGGGAAGAGCCGAAAGACACATGGTATATTGATACCGTGTAGAAGGATTGATGTGACATGTGACTCATTAGTGGTGTACCAGGTCCAAAAAGTCATGAATAAAATATTTATAAAAATGGAAAGAGAAGAGATGGAGAAAAAACATCTATGTTTGAAAATCACAAGGTAACAACTTTCACATCAGCCACTGTTCACGCGGGAACTGTTCATCACCAGAGGTGAAGAGCTTCATGGCTAGCTTGGGGCAGTAGACCCATCTGATCTAAGTAGGCCATGAATTCACGATCGGTCAATGCAGCCACAGCCGGCCCAGGTAGGGTCAGCAGGGAAAAGACCTGGCTGGGTGGAGCTAGAATTCCCTCACTCGTGTACTGCTGTACTGAAAAAAGGGAGGACGTGCGCTGTGTACAAAGAGTCAAAGACTAATGCGGTAACTGAGTAGAGGATGGACGAAAATTTTGCGTACAAAATCATCTTCAATTTTTATAATATTATAGGTAAAGATTGAATAGATTCACATCTTCGTACCCGAGCCCCATATTTCCTACTACTTCGCTTAGAAAAAAGAAACATGTTGTTTTAGACATTGACACAGTCCCCAAAATACAACTTTGACAACTTATTTATGTTATAGTATATTTGTAGTATCAATTGTATGACCCTATAAAATTGTAATATTATGATATTCTGGTCACAAAAACTATGTTCTATTACAAAATGCTAAAAGAACCCAATATAGTTCTAATATTGTGGAAGTATTTCTTGAGAAAAATCTACAAGTACAATTTTCATGTGTCCAATCTAATTAGTTAAAAGATATTGATAAGAACATTTTTAAAGTTTGACTTCAAACATGTCCAAAAGGAGATGTTTTTTTGTGACTGGAGGGGGTAGTAATTTTGGTGACAAATATACACATACGAGTTTCATATACCAAGATTAAATATTTTGAAGATATTGATGGTCAAAGTTCTGATTGTTTAACTTAACGTATGTCCAAAATGGCATGTTTGCGTGACTGGAGCCCAGAGGGAGTATGAAATTAATATGCTAATTAGTAGATTCAGCCTTCAATCAATCTTTGAACTGTGCAGTTCAGAATAAAACTACAGATTGGTCATTACCCATCAATTATTATTATACTACGTATTTGTTTCTTCTTGGCTTGTCTGAAGTGATCTGTTGTTTCTCCTCATCATGTAGGTTTGGCATAACTATAGTTTTGATAGCCATGTCATTGAGAACTGTGGAATCAAGGTTGCTGGATTTCATGCTGATACGATGCATCTTGCACGCCTGTGGGATTCTTCCAGGAGAACTGATGGTGGATATTCACTTGAAGGACTAACAAATGATCACAGAGTCATGGATGCTGTTGTAAAGGACATACCTAAAACTGGGAAGGTGTCAATGAAAACTATCTTTGGCCGGAAAAAGGTTAGAAAAGATGGATCTGAAGGGAAAACCATATCTATCGAGCCAGTCGAAAAGTTACAAAGGGAGGATAGAGAGTTGTGGATTTGCTATTCCTCACTAGATTCAATGAGTACATTAAAGCTTTATGAAAGCTTGAAAAACAAGCTTGAAGCAAAGGAATGGATTTTCGATGATTGTCCTAGAGGAACAATGTATGATTTCTACGAAGAGTATTGGCGTCCCTTTGGTGCTCTTCTTGTAAAGATGGAAACAGAGGGAGTGCTTGTTGACCGTGCATACCTTTCGGAGATTGAGAAAGCTGCTGTTACTGAACGAGAATTAGCAGCGGATAAGTTTCGGAAATGGGCATCTAAGCATTGTCCTGATGCCAAGTACATGAATGTGAATAGTGATAATCAAATTCGCCAACTTTTCTTTGGTGGCATCGAAAATAGGTATTCCTACCACCCTTGTATAATCTCTTTGTATGTCTGCTTGATTTGTATATACTTTATGCCAGGATATCTTTTTGAATGCATGTCATTTAGGAACCACTGTAAAAGGATATCATTAATATGTGTTAAAACCAATAATTGCTTGCTGTTCTTATATGCATTGGTCCACGCATGGTTTAAACTTGTTAGCAACTGTTCTTGTGTGTCCAACACTCCAACACATGAATAATTCTTCATATCAACAAGAGGTGGAAAACGAGG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